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T4 fibritin trimerization motif, twin strep II tag and 8-His were introduced at C-terminal. ; 2 polymer man '16L9 Fv' 25730.025 2 ? ? ? ? 3 polymer man 'GW01 Fv' 26186.488 2 ? ? ? ? 4 non-polymer syn 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose 221.208 21 ? ? ? ? # _entity_name_com.entity_id 1 _entity_name_com.name 'S glycoprotein,E2,Peplomer protein' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MFVFLVLLPLVSSQCVNLTTRTQLPPAYTNSFTRGVYYPDKVFRSSVLHSTQDLFLPFFSNVTWFHVISGTNGTKRFDNP VLPFNDGVYFASIEKSNIIRGWIFGTTLDSKTQSLLIVNNATNVVIKVCEFQFCNDPFLDHKNNKSWMESEFRVYSSANN CTFEYVSQPFLMDLEGKQGNFKNLREFVFKNIDGYFKIYSKHTPIIVREPEDLPQGFSALEPLVDLPIGINITRFQTLLA LHRSYLTPGDSSSGWTAGAAAYYVGYLQPRTFLLKYNENGTITDAVDCALDPLSETKCTLKSFTVEKGIYQTSNFRVQPT 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'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;N-acetyl-beta-D-glucosamine; 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-glucose; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE ; 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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B CYS 391 B CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf19 disulf ? ? B CYS 477 SG ? ? ? 1_555 B CYS 485 SG ? ? B CYS 480 B CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf20 disulf ? ? B CYS 535 SG ? ? ? 1_555 B CYS 587 SG ? ? B CYS 538 B CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf21 disulf ? ? B CYS 614 SG ? ? ? 1_555 B CYS 646 SG ? ? B CYS 617 B CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf22 disulf ? ? B CYS 659 SG ? ? ? 1_555 B CYS 668 SG ? ? B CYS 662 B CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf23 disulf ? ? B CYS 735 SG ? ? ? 1_555 B CYS 757 SG ? ? B CYS 738 B CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf24 disulf ? ? B CYS 740 SG ? ? ? 1_555 B CYS 746 SG ? ? B CYS 743 B CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf25 disulf ? ? B CYS 1029 SG ? ? ? 1_555 B CYS 1040 SG ? ? B CYS 1032 B CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf26 disulf ? ? B CYS 1079 SG ? ? ? 1_555 B CYS 1123 SG ? ? B CYS 1082 B CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf27 disulf ? ? C CYS 129 SG ? ? ? 1_555 C CYS 161 SG ? ? C CYS 131 C CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf28 disulf ? ? C CYS 288 SG ? ? ? 1_555 C CYS 298 SG ? ? C CYS 291 C CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf29 disulf ? ? C CYS 333 SG ? ? ? 1_555 C CYS 358 SG ? ? C CYS 336 C CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf30 disulf ? ? C CYS 376 SG ? ? ? 1_555 C CYS 429 SG ? ? C CYS 379 C CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf31 disulf ? ? C CYS 388 SG ? ? ? 1_555 C CYS 522 SG ? ? C CYS 391 C CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf32 disulf ? ? C CYS 477 SG ? ? ? 1_555 C CYS 485 SG ? ? C CYS 480 C CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf33 disulf ? ? C CYS 535 SG ? ? ? 1_555 C CYS 587 SG ? ? C CYS 538 C CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf34 disulf ? ? C CYS 614 SG ? ? ? 1_555 C CYS 646 SG ? ? C CYS 617 C CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf35 disulf ? ? C CYS 659 SG ? ? ? 1_555 C CYS 668 SG ? ? C CYS 662 C CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf36 disulf ? ? C CYS 735 SG ? ? ? 1_555 C CYS 757 SG ? ? C CYS 738 C CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf37 disulf ? ? C CYS 740 SG ? ? ? 1_555 C CYS 746 SG ? ? C CYS 743 C CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf38 disulf ? ? C CYS 1029 SG ? ? ? 1_555 C CYS 1040 SG ? ? C CYS 1032 C CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf39 disulf ? ? C CYS 1079 SG ? ? ? 1_555 C CYS 1123 SG ? ? C CYS 1082 C CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf40 disulf ? ? D CYS 22 SG ? ? ? 1_555 D CYS 90 SG ? ? D CYS 22 D CYS 90 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf41 disulf ? ? D CYS 148 SG ? ? ? 1_555 D CYS 221 SG ? ? D CYS 148 D CYS 221 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf42 disulf ? ? E CYS 22 SG ? ? ? 1_555 E CYS 89 SG ? ? E CYS 22 E CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf43 disulf ? ? E CYS 146 SG ? ? ? 1_555 E CYS 220 SG ? ? E CYS 146 E CYS 220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf44 disulf ? ? F CYS 22 SG ? ? ? 1_555 F CYS 90 SG ? ? F CYS 22 F CYS 90 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf45 disulf ? ? F CYS 148 SG ? ? ? 1_555 F CYS 221 SG ? ? F CYS 148 F CYS 221 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf46 disulf ? ? G CYS 22 SG ? ? ? 1_555 G CYS 89 SG ? ? G CYS 22 G CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf47 disulf ? ? G CYS 146 SG ? ? ? 1_555 G CYS 220 SG ? ? G CYS 146 G CYS 220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? covale1 covale one ? A ASN 706 ND2 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? A ASN 709 A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 714 ND2 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? A ASN 717 A NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 798 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? A ASN 801 A NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? A ASN 1095 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? A ASN 1098 A NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? A ASN 1131 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? A ASN 1134 A NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? B ASN 160 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? B ASN 165 B NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? B ASN 279 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? B ASN 282 B NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? B ASN 328 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? B ASN 331 B NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? B ASN 613 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? B ASN 616 B NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.430 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? B ASN 706 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? B ASN 709 B NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? B ASN 714 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? B ASN 717 B NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.427 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? B ASN 798 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? B ASN 801 B NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.427 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? B ASN 1095 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? B ASN 1098 B NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? B ASN 1131 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? B ASN 1134 B NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? C ASN 279 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? C ASN 282 C NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.422 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? C ASN 328 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? C ASN 331 C NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? C ASN 706 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? C ASN 709 C NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.430 ? N-Glycosylation covale18 covale one ? C ASN 714 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? C ASN 717 C NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? N-Glycosylation covale19 covale one ? C ASN 798 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? C ASN 801 C NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? N-Glycosylation covale20 covale one ? C ASN 1095 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? C ASN 1098 C NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale21 covale one ? C ASN 1131 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? C ASN 1134 C NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 3 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 5 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 3 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 3 ? AB5 ? 3 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 2 ? AC2 ? 3 ? AC3 ? 2 ? AC4 ? 4 ? AC5 ? 3 ? AC6 ? 5 ? AC7 ? 5 ? AC8 ? 4 ? AC9 ? 2 ? AD1 ? 4 ? AD2 ? 4 ? AD3 ? 3 ? AD4 ? 2 ? AD5 ? 2 ? AD6 ? 4 ? AD7 ? 3 ? AD8 ? 2 ? AD9 ? 2 ? AE1 ? 3 ? AE2 ? 5 ? AE3 ? 4 ? AE4 ? 4 ? AE5 ? 2 ? AE6 ? 4 ? AE7 ? 2 ? AE8 ? 2 ? AE9 ? 3 ? AF1 ? 2 ? AF2 ? 4 ? AF3 ? 2 ? AF4 ? 3 ? AF5 ? 2 ? AF6 ? 3 ? AF7 ? 3 ? AF8 ? 4 ? AF9 ? 4 ? AG1 ? 4 ? AG2 ? 4 ? AG3 ? 3 ? AG4 ? 2 ? AG5 ? 3 ? AG6 ? 4 ? AG7 ? 4 ? AG8 ? 4 ? 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