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B CYS 1029 SG ? ? ? 1_555 B CYS 1040 SG ? ? B CYS 1032 B CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf28 disulf ? ? B CYS 1079 SG ? ? ? 1_555 B CYS 1123 SG ? ? B CYS 1082 B CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf29 disulf ? ? C CYS 15 SG ? ? ? 1_555 C CYS 134 SG ? ? C CYS 15 C CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf30 disulf ? ? C CYS 129 SG ? ? ? 1_555 C CYS 161 SG ? ? C CYS 131 C CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf31 disulf ? ? C CYS 288 SG ? ? ? 1_555 C CYS 298 SG ? ? C CYS 291 C CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf32 disulf ? ? C CYS 333 SG ? ? ? 1_555 C CYS 358 SG ? ? C CYS 336 C CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.011 ? ? disulf33 disulf ? ? C CYS 376 SG ? ? ? 1_555 C CYS 429 SG ? ? C CYS 379 C CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf34 disulf ? ? C CYS 388 SG ? ? ? 1_555 C CYS 522 SG ? ? C CYS 391 C CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf35 disulf ? ? C CYS 477 SG ? ? ? 1_555 C CYS 485 SG ? ? C CYS 480 C CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf36 disulf ? ? C CYS 535 SG ? ? ? 1_555 C CYS 587 SG ? ? C CYS 538 C CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf37 disulf ? ? C CYS 614 SG ? ? ? 1_555 C CYS 646 SG ? ? C CYS 617 C CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf38 disulf ? ? C CYS 659 SG ? ? ? 1_555 C CYS 668 SG ? ? C CYS 662 C CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? disulf39 disulf ? ? C CYS 735 SG ? ? ? 1_555 C CYS 757 SG ? ? C CYS 738 C CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf40 disulf ? ? C CYS 740 SG ? ? ? 1_555 C CYS 746 SG ? ? C CYS 743 C CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf41 disulf ? ? C CYS 1029 SG ? ? ? 1_555 C CYS 1040 SG ? ? C CYS 1032 C CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf42 disulf ? ? C CYS 1079 SG ? ? ? 1_555 C CYS 1123 SG ? ? C CYS 1082 C CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf43 disulf ? ? D CYS 115 SG ? ? ? 1_555 D CYS 123 SG ? ? D CYS 133 D CYS 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf44 disulf ? ? D CYS 326 SG ? ? ? 1_555 D CYS 343 SG ? ? D CYS 344 D CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf45 disulf ? ? D CYS 512 SG ? ? ? 1_555 D CYS 524 SG ? ? D CYS 530 D CYS 542 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? covale1 covale one ? A ASN 17 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? A ASN 17 A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 61 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? A ASN 61 A NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 120 ND2 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? A ASN 122 E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? A ASN 160 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? A ASN 165 A NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? A ASN 231 ND2 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? A ASN 234 F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? A ASN 279 ND2 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? A ASN 282 G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? A ASN 328 ND2 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? A ASN 331 H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? A ASN 340 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? A ASN 343 A NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? A ASN 613 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? A ASN 616 A NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? A ASN 706 ND2 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? A ASN 709 I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? A ASN 714 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? A ASN 717 J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? A ASN 798 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? A ASN 801 K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? A ASN 1071 ND2 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? A ASN 1074 A NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? A ASN 1095 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? A ASN 1098 L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? A ASN 1131 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? A ASN 1134 M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? B ASN 17 ND2 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? B ASN 17 B NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? B ASN 61 ND2 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? B ASN 61 B NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale18 covale one ? B ASN 120 ND2 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? B ASN 122 B NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? N-Glycosylation covale19 covale one ? B ASN 160 ND2 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? B ASN 165 B NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? N-Glycosylation covale20 covale one ? B ASN 231 ND2 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? B ASN 234 B NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale21 covale one ? B ASN 279 ND2 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? B ASN 282 B NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale22 covale one ? B ASN 328 ND2 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? B ASN 331 B NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale23 covale one ? B ASN 340 ND2 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? B ASN 343 B NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale24 covale one ? B ASN 613 ND2 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? B ASN 616 B NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale25 covale one ? B ASN 706 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? B ASN 709 N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale26 covale one ? B ASN 714 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? B ASN 717 O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale27 covale one ? B ASN 798 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? B ASN 801 P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale28 covale one ? B ASN 1071 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? B ASN 1074 Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale29 covale one ? B ASN 1095 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? B ASN 1098 R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale30 covale one ? B ASN 1131 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? B ASN 1134 S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale31 covale one ? C ASN 17 ND2 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? C ASN 17 C NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale32 covale one ? C ASN 61 ND2 ? ? ? 1_555 QA NAG . C1 ? ? C ASN 61 C NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? N-Glycosylation covale33 covale one ? C ASN 120 ND2 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? C ASN 122 C NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? N-Glycosylation covale34 covale one ? C ASN 160 ND2 ? ? ? 1_555 SA NAG . C1 ? ? C ASN 165 C NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale35 covale one ? C ASN 231 ND2 ? ? ? 1_555 TA NAG . C1 ? ? C ASN 234 C NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale36 covale one ? C ASN 279 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? C ASN 282 T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale37 covale one ? C ASN 328 ND2 ? ? ? 1_555 UA NAG . C1 ? ? C ASN 331 C NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? N-Glycosylation covale38 covale one ? C ASN 340 ND2 ? ? ? 1_555 VA NAG . C1 ? ? C ASN 343 C NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? N-Glycosylation covale39 covale one ? C ASN 613 ND2 ? ? ? 1_555 WA NAG . C1 ? ? C ASN 616 C NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale40 covale one ? C ASN 706 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? C ASN 709 U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? N-Glycosylation covale41 covale one ? C ASN 714 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? C ASN 717 V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale42 covale one ? C ASN 798 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? C ASN 801 W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale43 covale one ? C ASN 1071 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? C ASN 1074 X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale44 covale one ? C ASN 1095 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? C ASN 1098 Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale45 covale one ? C ASN 1131 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? C ASN 1134 Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale46 covale both ? E NAG . O4 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? E NAG 1 E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale47 covale both ? F NAG . O4 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? F NAG 1 F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale48 covale both ? G NAG . O4 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? G NAG 1 G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale49 covale both ? H NAG . O4 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? H NAG 1 H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale50 covale both ? I NAG . O4 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? I NAG 1 I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale51 covale both ? J NAG . O4 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? J NAG 1 J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale52 covale both ? K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? K NAG 1 K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale53 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? L NAG 1 L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale54 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? M NAG 1 M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale55 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? N NAG 1 N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale56 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? O NAG 1 O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale57 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? P NAG 1 P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale58 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? Q NAG 1 Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale59 covale both ? R NAG . O4 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? R NAG 1 R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale60 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? S NAG 1 S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale61 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? T NAG 1 T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? ? covale62 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? U NAG 1 U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? ? covale63 covale both ? V NAG . O4 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? V NAG 1 V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale64 covale both ? W NAG . O4 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? W NAG 1 W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale65 covale both ? X NAG . O4 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? X NAG 1 X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale66 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? Y NAG 1 Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale67 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? Z NAG 1 Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? metalc1 metalc ? ? D HIS 356 NE2 ? ? ? 1_555 XA ZN . ZN ? ? D HIS 374 D ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? ? metalc2 metalc ? ? D HIS 360 NE2 ? ? ? 1_555 XA ZN . ZN ? ? 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_em_admin.deposition_site PDBJ _em_admin.last_update 2024-10-30 _em_admin.map_release_date 2022-09-21 _em_admin.title 'Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Omicron spike protein (S-6P-RRAR) in complex with human ACE2 ectodomain (one-RBD-up state)' # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type NONE _em_ctf_correction.details ? # loop_ _em_entity_assembly_naturalsource.id _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id _em_entity_assembly_naturalsource.cell _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_naturalsource.organ _em_entity_assembly_naturalsource.organelle _em_entity_assembly_naturalsource.organism _em_entity_assembly_naturalsource.strain _em_entity_assembly_naturalsource.tissue 2 1 ? ? 2697049 ? ? 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