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GLN L 81 GLU L 85 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 336 SG ? ? ? 1_555 A CYS 361 SG ? ? A CYS 336 A CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 379 SG ? ? ? 1_555 A CYS 432 SG ? ? A CYS 379 A CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf3 disulf ? ? A CYS 391 SG ? ? ? 1_555 A CYS 525 SG ? ? A CYS 391 A CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf4 disulf ? ? A CYS 480 SG ? ? ? 1_555 A CYS 488 SG ? ? A CYS 480 A CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf5 disulf ? ? B CYS 48 SG ? ? ? 1_555 B CYS 122 SG ? ? H CYS 22 H CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf6 disulf ? ? C CYS 48 SG ? ? ? 1_555 C CYS 116 SG ? ? L CYS 22 L CYS 90 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? covale1 covale one ? A ASN 343 ND2 ? ? ? 1_555 D NAG . C1 ? ? A ASN 343 B NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? B ASN 85 ND2 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? H ASN 59 C NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale3 covale both ? D NAG . O4 ? ? ? 1_555 D NAG . C1 ? ? B NAG 1 B NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? ? covale4 covale both ? E NAG . O4 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? C NAG 1 C NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale5 covale both ? E NAG . O6 ? ? ? 1_555 E FUC . C1 ? ? C NAG 1 C FUC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale6 covale both ? E NAG . O4 ? ? ? 1_555 E BMA . C1 ? ? C NAG 2 C BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale7 covale both ? E BMA . O3 ? ? ? 1_555 E MAN . C1 ? ? C BMA 3 C MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale8 covale both ? E BMA . O6 ? ? ? 1_555 E MAN . C1 ? ? C BMA 3 C MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 6 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 5 ? AA8 ? 4 ? 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ILE A 358 ? ARG A 355 ILE A 358 AA1 2 VAL A 395 ? ARG A 403 ? VAL A 395 ARG A 403 AA1 3 PRO A 507 ? SER A 514 ? PRO A 507 SER A 514 AA1 4 GLY A 431 ? ASN A 437 ? GLY A 431 ASN A 437 AA1 5 THR A 376 ? CYS A 379 ? THR A 376 CYS A 379 AA2 1 LEU A 452 ? ARG A 454 ? LEU A 452 ARG A 454 AA2 2 LEU A 492 ? SER A 494 ? LEU A 492 SER A 494 AA3 1 TYR A 473 ? GLN A 474 ? TYR A 473 GLN A 474 AA3 2 CYS A 488 ? TYR A 489 ? CYS A 488 TYR A 489 AA4 1 GLN B 29 ? GLN B 32 ? GLN H 3 GLN H 6 AA4 2 SER B 43 ? SER B 51 ? SER H 17 SER H 25 AA4 3 ALA B 104 ? SER B 110 ? ALA H 78 SER H 84 AA4 4 VAL B 94 ? ASP B 99 ? VAL H 68 ASP H 73 AA5 1 GLU B 36 ? LYS B 38 ? GLU H 10 LYS H 12 AA5 2 THR B 142 ? VAL B 146 ? THR H 116 VAL H 120 AA5 3 ALA B 118 ? ASP B 125 ? ALA H 92 ASP H 99 AA5 4 MET B 60 ? GLN B 65 ? MET H 34 GLN H 39 AA5 5 LEU B 71 ? ILE B 77 ? LEU H 45 ILE H 51 AA5 6 SER B 84 ? TYR B 86 ? SER H 58 TYR H 60 AA6 1 GLU B 36 ? LYS B 38 ? GLU H 10 LYS H 12 AA6 2 THR B 142 ? VAL B 146 ? THR H 116 VAL H 120 AA6 3 ALA B 118 ? ASP B 125 ? ALA H 92 ASP H 99 AA6 4 LEU B 135 ? TRP B 138 ? LEU H 109 TRP H 112 AA7 1 SER C 35 ? SER C 37 ? SER L 9 SER L 11 AA7 2 THR C 131 ? THR C 134 ? THR L 105 THR L 108 AA7 3 ALA C 112 ? TYR C 119 ? ALA L 86 TYR L 93 AA7 4 VAL C 61 ? HIS C 66 ? VAL L 35 HIS L 40 AA7 5 LYS C 73 ? ILE C 76 ? LYS L 47 ILE L 50 AA8 1 SER C 35 ? SER C 37 ? SER L 9 SER L 11 AA8 2 THR C 131 ? THR C 134 ? THR L 105 THR L 108 AA8 3 ALA C 112 ? TYR C 119 ? ALA L 86 TYR L 93 AA8 4 TRP C 125 ? PHE C 127 ? TRP L 99 PHE L 101 AA9 1 VAL C 44 ? THR C 49 ? VAL L 18 THR L 23 AA9 2 THR C 98 ? VAL C 103 ? THR L 72 VAL L 77 AA9 3 PHE C 90 ? SER C 95 ? PHE L 64 SER L 69 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N LYS A 356 ? N LYS A 356 O ALA A 397 ? O ALA A 397 AA1 2 3 N TYR A 396 ? N TYR A 396 O SER A 514 ? O SER A 514 AA1 3 4 O LEU A 513 ? O LEU A 513 N CYS A 432 ? N CYS A 432 AA1 4 5 O VAL A 433 ? O VAL A 433 N LYS A 378 ? N LYS A 378 AA2 1 2 N TYR A 453 ? N TYR A 453 O GLN A 493 ? O GLN A 493 AA3 1 2 N TYR A 473 ? N TYR A 473 O TYR A 489 ? O TYR A 489 AA4 1 2 N VAL B 31 ? N VAL H 5 O LYS B 49 ? O LYS H 23 AA4 2 3 N VAL B 46 ? N VAL H 20 O MET B 107 ? O MET H 81 AA4 3 4 O LYS B 108 ? O LYS H 82 N THR B 95 ? N THR H 69 AA5 1 2 N LYS B 38 ? N LYS H 12 O THR B 145 ? O THR H 119 AA5 2 3 O THR B 142 ? O THR H 116 N TYR B 120 ? N TYR H 94 AA5 3 4 O ALA B 123 ? O ALA H 97 N HIS B 61 ? N HIS H 35 AA5 4 5 N ARG B 64 ? N ARG H 38 O GLU B 72 ? O GLU H 46 AA5 5 6 N TRP B 76 ? N TRP H 50 O ASN B 85 ? O ASN H 59 AA6 1 2 N LYS B 38 ? N LYS H 12 O THR B 145 ? O THR H 119 AA6 2 3 O THR B 142 ? O THR H 116 N TYR B 120 ? N TYR H 94 AA6 3 4 N ARG B 124 ? N ARG H 98 O TYR B 137 ? O TYR H 111 AA7 1 2 N ALA C 36 ? N ALA L 10 O THR C 134 ? O THR L 108 AA7 2 3 O THR C 131 ? O THR L 105 N TYR C 114 ? N TYR L 88 AA7 3 4 O ASN C 117 ? O ASN L 91 N SER C 62 ? N SER L 36 AA7 4 5 N GLN C 65 ? N GLN L 39 O LYS C 73 ? O LYS L 47 AA8 1 2 N ALA C 36 ? N ALA L 10 O THR C 134 ? O THR L 108 AA8 2 3 O THR C 131 ? O THR L 105 N TYR C 114 ? N TYR L 88 AA8 3 4 N SER C 118 ? N SER L 92 O VAL C 126 ? O VAL L 100 AA9 1 2 N CYS C 48 ? N CYS L 22 O ALA C 99 ? O ALA L 73 AA9 2 3 O THR C 102 ? O THR L 76 N SER C 91 ? N SER L 65 # _atom_sites.entry_id 7X8W _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[1] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[2] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[3] ? _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 _atom_sites.solution_primary ? _atom_sites.solution_secondary ? _atom_sites.solution_hydrogens ? _atom_sites.special_details ? # loop_ _atom_type.symbol C H N O S # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 MET 1 1 ? ? ? 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C SER 242 # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.name 1 1 20 mM Tris-HCl 'Tris hydrochloride' 1 2 150 mM NaCl 'Sodium chloride' # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details ? # _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_molwt.id 1 _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag NO _em_entity_assembly_molwt.units MEGADALTONS _em_entity_assembly_molwt.value 0.56 # _em_entity_assembly_naturalsource.id 2 _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.cell ? _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location ? _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id 9606 _em_entity_assembly_naturalsource.organ ? _em_entity_assembly_naturalsource.organelle ? _em_entity_assembly_naturalsource.organism 'Homo sapiens' _em_entity_assembly_naturalsource.strain ? _em_entity_assembly_naturalsource.tissue ? # _em_entity_assembly_recombinant.id 2 _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_recombinant.cell ? _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id 9606 _em_entity_assembly_recombinant.organism 'Homo sapiens' _em_entity_assembly_recombinant.plasmid ? _em_entity_assembly_recombinant.strain ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 50 _em_image_recording.average_exposure_time ? _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode COUNTING _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged ? _em_image_recording.num_real_images ? _em_image_recording.avg_electron_dose_per_subtomogram ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' ? crYOLO ? 1 ? ? 2 'IMAGE ACQUISITION' ? 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