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EMDB EMD-33616 ? ? # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Cryo-EM structure of F-ATP synthase from Mycolicibacterium smegmatis (rotational state 2)' _pdbx_database_related.db_id EMD-33616 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7Y5C _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2022-06-16 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBJ _pdbx_database_status.process_site PDBJ _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Saw, W.-G.' 1 0000-0002-2510-387X 'Wong, C.F.' 2 0000-0002-3330-4815 'Grueber, G.' 3 0000-0002-5730-8319 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Antimicrob.Agents Chemother.' _citation.journal_id_ASTM AMACCQ _citation.journal_id_CSD 0788 _citation.journal_id_ISSN 1098-6596 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 66 _citation.language ? _citation.page_first e0105622 _citation.page_last e0105622 _citation.title ;Structural Elements Involved in ATP Hydrolysis Inhibition and ATP Synthesis of Tuberculosis and Nontuberculous Mycobacterial F-ATP Synthase Decipher New Targets for Inhibitors. ; _citation.year 2022 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1128/aac.01056-22 _citation.pdbx_database_id_PubMed 36445139 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # 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_entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MAELTISAADIEGAIEDYVSSFSADTEREEIGTVIDAGDGIAHVEGLPSVMTQELLEFPGGVLGVALNLDEHSVGAVILG EFEKIEEGQQVKRTGEVLSVPVGDAFLGRVVNPLGQPIDGQGDIAAETRRALELQAPSVVQRQSVSEPLQTGIKAIDAMT PIGRGQRQLIIGDRKTGKTAVCVDTILNQREAWLTGDPKQQVRCVYVAIGQKGTTIASVKRALEEGGAMEYTTIVAAPAS DAAGFKWLAPYTGSAIGQHWMYNGKHVLIVFDDLSKQADAYRAISLLLRRPPGREAFPGDVFYLHSRLLERCAKLSDELG GGSMTGLPIIETKANDISAFIPTNVISITDGQCFLESDLFNQGVRPAINVGVSVSRVGGAAQIKAMKEVAGSLRLDLSQY RELEAFAAFASDLDAASKAQLDRGARLVELLKQPQYSPLAVEEQVVAIFLGTQGHLDSVPVEDVQRFESELLEHVKASHS DIFDGIRETKKLSEEAEEKLVSVINEFKKGFQASDGSSVVVSENAEALDPEDLEKESVKVRKPAPKKA ; ;MAELTISAADIEGAIEDYVSSFSADTEREEIGTVIDAGDGIAHVEGLPSVMTQELLEFPGGVLGVALNLDEHSVGAVILG EFEKIEEGQQVKRTGEVLSVPVGDAFLGRVVNPLGQPIDGQGDIAAETRRALELQAPSVVQRQSVSEPLQTGIKAIDAMT PIGRGQRQLIIGDRKTGKTAVCVDTILNQREAWLTGDPKQQVRCVYVAIGQKGTTIASVKRALEEGGAMEYTTIVAAPAS DAAGFKWLAPYTGSAIGQHWMYNGKHVLIVFDDLSKQADAYRAISLLLRRPPGREAFPGDVFYLHSRLLERCAKLSDELG GGSMTGLPIIETKANDISAFIPTNVISITDGQCFLESDLFNQGVRPAINVGVSVSRVGGAAQIKAMKEVAGSLRLDLSQY RELEAFAAFASDLDAASKAQLDRGARLVELLKQPQYSPLAVEEQVVAIFLGTQGHLDSVPVEDVQRFESELLEHVKASHS DIFDGIRETKKLSEEAEEKLVSVINEFKKGFQASDGSSVVVSENAEALDPEDLEKESVKVRKPAPKKA ; A,B,C ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MHHHHHHTATAEKTAGRVVRITGPVVDVEFPRGSVPELFNALHAEITFGALAKTLTLEVAQHLGDSLVRCISMQPTDGLV RGVEVTDTGASISVPVGDGVKGHVFNALGDCLDDPGYGKDFEHWSIHRKPPAFSDLEPRTEMLETGLKVVDLLTPYVRGG KIALFGGAGVGKTVLIQEMINRIARNFGGTSVFAGVGERTREGNDLWVELADANVLKDTALVFGQMDEPPGTRMRVALSA LTMAEFFRDEQGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSTLLGRMPSAVGYQPTLADEMGELQERITSTRGRSITSMQAVYVPADD YTDPAPATTFAHLDATTELSRAVFSKGIFPAVDPLASSSTILDPAIVGDEHYRVAQEVIRILQRYKDLQDIIAILGIDEL SEEDKQLVNRARRIERFLSQNMMAAEQFTGQPGSTVPLKETIEAFDKLTKGEFDHLPEQAFFLIGGLDDLAKKAESLGAK L ; ;MHHHHHHTATAEKTAGRVVRITGPVVDVEFPRGSVPELFNALHAEITFGALAKTLTLEVAQHLGDSLVRCISMQPTDGLV RGVEVTDTGASISVPVGDGVKGHVFNALGDCLDDPGYGKDFEHWSIHRKPPAFSDLEPRTEMLETGLKVVDLLTPYVRGG 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'polypeptide(L)' no no ;MADLNVEIVAVERELWSGPATFVFTRTTAGEIGILPRHIPLVAQLVDDAMVRVEREGEDDLRIAVDGGFLSVTEETVRIL VENAQFESEIDADAAKEDAASDDERTAAWGRARLRALGQID ; ;MADLNVEIVAVERELWSGPATFVFTRTTAGEIGILPRHIPLVAQLVDDAMVRVEREGEDDLRIAVDGGFLSVTEETVRIL VENAQFESEIDADAAKEDAASDDERTAAWGRARLRALGQID ; H ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MLAAEEGGAAIHVGHHTLVFELFGMTFNGDTILATAVTAVIVIALAFYLRAKVTSTGVPSGVQLFWEALTIQMRQQIEGS IGMKIAPFVLPLSVTIFVFILISNWLAVLPLQYGGADGAAAELYKAPASDINFVLALALFVFVCYHAAGIWRRGIVGHPI KVVKGHVAFLAPINIVEELAKPISLALRLFGNIFAGGILVALIAMFPWYIQWFPNAVWKTFDLFVGLIQAFIFSLLTILY FSQSMELDHEDH ; ;MLAAEEGGAAIHVGHHTLVFELFGMTFNGDTILATAVTAVIVIALAFYLRAKVTSTGVPSGVQLFWEALTIQMRQQIEGS IGMKIAPFVLPLSVTIFVFILISNWLAVLPLQYGGADGAAAELYKAPASDINFVLALALFVFVCYHAAGIWRRGIVGHPI KVVKGHVAFLAPINIVEELAKPISLALRLFGNIFAGGILVALIAMFPWYIQWFPNAVWKTFDLFVGLIQAFIFSLLTILY FSQSMELDHEDH ; a ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MGEFSATILAASQAAEEGGGGSNFLIPNGTFFAVLIIFLIVLGVISKWVVPPISKVLAEREAMLAKTAADNRKSAEQVAA 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LSDKVSATTLDLLRTAVSNRWSTESNLIDAVEHTARLALLKRAEIAGEVDEVEEQLFRFGRVLDAEPRLSALLSDYTTPA EGRVALLDKALTGRPGVNQTAAALLSQTVGLLRGERADEAVIDLAELAVSRRGEVVAHVSAAAELSDAQRTRLTEVLSRI YGRPVSVQLHVDPELLGGLSITVGDEVIDGSIASRLAAAQTGLPD ; d ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MDLDPNAIITAGALIGGGLIMGGGAIGAGIGDGIAGNALISGIARQPEAQGRLFTPFFITVGLVEAAYFINLAFMALFVF ATPGLQ ; ;MDLDPNAIITAGALIGGGLIMGGGAIGAGIGDGIAGNALISGIARQPEAQGRLFTPFFITVGLVEAAYFINLAFMALFVF ATPGLQ ; 7,8,9,1,2,3,4,5,6 ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ALA n 1 3 GLU n 1 4 LEU n 1 5 THR n 1 6 ILE n 1 7 SER n 1 8 ALA n 1 9 ALA n 1 10 ASP n 1 11 ILE n 1 12 GLU n 1 13 GLY n 1 14 ALA n 1 15 ILE n 1 16 GLU n 1 17 ASP n 1 18 TYR n 1 19 VAL n 1 20 SER n 1 21 SER n 1 22 PHE n 1 23 SER n 1 24 ALA n 1 25 ASP n 1 26 THR n 1 27 GLU n 1 28 ARG n 1 29 GLU n 1 30 GLU n 1 31 ILE n 1 32 GLY n 1 33 THR n 1 34 VAL n 1 35 ILE n 1 36 ASP n 1 37 ALA n 1 38 GLY n 1 39 ASP n 1 40 GLY n 1 41 ILE n 1 42 ALA n 1 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'Mycolicibacterium smegmatis' 1772 ? ? ? ? ? ? 'mc(2)4517' ? ? ? ? ? ? ? Plasmid ? ? ? pYUB1049 ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP ATPA_MYCS2 A0R202 ? 1 ;MAELTISAADIEGAIEDYVSSFSADTEREEIGTVIDAGDGIAHVEGLPSVMTQELLEFPGGVLGVALNLDEHSVGAVILG EFEKIEEGQQVKRTGEVLSVPVGDAFLGRVVNPLGQPIDGQGDIAAETRRALELQAPSVVQRQSVSEPLQTGIKAIDAMT PIGRGQRQLIIGDRKTGKTAVCVDTILNQREAWLTGDPKQQVRCVYVAIGQKGTTIASVKRALEEGGAMEYTTIVAAPAS DAAGFKWLAPYTGSAIGQHWMYNGKHVLIVFDDLSKQADAYRAISLLLRRPPGREAFPGDVFYLHSRLLERCAKLSDELG GGSMTGLPIIETKANDISAFIPTNVISITDGQCFLESDLFNQGVRPAINVGVSVSRVGGAAQIKAMKEVAGSLRLDLSQY RELEAFAAFASDLDAASKAQLDRGARLVELLKQPQYSPLAVEEQVVAIFLGTQGHLDSVPVEDVQRFESELLEHVKASHS DIFDGIRETKKLSEEAEEKLVSVINEFKKGFQASDGSSVVVSENAEALDPEDLEKESVKVRKPAPKKA ; 1 2 UNP ATPB_MYCS2 A0R200 ? 2 ;TATAEKTAGRVVRITGPVVDVEFPRGSVPELFNALHAEITFGALAKTLTLEVAQHLGDSLVRCISMQPTDGLVRGVEVTD TGASISVPVGDGVKGHVFNALGDCLDDPGYGKDFEHWSIHRKPPAFSDLEPRTEMLETGLKVVDLLTPYVRGGKIALFGG AGVGKTVLIQEMINRIARNFGGTSVFAGVGERTREGNDLWVELADANVLKDTALVFGQMDEPPGTRMRVALSALTMAEFF RDEQGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSTLLGRMPSAVGYQPTLADEMGELQERITSTRGRSITSMQAVYVPADDYTDPAPA TTFAHLDATTELSRAVFSKGIFPAVDPLASSSTILDPAIVGDEHYRVAQEVIRILQRYKDLQDIIAILGIDELSEEDKQL VNRARRIERFLSQNMMAAEQFTGQPGSTVPLKETIEAFDKLTKGEFDHLPEQAFFLIGGLDDLAKKAESLGAKL ; 2 3 UNP ATPG_MYCS2 A0R201 ? 3 ;MAATLRELRGRIRSAGSIKKITKAQELIATSRIAKAQARVEAARPYAAEITNMLTELAGASALDHPLLVERKQPKRAGVL VVSSDRGLCGAYNANVLRRAEELFSLLRDEGKDPVLYVVGRKALGYFSFRQRTVVESWTGFSERPTYENAREIADTLVNA FMAGADDEGDDAGADGILGVDELHIVFTEFRSMLSQTAVARRAAPMEVEYVGEVETGPRTLYSFEPDPETLFDALLPRYI ATRVYAALLEAAASESASRRRAMKSATDNADDLIKALTLAANRERQAQITQEISEIVGGANALAGSK ; 1 4 UNP ATPE_MYCS2 A0R1Z9 ? 4 ;MADLNVEIVAVERELWSGPATFVFTRTTAGEIGILPRHIPLVAQLVDDAMVRVEREGEDDLRIAVDGGFLSVTEETVRIL VENAQFESEIDADAAKEDAASDDERTAAWGRARLRALGQID ; 1 5 UNP A0R206_MYCS2 A0R206 ? 5 ;MLAAEEGGAAIHVGHHTLVFELFGMTFNGDTILATAVTAVIVIALAFYLRAKVTSTGVPSGVQLFWEALTIQMRQQIEGS IGMKIAPFVLPLSVTIFVFILISNWLAVLPLQYGGADGAAAELYKAPASDINFVLALALFVFVCYHAAGIWRRGIVGHPI KVVKGHVAFLAPINIVEELAKPISLALRLFGNIFAGGILVALIAMFPWYIQWFPNAVWKTFDLFVGLIQAFIFSLLTILY FSQSMELDHEDH ; 1 6 UNP ATPF_MYCS2 A0R204 ? 6 ;MGEFSATILAASQAAEEGGGGSNFLIPNGTFFAVLIIFLIVLGVISKWVVPPISKVLAEREAMLAKTAADNRKSAEQVAA AQADYEKEMAEARAQASALRDEARAAGRSVVDEKRAQASGEVAQTLTQADQQLSAQGDQVRSGLESSVDGLSAKLASRIL GVDVNSGGTQ ; 1 7 UNP ATPFD_MYCS2 A0R203 ? 7 ;MSIFIGQLIGFAVIAFIIVKWVVPPVRTLMRNQQEAVRAALAESAEAAKKLADADAMHAKALADAKAESEKVTEEAKQDS ERIAAQLSEQAGSEAERIKAQGAQQIQLMRQQLIRQLRTGLGAEAVNKAAEIVRAHVADPQAQSATVDRFLSELEQMAPS SVVIDTAATSRLRAASRQSLAALVEKFDSVAGGLDADGLTNLADELASVAKLLLSETALNKHLAEPTDDSAPKVRLLERL LSDKVSATTLDLLRTAVSNRWSTESNLIDAVEHTARLALLKRAEIAGEVDEVEEQLFRFGRVLDAEPRLSALLSDYTTPA EGRVALLDKALTGRPGVNQTAAALLSQTVGLLRGERADEAVIDLAELAVSRRGEVVAHVSAAAELSDAQRTRLTEVLSRI YGRPVSVQLHVDPELLGGLSITVGDEVIDGSIASRLAAAQTGLPD ; 1 8 UNP A0R205_MYCS2 A0R205 ? 8 ;MDLDPNAIITAGALIGGGLIMGGGAIGAGIGDGIAGNALISGIARQPEAQGRLFTPFFITVGLVEAAYFINLAFMALFVF ATPGLQ ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7Y5C A 1 ? 548 ? 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A0R205 1 ? 86 ? 1 86 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 4 7Y5C MET D 1 ? UNP A0R200 ? ? 'initiating methionine' -5 1 4 7Y5C HIS D 2 ? UNP A0R200 ? ? 'expression tag' -4 2 4 7Y5C HIS D 3 ? UNP A0R200 ? ? 'expression tag' -3 3 4 7Y5C HIS D 4 ? UNP A0R200 ? ? 'expression tag' -2 4 4 7Y5C HIS D 5 ? UNP A0R200 ? ? 'expression tag' -1 5 4 7Y5C HIS D 6 ? UNP A0R200 ? ? 'expression tag' 0 6 4 7Y5C HIS D 7 ? UNP A0R200 ? ? 'expression tag' 1 7 5 7Y5C MET E 1 ? UNP A0R200 ? ? 'initiating methionine' -5 8 5 7Y5C HIS E 2 ? UNP A0R200 ? ? 'expression tag' -4 9 5 7Y5C HIS E 3 ? UNP A0R200 ? ? 'expression tag' -3 10 5 7Y5C HIS E 4 ? UNP A0R200 ? ? 'expression tag' -2 11 5 7Y5C HIS E 5 ? UNP A0R200 ? ? 'expression tag' -1 12 5 7Y5C HIS E 6 ? UNP A0R200 ? ? 'expression tag' 0 13 5 7Y5C HIS E 7 ? UNP A0R200 ? ? 'expression tag' 1 14 6 7Y5C MET F 1 ? UNP A0R200 ? ? 'initiating methionine' -5 15 6 7Y5C HIS F 2 ? UNP A0R200 ? ? 'expression tag' -4 16 6 7Y5C HIS F 3 ? UNP A0R200 ? ? 'expression tag' -3 17 6 7Y5C HIS F 4 ? UNP A0R200 ? ? 'expression tag' -2 18 6 7Y5C HIS F 5 ? UNP A0R200 ? ? 'expression tag' -1 19 6 7Y5C HIS F 6 ? UNP A0R200 ? ? 'expression tag' 0 20 6 7Y5C HIS F 7 ? UNP A0R200 ? ? 'expression tag' 1 21 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ADP non-polymer n "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N5 O10 P2' 427.201 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 ATP non-polymer . "ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" ? 'C10 H16 N5 O13 P3' 507.181 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7Y5C _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7Y5C _struct.title 'Cryo-EM structure of F-ATP synthase from Mycolicibacterium smegmatis (rotational state 2)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7Y5C _struct_keywords.text 'Complex, F-ATP synthase, cryo-EM, mycobacteria, HYDROLASE' _struct_keywords.pdbx_keywords HYDROLASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 2 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 6 ? K N N 7 ? L N N 8 ? M N N 8 ? N N N 8 ? O N N 8 ? P N N 8 ? Q N N 8 ? R N N 8 ? S N N 8 ? T N N 8 ? U N N 9 ? V N N 10 ? W N N 9 ? X N N 10 ? Y N N 9 ? Z N N 10 ? AA N N 9 ? BA N N 10 ? CA N N 11 ? DA N N 9 ? EA N N 10 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 THR A 5 ? SER A 20 ? THR A 5 SER A 20 1 ? 16 HELX_P HELX_P2 AA2 GLY A 103 ? LEU A 107 ? GLY A 103 LEU A 107 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 AA3 SER A 138 ? ARG A 142 ? SER A 138 ARG A 142 5 ? 5 HELX_P HELX_P4 AA4 ILE A 153 ? THR A 160 ? ILE A 153 THR A 160 1 ? 8 HELX_P HELX_P5 AA5 GLY A 177 ? THR A 195 ? GLY A 177 THR A 195 1 ? 19 HELX_P HELX_P6 AA6 ASP A 197 ? GLN A 200 ? ASP A 197 GLN A 200 5 ? 4 HELX_P HELX_P7 AA7 LYS A 212 ? GLY A 227 ? LYS A 212 GLY A 227 1 ? 16 HELX_P HELX_P8 AA8 ALA A 242 ? GLY A 264 ? ALA A 242 GLY A 264 1 ? 23 HELX_P HELX_P9 AA9 LEU A 274 ? LEU A 288 ? LEU A 274 LEU A 288 1 ? 15 HELX_P HELX_P10 AB1 GLY A 293 ? PHE A 297 ? GLY A 293 PHE A 297 5 ? 5 HELX_P HELX_P11 AB2 PRO A 298 ? GLY A 299 ? PRO A 298 GLY A 299 5 ? 2 HELX_P HELX_P12 AB3 ASP A 300 ? GLU A 310 ? ASP A 300 GLU A 310 1 ? 11 HELX_P HELX_P13 AB4 ALA A 339 ? SER A 347 ? ALA A 339 SER A 347 1 ? 9 HELX_P HELX_P14 AB5 GLU A 356 ? GLY A 363 ? GLU A 356 GLY A 363 1 ? 8 HELX_P HELX_P15 AB6 VAL A 377 ? ALA A 381 ? VAL A 377 ALA A 381 5 ? 5 HELX_P HELX_P16 AB7 ILE A 383 ? ALA A 390 ? ILE A 383 ALA A 390 1 ? 8 HELX_P HELX_P17 AB8 SER A 392 ? ALA A 407 ? SER A 392 ALA A 407 1 ? 16 HELX_P HELX_P18 AB9 ASP A 414 ? LEU A 431 ? ASP A 414 LEU A 431 1 ? 18 HELX_P HELX_P19 AC1 ALA A 440 ? GLN A 453 ? ALA A 440 GLN A 453 1 ? 14 HELX_P HELX_P20 AC2 PRO A 460 ? GLU A 462 ? PRO A 460 GLU A 462 5 ? 3 HELX_P HELX_P21 AC3 ASP A 463 ? SER A 478 ? ASP A 463 SER A 478 1 ? 16 HELX_P HELX_P22 AC4 SER A 480 ? LYS A 490 ? SER A 480 LYS A 490 1 ? 11 HELX_P HELX_P23 AC5 SER A 493 ? PHE A 511 ? SER A 493 PHE A 511 1 ? 19 HELX_P HELX_P24 AC6 GLU B 12 ? PHE B 22 ? GLU B 12 PHE B 22 1 ? 11 HELX_P HELX_P25 AC7 SER B 138 ? ARG B 142 ? SER B 138 ARG B 142 5 ? 5 HELX_P HELX_P26 AC8 ILE B 153 ? THR B 160 ? ILE B 153 THR B 160 1 ? 8 HELX_P HELX_P27 AC9 GLY B 177 ? ASN B 188 ? GLY B 177 ASN B 188 1 ? 12 HELX_P HELX_P28 AD1 GLN B 189 ? THR B 195 ? GLN B 189 THR B 195 1 ? 7 HELX_P HELX_P29 AD2 LYS B 212 ? GLY B 227 ? LYS B 212 GLY B 227 1 ? 16 HELX_P HELX_P30 AD3 ALA B 228 ? GLU B 230 ? ALA B 228 GLU B 230 5 ? 3 HELX_P HELX_P31 AD4 ALA B 242 ? ASN B 263 ? 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B MG 600 B ATP 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.888 ? ? metalc11 metalc ? ? W MG . MG ? ? ? 1_555 X ATP . O3G ? ? B MG 600 B ATP 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.119 ? ? metalc12 metalc ? ? W MG . MG ? ? ? 1_555 X ATP . O1A ? ? B MG 600 B ATP 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.008 ? ? metalc13 metalc ? ? W MG . MG ? ? ? 1_555 X ATP . O3A ? ? B MG 600 B ATP 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.106 ? ? metalc14 metalc ? ? W MG . MG ? ? ? 1_555 X ATP . O1G ? ? B MG 600 B ATP 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.441 ? ? metalc15 metalc ? ? C THR 179 OG1 ? ? ? 1_555 Y MG . MG ? ? C THR 179 C MG 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.853 ? ? metalc16 metalc ? ? Y MG . MG ? ? ? 1_555 Z ATP . O1A ? ? C MG 600 C ATP 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.140 ? ? metalc17 metalc ? ? Y MG . MG ? ? ? 1_555 Z ATP . O3A ? ? C MG 600 C ATP 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? ? metalc18 metalc ? ? Y MG . MG ? ? ? 1_555 Z ATP . O1B ? ? C MG 600 C ATP 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.141 ? ? metalc19 metalc ? ? Y MG . MG ? ? ? 1_555 Z ATP . O3B ? ? C MG 600 C ATP 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.513 ? ? metalc20 metalc ? ? Y MG . MG ? ? ? 1_555 Z ATP . O3G ? ? C MG 600 C ATP 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? ? metalc21 metalc ? ? Y MG . MG ? ? ? 1_555 Z ATP . O1G ? ? C MG 600 C ATP 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.919 ? ? metalc22 metalc ? ? D THR 173 OG1 ? ? ? 1_555 AA MG . MG ? ? D THR 167 D MG 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.765 ? ? metalc23 metalc ? ? AA MG . MG ? ? ? 1_555 BA ATP . O2A ? ? D MG 500 D ATP 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.916 ? ? metalc24 metalc ? ? AA MG . MG ? ? ? 1_555 BA ATP . O3A ? ? D MG 500 D ATP 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? ? metalc25 metalc ? ? AA MG . MG ? ? ? 1_555 BA ATP . O1B ? ? D MG 500 D ATP 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.925 ? ? metalc26 metalc ? ? AA MG . MG ? ? ? 1_555 BA ATP . O1A ? ? D MG 500 D ATP 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.783 ? ? metalc27 metalc ? ? F THR 173 OG1 ? ? ? 1_555 DA MG . MG ? ? F THR 167 F MG 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.070 ? ? metalc28 metalc ? ? DA MG . MG ? ? ? 1_555 EA ATP . O1B ? ? F MG 500 F ATP 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? metalc29 metalc ? ? DA MG . MG ? ? ? 1_555 EA ATP . O2G ? ? F MG 500 F ATP 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.706 ? ? metalc30 metalc ? ? DA MG . MG ? ? ? 1_555 EA ATP . O3B ? ? F MG 500 F ATP 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.963 ? ? # _struct_conn_type.id metalc _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 6 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 5 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 6 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 7 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 5 ? AB2 ? 3 ? AB3 ? 6 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 7 ? AB6 ? 6 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 7 ? AB9 ? 7 ? AC1 ? 2 ? AC2 ? 2 ? AC3 ? 7 ? AC4 ? 7 ? AC5 ? 2 ? AC6 ? 5 ? AC7 ? 7 ? AC8 ? 2 ? AC9 ? 6 ? AD1 ? 5 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA2 5 6 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? parallel AA4 2 3 ? parallel AA4 3 4 ? parallel AA4 4 5 ? parallel AA5 1 2 ? parallel AA5 2 3 ? parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? parallel AA6 4 5 ? parallel AA6 5 6 ? parallel AA7 1 2 ? parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA8 4 5 ? anti-parallel AA8 5 6 ? anti-parallel AA8 6 7 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? parallel AB1 2 3 ? parallel AB1 3 4 ? parallel AB1 4 5 ? parallel AB2 1 2 ? parallel AB2 2 3 ? parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB3 4 5 ? anti-parallel AB3 5 6 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? parallel AB5 2 3 ? parallel AB5 3 4 ? parallel AB5 4 5 ? parallel AB5 5 6 ? parallel AB5 6 7 ? parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB6 4 5 ? anti-parallel AB6 5 6 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? parallel AB8 2 3 ? parallel AB8 3 4 ? parallel AB8 4 5 ? parallel AB8 5 6 ? parallel AB8 6 7 ? parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AB9 4 5 ? anti-parallel AB9 5 6 ? anti-parallel AB9 6 7 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC3 1 2 ? parallel AC3 2 3 ? parallel AC3 3 4 ? parallel AC3 4 5 ? parallel AC3 5 6 ? parallel AC3 6 7 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC4 4 5 ? anti-parallel AC4 5 6 ? anti-parallel AC4 6 7 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC6 1 2 ? parallel AC6 2 3 ? parallel AC6 3 4 ? parallel AC6 4 5 ? parallel AC7 1 2 ? parallel AC7 2 3 ? parallel AC7 3 4 ? parallel AC7 4 5 ? parallel AC7 5 6 ? parallel AC7 6 7 ? parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AC9 4 5 ? parallel AC9 5 6 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD1 4 5 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 GLU A 29 ? GLU A 30 ? GLU A 29 GLU A 30 AA1 2 GLU K 426 ? GLY K 430 ? GLU d 426 GLY d 430 AA1 3 LEU K 419 ? THR K 422 ? LEU d 419 THR d 422 AA1 4 HIS K 378 ? ALA K 381 ? HIS d 378 ALA d 381 AA1 5 GLN K 408 ? VAL K 411 ? GLN d 408 VAL d 411 AA2 1 THR A 33 ? GLY A 38 ? THR A 33 GLY A 38 AA2 2 ILE A 41 ? GLU A 45 ? ILE A 41 GLU A 45 AA2 3 SER A 73 ? ILE A 78 ? SER A 73 ILE A 78 AA2 4 LEU A 63 ? ASP A 70 ? LEU A 63 ASP A 70 AA2 5 GLU A 54 ? GLU A 57 ? GLU A 54 GLU A 57 AA2 6 LYS A 92 ? VAL A 97 ? LYS A 92 VAL A 97 AA3 1 SER A 99 ? VAL A 102 ? SER A 99 VAL A 102 AA3 2 THR A 128 ? ALA A 131 ? THR A 128 ALA A 131 AA4 1 VAL A 110 ? VAL A 111 ? VAL A 110 VAL A 111 AA4 2 THR A 232 ? ALA A 237 ? THR A 232 ALA A 237 AA4 3 VAL A 202 ? ILE A 209 ? VAL A 202 ILE A 209 AA4 4 HIS A 266 ? PHE A 271 ? HIS A 266 PHE A 271 AA4 5 MET A 324 ? LEU A 327 ? MET A 324 LEU A 327 AA5 1 ILE A 329 ? GLU A 331 ? ILE A 329 GLU A 331 AA5 2 LEU A 169 ? GLY A 172 ? LEU A 169 GLY A 172 AA5 3 GLY A 351 ? PHE A 354 ? GLY A 351 PHE A 354 AA5 4 VAL A 374 ? SER A 375 ? VAL A 374 SER A 375 AA6 1 GLU A 534 ? LYS A 535 ? GLU A 534 LYS A 535 AA6 2 GLN G 196 ? ARG G 202 ? GLN G 196 ARG G 202 AA6 3 ILE G 185 ? PHE G 190 ? ILE G 185 PHE G 190 AA6 4 GLY G 78 ? VAL G 82 ? GLY G 78 VAL G 82 AA6 5 VAL G 115 ? VAL G 119 ? VAL G 115 VAL G 119 AA6 6 SER G 137 ? TRP G 138 ? SER G 137 TRP G 138 AA7 1 VAL A 538 ? VAL A 540 ? VAL A 538 VAL A 540 AA7 2 VAL G 208 ? TYR G 210 ? VAL G 208 TYR G 210 AA8 1 ILE B 31 ? GLY B 38 ? ILE B 31 GLY B 38 AA8 2 ILE B 41 ? GLU B 45 ? ILE B 41 GLU B 45 AA8 3 VAL B 74 ? ILE B 78 ? VAL B 74 ILE B 78 AA8 4 LEU B 63 ? VAL B 65 ? LEU B 63 VAL B 65 AA8 5 LEU B 55 ? GLU B 57 ? LEU B 55 GLU B 57 AA8 6 GLN B 90 ? LYS B 92 ? GLN B 90 LYS B 92 AA8 7 ILE B 31 ? GLY B 38 ? ILE B 31 GLY B 38 AA9 1 SER B 99 ? VAL B 102 ? SER B 99 VAL B 102 AA9 2 THR B 128 ? ALA B 131 ? THR B 128 ALA B 131 AB1 1 VAL B 110 ? VAL B 111 ? VAL B 110 VAL B 111 AB1 2 THR B 232 ? ALA B 237 ? THR B 232 ALA B 237 AB1 3 VAL B 202 ? ILE B 209 ? VAL B 202 ILE B 209 AB1 4 HIS B 266 ? PHE B 271 ? HIS B 266 PHE B 271 AB1 5 MET B 324 ? LEU B 327 ? MET B 324 LEU B 327 AB2 1 ILE B 329 ? GLU B 331 ? ILE B 329 GLU B 331 AB2 2 ILE B 170 ? GLY B 172 ? ILE B 170 GLY B 172 AB2 3 PHE B 354 ? LEU B 355 ? PHE B 354 LEU B 355 AB3 1 VAL C 44 ? GLU C 45 ? VAL C 44 GLU C 45 AB3 2 GLY C 32 ? VAL C 34 ? GLY C 32 VAL C 34 AB3 3 GLN C 90 ? VAL C 97 ? GLN C 90 VAL C 97 AB3 4 GLU C 54 ? GLU C 57 ? GLU C 54 GLU C 57 AB3 5 LEU C 63 ? VAL C 65 ? LEU C 63 VAL C 65 AB3 6 VAL C 77 ? LEU C 79 ? VAL C 77 LEU C 79 AB4 1 SER C 99 ? VAL C 102 ? SER C 99 VAL C 102 AB4 2 THR C 128 ? ALA C 131 ? THR C 128 ALA C 131 AB5 1 VAL C 110 ? VAL C 111 ? VAL C 110 VAL C 111 AB5 2 THR C 232 ? ALA C 237 ? THR C 232 ALA C 237 AB5 3 VAL C 202 ? ILE C 209 ? VAL C 202 ILE C 209 AB5 4 HIS C 266 ? PHE C 271 ? HIS C 266 PHE C 271 AB5 5 SER C 323 ? GLU C 331 ? SER C 323 GLU C 331 AB5 6 LEU C 169 ? GLY C 172 ? 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