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'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;N-acetyl-beta-D-glucosamine; 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-glucose; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE ; 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 Y01 non-polymer . 'CHOLESTEROL HEMISUCCINATE' ? 'C31 H50 O4' 486.726 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7WLK _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 7WLK _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.006 ? 9676 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.729 ? 13119 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 11.969 ? 1382 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.045 ? 1535 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 1581 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7WLK _struct.title 'CryoEM structure of human low-voltage activated T-type calcium channel Cav3.3 in complex with Otilonium Bromide(OB)' _struct.pdbx_structure_determination_methodology ? _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7WLK _struct_keywords.text 'OB, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 3 ? E N N 4 ? F N N 3 ? G N N 3 ? H N N 3 ? I N N 5 ? J N N 5 ? K N N 5 ? L N N 6 ? M N N 5 ? N N N 6 ? O N N 5 ? P N N 3 ? Q N N 5 ? R N N 4 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 THR A 66 ? CYS A 77 ? THR A 66 CYS A 77 1 ? 12 HELX_P HELX_P2 AA2 ASN A 78 ? MET A 98 ? ASN A 78 MET A 98 1 ? 21 HELX_P HELX_P3 AA3 SER A 109 ? GLY A 138 ? SER A 109 GLY A 138 1 ? 30 HELX_P HELX_P4 AA4 CYS A 144 ? GLY A 147 ? CYS A 144 GLY A 147 5 ? 4 HELX_P HELX_P5 AA5 ASP A 148 ? GLN A 170 ? ASP A 148 GLN A 170 1 ? 23 HELX_P HELX_P6 AA6 ILE A 177 ? ASN A 190 ? ILE A 177 ASN A 190 5 ? 14 HELX_P HELX_P7 AA7 VAL A 192 ? LEU A 206 ? VAL A 192 LEU A 206 1 ? 15 HELX_P HELX_P8 AA8 LEU A 209 ? ALA A 232 ? LEU A 209 ALA A 232 1 ? 24 HELX_P HELX_P9 AA9 GLY A 233 ? ASN A 237 ? GLY A 233 ASN A 237 5 ? 5 HELX_P HELX_P10 AB1 ASN A 318 ? TYR A 323 ? ASN A 318 TYR A 323 5 ? 6 HELX_P HELX_P11 AB2 ASN A 332 ? ALA A 337 ? ASN A 332 ALA A 337 1 ? 6 HELX_P HELX_P12 AB3 ILE A 343 ? THR A 355 ? ILE A 343 THR A 355 1 ? 13 HELX_P HELX_P13 AB4 GLY A 358 ? HIS A 370 ? GLY A 358 HIS A 370 1 ? 13 HELX_P HELX_P14 AB5 SER A 371 ? TYR A 373 ? SER A 371 TYR A 373 5 ? 3 HELX_P HELX_P15 AB6 ASN A 374 ? ILE A 383 ? ASN A 374 ILE A 383 1 ? 10 HELX_P HELX_P16 AB7 MET A 389 ? LEU A 413 ? MET A 389 LEU A 413 1 ? 25 HELX_P HELX_P17 AB8 GLU A 628 ? ASP A 638 ? GLU A 628 ASP A 638 1 ? 11 HELX_P HELX_P18 AB9 TYR A 641 ? GLU A 660 ? TYR A 641 GLU A 660 1 ? 20 HELX_P HELX_P19 AC1 PRO A 665 ? ALA A 693 ? PRO A 665 ALA A 693 1 ? 29 HELX_P HELX_P20 AC2 GLY A 695 ? ASN A 702 ? GLY A 695 ASN A 702 1 ? 8 HELX_P HELX_P21 AC3 ASN A 702 ? GLY A 721 ? ASN A 702 GLY A 721 1 ? 20 HELX_P HELX_P22 AC4 GLY A 725 ? LEU A 730 ? GLY A 725 LEU A 730 1 ? 6 HELX_P HELX_P23 AC5 ARG A 731 ? PHE A 744 ? ARG A 731 PHE A 744 5 ? 14 HELX_P HELX_P24 AC6 MET A 745 ? GLY A 785 ? MET A 745 GLY A 785 1 ? 41 HELX_P HELX_P25 AC7 SER A 806 ? THR A 819 ? SER A 806 THR A 819 1 ? 14 HELX_P HELX_P26 AC8 ASP A 822 ? ALA A 832 ? ASP A 822 ALA A 832 1 ? 11 HELX_P HELX_P27 AC9 SER A 835 ? TRP A 837 ? SER A 835 TRP A 837 5 ? 3 HELX_P HELX_P28 AD1 ALA A 838 ? TYR A 851 ? ALA A 838 TYR A 851 1 ? 14 HELX_P HELX_P29 AD2 VAL A 852 ? GLN A 866 ? VAL A 852 GLN A 866 1 ? 15 HELX_P HELX_P30 AD3 LEU A 1171 ? ALA A 1188 ? LEU A 1171 ALA A 1188 1 ? 18 HELX_P HELX_P31 AD4 SER A 1198 ? GLY A 1227 ? SER A 1198 GLY A 1227 1 ? 30 HELX_P HELX_P32 AD5 ALA A 1234 ? ARG A 1237 ? ALA A 1234 ARG A 1237 5 ? 4 HELX_P HELX_P33 AD6 SER A 1238 ? ALA A 1260 ? SER A 1238 ALA A 1260 1 ? 23 HELX_P HELX_P34 AD7 ILE A 1267 ? ARG A 1281 ? ILE A 1267 ARG A 1281 1 ? 15 HELX_P HELX_P35 AD8 ALA A 1289 ? LYS A 1304 ? ALA A 1289 LYS A 1304 1 ? 16 HELX_P HELX_P36 AD9 ILE A 1306 ? PHE A 1328 ? ILE A 1306 PHE A 1328 1 ? 23 HELX_P HELX_P37 AE1 ASN A 1345 ? ASN A 1353 ? ASN A 1345 ASN A 1353 1 ? 9 HELX_P HELX_P38 AE2 LEU A 1366 ? SER A 1378 ? LEU A 1366 SER A 1378 1 ? 13 HELX_P HELX_P39 AE3 GLY A 1381 ? ALA A 1392 ? GLY A 1381 ALA A 1392 1 ? 12 HELX_P HELX_P40 AE4 ASN A 1404 ? TRP A 1406 ? ASN A 1404 TRP A 1406 5 ? 3 HELX_P HELX_P41 AE5 MET A 1407 ? ARG A 1462 ? MET A 1407 ARG A 1462 1 ? 56 HELX_P HELX_P42 AE6 SER A 1486 ? SER A 1505 ? SER A 1486 SER A 1505 1 ? 20 HELX_P HELX_P43 AE7 PRO A 1512 ? PHE A 1541 ? PRO A 1512 PHE A 1541 1 ? 30 HELX_P HELX_P44 AE8 GLY A 1542 ? ASP A 1549 ? GLY A 1542 ASP A 1549 1 ? 8 HELX_P HELX_P45 AE9 TRP A 1551 ? ALA A 1575 ? TRP A 1551 ALA A 1575 1 ? 25 HELX_P HELX_P46 AF1 ASN A 1580 ? ARG A 1591 ? ASN A 1580 ARG A 1591 1 ? 12 HELX_P HELX_P47 AF2 ILE A 1592 ? LYS A 1600 ? ILE A 1592 LYS A 1600 5 ? 9 HELX_P HELX_P48 AF3 ALA A 1602 ? GLN A 1614 ? ALA A 1602 GLN A 1614 1 ? 13 HELX_P HELX_P49 AF4 ALA A 1615 ? GLY A 1642 ? ALA A 1615 GLY A 1642 1 ? 28 HELX_P HELX_P50 AF5 ASN A 1663 ? THR A 1676 ? ASN A 1663 THR A 1676 1 ? 14 HELX_P HELX_P51 AF6 ASN A 1679 ? LEU A 1688 ? ASN A 1679 LEU A 1688 1 ? 10 HELX_P HELX_P52 AF7 ARG A 1696 ? SER A 1700 ? ARG A 1696 SER A 1700 5 ? 5 HELX_P HELX_P53 AF8 SER A 1701 ? LYS A 1738 ? SER A 1701 LYS A 1738 1 ? 38 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 239 SG ? ? ? 1_555 A CYS 280 SG ? ? A CYS 239 A CYS 280 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 269 SG ? ? ? 1_555 A CYS 326 SG ? ? A CYS 269 A CYS 326 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf3 disulf ? ? A CYS 1335 SG ? ? ? 1_555 A CYS 1349 SG ? ? A CYS 1335 A CYS 1349 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf4 disulf ? ? A CYS 1646 SG ? ? ? 1_555 A CYS 1652 SG ? ? A CYS 1646 A CYS 1652 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf5 disulf ? ? A CYS 1691 SG ? ? ? 1_555 A CYS 1698 SG ? ? A CYS 1691 A CYS 1698 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? covale1 covale one ? A ASN 1342 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? A ASN 1342 A NAG 2313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 1345 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? A ASN 1345 A NAG 2311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale3 covale none ? A PHE 1672 CD1 ? ? ? 1_555 O Y01 . CAA ? ? A PHE 1672 A Y01 2314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? ? metalc1 metalc ? ? A GLU 357 OE2 ? ? ? 1_555 E CA . CA ? ? A GLU 357 A CA 2304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.425 ? ? metalc2 metalc ? ? A ASP 1380 OD1 ? ? ? 1_555 E CA . CA ? ? A ASP 1380 A CA 2304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.796 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? metalc ? ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ARG A 238 ? CYS A 239 ? ARG A 238 CYS A 239 AA1 2 CYS A 326 ? ARG A 327 ? CYS A 326 ARG A 327 AA2 1 TYR A 1333 ? HIS A 1334 ? TYR A 1333 HIS A 1334 AA2 2 VAL A 1357 ? HIS A 1358 ? 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