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'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _pdbx_entity_src_syn.entity_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id _pdbx_entity_src_syn.details 6 1 sample 1 38 'Pseudomonas aeruginosa' ? 287 ? 7 1 sample 1 54 'Pseudomonas aeruginosa' ? 287 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 7XG4 7XG4 ? 1 ? 1 2 PDB 7XG4 7XG4 ? 2 ? 1 3 PDB 7XG4 7XG4 ? 3 ? 1 4 PDB 7XG4 7XG4 ? 4 ? 1 5 PDB 7XG4 7XG4 ? 5 ? 1 6 PDB 7XG4 7XG4 ? 6 ? 1 7 PDB 7XG4 7XG4 ? 7 ? 1 8 PDB 7XG4 7XG4 ? 8 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7XG4 A 1 ? 253 ? 7XG4 -9 ? 243 ? -9 243 2 2 7XG4 B 1 ? 220 ? 7XG4 1 ? 220 ? 1 220 3 3 7XG4 C 1 ? 348 ? 7XG4 1 ? 348 ? 1 348 4 3 7XG4 D 1 ? 348 ? 7XG4 1 ? 348 ? 1 348 5 3 7XG4 E 1 ? 348 ? 7XG4 1 ? 348 ? 1 348 6 3 7XG4 F 1 ? 348 ? 7XG4 1 ? 348 ? 1 348 7 3 7XG4 G 1 ? 348 ? 7XG4 1 ? 348 ? 1 348 8 4 7XG4 H 1 ? 268 ? 7XG4 1 ? 268 ? 1 268 9 5 7XG4 I 1 ? 61 ? 7XG4 1 ? 61 ? 1 61 10 6 7XG4 J 1 ? 38 ? 7XG4 1 ? 38 ? 1 38 11 7 7XG4 K 1 ? 54 ? 7XG4 1 ? 54 ? 1 54 12 8 7XG4 L 1 ? 626 ? 7XG4 1 ? 626 ? 1 626 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight 23G 'RNA OH 3 prime terminus' n ;GUANOSINE-5'-PHOSPHATE-2',3'-CYCLIC PHOSPHATE ; ? 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'Pseudomonas aeruginosa' ? ? # loop_ _em_entity_assembly_recombinant.id _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id _em_entity_assembly_recombinant.cell _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_recombinant.organism _em_entity_assembly_recombinant.plasmid _em_entity_assembly_recombinant.strain 2 1 ? 562 'Escherichia coli' ? ? 3 2 ? 562 'Escherichia coli' ? ? # _em_entity_assembly_synthetic.id 1 _em_entity_assembly_synthetic.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_synthetic.cell ? _em_entity_assembly_synthetic.cellular_location ? _em_entity_assembly_synthetic.ncbi_tax_id 287 _em_entity_assembly_synthetic.organ ? _em_entity_assembly_synthetic.organelle ? _em_entity_assembly_synthetic.organism 'Pseudomonas aeruginosa' _em_entity_assembly_synthetic.strain ? _em_entity_assembly_synthetic.tissue ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 50 _em_image_recording.average_exposure_time ? _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode ? _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K3 (6k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged ? _em_image_recording.num_real_images ? _em_image_recording.avg_electron_dose_per_subtomogram ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'CRYSTALLOGRAPHY MERGING' ? ? ? 1 1 1 2 'IMAGE ACQUISITION' ? ? ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? ? ? 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? ? ? ? ? ? 8 'MODEL REFINEMENT' ? ? ? ? ? ? 9 OTHER ? ? ? ? ? ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? ? ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? ? ? 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 7XG4 'double helix' 7XG4 'a-form double helix' 7XG4 'b-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 I U 9 1_555 K DA 43 1_555 1.486 0.967 -0.738 -24.871 -3.549 37.752 1 I_U9:DA43_K I 9 ? 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