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UK ? ? primary 'Commun Biol' ? ? 2399-3642 ? ? 5 ? 1197 1197 'An LH1-RC photocomplex from an extremophilic phototroph provides insight into origins of two photosynthesis proteins.' 2022 ? 10.1038/s42003-022-04174-2 36344631 ? ? ? ? ? ? ? ? ? UK ? ? 1 'Commun Biol' ? ? 2399-3642 ? ? 5 ? ? ? 'An LH1-RC photocomplex from an extremophilic phototroph provides insight into origins of two photosynthesis proteins' 2022 ? 10.1038/s42003-022-04 ? ? ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Tani, K.' 1 0000-0003-4835-154X primary 'Kanno, R.' 2 ? primary 'Kurosawa, K.' 3 ? primary 'Takaichi, S.' 4 0000-0002-1621-9141 primary 'Nagashima, K.V.P.' 5 ? primary 'Hall, M.' 6 ? primary 'Yu, L.J.' 7 0000-0002-4962-1049 primary 'Kimura, Y.' 8 0000-0003-3747-0367 primary 'Madigan, M.T.' 9 ? primary 'Mizoguchi, A.' 10 ? primary 'Humbel, B.M.' 11 ? primary 'Wang-Otomo, Z.Y.' 12 0000-0003-1676-2002 1 'Tani, K.' 13 ? 1 'Kanno, R.' 14 ? 1 'Kurosawa, K.' 15 ? 1 'Takaichi, S.' 16 ? 1 'Nagashima, K.V.P.' 17 ? 1 'Hall, M.' 18 ? 1 'Yu, L.-J.' 19 ? 1 'Kimura, Y.' 20 ? 1 'Madigan, M.T.' 21 ? 1 'Mizoguchi, A.' 22 ? 1 'Humbel, B.M.' 23 ? 1 'Wang-Otomo, Z.-Y.' 24 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? 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GLN n # loop_ _entity_src_nat.entity_id _entity_src_nat.pdbx_src_id _entity_src_nat.pdbx_alt_source_flag _entity_src_nat.pdbx_beg_seq_num _entity_src_nat.pdbx_end_seq_num _entity_src_nat.common_name _entity_src_nat.pdbx_organism_scientific _entity_src_nat.pdbx_ncbi_taxonomy_id _entity_src_nat.genus _entity_src_nat.species _entity_src_nat.strain _entity_src_nat.tissue _entity_src_nat.tissue_fraction _entity_src_nat.pdbx_secretion _entity_src_nat.pdbx_fragment _entity_src_nat.pdbx_variant _entity_src_nat.pdbx_cell_line _entity_src_nat.pdbx_atcc _entity_src_nat.pdbx_cellular_location _entity_src_nat.pdbx_organ _entity_src_nat.pdbx_organelle _entity_src_nat.pdbx_cell _entity_src_nat.pdbx_plasmid_name _entity_src_nat.pdbx_plasmid_details _entity_src_nat.details 1 1 sample 1 344 ? 'Rhodopila globiformis' 1071 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 1 275 ? 'Rhodopila globiformis' 1071 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample 1 326 ? 'Rhodopila globiformis' 1071 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 4 1 sample 1 258 ? 'Rhodopila globiformis' 1071 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 5 1 sample 1 61 ? 'Rhodopila globiformis' 1071 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 6 1 sample 1 73 ? 'Rhodopila globiformis' 1071 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 7 1 sample 1 22 ? 'Rhodopila globiformis' 1071 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A0A2S6NEK5_RHOGL A0A2S6NEK5 ? 1 ;MNTGVQAALAAAAVAAVAVAGVVFGTFERPPIETVQRGARGLAMSELYNPRFLAETRAENVVPASLPRLPDVGLKAGEVY HNVQVLKDVSVGNFTRLMASMTTWVAPQQGCGYCHNTNNMASDAKYTKVVARRMIQMVQHINQDWKVHVMANAPTGVVCY TCHRGNPVPKNIWFNNPGPLQAGGYAEAEIGKNHPAPFANNSSLPLDPFTPFLEHAENIRVQATQALPGTDNSSIKQTYW TYALMASFTQALGVNCTYCHDSRLWESWDMAPPQRVTAWYGIRMVRDLNNNFLDPLKTTFPDYRRGPLGDSPKVWCATCH NGVYKPLFGKSMVTTFPELTKVSQ ; 1 2 UNP A0A2S6NEG7_RHOGL A0A2S6NEG7 ? 2 ;MAMLSFEPKYRTRGGTLIGGDLFDFWVGPLWVGFFGVTAAFFAILGTLLIVWAAALGPTWNIWRINIAPPDISYGLAFAP LREGGLWQLITVCACGAFVSWALRQVEIARKLGMGLHIPFAFSFAILAYFTLVVFRPLLMGAWGYGFPYGILSHLDWVSN TGYQYLHFHYNPAHMIAISFFFTNALALALHGSLILSAANPPKGEVVKGAEQENGYFRDVIGYSIGTLGIHRLGVFLAVS AAFWSAVCIIISGPFWTRGWPEWWSWWLNLPMWSH ; 1 3 UNP A0A2S6NEP5_RHOGL A0A2S6NEP5 ? 3 ;MPEFQNVFTRVQVKGPVHMGVPLPRGSWARTGKPFHLYLLGLIGDAQIGPIYLGFSGVASIIFGFIAIEIIGFNMLASVD WSVPEFFRQFFWLALEPPAPKYGLGLAPLAEGGWWGMAGFFLTASILLWWVRMYRRARALGLGTHTAWAFASAIFLYLSL GFIRPILMGCWCEAPPFGIFPHLDWTAAFSLRYGNLFYNPFHMLSIAFLYGSAVLFAMHGGTVLATTRFGGEREVEQITD RGTAGERAMLFWRWTMGFNATFESIHRWGWWFAVLVTLTGGIGILLTGTVVDNWFLWGVKHGIAAPWPNVFPHVVDPALL ATGVGK ; 1 4 UNP A0A2S6MZS1_RHOGL A0A2S6MZS1 ? 4 ;MEIGAITQQIDAAQLVLYTFWLFFAGLIIYLRMEDKREGYPLVTEIPGKFLEGFPPMPAPKTFILTHNQGTVTVPRAVPR AEIEYKAEPCAAWPGAPHEPVGPNKMLSGAGPSGYALRFDTPEPTFDTGVPRMAPMRVATDHVFDEDGPNPIGYDLVGFD GIVAGKITDAWVDREESLVRYLEAKLTNDKSILVPMPLSRVKDSTGQVLLASLKGEQVLEAPTLANPDQVTLREEDRIAA YFASGHLYATQARQESIL ; 1 5 UNP A0A2S6NEK3_RHOGL A0A2S6NEK3 ? 5 MWRMWLLFDPRRILVALGVFLFVLALLIHFILLSTDRFNWLDGPHRGAVAAQMAPLPAPVK 1 6 UNP A0A2S6NEL9_RHOGL A0A2S6NEL9 ? 6 MTPGGPSITGLTEAEAKEFHGIFITSFIVFTVIAIVAHLLAWQWRPWLPAVTGYGTAMNDAVSFIHATISQLA 1 7 PDB 7XXF 7XXF ? 7 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7XXF C 1 ? 344 ? 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A0A2S6NEL9 1 ? 73 ? 1 73 23 5 7XXF W 1 ? 61 ? A0A2S6NEK3 1 ? 61 ? 1 61 24 6 7XXF X 1 ? 73 ? A0A2S6NEL9 1 ? 73 ? 1 73 25 5 7XXF Y 1 ? 61 ? A0A2S6NEK3 1 ? 61 ? 1 61 26 6 7XXF Z 1 ? 73 ? A0A2S6NEL9 1 ? 73 ? 1 73 27 5 7XXF 1 1 ? 61 ? A0A2S6NEK3 1 ? 61 ? 1 61 28 6 7XXF 2 1 ? 73 ? A0A2S6NEL9 1 ? 73 ? 1 73 29 5 7XXF 3 1 ? 61 ? A0A2S6NEK3 1 ? 61 ? 1 61 30 6 7XXF 4 1 ? 73 ? A0A2S6NEL9 1 ? 73 ? 1 73 31 5 7XXF 5 1 ? 61 ? A0A2S6NEK3 1 ? 61 ? 1 61 32 6 7XXF 6 1 ? 73 ? A0A2S6NEL9 1 ? 73 ? 1 73 33 5 7XXF 7 1 ? 61 ? A0A2S6NEK3 1 ? 61 ? 1 61 34 6 7XXF 8 1 ? 73 ? A0A2S6NEL9 1 ? 73 ? 1 73 35 5 7XXF 9 1 ? 61 ? A0A2S6NEK3 1 ? 61 ? 1 61 36 6 7XXF 0 1 ? 73 ? A0A2S6NEL9 1 ? 73 ? 1 73 37 7 7XXF a 1 ? 22 ? 7XXF 1 ? 22 ? 1 22 38 7 7XXF b 1 ? 22 ? 7XXF 1 ? 22 ? 1 22 39 7 7XXF c 1 ? 22 ? 7XXF 1 ? 22 ? 1 22 40 7 7XXF d 1 ? 22 ? 7XXF 1 ? 22 ? 1 22 41 7 7XXF e 1 ? 22 ? 7XXF 1 ? 22 ? 1 22 42 7 7XXF f 1 ? 22 ? 7XXF 1 ? 22 ? 1 22 43 7 7XXF g 1 ? 22 ? 7XXF 1 ? 22 ? 1 22 44 7 7XXF h 1 ? 22 ? 7XXF 1 ? 22 ? 1 22 45 7 7XXF i 1 ? 22 ? 7XXF 1 ? 22 ? 1 22 46 7 7XXF j 1 ? 22 ? 7XXF 1 ? 22 ? 1 22 47 7 7XXF k 1 ? 22 ? 7XXF 1 ? 22 ? 1 22 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 BCL non-polymer . 'BACTERIOCHLOROPHYLL A' ? 'C55 H74 Mg N4 O6' 911.504 BPH non-polymer . 'BACTERIOPHEOPHYTIN A' ? 'C55 H76 N4 O6' 889.215 CDL non-polymer . CARDIOLIPIN ;DIPHOSPHATIDYL GLYCEROL; BIS-(1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHO)-1',3'-SN-GLYCEROL ; 'C81 H156 O17 P2 -2' 1464.043 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 FE non-polymer . 'FE (III) ION' ? 'Fe 3' 55.845 FME 'L-peptide linking' n N-FORMYLMETHIONINE ? 'C6 H11 N O3 S' 177.221 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HEC non-polymer . 'HEME C' ? 'C34 H34 Fe N4 O4' 618.503 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 HOH non-polymer . WATER ? 'H2 O' 18.015 I7D non-polymer . ;(6~{E},8~{E},10~{E},12~{E},14~{E},16~{E},18~{E},20~{E},22~{E},24~{E},26~{E},28~{E})-2,31-dimethoxy-2,6,10,14,19,23,27,31-octamethyl-dotriaconta-6,8,10,12,14,16,18,20,22,24,26,28-dodecaen-5-one ; R.g.Keto-II 'C42 H60 O3' 612.924 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 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'C9 H11 N O3' 181.189 U10 non-polymer . UBIQUINONE-10 'Coenzyme Q10' 'C59 H90 O4' 863.343 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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LEU IA 7 ? FME 9 1 LEU 9 7 5 ? 7 HELX_P HELX_P108 AL9 ASP IA 9 ? SER IA 34 ? ASP 9 9 SER 9 34 1 ? 26 HELX_P HELX_P109 AM1 THR JA 12 ? ARG JA 45 ? THR 0 12 ARG 0 45 1 ? 34 HELX_P HELX_P110 AM2 ALA KA 2 ? ARG KA 21 ? ALA a 2 ARG a 21 1 ? 20 HELX_P HELX_P111 AM3 ALA LA 2 ? GLN LA 22 ? ALA b 2 GLN b 22 1 ? 21 HELX_P HELX_P112 AM4 ALA MA 2 ? SER MA 20 ? ALA c 2 SER c 20 1 ? 19 HELX_P HELX_P113 AM5 ALA NA 2 ? ARG NA 21 ? ALA d 2 ARG d 21 1 ? 20 HELX_P HELX_P114 AM6 ALA OA 2 ? LEU OA 19 ? ALA e 2 LEU e 19 1 ? 18 HELX_P HELX_P115 AM7 ALA PA 2 ? GLN PA 22 ? ALA f 2 GLN f 22 1 ? 21 HELX_P HELX_P116 AM8 ALA QA 2 ? GLN QA 22 ? ALA g 2 GLN g 22 1 ? 21 HELX_P HELX_P117 AM9 ALA RA 2 ? ARG RA 21 ? ALA h 2 ARG h 21 1 ? 20 HELX_P HELX_P118 AN1 ALA SA 2 ? SER SA 20 ? ALA i 2 SER i 20 1 ? 19 HELX_P HELX_P119 AN2 ALA TA 2 ? ARG TA 21 ? ALA j 2 ARG j 21 1 ? 20 HELX_P HELX_P120 AN3 ALA UA 2 ? SER UA 20 ? ALA k 2 SER k 20 1 ? 19 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? C CYS 170 SG ? ? ? 1_555 C CYS 172 SG ? ? M CYS 170 M CYS 172 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? covale1 covale none ? A CYS 111 SG ? ? ? 1_555 VA HEC . CAB ? ? C CYS 111 C HEC 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.969 ? ? covale2 covale none ? A CYS 159 SG ? ? ? 1_555 WA HEC . CAB ? ? C CYS 159 C HEC 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.940 ? ? covale3 covale none ? A CYS 256 SG ? ? ? 1_555 XA HEC . CAB ? ? C CYS 256 C HEC 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.911 ? ? covale4 covale none ? A CYS 316 SG ? ? ? 1_555 YA HEC . CAB ? ? C CYS 316 C HEC 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.976 ? ? covale5 covale both ? E FME 1 C ? ? ? 1_555 E TRP 2 N ? ? A FME 1 A TRP 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? ? covale6 covale both ? G FME 1 C ? ? ? 1_555 G TRP 2 N ? ? D FME 1 D TRP 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale7 covale both ? I FME 1 C ? ? ? 1_555 I TRP 2 N ? ? F FME 1 F TRP 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale8 covale both ? K FME 1 C ? ? ? 1_555 K TRP 2 N ? ? I FME 1 I TRP 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale9 covale both ? M FME 1 C ? ? ? 1_555 M TRP 2 N ? ? K FME 1 K TRP 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale10 covale both ? O FME 1 C ? ? ? 1_555 O TRP 2 N ? ? O FME 1 O TRP 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale11 covale both ? Q FME 1 C ? ? ? 1_555 Q TRP 2 N ? ? Q FME 1 Q TRP 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale12 covale both ? S FME 1 C ? ? ? 1_555 S TRP 2 N ? ? S FME 1 S TRP 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale13 covale both ? U FME 1 C ? ? ? 1_555 U TRP 2 N ? ? U FME 1 U TRP 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale14 covale both ? W FME 1 C ? ? ? 1_555 W TRP 2 N ? ? W FME 1 W TRP 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale15 covale both ? Y FME 1 C ? ? ? 1_555 Y TRP 2 N ? ? Y FME 1 Y TRP 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale16 covale both ? AA FME 1 C ? ? ? 1_555 AA TRP 2 N ? ? 1 FME 1 1 TRP 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? ? covale17 covale both ? CA FME 1 C ? ? ? 1_555 CA TRP 2 N ? ? 3 FME 1 3 TRP 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale18 covale both ? EA FME 1 C ? ? ? 1_555 EA TRP 2 N ? ? 5 FME 1 5 TRP 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale19 covale both ? GA FME 1 C ? ? ? 1_555 GA TRP 2 N ? ? 7 FME 1 7 TRP 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale20 covale both ? IA FME 1 C ? ? ? 1_555 IA TRP 2 N ? ? 9 FME 1 9 TRP 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale21 covale both ? KA FME 1 C ? ? ? 1_555 KA ALA 2 N ? ? a FME 1 a ALA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale22 covale both ? LA FME 1 C ? ? ? 1_555 LA ALA 2 N ? ? b FME 1 b ALA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale23 covale both ? MA FME 1 C ? ? ? 1_555 MA ALA 2 N ? ? c FME 1 c ALA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? covale24 covale both ? NA FME 1 C ? ? ? 1_555 NA ALA 2 N ? ? d FME 1 d ALA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale25 covale both ? OA FME 1 C ? ? ? 1_555 OA ALA 2 N ? ? e FME 1 e ALA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? covale26 covale both ? PA FME 1 C ? ? ? 1_555 PA ALA 2 N ? ? f FME 1 f ALA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale27 covale both ? QA FME 1 C ? ? ? 1_555 QA ALA 2 N ? ? g FME 1 g ALA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale28 covale both ? RA FME 1 C ? ? ? 1_555 RA ALA 2 N ? ? h FME 1 h ALA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? covale29 covale both ? SA FME 1 C ? ? ? 1_555 SA ALA 2 N ? ? i FME 1 i ALA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale30 covale both ? TA FME 1 C ? ? ? 1_555 TA ALA 2 N ? ? j FME 1 j ALA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale31 covale both ? UA FME 1 C ? ? ? 1_555 UA ALA 2 N ? ? k FME 1 k ALA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? metalc1 metalc ? ? A MET 98 SD ? ? ? 1_555 VA HEC . FE ? ? C MET 98 C HEC 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.113 ? ? metalc2 metalc ? ? A HIS 115 NE2 ? ? ? 1_555 VA HEC . FE ? ? C HIS 115 C HEC 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.970 ? ? metalc3 metalc ? ? A MET 134 SD ? ? ? 1_555 WA HEC . FE ? ? C MET 134 C HEC 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? ? metalc4 metalc ? ? A HIS 148 NE2 ? ? ? 1_555 YA HEC . FE ? ? C HIS 148 C HEC 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.014 ? ? metalc5 metalc ? ? A HIS 163 NE2 ? ? ? 1_555 WA HEC . FE ? ? C HIS 163 C HEC 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? metalc6 metalc ? ? A MET 245 SD ? ? ? 1_555 XA HEC . FE ? ? C MET 245 C HEC 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.143 ? ? metalc7 metalc ? ? A HIS 260 NE2 ? ? ? 1_555 XA HEC . FE ? ? C HIS 260 C HEC 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.006 ? ? metalc8 metalc ? ? A HIS 320 NE2 ? ? ? 1_555 YA HEC . FE ? ? C HIS 320 C HEC 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.987 ? ? metalc9 metalc ? ? B HIS 191 NE2 ? ? ? 1_555 PB FE . FE ? ? L HIS 191 M FE 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? ? metalc10 metalc ? ? B HIS 231 NE2 ? ? ? 1_555 PB FE . FE ? ? L HIS 231 M FE 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.248 ? ? metalc11 metalc ? ? C HIS 219 NE2 ? ? ? 1_555 PB FE . FE ? ? M HIS 219 M FE 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.194 ? ? metalc12 metalc ? ? C GLU 234 OE1 ? ? ? 1_555 PB FE . FE ? ? M GLU 234 M FE 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.078 ? ? metalc13 metalc ? ? C GLU 234 OE2 ? ? ? 1_555 PB FE . FE ? ? M GLU 234 M FE 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? metalc14 metalc ? ? C HIS 266 NE2 ? ? ? 1_555 PB FE . FE ? ? M HIS 266 M FE 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.205 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? metalc ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PRO 30 A . ? PRO 30 C PRO 31 A ? PRO 31 C 1 3.05 2 GLY 49 C . ? GLY 49 M PRO 50 C ? 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ASP D 173 ? VAL H 163 ASP H 173 AB1 3 ASP D 155 ? VAL D 157 ? ASP H 155 VAL H 157 AB1 4 GLN D 207 ? LEU D 209 ? GLN H 207 LEU H 209 AB1 5 ARG D 200 ? LYS D 202 ? 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VD 16 I7D 1 101 110 I7D RKX 3 . WD 10 BCL 1 102 101 BCL BCL 3 . XD 13 LMT 1 103 200 LMT LMT 3 . YD 16 I7D 1 101 110 I7D RKX 4 . ZD 10 BCL 1 102 101 BCL BCL 4 . AE 9 PGV 1 101 307 PGV PGV 5 . BE 10 BCL 1 102 101 BCL BCL 5 . CE 9 PGV 1 103 201 PGV PGV 5 . DE 9 PGV 1 104 201 PGV PGV 5 . EE 17 CDL 1 101 200 CDL CDL 6 . FE 16 I7D 1 102 110 I7D RKX 6 . GE 10 BCL 1 103 101 BCL BCL 6 . HE 17 CDL 1 104 200 CDL CDL 6 . IE 12 U10 1 401 401 U10 U10 7 . JE 10 BCL 1 402 101 BCL BCL 7 . KE 16 I7D 1 101 102 I7D RKX 8 . LE 10 BCL 1 102 101 BCL BCL 8 . ME 10 BCL 1 101 101 BCL BCL 9 . NE 17 CDL 1 101 200 CDL CDL 0 . OE 10 BCL 1 102 101 BCL BCL 0 . PE 19 HOH 1 501 698 HOH HOH C . PE 19 HOH 2 502 1565 HOH HOH C . PE 19 HOH 3 503 1584 HOH HOH C . PE 19 HOH 4 504 426 HOH HOH C . PE 19 HOH 5 505 1595 HOH HOH C . PE 19 HOH 6 506 999 HOH HOH C . PE 19 HOH 7 507 468 HOH HOH C . PE 19 HOH 8 508 59 HOH HOH C . PE 19 HOH 9 509 1592 HOH HOH C . PE 19 HOH 10 510 526 HOH HOH C . PE 19 HOH 11 511 1265 HOH HOH C . PE 19 HOH 12 512 627 HOH HOH C . PE 19 HOH 13 513 389 HOH HOH C . PE 19 HOH 14 514 1603 HOH HOH C . PE 19 HOH 15 515 623 HOH HOH C . PE 19 HOH 16 516 216 HOH HOH C . PE 19 HOH 17 517 1551 HOH HOH C . PE 19 HOH 18 518 498 HOH HOH C . PE 19 HOH 19 519 43 HOH HOH C . PE 19 HOH 20 520 94 HOH HOH C . PE 19 HOH 21 521 306 HOH HOH C . PE 19 HOH 22 522 1614 HOH HOH C . PE 19 HOH 23 523 64 HOH HOH C . PE 19 HOH 24 524 188 HOH HOH C . PE 19 HOH 25 525 237 HOH HOH C . PE 19 HOH 26 526 386 HOH HOH C . PE 19 HOH 27 527 414 HOH HOH C . PE 19 HOH 28 528 137 HOH HOH C . PE 19 HOH 29 529 934 HOH HOH C . PE 19 HOH 30 530 168 HOH HOH C . PE 19 HOH 31 531 532 HOH HOH C . PE 19 HOH 32 532 1601 HOH HOH C . PE 19 HOH 33 533 407 HOH HOH C . PE 19 HOH 34 534 93 HOH HOH C . PE 19 HOH 35 535 283 HOH HOH C . PE 19 HOH 36 536 916 HOH HOH C . PE 19 HOH 37 537 369 HOH HOH C . PE 19 HOH 38 538 633 HOH HOH C . PE 19 HOH 39 539 656 HOH HOH C . PE 19 HOH 40 540 56 HOH HOH C . PE 19 HOH 41 541 482 HOH HOH C . PE 19 HOH 42 542 377 HOH HOH C . PE 19 HOH 43 543 324 HOH HOH C . PE 19 HOH 44 544 384 HOH HOH C . PE 19 HOH 45 545 419 HOH HOH C . PE 19 HOH 46 546 66 HOH HOH C . PE 19 HOH 47 547 1569 HOH HOH C . PE 19 HOH 48 548 128 HOH HOH C . PE 19 HOH 49 549 240 HOH HOH C . PE 19 HOH 50 550 149 HOH HOH C . PE 19 HOH 51 551 400 HOH HOH C . PE 19 HOH 52 552 622 HOH HOH C . PE 19 HOH 53 553 225 HOH HOH C . PE 19 HOH 54 554 70 HOH HOH C . PE 19 HOH 55 555 182 HOH HOH C . PE 19 HOH 56 556 1564 HOH HOH C . PE 19 HOH 57 557 262 HOH HOH C . PE 19 HOH 58 558 30 HOH HOH C . PE 19 HOH 59 559 1609 HOH HOH C . PE 19 HOH 60 560 57 HOH HOH C . PE 19 HOH 61 561 10 HOH HOH C . PE 19 HOH 62 562 1 HOH HOH C . PE 19 HOH 63 563 77 HOH HOH C . PE 19 HOH 64 564 147 HOH HOH C . PE 19 HOH 65 565 199 HOH HOH C . PE 19 HOH 66 566 38 HOH HOH C . PE 19 HOH 67 567 141 HOH HOH C . PE 19 HOH 68 568 211 HOH HOH C . PE 19 HOH 69 569 220 HOH HOH C . PE 19 HOH 70 570 1550 HOH HOH C . PE 19 HOH 71 571 1570 HOH HOH C . PE 19 HOH 72 572 119 HOH HOH C . PE 19 HOH 73 573 1600 HOH HOH C . PE 19 HOH 74 574 1166 HOH HOH C . PE 19 HOH 75 575 53 HOH HOH C . PE 19 HOH 76 576 164 HOH HOH C . PE 19 HOH 77 577 1572 HOH HOH C . PE 19 HOH 78 578 1599 HOH HOH C . PE 19 HOH 79 579 13 HOH HOH C . PE 19 HOH 80 580 44 HOH HOH C . PE 19 HOH 81 581 518 HOH HOH C . PE 19 HOH 82 582 219 HOH HOH C . PE 19 HOH 83 583 1567 HOH HOH C . PE 19 HOH 84 584 151 HOH HOH C . PE 19 HOH 85 585 2 HOH HOH C . PE 19 HOH 86 586 440 HOH HOH C . PE 19 HOH 87 587 428 HOH HOH C . PE 19 HOH 88 588 1556 HOH HOH C . PE 19 HOH 89 589 268 HOH HOH C . PE 19 HOH 90 590 114 HOH HOH C . PE 19 HOH 91 591 799 HOH HOH C . PE 19 HOH 92 592 31 HOH HOH C . PE 19 HOH 93 593 196 HOH HOH C . PE 19 HOH 94 594 854 HOH HOH C . PE 19 HOH 95 595 1611 HOH HOH C . PE 19 HOH 96 596 299 HOH HOH C . PE 19 HOH 97 597 145 HOH HOH C . PE 19 HOH 98 598 709 HOH HOH C . PE 19 HOH 99 599 134 HOH HOH C . PE 19 HOH 100 600 242 HOH HOH C . PE 19 HOH 101 601 1594 HOH HOH C . PE 19 HOH 102 602 1148 HOH HOH C . PE 19 HOH 103 603 322 HOH HOH C . PE 19 HOH 104 604 25 HOH HOH C . PE 19 HOH 105 605 1571 HOH HOH C . PE 19 HOH 106 606 51 HOH HOH C . PE 19 HOH 107 607 275 HOH HOH C . PE 19 HOH 108 608 279 HOH HOH C . PE 19 HOH 109 609 730 HOH HOH C . PE 19 HOH 110 610 1032 HOH HOH C . PE 19 HOH 111 611 675 HOH HOH C . PE 19 HOH 112 612 664 HOH HOH C . PE 19 HOH 113 613 971 HOH HOH C . PE 19 HOH 114 614 130 HOH HOH C . PE 19 HOH 115 615 425 HOH HOH C . PE 19 HOH 116 616 412 HOH HOH C . PE 19 HOH 117 617 399 HOH HOH C . PE 19 HOH 118 618 689 HOH HOH C . PE 19 HOH 119 619 232 HOH HOH C . PE 19 HOH 120 620 264 HOH HOH C . PE 19 HOH 121 621 135 HOH HOH C . PE 19 HOH 122 622 1552 HOH HOH C . PE 19 HOH 123 623 276 HOH HOH C . PE 19 HOH 124 624 192 HOH HOH C . PE 19 HOH 125 625 265 HOH HOH C . PE 19 HOH 126 626 1602 HOH HOH C . PE 19 HOH 127 627 1370 HOH HOH C . PE 19 HOH 128 628 1345 HOH HOH C . PE 19 HOH 129 629 1566 HOH HOH C . PE 19 HOH 130 630 512 HOH HOH C . PE 19 HOH 131 631 1379 HOH HOH C . PE 19 HOH 132 632 649 HOH HOH C . PE 19 HOH 133 633 1573 HOH HOH C . PE 19 HOH 134 634 1604 HOH HOH C . PE 19 HOH 135 635 409 HOH HOH C . PE 19 HOH 136 636 547 HOH HOH C . QE 19 HOH 1 401 1605 HOH HOH L . QE 19 HOH 2 402 328 HOH HOH L . QE 19 HOH 3 403 1562 HOH HOH L . QE 19 HOH 4 404 65 HOH HOH L . QE 19 HOH 5 405 200 HOH HOH L . QE 19 HOH 6 406 1560 HOH HOH L . QE 19 HOH 7 407 161 HOH HOH L . QE 19 HOH 8 408 160 HOH HOH L . QE 19 HOH 9 409 1568 HOH HOH L . QE 19 HOH 10 410 1613 HOH HOH L . QE 19 HOH 11 411 101 HOH HOH L . QE 19 HOH 12 412 1585 HOH HOH L . QE 19 HOH 13 413 344 HOH HOH L . QE 19 HOH 14 414 1607 HOH HOH L . QE 19 HOH 15 415 475 HOH HOH L . QE 19 HOH 16 416 96 HOH HOH L . QE 19 HOH 17 417 125 HOH HOH L . QE 19 HOH 18 418 52 HOH HOH L . QE 19 HOH 19 419 156 HOH HOH L . QE 19 HOH 20 420 133 HOH HOH L . QE 19 HOH 21 421 241 HOH HOH L . QE 19 HOH 22 422 175 HOH HOH L . QE 19 HOH 23 423 338 HOH HOH L . QE 19 HOH 24 424 181 HOH HOH L . QE 19 HOH 25 425 173 HOH HOH L . QE 19 HOH 26 426 515 HOH HOH L . QE 19 HOH 27 427 318 HOH HOH L . QE 19 HOH 28 428 97 HOH HOH L . QE 19 HOH 29 429 74 HOH HOH L . QE 19 HOH 30 430 514 HOH HOH L . QE 19 HOH 31 431 209 HOH HOH L . QE 19 HOH 32 432 19 HOH HOH L . QE 19 HOH 33 433 669 HOH HOH L . QE 19 HOH 34 434 378 HOH HOH L . QE 19 HOH 35 435 6 HOH HOH L . QE 19 HOH 36 436 346 HOH HOH L . QE 19 HOH 37 437 88 HOH HOH L . QE 19 HOH 38 438 8 HOH HOH L . QE 19 HOH 39 439 1596 HOH HOH L . QE 19 HOH 40 440 165 HOH HOH L . QE 19 HOH 41 441 121 HOH HOH L . QE 19 HOH 42 442 177 HOH HOH L . QE 19 HOH 43 443 1597 HOH HOH L . QE 19 HOH 44 444 1606 HOH HOH L . QE 19 HOH 45 445 7 HOH HOH L . QE 19 HOH 46 446 969 HOH HOH L . QE 19 HOH 47 447 226 HOH HOH L . QE 19 HOH 48 448 214 HOH HOH L . QE 19 HOH 49 449 9 HOH HOH L . QE 19 HOH 50 450 1561 HOH HOH L . QE 19 HOH 51 451 210 HOH HOH L . QE 19 HOH 52 452 81 HOH HOH L . QE 19 HOH 53 453 118 HOH HOH L . QE 19 HOH 54 454 562 HOH HOH L . 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MET 'modified residue' 5 M FME 1 K FME 1 ? MET 'modified residue' 6 O FME 1 O FME 1 ? MET 'modified residue' 7 Q FME 1 Q FME 1 ? MET 'modified residue' 8 S FME 1 S FME 1 ? MET 'modified residue' 9 U FME 1 U FME 1 ? MET 'modified residue' 10 W FME 1 W FME 1 ? MET 'modified residue' 11 Y FME 1 Y FME 1 ? MET 'modified residue' 12 AA FME 1 1 FME 1 ? MET 'modified residue' 13 CA FME 1 3 FME 1 ? MET 'modified residue' 14 EA FME 1 5 FME 1 ? MET 'modified residue' 15 GA FME 1 7 FME 1 ? MET 'modified residue' 16 IA FME 1 9 FME 1 ? 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RELION 3.1 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 5.0 _em_specimen.details 'This sample was monodisperse.' _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'Japan Agency for Medical Research and Development (AMED)' Japan JP21am0101118 1 'Japan Agency for Medical Research and Development (AMED)' Japan JP21am0101116 2 'Japan Society for the Promotion of Science (JSPS)' Japan JP16H04174 3 'Japan Society for the Promotion of Science (JSPS)' Japan JP18H05153 4 'Japan Society for the Promotion of Science (JSPS)' Japan 20H05086 5 'Japan Society for the Promotion of Science (JSPS)' Japan 20H02856 6 # loop_ _pdbx_entity_instance_feature.ordinal _pdbx_entity_instance_feature.comp_id _pdbx_entity_instance_feature.asym_id _pdbx_entity_instance_feature.seq_num _pdbx_entity_instance_feature.auth_comp_id _pdbx_entity_instance_feature.auth_asym_id _pdbx_entity_instance_feature.auth_seq_num _pdbx_entity_instance_feature.feature_type _pdbx_entity_instance_feature.details 1 I7D ? ? 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