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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.533 ? 37248 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 7.715 ? 4090 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.045 ? 4489 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 4684 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7YBI _struct.title 'SARS-CoV-2 Mu variant spike (open state)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7YBI _struct_keywords.text 'SARS-CoV-2, Mu, spike, VIRAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 2 ? F N N 2 ? G N N 2 ? H N N 2 ? I N N 3 ? J N N 4 ? K N N 4 ? L N N 2 ? M N N 2 ? N N N 2 ? O N N 2 ? P N N 2 ? Q N N 2 ? R N N 2 ? S N N 3 ? T N N 4 ? U N N 4 ? V N N 2 ? W N N 2 ? X N N 2 ? Y N N 2 ? 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SER C 758 ALA C 783 1 ? 26 HELX_P HELX_P58 AG4 SER C 816 ? VAL C 826 ? SER C 816 VAL C 826 1 ? 11 HELX_P HELX_P59 AG5 THR C 866 ? THR C 883 ? THR C 866 THR C 883 1 ? 18 HELX_P HELX_P60 AG6 TRP C 886 ? ALA C 890 ? TRP C 886 ALA C 890 5 ? 5 HELX_P HELX_P61 AG7 PRO C 897 ? GLY C 910 ? PRO C 897 GLY C 910 1 ? 14 HELX_P HELX_P62 AG8 GLN C 913 ? ASN C 919 ? GLN C 913 ASN C 919 1 ? 7 HELX_P HELX_P63 AG9 ASN C 919 ? THR C 941 ? ASN C 919 THR C 941 1 ? 23 HELX_P HELX_P64 AH1 ALA C 942 ? ALA C 944 ? ALA C 942 ALA C 944 5 ? 3 HELX_P HELX_P65 AH2 LEU C 945 ? LEU C 966 ? LEU C 945 LEU C 966 1 ? 22 HELX_P HELX_P66 AH3 VAL C 976 ? LEU C 984 ? VAL C 976 LEU C 984 1 ? 9 HELX_P HELX_P67 AH4 ASP C 985 ? CYS C 1032 ? ASP C 985 CYS C 1032 1 ? 48 HELX_P HELX_P68 AH5 THR C 1116 ? ASP C 1118 ? THR C 1116 ASP C 1118 5 ? 3 HELX_P HELX_P69 AH6 PRO C 1140 ? HIS C 1159 ? PRO C 1140 HIS C 1159 1 ? 20 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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A CYS 662 SG ? ? ? 1_555 A CYS 671 SG ? ? A CYS 662 A CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf11 disulf ? ? A CYS 738 SG ? ? ? 1_555 A CYS 760 SG ? ? A CYS 738 A CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf12 disulf ? ? A CYS 743 SG ? ? ? 1_555 A CYS 749 SG ? ? A CYS 743 A CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf13 disulf ? ? A CYS 1032 SG ? ? ? 1_555 A CYS 1043 SG ? ? A CYS 1032 A CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf14 disulf ? ? A CYS 1082 SG ? ? ? 1_555 A CYS 1126 SG ? ? A CYS 1082 A CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf15 disulf ? ? B CYS 15 SG ? ? ? 1_555 B CYS 136 SG ? ? B CYS 15 B CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf16 disulf ? ? B CYS 131 SG ? ? ? 1_555 B CYS 166 SG ? ? B CYS 131 B CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf17 disulf ? ? B CYS 291 SG ? ? ? 1_555 B CYS 301 SG ? ? B CYS 291 B CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf18 disulf ? ? B CYS 336 SG ? ? ? 1_555 B CYS 361 SG ? ? B CYS 336 B CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf19 disulf ? ? B CYS 379 SG ? ? ? 1_555 B CYS 432 SG ? ? B CYS 379 B CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf20 disulf ? ? B CYS 391 SG ? ? ? 1_555 B CYS 525 SG ? ? B CYS 391 B CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf21 disulf ? ? B CYS 480 SG ? ? ? 1_555 B CYS 488 SG ? ? B CYS 480 B CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf22 disulf ? ? B CYS 538 SG ? ? ? 1_555 B CYS 590 SG ? ? B CYS 538 B CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf23 disulf ? ? B CYS 617 SG ? ? ? 1_555 B CYS 649 SG ? ? B CYS 617 B CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf24 disulf ? ? B CYS 662 SG ? ? ? 1_555 B CYS 671 SG ? ? B CYS 662 B CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf25 disulf ? ? B CYS 738 SG ? ? ? 1_555 B CYS 760 SG ? ? B CYS 738 B CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf26 disulf ? ? B CYS 743 SG ? ? ? 1_555 B CYS 749 SG ? ? B CYS 743 B CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf27 disulf ? ? B CYS 1032 SG ? ? ? 1_555 B CYS 1043 SG ? ? B CYS 1032 B CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? ? disulf28 disulf ? ? B CYS 1082 SG ? ? ? 1_555 B CYS 1126 SG ? ? B CYS 1082 B CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf29 disulf ? ? C CYS 15 SG ? ? ? 1_555 C CYS 136 SG ? ? C CYS 15 C CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf30 disulf ? ? C CYS 131 SG ? ? ? 1_555 C CYS 166 SG ? ? C CYS 131 C CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf31 disulf ? ? C CYS 291 SG ? ? ? 1_555 C CYS 301 SG ? ? C CYS 291 C CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf32 disulf ? ? C CYS 336 SG ? ? ? 1_555 C CYS 361 SG ? ? C CYS 336 C CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf33 disulf ? ? C CYS 379 SG ? ? ? 1_555 C CYS 432 SG ? ? C CYS 379 C CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf34 disulf ? ? C CYS 391 SG ? ? ? 1_555 C CYS 525 SG ? ? C CYS 391 C CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf35 disulf ? ? C CYS 480 SG ? ? ? 1_555 C CYS 488 SG ? ? C CYS 480 C CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf36 disulf ? ? C CYS 538 SG ? ? ? 1_555 C CYS 590 SG ? ? C CYS 538 C CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf37 disulf ? ? C CYS 617 SG ? ? ? 1_555 C CYS 649 SG ? ? C CYS 617 C CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf38 disulf ? ? C CYS 662 SG ? ? ? 1_555 C CYS 671 SG ? ? C CYS 662 C CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf39 disulf ? ? C CYS 738 SG ? ? ? 1_555 C CYS 760 SG ? ? C CYS 738 C CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf40 disulf ? ? C CYS 743 SG ? ? ? 1_555 C CYS 749 SG ? ? C CYS 743 C CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf41 disulf ? ? C CYS 1032 SG ? ? ? 1_555 C CYS 1043 SG ? ? C CYS 1032 C CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf42 disulf ? ? C CYS 1082 SG ? ? ? 1_555 C CYS 1126 SG ? ? C CYS 1082 C CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? covale1 covale one ? A ASN 17 ND2 ? ? ? 1_555 D NAG . C1 ? ? A ASN 17 D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 61 ND2 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? A ASN 61 A NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 122 ND2 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? A ASN 122 A NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? A ASN 149 ND2 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? A ASN 149 A NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? A ASN 165 ND2 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? A ASN 165 A NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? A ASN 282 ND2 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? A ASN 282 A NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? A ASN 331 ND2 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? A ASN 331 E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? A ASN 603 ND2 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? A ASN 603 A NAG 1408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? A ASN 616 ND2 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? A ASN 616 F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? A ASN 657 ND2 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? A ASN 657 A NAG 1409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? A ASN 709 ND2 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? A ASN 709 A NAG 1410 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? A ASN 717 ND2 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? A ASN 717 G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? A ASN 801 ND2 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? A ASN 801 H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? A ASN 1074 ND2 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? A ASN 1074 I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? A ASN 1098 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? A ASN 1098 J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? A ASN 1134 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? A ASN 1134 K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? A ASN 1158 ND2 ? ? ? 1_555 QA NAG . C1 ? ? A ASN 1158 A NAG 1411 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale18 covale one ? B ASN 17 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? B ASN 17 L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale19 covale one ? B ASN 61 ND2 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? B ASN 61 B NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale20 covale one ? B ASN 122 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? B ASN 122 M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale21 covale one ? B ASN 149 ND2 ? ? ? 1_555 SA NAG . C1 ? ? B ASN 149 B NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale22 covale one ? B ASN 165 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? B ASN 165 N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? N-Glycosylation covale23 covale one ? B ASN 234 ND2 ? ? ? 1_555 TA NAG . C1 ? ? B ASN 234 B NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale24 covale one ? B ASN 282 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? B ASN 282 O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale25 covale one ? B ASN 331 ND2 ? ? ? 1_555 UA NAG . C1 ? ? B ASN 331 B NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? N-Glycosylation covale26 covale one ? B ASN 343 ND2 ? ? ? 1_555 VA NAG . C1 ? ? B ASN 343 B NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale27 covale one ? B ASN 603 ND2 ? ? ? 1_555 WA NAG . C1 ? ? B ASN 603 B NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale28 covale one ? B ASN 616 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? B ASN 616 P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale29 covale one ? B ASN 657 ND2 ? ? ? 1_555 XA NAG . C1 ? ? B ASN 657 B NAG 1407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale30 covale one ? B ASN 709 ND2 ? ? ? 1_555 YA NAG . C1 ? ? B ASN 709 B NAG 1408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale31 covale one ? B ASN 717 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? B ASN 717 Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale32 covale one ? B ASN 801 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? B ASN 801 R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale33 covale one ? B ASN 1074 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? B ASN 1074 S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale34 covale one ? B ASN 1098 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? B ASN 1098 T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale35 covale one ? B ASN 1134 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? B ASN 1134 U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale36 covale one ? B ASN 1158 ND2 ? ? ? 1_555 ZA NAG . C1 ? ? B ASN 1158 B NAG 1409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale37 covale one ? C ASN 17 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? C ASN 17 V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale38 covale one ? C ASN 61 ND2 ? ? ? 1_555 AB NAG . C1 ? ? C ASN 61 C NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? N-Glycosylation covale39 covale one ? C ASN 149 ND2 ? ? ? 1_555 BB NAG . C1 ? ? C ASN 149 C NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? N-Glycosylation covale40 covale one ? C ASN 165 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? C ASN 165 X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? N-Glycosylation covale41 covale one ? C ASN 234 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? C ASN 234 Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale42 covale one ? C ASN 282 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? C ASN 282 Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.463 ? N-Glycosylation covale43 covale one ? C ASN 331 ND2 ? ? ? 1_555 CB NAG . C1 ? ? C ASN 331 C NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? N-Glycosylation covale44 covale one ? C ASN 603 ND2 ? ? ? 1_555 EB NAG . C1 ? ? C ASN 603 C NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale45 covale one ? C ASN 616 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? C ASN 616 a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale46 covale one ? C ASN 657 ND2 ? ? ? 1_555 FB NAG . C1 ? ? C ASN 657 C NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale47 covale one ? C ASN 709 ND2 ? ? ? 1_555 GB NAG . C1 ? ? C ASN 709 C NAG 1407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale48 covale one ? 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