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O ILE q 454 AR1 1 2 N ALA R 444 ? N ALA q 444 O TYR R 451 ? O TYR q 451 AR2 1 2 N ASN R 486 ? N ASN q 486 O THR R 507 ? O THR q 507 AR3 1 2 N VAL S 152 ? N VAL r 152 O VAL S 275 ? O VAL r 275 AR4 1 2 N ILE S 158 ? N ILE r 158 O VAL S 269 ? O VAL r 269 AR4 2 3 O LYS S 272 ? O LYS r 272 N LYS S 192 ? N LYS r 192 AR4 3 4 N ALA S 196 ? N ALA r 196 O VAL S 212 ? O VAL r 212 AR5 1 2 N ILE S 158 ? N ILE r 158 O VAL S 269 ? O VAL r 269 AR5 2 3 O LYS S 272 ? O LYS r 272 N LYS S 192 ? N LYS r 192 AR5 3 4 N ILE S 193 ? N ILE r 193 O VAL S 219 ? O VAL r 219 AR6 1 2 N TYR S 168 ? N TYR r 168 O THR S 258 ? O THR r 258 AR6 2 3 O LEU S 259 ? O LEU r 259 N VAL S 250 ? N VAL r 250 AR6 3 4 O LYS S 249 ? O LYS r 249 N LEU S 227 ? N LEU r 227 AR7 1 2 N TYR S 168 ? N TYR r 168 O THR S 258 ? O THR r 258 AR7 2 3 O LEU S 259 ? O LEU r 259 N VAL S 250 ? N VAL r 250 AR7 3 4 O THR S 243 ? O THR r 243 N TYR S 233 ? N TYR r 233 AR8 1 2 N PHE S 362 ? N PHE r 362 O LYS S 525 ? O LYS r 525 AR9 1 2 N SER T 89 ? 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S . n EA 2 335 ARG 335 335 ? ? ? S . n EA 2 336 LYS 336 336 ? ? ? S . n EA 2 337 VAL 337 337 ? ? ? S . n EA 2 338 SER 338 338 ? ? ? S . n EA 2 339 PHE 339 339 ? ? ? S . n EA 2 340 GLU 340 340 ? ? ? S . n EA 2 341 LEU 341 341 ? ? ? S . n EA 2 342 LYS 342 342 ? ? ? S . n EA 2 343 ASP 343 343 ? ? ? S . n EA 2 344 GLY 344 344 ? ? ? S . n EA 2 345 SER 345 345 ? ? ? S . n EA 2 346 GLU 346 346 ? ? ? S . n EA 2 347 PHE 347 347 ? ? ? S . n EA 2 348 ALA 348 348 ? ? ? S . n EA 2 349 SER 349 349 ? ? ? S . n EA 2 350 VAL 350 350 ? ? ? S . n EA 2 351 ASP 351 351 ? ? ? S . n EA 2 352 ASN 352 352 ? ? ? S . n EA 2 353 ASN 353 353 ? ? ? S . n EA 2 354 GLY 354 354 ? ? ? S . n EA 2 355 ASN 355 355 ? ? ? S . n EA 2 356 ILE 356 356 ? ? ? S . n EA 2 357 THR 357 357 ? ? ? S . n EA 2 358 GLY 358 358 ? ? ? S . n EA 2 359 ILE 359 359 ? ? ? S . n EA 2 360 SER 360 360 ? ? ? S . n EA 2 361 GLU 361 361 ? ? ? S . n EA 2 362 GLY 362 362 ? ? ? S . n EA 2 363 THR 363 363 ? ? ? S . n EA 2 364 ALA 364 364 ? ? ? 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S . n EA 2 395 GLU 395 395 ? ? ? S . n EA 2 396 VAL 396 396 ? ? ? S . n EA 2 397 ASN 397 397 ? ? ? S . n EA 2 398 ILE 398 398 ? ? ? S . n EA 2 399 ASP 399 399 ? ? ? S . n EA 2 400 ALA 400 400 ? ? ? S . n EA 2 401 GLU 401 401 ? ? ? S . n EA 2 402 SER 402 402 ? ? ? S . n EA 2 403 THR 403 403 ? ? ? S . n EA 2 404 GLN 404 404 ? ? ? S . n EA 2 405 GLN 405 405 ? ? ? S . n EA 2 406 LEU 406 406 ? ? ? S . n EA 2 407 ASP 407 407 ? ? ? S . n EA 2 408 VAL 408 408 ? ? ? S . n EA 2 409 LYS 409 409 ? ? ? S . n EA 2 410 ILE 410 410 ? ? ? S . n EA 2 411 GLN 411 411 ? ? ? S . n EA 2 412 PRO 412 412 ? ? ? S . n EA 2 413 SER 413 413 ? ? ? S . n EA 2 414 THR 414 414 ? ? ? S . n EA 2 415 ASN 415 415 ? ? ? S . n EA 2 416 SER 416 416 ? ? ? S . n EA 2 417 VAL 417 417 ? ? ? S . n EA 2 418 SER 418 418 ? ? ? S . n EA 2 419 TYR 419 419 ? ? ? S . n EA 2 420 SER 420 420 ? ? ? S . n EA 2 421 ILE 421 421 ? ? ? S . n EA 2 422 THR 422 422 ? ? ? S . n EA 2 423 GLU 423 423 ? ? ? S . n EA 2 424 GLY 424 424 ? ? ? 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S . n EA 2 455 LYS 455 455 ? ? ? S . n EA 2 456 ASP 456 456 ? ? ? S . n EA 2 457 VAL 457 457 ? ? ? S . n EA 2 458 SER 458 458 ? ? ? S . n EA 2 459 VAL 459 459 ? ? ? S . n EA 2 460 THR 460 460 ? ? ? S . n EA 2 461 ILE 461 461 ? ? ? S . n EA 2 462 SER 462 462 ? ? ? S . n EA 2 463 THR 463 463 ? ? ? S . n EA 2 464 SER 464 464 ? ? ? S . n EA 2 465 GLN 465 465 ? ? ? S . n EA 2 466 VAL 466 466 ? ? ? S . n EA 2 467 GLU 467 467 ? ? ? S . n EA 2 468 GLU 468 468 ? ? ? S . n EA 2 469 THR 469 469 ? ? ? S . n EA 2 470 PRO 470 470 ? ? ? S . n EA 2 471 GLU 471 471 ? ? ? S . n EA 2 472 GLU 472 472 ? ? ? S . n EA 2 473 THR 473 473 ? ? ? S . n EA 2 474 THR 474 474 ? ? ? S . n EA 2 475 THR 475 475 ? ? ? S . n EA 2 476 GLU 476 476 ? ? ? S . n # _pdbx_contact_author.id 2 _pdbx_contact_author.email naomiyazaki@gmail.com _pdbx_contact_author.name_first Naoyuki _pdbx_contact_author.name_last Miyazaki _pdbx_contact_author.name_mi ? _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0002-4880-7300 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 'complete icosahedral assembly' ? 1860-meric 1860 2 'icosahedral asymmetric unit' ? 31-meric 31 3 'icosahedral pentamer' ? 155-meric 155 4 'icosahedral 23 hexamer' ? 186-meric 186 5 'icosahedral asymmetric unit, std point frame' ? 31-meric 31 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 '(1-60)' A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA 2 1 A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA 3 '(1-5)' A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA 4 '(1,2,6,10,23,24)' A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA 5 P A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] P 'transform to point frame' ? ? 0.30901699 -0.50000000 0.80901699 0.00000 0.80901699 -0.30901699 -0.50000000 0.00000 0.50000000 0.80901699 0.30901699 0.00000 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 2 'point symmetry operation' ? ? 0.80901699 0.30901700 0.50000000 0.00000 0.30901699 0.50000000 -0.80901700 0.00000 -0.50000000 0.80901699 0.30901699 0.00000 3 'point symmetry operation' ? ? 0.50000000 0.80901700 0.30901699 0.00000 0.80901699 -0.30901699 -0.50000000 0.00000 -0.30901699 0.50000000 -0.80901700 0.00000 4 'point symmetry operation' ? ? 0.50000000 0.80901699 -0.30901700 0.00000 0.80901699 -0.30901700 0.50000000 0.00000 0.30901700 -0.50000000 -0.80901699 0.00000 5 'point symmetry operation' ? ? 0.80901700 0.30901699 -0.50000000 0.00000 0.30901699 0.50000000 0.80901699 0.00000 0.50000000 -0.80901699 0.30901700 0.00000 6 'point symmetry operation' ? ? -0.50000000 0.80901699 0.30901699 0.00000 0.80901700 0.30901699 0.49999999 0.00000 0.30901700 0.50000001 -0.80901699 0.00000 7 'point symmetry operation' ? 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