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UNP P08754 GLN 204 'engineered mutation' 204 53 11 7X6I HIS H 120 J UNP P08754 ? ? linker 110 54 11 7X6I HIS H 121 K UNP P08754 ? ? linker 110 55 11 7X6I HIS H 122 L UNP P08754 ? ? linker 110 56 11 7X6I HIS H 123 M UNP P08754 ? ? linker 110 57 11 7X6I HIS H 124 N UNP P08754 ? ? linker 110 58 11 7X6I HIS H 125 O UNP P08754 ? ? linker 110 59 12 7X6I LEU H 210 ? UNP P08754 GLN 204 'engineered mutation' 204 60 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CA non-polymer . 'CALCIUM ION' ? 'Ca 2' 40.078 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 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LEU H 123 ARG H 132 1 ? 10 HELX_P HELX_P212 AX5 ASP H 139 ? ARG H 148 ? ASP H 133 ARG H 142 1 ? 10 HELX_P HELX_P213 AX6 SER H 149 ? TYR H 152 ? SER H 143 TYR H 146 5 ? 4 HELX_P HELX_P214 AX7 SER H 157 ? ASP H 164 ? SER H 151 ASP H 158 1 ? 8 HELX_P HELX_P215 AX8 ASP H 164 ? SER H 169 ? ASP H 158 SER H 163 1 ? 6 HELX_P HELX_P216 AX9 THR H 176 ? ARG H 182 ? THR H 170 ARG H 176 1 ? 7 HELX_P HELX_P217 AY1 LEU H 210 ? PHE H 221 ? LEU H 204 PHE H 215 5 ? 12 HELX_P HELX_P218 AY2 SER H 234 ? TYR H 236 ? SER H 228 TYR H 230 5 ? 3 HELX_P HELX_P219 AY3 ASN H 247 ? ASN H 262 ? ASN H 241 ASN H 256 1 ? 16 HELX_P HELX_P220 AY4 LYS H 263 ? THR H 266 ? LYS H 257 THR H 260 5 ? 4 HELX_P HELX_P221 AY5 LYS H 276 ? LYS H 285 ? LYS H 270 LYS H 279 1 ? 10 HELX_P HELX_P222 AY6 PRO H 288 ? CYS H 292 ? PRO H 282 CYS H 286 5 ? 5 HELX_P HELX_P223 AY7 THR H 301 ? ASP H 315 ? THR H 295 ASP H 309 1 ? 15 HELX_P HELX_P224 AY8 ASP H 334 ? ASN H 353 ? 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D ASP 439 D CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.818 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? metalc ? ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 6 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 6 ? AA7 ? 6 ? 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D ASP 439 ? 1_555 84.2 ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2023-04-26 2 'Structure model' 1 1 2023-05-24 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Database references' 2 2 'Structure model' 'Structure summary' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 2 'Structure model' citation 2 2 'Structure model' citation_author 3 2 'Structure model' struct # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 2 'Structure model' '_citation.country' 2 2 'Structure model' '_citation.journal_abbrev' 3 2 'Structure model' '_citation.journal_id_CSD' 4 2 'Structure model' '_citation.journal_id_ISSN' 5 2 'Structure model' '_citation.journal_volume' 6 2 'Structure model' '_citation.page_first' 7 2 'Structure model' '_citation.page_last' 8 2 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_DOI' 9 2 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_PubMed' 10 2 'Structure model' '_citation.title' 11 2 'Structure model' '_citation.year' 12 2 'Structure model' '_struct.title' # _pdbx_entry_details.entry_id 7X6I _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest Y # _em_3d_fitting.entry_id 7X6I _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_protocol ? _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 7X6I _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.details ;We combined two different maps from the same dataset (D_1300028166_em-additional-volume_P1.map.V2 and D_1300028166_em-additional-volume_P2.map.V2) to generate a composite map (D_1300028166_em-volume_P1.map.V2). The density of the G protein area could not be visualized clearly in the consensus map of this EM dataset. Therefore, we performed focused classification and local refinement to improve the density of the G protein area using symmetry expanded particles with C4 symmetry imposition, which required more number of particles. Finally, the number of particles used to reconstruct additional volume data 2 (D_1300028166_em-additional-volume_P2.map.V2) is 18,935 and the number of particles used to reconstruct additional volume data 1 (D_1300028166_em-additional-volume_P1.map.V2) is 205,343. Furthermore, the resolution stated above is based on map resolution estimates calculated by a validation tool in Phenix, FSC (model) = 0.5. ; _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.num_particles 18935 _em_3d_reconstruction.resolution 3.93 _em_3d_reconstruction.resolution_method OTHER _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 8.0 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # loop_ _em_entity_assembly.id _em_entity_assembly.parent_id _em_entity_assembly.details _em_entity_assembly.name _em_entity_assembly.source _em_entity_assembly.type _em_entity_assembly.entity_id_list _em_entity_assembly.synonym _em_entity_assembly.oligomeric_details 1 0 ? 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