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Three rounds of reference-free 2d classification were carried to remove bad particles followed by NU-refinement. ; _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 973755 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' ? cryoSPARC 3.0 1 ? ? 2 'IMAGE ACQUISITION' ? EPU ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? ? ? 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? Coot 0.9.5 ? 1 ? 8 'MODEL FITTING' ? 'UCSF Chimera' 1.15 ? 1 ? 9 OTHER ? ? ? ? ? ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? cryoSPARC 3.0 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? cryoSPARC 3.0 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? ? ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? cryoSPARC 3.0 1 ? ? 14 'MODEL REFINEMENT' ? PHENIX 1.19 ? 1 ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 0.1 _em_specimen.details 'The protein sample was made on a holey carbon grid with an additional layer of thin carbon.' _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'Science and Engineering Research Board (SERB)' India RJN-094/2017 1 'Department of Biotechnology (DBT, India)' India DBT/PR12422/MED/31/287/2014 2 # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'light scattering' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ;Size-exclusion chromatography with Multi Angle Light Scattering is used to validate octameric nature of MsDisA. TEM analysis also supports the octameric assembly. ; #