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HEK293 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _pdbx_entity_src_syn.entity_id 5 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag sample _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num 8 _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific 'Homo sapiens' _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name ? _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id 9606 _pdbx_entity_src_syn.details ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP GNAO_HUMAN P09471 ? 1 LSAEERAALERSKAIEKNLKEDGISAAKDVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIH 5 2 UNP GNAO_HUMAN P09471 ? 1 TTGIVETHFTFKNLHFRLFDVGGQRSERKKWIHCFEDVTAIIFCVALSGY 182 3 UNP GNAO_HUMAN P09471 ? 1 ;NRMHESLMLFDSICNNKFFIDTSIILFLNKKDLFGEKIKKSPLTICFPEYTGPNTYEDAAAYIQAQFESKNRSPNKEIYC HMTCATDTNNIQVVFDAVTDIIIANNLRGCGLY ; 242 4 UNP GBB1_HUMAN P62873 ? 2 ;ELDQLRQEAEQLKNQIRDARKACADATLSQITNNIDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYAMHWGTDSRLLVSASQDGKLIIW DSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNICSIYNLKTREGNVRVSRELAGHTGYLSCCRFLDDNQIVTSSG DTTCALWDIETGQQTTTFTGHTGDVMSLSLAPDTRLFVSGACDASAKLWDVREGMCRQTFTGHESDINAICFFPNGNAFA TGSDDATCRLFDLRADQELMTYSHDNIICGITSVSFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDALKADRAGVLAGHDNRVSCLGVTD DGMAVATGSWDSFLKIWN ; 3 5 UNP GBG2_HUMAN P59768 ? 3 ASIAQARKLVEQLKMEANIDRIKVSKAAADLMAYCEAHAKEDPLLTPVPASENPFR 7 6 PDB 7Y24 7Y24 ? 4 ? 1 7 PDB 7Y24 7Y24 ? 5 ? 1 8 UNP SSR2_HUMAN P30874 ? 6 ;MDMADEPLNGSHTWLSIPFDLNGSVVSTNTSNQTEPYYDLTSNAVLTFIYFVVCIIGLCGNTLVIYVILRYAKMKTITNI YILNLAIADELFMLGLPFLAMQVALVHWPFGKAICRVVMTVDGINQFTSIFCLTVMSIDRYLAVVHPIKSAKWRRPRTAK MITMAVWGVSLLVILPIMIYAGLRSNQWGRSSCTINWPGESGAWYTGFIIYTFILGFLVPLTIICLCYLFIIIKVKSSGI RVGSSKRKKSEKKVTRMVSIVVAVFIFCWLPFYIFNVSSVSMAISPTPALKGMFDFVVVLTYANSCANPILYAFLSDNFK KSFQNVL ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7Y24 A 1 ? 53 ? 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UNP P09471 ? ? linker 175 4 1 7Y24 SER A 56 ? UNP P09471 ? ? linker 176 5 1 7Y24 GLY A 57 ? UNP P09471 ? ? linker 177 6 1 7Y24 GLY A 58 ? UNP P09471 ? ? linker 178 7 1 7Y24 SER A 59 ? UNP P09471 ? ? linker 179 8 1 7Y24 GLY A 60 ? UNP P09471 ? ? linker 180 9 1 7Y24 GLY A 61 ? UNP P09471 ? ? linker 181 10 2 7Y24 ASP A 107 ? UNP P09471 ALA 227 'engineered mutation' 227 11 2 7Y24 ASP A 110 ? UNP P09471 GLY 230 'engineered mutation' 230 12 3 7Y24 ASP A 120 ? UNP P09471 LEU 250 'engineered mutation' 250 13 3 7Y24 ALA A 202 ? UNP P09471 ILE 332 'engineered mutation' 332 14 3 7Y24 ILE A 205 ? UNP P09471 VAL 335 'engineered mutation' 335 15 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 DPN 'D-peptide linking' . D-PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 DTR 'D-peptide linking' . D-TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7Y24 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 7Y24 _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 8406 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.604 ? 11471 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 4.408 ? 1200 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.043 ? 1355 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.006 ? 1453 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7Y24 _struct.title 'Cryo-EM structure of the octreotide-bound SSTR2-miniGo-scFv16 complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7Y24 _struct_keywords.text 'GPCR, somatostatin receptor, G protein, STRUCTURAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'STRUCTURAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 2 ? ALA A 26 ? SER A 6 ALA A 30 1 ? 25 HELX_P HELX_P2 AA2 SER A 40 ? MET A 49 ? SER A 44 MET A 53 1 ? 10 HELX_P HELX_P3 AA3 GLU A 88 ? TRP A 92 ? GLU A 208 TRP A 212 5 ? 5 HELX_P HELX_P4 AA4 TYR A 111 ? ASN A 126 ? TYR A 231 ASN A 256 1 ? 16 HELX_P HELX_P5 AA5 LYS A 142 ? LYS A 150 ? LYS A 272 LYS A 280 1 ? 9 HELX_P HELX_P6 AA6 THR A 166 ? SER A 180 ? 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VAL E 219 SER E 237 1 ? 19 HELX_P HELX_P21 AC3 SER F 244 ? MET F 282 ? SER E 244 MET E 282 1 ? 39 HELX_P HELX_P22 AC4 THR F 287 ? PHE F 314 ? THR E 287 PHE E 314 1 ? 28 HELX_P HELX_P23 AC5 SER F 316 ? ASN F 325 ? SER E 316 ASN E 325 1 ? 10 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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