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_exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7Y1C _struct.title 'CryoEM structure of Klebsiella phage Kp9 tail complex applied with C6 symmetry' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7Y1C _struct_keywords.text 'Complex, Podophage, short non-contractile tail, VIRUS' _struct_keywords.pdbx_keywords VIRUS # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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H N N 4 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 7Y1C 7Y1C ? 1 ? 1 2 PDB 7Y1C 7Y1C ? 2 ? 1 3 PDB 7Y1C 7Y1C ? 3 ? 1 4 PDB 7Y1C 7Y1C ? 4 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7Y1C A 1 ? 535 ? 7Y1C 1 ? 535 ? 1 535 2 1 7Y1C L 1 ? 535 ? 7Y1C 1 ? 535 ? 1 535 3 2 7Y1C W 1 ? 192 ? 7Y1C 1 ? 192 ? 1 192 4 2 7Y1C X 1 ? 192 ? 7Y1C 1 ? 192 ? 1 192 5 3 7Y1C Y 1 ? 791 ? 7Y1C 1 ? 791 ? 1 791 6 4 7Y1C e 1 ? 777 ? 7Y1C 1 ? 777 ? 1 777 7 4 7Y1C f 1 ? 777 ? 7Y1C 1 ? 777 ? 1 777 8 4 7Y1C g 1 ? 777 ? 7Y1C 1 ? 777 ? 1 777 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLU A 7 ? 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LEU A 395 THR A 410 1 ? 16 HELX_P HELX_P16 AB7 GLY A 435 ? ALA A 453 ? GLY A 435 ALA A 453 1 ? 19 HELX_P HELX_P17 AB8 ASN A 461 ? GLY A 474 ? ASN A 461 GLY A 474 1 ? 14 HELX_P HELX_P18 AB9 THR A 483 ? ALA A 517 ? THR A 483 ALA A 517 1 ? 35 HELX_P HELX_P19 AC1 SER A 518 ? GLY A 530 ? SER A 518 GLY A 530 1 ? 13 HELX_P HELX_P20 AC2 GLY B 13 ? THR B 39 ? GLY L 13 THR L 39 1 ? 27 HELX_P HELX_P21 AC3 SER B 61 ? PHE B 79 ? SER L 61 PHE L 79 1 ? 19 HELX_P HELX_P22 AC4 SER B 90 ? LEU B 98 ? SER L 90 LEU L 98 1 ? 9 HELX_P HELX_P23 AC5 ALA B 101 ? ASN B 125 ? ALA L 101 ASN L 125 1 ? 25 HELX_P HELX_P24 AC6 SER B 126 ? ALA B 141 ? SER L 126 ALA L 141 1 ? 16 HELX_P HELX_P25 AC7 ARG B 161 ? ASN B 163 ? ARG L 161 ASN L 163 5 ? 3 HELX_P HELX_P26 AC8 PRO B 190 ? GLY B 202 ? PRO L 190 GLY L 202 1 ? 13 HELX_P HELX_P27 AC9 TYR B 267 ? GLU B 270 ? TYR L 267 GLU L 270 5 ? 4 HELX_P HELX_P28 AD1 TYR B 271 ? LYS B 294 ? TYR L 271 LYS L 294 1 ? 24 HELX_P HELX_P29 AD2 GLN B 306 ? ALA B 312 ? GLN L 306 ALA L 312 1 ? 7 HELX_P HELX_P30 AD3 LYS B 333 ? PHE B 355 ? LYS L 333 PHE L 355 1 ? 23 HELX_P HELX_P31 AD4 ALA B 377 ? TYR B 388 ? ALA L 377 TYR L 388 1 ? 12 HELX_P HELX_P32 AD5 TYR B 388 ? LEU B 395 ? TYR L 388 LEU L 395 1 ? 8 HELX_P HELX_P33 AD6 LEU B 395 ? THR B 410 ? LEU L 395 THR L 410 1 ? 16 HELX_P HELX_P34 AD7 GLY B 435 ? ALA B 453 ? GLY L 435 ALA L 453 1 ? 19 HELX_P HELX_P35 AD8 ASN B 461 ? GLY B 474 ? ASN L 461 GLY L 474 1 ? 14 HELX_P HELX_P36 AD9 THR B 483 ? ALA B 517 ? THR L 483 ALA L 517 1 ? 35 HELX_P HELX_P37 AE1 SER B 518 ? VAL B 529 ? SER L 518 VAL L 529 1 ? 12 HELX_P HELX_P38 AE2 ASP C 5 ? ALA C 23 ? ASP W 5 ALA W 23 1 ? 19 HELX_P HELX_P39 AE3 ASP C 39 ? SER C 56 ? ASP W 39 SER W 56 1 ? 18 HELX_P HELX_P40 AE4 ASP C 122 ? MET C 126 ? ASP W 122 MET W 126 5 ? 5 HELX_P HELX_P41 AE5 PRO C 127 ? PHE C 147 ? PRO W 127 PHE W 147 1 ? 21 HELX_P HELX_P42 AE6 GLU C 150 ? GLN C 176 ? GLU W 150 GLN W 176 1 ? 27 HELX_P HELX_P43 AE7 TYR C 185 ? GLY C 191 ? TYR W 185 GLY W 191 1 ? 7 HELX_P HELX_P44 AE8 ASN D 2 ? ALA D 6 ? ASN X 2 ALA X 6 5 ? 5 HELX_P HELX_P45 AE9 ALA D 11 ? ALA D 23 ? ALA X 11 ALA X 23 1 ? 13 HELX_P HELX_P46 AF1 SER D 37 ? SER D 56 ? SER X 37 SER X 56 1 ? 20 HELX_P HELX_P47 AF2 ASP D 122 ? MET D 126 ? ASP X 122 MET X 126 5 ? 5 HELX_P HELX_P48 AF3 PRO D 127 ? PHE D 146 ? PRO X 127 PHE X 146 1 ? 20 HELX_P HELX_P49 AF4 GLU D 150 ? GLN D 176 ? GLU X 150 GLN X 176 1 ? 27 HELX_P HELX_P50 AF5 TYR D 185 ? GLY D 191 ? TYR X 185 GLY X 191 1 ? 7 HELX_P HELX_P51 AF6 ASN E 109 ? ASN E 113 ? ASN Y 109 ASN Y 113 1 ? 5 HELX_P HELX_P52 AF7 GLU E 184 ? ASP E 190 ? GLU Y 184 ASP Y 190 1 ? 7 HELX_P HELX_P53 AF8 ASP E 190 ? HIS E 206 ? ASP Y 190 HIS Y 206 1 ? 17 HELX_P HELX_P54 AF9 SER E 251 ? LEU E 255 ? SER Y 251 LEU Y 255 5 ? 5 HELX_P HELX_P55 AG1 VAL E 616 ? GLY E 621 ? VAL Y 616 GLY Y 621 1 ? 6 HELX_P HELX_P56 AG2 ASN E 646 ? THR E 651 ? ASN Y 646 THR Y 651 1 ? 6 HELX_P HELX_P57 AG3 SER F 26 ? LYS F 28 ? SER e 26 LYS e 28 5 ? 3 HELX_P HELX_P58 AG4 ARG F 91 ? ALA F 116 ? ARG e 91 ALA e 116 1 ? 26 HELX_P HELX_P59 AG5 ASN F 146 ? LEU F 154 ? ASN e 146 LEU e 154 1 ? 9 HELX_P HELX_P60 AG6 SER G 26 ? LYS G 28 ? SER f 26 LYS f 28 5 ? 3 HELX_P HELX_P61 AG7 ARG G 91 ? ALA G 116 ? ARG f 91 ALA f 116 1 ? 26 HELX_P HELX_P62 AG8 ASN G 146 ? GLU G 156 ? ASN f 146 GLU f 156 1 ? 11 HELX_P HELX_P63 AG9 ARG H 91 ? ALA H 116 ? ARG g 91 ALA g 116 1 ? 26 HELX_P HELX_P64 AH1 ASN H 146 ? GLY H 159 ? ASN g 146 GLY g 159 1 ? 14 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 5 ? AA4 ? 3 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 3 ? AA7 ? 5 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 3 ? AB1 ? 3 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 4 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 5 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 3 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 3 ? AC3 ? 4 ? AC4 ? 4 ? AC5 ? 2 ? AC6 ? 4 ? AC7 ? 4 ? AC8 ? 4 ? AC9 ? 2 ? AD1 ? 2 ? AD2 ? 4 ? AD3 ? 3 ? AD4 ? 2 ? AD5 ? 4 ? AD6 ? 3 ? AD7 ? 2 ? AD8 ? 4 ? AD9 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA3 4 5 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB5 4 5 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB8 1 2 ? parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC3 1 2 ? parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD2 3 4 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD4 1 2 ? parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD5 3 4 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD7 1 2 ? parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD8 3 4 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AD9 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 THR A 88 ? ILE A 89 ? THR A 88 ILE A 89 AA1 2 ALA A 420 ? VAL A 421 ? ALA A 420 VAL A 421 AA2 1 LYS A 158 ? TYR A 160 ? LYS A 158 TYR A 160 AA2 2 ASN A 143 ? TYR A 147 ? ASN A 143 TYR A 147 AA2 3 TYR A 250 ? ARG A 254 ? TYR A 250 ARG A 254 AA3 1 TYR A 165 ? ARG A 169 ? TYR A 165 ARG A 169 AA3 2 VAL A 175 ? ALA A 185 ? VAL A 175 ALA A 185 AA3 3 GLU A 209 ? LEU A 218 ? GLU A 209 LEU A 218 AA3 4 TYR A 225 ? GLU A 230 ? TYR A 225 GLU A 230 AA3 5 ALA A 241 ? TYR A 243 ? ALA A 241 TYR A 243 AA4 1 ILE A 326 ? PHE A 328 ? ILE A 326 PHE A 328 AA4 2 GLY A 297 ? VAL A 299 ? GLY A 297 VAL A 299 AA4 3 PHE B 318 ? PRO B 320 ? PHE L 318 PRO L 320 AA5 1 THR B 88 ? ILE B 89 ? THR L 88 ILE L 89 AA5 2 ALA B 420 ? VAL B 421 ? ALA L 420 VAL L 421 AA6 1 LYS B 158 ? TYR B 160 ? LYS L 158 TYR L 160 AA6 2 LEU B 145 ? TYR B 147 ? LEU L 145 TYR L 147 AA6 3 TYR B 250 ? PRO B 252 ? TYR L 250 PRO L 252 AA7 1 TYR B 165 ? ARG B 169 ? TYR L 165 ARG L 169 AA7 2 VAL B 175 ? ALA B 185 ? VAL L 175 ALA L 185 AA7 3 GLU B 209 ? 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