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Armstrong ? ? ? ? 'Lymphocytic choriomeningitis virus (strain Armstrong)' 11624 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli BL21' 511693 ? ? ? ? ? ? BL21 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 'Biological sequence' 1 2210 ? ? ? ? Armstrong ? ? ? ? 'Lymphocytic choriomeningitis virus (strain Armstrong)' 11624 ? ? ? ? ? ? ? ? 'unidentified baculovirus' 10469 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP Z_LYCVA P18541 ? 1 ;MGQGKSREEKGTNSTNRAEILPDTTYLGPLSCKSCWQKFDSLVRCHDHYLCRHCLNLLLSVSDRCPLCKYPLPTRLKIST APSSPPPYEE ; 1 2 UNP A0A218M2D5_LYCVA A0A218M2D5 ? 2 ;MDEIISELRELCLNYIEQDERLSRQKLNFLGQREPRMVLIEGLKLLSRCIEIDSADKSGCTHNHDDKSVETILVESGIVC PGLPLIIPDGYKLIDNSLILLECFVRSTPASFEKKFIEDTNKLACIREDLAVAGVTLVPIVDGRCDYDNSFMPEWANFKF RDLLFKLLEYSNQNEKVFEESEYFRLCESLKTTIDKRSGMDSMKILKDARSTHNDEIMRMCHEGINPNMSCDDVVFGINS LFSRFRRDLESGKLKRNFQKVNPEGLIKEFSELYENLADSDDILTLSREAVESCPLMRFITAETHGHERGSETSTEYERL LSMLNKVKSLKLLNTRRRQLLNLDVLCLSSLIKQSKFKGLKNDKHWVGCCYSSVNDRLVSFHSTKEEFIRLLRNRKKSKV FRKVSFEELFRASISEFIAKIQKCLLVVGLSFEHYGLSEHLEQECHIPFTEFENFMKIGAHPIMYYTKFEDYNFQPSTEQ LKNIQSLRRLSSVCLALTNSMKTSSVARLRQNQIGSVRYQVVECKEVFCQVIKLDSEEYHLLYQKTGESSRCYSIQGPDG HLISFYADPKRFFLPIFSDEVLYNMIDIMISWIRSCPDLKDCLTDIEVALRTLLLLMLTNPTKRNQKQVQSVRYLVMAIV SDFSSTSLMDKLREDLITPAEKVVYKLLRFLIKTIFGTGEKVLLSAKFKFMLNVSYLCHLITKETPDRLTDQIKCFEKFF EPKSQFGFFVNPKEAITPEEECVFYEQMKRFTSKEIDCQHTTPGVNLEAFSLMVSSFNNGTLIFKGEKKLNSLDPMTNSG CATALDLASNKSVVVNKHLNGERLLEYDFNKLLVSAVSQITESFVRKQKYKLSHSDYEYKVSKLVSRLVIGSKGEETGRS EDNLAEICFDGEEETSFFKSLEEKVNTTIARYRRGRRANDKGDGEKLTNTKGLHHLQLILTGKMAHLRKVILSEISFHLV EDFDPSCLTNDDMKFICEAVEGSTELSPLYFTSVIKDQCGLDEMAKNLCRKFFSENDWFSCMKMILLQMNANAYSGKYRH MQRQGLNFKFDWDKLEEDVRISERESNSESLSKALSLTKCMSAALKNLCFYSEESPTSYTSVGPDSGRLKFALSYKEQVG GNRELYIGDLRTKMFTRLIEDYFESFSSFFSGSCLNNDKEFENAILSMTINVREGFLNYSMDHSKWGPMMCPFLFLMFLQ NLKLGDDQYVRSGKDHVSTLLTWHMHKLVEVPFPVVNAMMKSYVKSKLKLLRGSETTVTERIFRQYFEMGIVPSHISSLI DMGQGILHNASDFYGLLSERFINYCIGVIFGERPEAYTSSDDQITLFDRRLSDLVVSDPEEVLVLLEFQSHLSGLLNKFI SPKSVAGRFAAEFKSRFYVWGEEVPLLTKFVSAALHNVKCKEPHQLCETIDTIADQAIANGVPVSLVNSIQRRTLDLLKY ANFPLDPFLLNTNTDVKDWLDGSRGYRIQRLIEELCPNETKVVRKLVRKLHHKLKNGEFNEEFFLDLFNRDKKEAILQLG DLLGLEEDLNQLADVNWLNLNEMFPLRMVLRQKVVYPSVMTFQEERIPSLIKTLQNKLCSKFTRGAQKLLSEAINKSAFQ SCISSGFIGLCKTLGSRCVRNKNRENLYIKKLLEDLTTDDHVTRVCNRDGITLYICDKQSHPEAHRDHICLLRPLLWDYI CISLSNSFELGVWVLAEPTKGKNNSENLTLKHLNPCDYVARKPESSRLLEDKVNLNQVIQSVRRLYPKIFEDQLLPFMSD MSSKNMRWSPRIKFLDLCVLIDINSESLSLISHVVKWKRDEHYTVLFSDLANSHQRSDSSLVDEFVVSTRDVCKNFLKQV YFESFVREFVATTRTLGNFSWFPHKEMMPSEDGAEALGPFQSFVSKVVNKNVERPMFRNDLQFGFGWFSYRMGDVVCNAA MLIRQGLTNPKAFKSLKDLWDYMLNYTKGVLEFSISVDFTHNQNNTDCLRKFSLIFLVRCQLQNPGVAELLSCSHLFKGE IDRRMLDECLHLLRTDSVFKVNDGVFDIRSEEFEDYMEDPLILGDSLELELLGSKRILDGIRSIDFERVGPEWEPVPLTV KMGALFEGRNLVQNIIVKLETKDMKVFLAGLEGYEKISDVLGNLFLHRFRTGEHLLGSEISVILQELCIDRSILLIPLSL LPDWFAFKDCRLCFSKSRSTLMYETVGGRFRLKGRSCDDWLGGSVAEDID ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7X6V B 1 ? 90 ? P18541 1 ? 90 ? 1 90 2 2 7X6V A 1 ? 2210 ? A0A218M2D5 1 ? 2210 ? 1 2210 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MN non-polymer . 'MANGANESE (II) ION' ? 'Mn 2' 54.938 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 'Zn 2' 65.409 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7X6V _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 7X6V _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.009 ? 11177 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.932 ? 15133 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 22.521 ? 1520 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.051 ? 1721 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 ? 1953 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7X6V _struct.title 'lymphocytic choriomeningitis virus polymerase- Matrix Z Protein Complex (LCMV L-Z Complex)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7X6V _struct_keywords.text 'L protein, RING finger protein, METAL BINDING PROTEIN-TRANSFERASE complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'METAL BINDING PROTEIN/TRANSFERASE' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 3 ? E N N 4 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 CYS A 51 ? SER A 60 ? CYS B 51 SER B 60 1 ? 10 HELX_P HELX_P2 AA2 ASP B 2 ? ILE B 16 ? ASP A 2 ILE A 16 1 ? 15 HELX_P HELX_P3 AA3 ASP B 19 ? GLY B 31 ? ASP A 19 GLY A 31 1 ? 13 HELX_P HELX_P4 AA4 GLU B 34 ? GLY B 59 ? GLU A 34 GLY A 59 1 ? 26 HELX_P HELX_P5 AA5 SER B 68 ? SER B 76 ? SER A 68 SER A 76 1 ? 9 HELX_P HELX_P6 AA6 THR B 108 ? ILE B 126 ? 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GLU A 442 ILE A 447 1 ? 6 HELX_P HELX_P21 AC3 LYS B 482 ? SER B 486 ? LYS A 482 SER A 486 5 ? 5 HELX_P HELX_P22 AC4 ARG B 488 ? VAL B 493 ? ARG A 488 VAL A 493 1 ? 6 HELX_P HELX_P23 AC5 VAL B 493 ? THR B 498 ? VAL A 493 THR A 498 1 ? 6 HELX_P HELX_P24 AC6 ASN B 499 ? LYS B 502 ? ASN A 499 LYS A 502 5 ? 4 HELX_P HELX_P25 AC7 ASP B 568 ? PHE B 572 ? ASP A 568 PHE A 572 5 ? 5 HELX_P HELX_P26 AC8 PHE B 573 ? PHE B 577 ? PHE A 573 PHE A 577 5 ? 5 HELX_P HELX_P27 AC9 VAL B 581 ? MET B 589 ? VAL A 581 MET A 589 1 ? 9 HELX_P HELX_P28 AD1 ILE B 590 ? TRP B 592 ? ILE A 590 TRP A 592 5 ? 3 HELX_P HELX_P29 AD2 SER B 595 ? LEU B 599 ? SER A 595 LEU A 599 5 ? 5 HELX_P HELX_P30 AD3 CYS B 602 ? ASN B 620 ? CYS A 602 ASN A 620 1 ? 19 HELX_P HELX_P31 AD4 THR B 622 ? VAL B 640 ? THR A 622 VAL A 640 1 ? 19 HELX_P HELX_P32 AD5 SER B 647 ? LYS B 651 ? SER A 647 LYS A 651 5 ? 5 HELX_P HELX_P33 AD6 PRO B 659 ? PHE B 676 ? PRO A 659 PHE A 676 1 ? 18 HELX_P HELX_P34 AD7 LEU B 683 ? LEU B 697 ? LEU A 683 LEU A 697 1 ? 15 HELX_P HELX_P35 AD8 CYS B 698 ? ILE B 701 ? CYS A 698 ILE A 701 5 ? 4 HELX_P HELX_P36 AD9 ARG B 708 ? GLY B 727 ? ARG A 708 GLY A 727 1 ? 20 HELX_P HELX_P37 AE1 THR B 737 ? THR B 752 ? THR A 737 THR A 752 1 ? 16 HELX_P HELX_P38 AE2 ALA B 769 ? ASN B 779 ? ALA A 769 ASN A 779 1 ? 11 HELX_P HELX_P39 AE3 GLU B 858 ? VAL B 865 ? GLU A 858 VAL A 865 1 ? 8 HELX_P HELX_P40 AE4 SER B 866 ? SER B 872 ? SER A 866 SER A 872 5 ? 7 HELX_P HELX_P41 AE5 ALA B 1084 ? LEU B 1088 ? ALA A 1084 LEU A 1088 5 ? 5 HELX_P HELX_P42 AE6 ASP B 1129 ? SER B 1148 ? ASP A 1129 SER A 1148 1 ? 20 HELX_P HELX_P43 AE7 ASN B 1157 ? ARG B 1173 ? ASN A 1157 ARG A 1173 1 ? 17 HELX_P HELX_P44 AE8 CYS B 1191 ? GLN B 1200 ? CYS A 1191 GLN A 1200 1 ? 10 HELX_P HELX_P45 AE9 GLY B 1213 ? HIS B 1226 ? GLY A 1213 HIS A 1226 1 ? 14 HELX_P HELX_P46 AF1 PRO B 1232 ? LYS B 1249 ? PRO A 1232 LYS A 1249 1 ? 18 HELX_P HELX_P47 AF2 VAL B 1258 ? GLY B 1270 ? VAL A 1258 GLY A 1270 1 ? 13 HELX_P HELX_P48 AF3 ASN B 1289 ? GLY B 1311 ? ASN A 1289 GLY A 1311 1 ? 23 HELX_P HELX_P49 AF4 ARG B 1329 ? ASP B 1338 ? ARG A 1329 ASP A 1338 1 ? 10 HELX_P HELX_P50 AF5 GLU B 1341 ? LEU B 1356 ? GLU A 1341 LEU A 1356 1 ? 16 HELX_P HELX_P51 AF6 LEU B 1386 ? LEU B 1395 ? LEU A 1386 LEU A 1395 1 ? 10 HELX_P HELX_P52 AF7 GLU B 1402 ? ASN B 1420 ? GLU A 1402 ASN A 1420 1 ? 19 HELX_P HELX_P53 AF8 PRO B 1423 ? ALA B 1441 ? PRO A 1423 ALA A 1441 1 ? 19 HELX_P HELX_P54 AF9 SER B 1463 ? CYS B 1476 ? SER A 1463 CYS A 1476 1 ? 14 HELX_P HELX_P55 AG1 ASN B 1478 ? VAL B 1482 ? ASN A 1478 VAL A 1482 5 ? 5 HELX_P HELX_P56 AG2 LYS B 1485 ? LYS B 1493 ? LYS A 1485 LYS A 1493 1 ? 9 HELX_P HELX_P57 AG3 GLU B 1501 ? PHE B 1508 ? GLU A 1501 PHE A 1508 1 ? 8 HELX_P HELX_P58 AG4 GLU B 1514 ? GLY B 1524 ? GLU A 1514 GLY A 1524 1 ? 11 HELX_P HELX_P59 AG5 ASP B 1528 ? ASP B 1534 ? ASP A 1528 ASP A 1534 1 ? 7 HELX_P HELX_P60 AG6 PRO B 1568 ? ASN B 1576 ? 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A ASP 1322 A MN 2301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.972 ? ? metalc11 metalc ? ? B GLU 1372 OE1 ? ? ? 1_555 E MN . MN ? ? A GLU 1372 A MN 2301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.956 ? ? metalc12 metalc ? ? B GLU 1372 OE2 ? ? ? 1_555 E MN . MN ? ? A GLU 1372 A MN 2301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.966 ? ? # _struct_conn_type.id metalc _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 2 ? 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