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Human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? 293T ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 7WZ8 7WZ8 ? 1 ? 1 2 UNP CLC4K_HUMAN Q9UJ71 ? 1 ;TVEKEAPDAHFTVDKQNISLWPREPPPKSGPSLVPGKTPTVRAALICLTLVLVASVLLQAVLYPRFMGTISDVKTNVQLL KGRVDNISTLDSEIKKNSDGMEAAGVQIQMVNESLGYVRSQFLKLKTSVEKANAQIQILTRSWEEVSTLNAQIPELKSDL EKASALNTKIRALQGSLENMSKLLKRQNDILQVVSQGWKYFKGNFYYFSLIPKTWYSAEQFCVSRNSHLTSVTSESEQEF LYKTAGGLIYWIGLTKAGMEGDWSWVDDTPFNKVQSVRFWIPGEPNNAGNNEHCGNIKAPSLQAWNDAPCDKTFLFICKR PYVPSEP ; 2 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7WZ8 C 1 ? 224 ? 7WZ8 -222 ? 1 ? -222 1 2 2 7WZ8 C 225 ? 551 ? Q9UJ71 2 ? 328 ? 2 328 3 1 7WZ8 A 1 ? 224 ? 7WZ8 -222 ? 1 ? -222 1 4 2 7WZ8 A 225 ? 551 ? Q9UJ71 2 ? 328 ? 2 328 5 1 7WZ8 B 1 ? 224 ? 7WZ8 -222 ? 1 ? -222 1 6 2 7WZ8 B 225 ? 551 ? Q9UJ71 2 ? 328 ? 2 328 7 1 7WZ8 F 1 ? 224 ? 7WZ8 -222 ? 1 ? -222 1 8 2 7WZ8 F 225 ? 551 ? Q9UJ71 2 ? 328 ? 2 328 9 1 7WZ8 D 1 ? 224 ? 7WZ8 -222 ? 1 ? -222 1 10 2 7WZ8 D 225 ? 551 ? Q9UJ71 2 ? 328 ? 2 328 11 1 7WZ8 E 1 ? 224 ? 7WZ8 -222 ? 1 ? -222 1 12 2 7WZ8 E 225 ? 551 ? Q9UJ71 2 ? 328 ? 2 328 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 2 7WZ8 ALA C 501 ? 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'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7WZ8 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7WZ8 _struct.title 'Structure of human langerin complex in Birbeck granules' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7WZ8 _struct_keywords.text 'Birbeck granule, C-type lectin, Langerhans cell, virus defense, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLU A 369 ? GLN A 420 ? GLU C 146 GLN C 197 1 ? 52 HELX_P HELX_P2 AA2 TRP A 439 ? ARG A 449 ? TRP C 216 ARG C 226 1 ? 11 HELX_P HELX_P3 AA3 SER A 458 ? GLY A 470 ? SER C 235 GLY C 247 1 ? 13 HELX_P HELX_P4 AA4 ASN A 496 ? ALA A 501 ? ASN C 273 ALA C 278 1 ? 6 HELX_P HELX_P5 AA5 ARG A 502 ? TRP A 504 ? ARG C 279 TRP C 281 5 ? 3 HELX_P HELX_P6 AA6 ASN A 511 ? 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SER F 235 GLY F 247 1 ? 13 HELX_P HELX_P21 AC3 SER D 500 ? TRP D 504 ? SER F 277 TRP F 281 5 ? 5 HELX_P HELX_P22 AC4 ASN D 511 ? ASN D 515 ? ASN F 288 ASN F 292 5 ? 5 HELX_P HELX_P23 AC5 VAL E 370 ? GLN E 420 ? VAL D 147 GLN D 197 1 ? 51 HELX_P HELX_P24 AC6 TRP E 439 ? ARG E 449 ? TRP D 216 ARG D 226 1 ? 11 HELX_P HELX_P25 AC7 SER E 458 ? ALA E 469 ? SER D 235 ALA D 246 1 ? 12 HELX_P HELX_P26 AC8 ASN E 496 ? TRP E 504 ? ASN D 273 TRP D 281 1 ? 9 HELX_P HELX_P27 AC9 ASN E 511 ? ASN E 515 ? ASN D 288 ASN D 292 5 ? 5 HELX_P HELX_P28 AD1 VAL F 370 ? GLN F 420 ? VAL E 147 GLN E 197 1 ? 51 HELX_P HELX_P29 AD2 TRP F 439 ? ARG F 449 ? TRP E 216 ARG E 226 1 ? 11 HELX_P HELX_P30 AD3 SER F 458 ? GLY F 470 ? SER E 235 GLY E 247 1 ? 13 HELX_P HELX_P31 AD4 ASN F 496 ? TRP F 504 ? ASN E 273 TRP E 281 1 ? 9 HELX_P HELX_P32 AD5 ASN F 511 ? ASN F 515 ? ASN E 288 ASN E 292 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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E CYS 518 SG ? ? ? 1_555 E CYS 534 SG ? ? D CYS 295 D CYS 311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf11 disulf ? ? F CYS 446 SG ? ? ? 1_555 F CYS 542 SG ? ? E CYS 223 E CYS 319 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf12 disulf ? ? F CYS 518 SG ? ? ? 1_555 F CYS 534 SG ? ? E CYS 295 E CYS 311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLU 508 A . ? GLU 285 C PRO 509 A ? PRO 286 C 1 -2.50 2 GLU 508 B . ? GLU 285 A PRO 509 B ? PRO 286 A 1 -1.95 3 GLU 508 C . ? GLU 285 B PRO 509 C ? 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AA6 ? 9 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 9 ? anti-parallel AA1 3 9 ? anti-parallel AA1 4 9 ? anti-parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA1 5 7 ? anti-parallel AA1 5 9 ? parallel AA1 7 8 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 9 ? anti-parallel AA2 3 9 ? anti-parallel AA2 4 9 ? anti-parallel AA2 5 6 ? anti-parallel AA2 5 7 ? anti-parallel AA2 5 9 ? parallel AA2 7 8 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 9 ? anti-parallel AA3 3 9 ? anti-parallel AA3 4 9 ? anti-parallel AA3 5 6 ? anti-parallel AA3 5 7 ? anti-parallel AA3 5 9 ? parallel AA3 7 8 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 9 ? anti-parallel AA4 3 9 ? anti-parallel AA4 4 9 ? anti-parallel AA4 5 6 ? anti-parallel AA4 5 7 ? anti-parallel AA4 5 9 ? parallel AA4 7 8 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 9 ? anti-parallel AA5 3 9 ? anti-parallel AA5 4 9 ? anti-parallel AA5 5 6 ? anti-parallel AA5 5 7 ? anti-parallel AA5 5 9 ? parallel AA5 7 8 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 9 ? anti-parallel AA6 3 9 ? anti-parallel AA6 4 9 ? anti-parallel AA6 5 6 ? anti-parallel AA6 5 7 ? anti-parallel AA6 5 9 ? parallel AA6 7 8 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 LYS A 423 ? 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