HEADER VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM 01-JUL-22 7YCN TITLE CRYSTAL STRUCTURE OF SARS-COV-2 SPIKE RBD IN COMPLEX WITH IY-2A FAB COMPND MOL_ID: 1; COMPND 2 MOLECULE: SPIKE PROTEIN S1; COMPND 3 CHAIN: J, A, B, G; COMPND 4 SYNONYM: S GLYCOPROTEIN,E2,PEPLOMER PROTEIN; COMPND 5 ENGINEERED: YES; COMPND 6 MOL_ID: 2; COMPND 7 MOLECULE: IY-2A FAB HEAVY CHAIN; COMPND 8 CHAIN: K, E, C, H; COMPND 9 ENGINEERED: YES; COMPND 10 MOL_ID: 3; COMPND 11 MOLECULE: IY-2A FAB LIGHT CHAIN; COMPND 12 CHAIN: L, F, D, I; COMPND 13 ENGINEERED: YES SOURCE MOL_ID: 1; SOURCE 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: SEVERE ACUTE RESPIRATORY SYNDROME CORONAVIRUS SOURCE 3 2; SOURCE 4 ORGANISM_COMMON: 2019-NCOV,SARS-COV-2; SOURCE 5 ORGANISM_TAXID: 2697049; SOURCE 6 GENE: S, 2; SOURCE 7 EXPRESSION_SYSTEM: HOMO SAPIENS; SOURCE 8 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID: 9606; SOURCE 9 MOL_ID: 2; SOURCE 10 ORGANISM_SCIENTIFIC: HOMO SAPIENS; SOURCE 11 ORGANISM_COMMON: HUMAN; SOURCE 12 ORGANISM_TAXID: 9606; SOURCE 13 EXPRESSION_SYSTEM: HOMO SAPIENS; SOURCE 14 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID: 9606; SOURCE 15 MOL_ID: 3; SOURCE 16 ORGANISM_SCIENTIFIC: HOMO SAPIENS; SOURCE 17 ORGANISM_COMMON: HUMAN; SOURCE 18 ORGANISM_TAXID: 9606; SOURCE 19 EXPRESSION_SYSTEM: HOMO SAPIENS; SOURCE 20 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID: 9606 KEYWDS ANTIBODY, SARS-COV-2, SPIKE, RBD, CLASS 4, VIRAL PROTEIN-IMMUNE KEYWDS 2 SYSTEM COMPLEX EXPDTA X-RAY DIFFRACTION AUTHOR A.MOHAPATRA,X.CHEN REVDAT 3 20-NOV-24 7YCN 1 REMARK REVDAT 2 29-NOV-23 7YCN 1 REMARK REVDAT 1 01-FEB-23 7YCN 0 JRNL AUTH K.A.HUANG,X.CHEN,A.MOHAPATRA,H.T.V.NGUYEN,L.SCHIMANSKI, JRNL AUTH 2 T.K.TAN,P.RIJAL,S.K.VESTER,R.A.HILLS,M.HOWARTH,J.R.KEEFFE, JRNL AUTH 3 A.A.COHEN,L.M.KAKUTANI,Y.M.WU,M.SHAHED-AL-MAHMUD,Y.C.CHOU, JRNL AUTH 4 P.J.BJORKMAN,A.R.TOWNSEND,C.MA JRNL TITL STRUCTURAL BASIS FOR A CONSERVED NEUTRALIZATION EPITOPE ON JRNL TITL 2 THE RECEPTOR-BINDING DOMAIN OF SARS-COV-2. JRNL REF NAT COMMUN V. 14 311 2023 JRNL REFN ESSN 2041-1723 JRNL PMID 36658148 JRNL DOI 10.1038/S41467-023-35949-8 REMARK 2 REMARK 2 RESOLUTION. 2.85 ANGSTROMS. REMARK 3 REMARK 3 REFINEMENT. REMARK 3 PROGRAM : PHENIX 1.19.2_4158 REMARK 3 AUTHORS : PAUL ADAMS,PAVEL AFONINE,VINCENT CHEN,IAN REMARK 3 : DAVIS,KRESHNA GOPAL,RALF GROSSE-KUNSTLEVE, REMARK 3 : LI-WEI HUNG,ROBERT IMMORMINO,TOM IOERGER, REMARK 3 : AIRLIE MCCOY,ERIK MCKEE,NIGEL MORIARTY, REMARK 3 : REETAL PAI,RANDY READ,JANE RICHARDSON, REMARK 3 : DAVID RICHARDSON,TOD ROMO,JIM SACCHETTINI, REMARK 3 : NICHOLAS SAUTER,JACOB SMITH,LAURENT REMARK 3 : STORONI,TOM TERWILLIGER,PETER ZWART REMARK 3 REMARK 3 REFINEMENT TARGET : ML REMARK 3 REMARK 3 DATA USED IN REFINEMENT. REMARK 3 RESOLUTION RANGE HIGH (ANGSTROMS) : 2.85 REMARK 3 RESOLUTION RANGE LOW (ANGSTROMS) : 33.64 REMARK 3 MIN(FOBS/SIGMA_FOBS) : 1.350 REMARK 3 COMPLETENESS FOR RANGE (%) : 99.9 REMARK 3 NUMBER OF REFLECTIONS : 94117 REMARK 3 REMARK 3 FIT TO DATA USED IN REFINEMENT. REMARK 3 R VALUE (WORKING + TEST SET) : 0.213 REMARK 3 R VALUE (WORKING SET) : 0.211 REMARK 3 FREE R VALUE : 0.250 REMARK 3 FREE R VALUE TEST SET SIZE (%) : 4.980 REMARK 3 FREE R VALUE TEST SET COUNT : 4687 REMARK 3 REMARK 3 FIT TO DATA USED IN REFINEMENT (IN BINS). REMARK 3 BIN RESOLUTION RANGE COMPL. NWORK NFREE RWORK RFREE REMARK 3 1 33.6400 - 8.8100 1.00 3055 139 0.1714 0.2052 REMARK 3 2 8.8000 - 7.0100 1.00 3007 154 0.1557 0.2023 REMARK 3 3 7.0100 - 6.1300 1.00 3004 153 0.1652 0.1913 REMARK 3 4 6.1300 - 5.5700 1.00 2998 149 0.1546 0.1836 REMARK 3 5 5.5700 - 5.1700 1.00 3016 130 0.1475 0.1834 REMARK 3 6 5.1700 - 4.8700 1.00 2978 169 0.1434 0.1988 REMARK 3 7 4.8700 - 4.6300 1.00 2950 187 0.1489 0.1800 REMARK 3 8 4.6300 - 4.4300 1.00 3003 153 0.1539 0.1955 REMARK 3 9 4.4300 - 4.2600 1.00 2952 191 0.1591 0.2044 REMARK 3 10 4.2600 - 4.1100 1.00 2965 167 0.1729 0.2046 REMARK 3 11 4.1100 - 3.9800 1.00 2982 142 0.1920 0.2183 REMARK 3 12 3.9800 - 3.8700 1.00 2972 163 0.2306 0.2966 REMARK 3 13 3.8700 - 3.7700 1.00 3005 151 0.2271 0.3033 REMARK 3 14 3.7700 - 3.6700 1.00 2942 178 0.2396 0.2756 REMARK 3 15 3.6700 - 3.5900 1.00 2988 154 0.2565 0.3143 REMARK 3 16 3.5900 - 3.5100 1.00 2980 135 0.2427 0.3165 REMARK 3 17 3.5100 - 3.4400 1.00 2959 153 0.2732 0.3314 REMARK 3 18 3.4400 - 3.3800 1.00 2968 158 0.2761 0.2962 REMARK 3 19 3.3800 - 3.3200 1.00 3012 146 0.2674 0.3156 REMARK 3 20 3.3200 - 3.2600 1.00 3008 145 0.2721 0.3041 REMARK 3 21 3.2600 - 3.2100 1.00 2949 152 0.2766 0.3009 REMARK 3 22 3.2100 - 3.1600 1.00 2971 138 0.2906 0.3023 REMARK 3 23 3.1600 - 3.1100 1.00 3009 165 0.2966 0.3258 REMARK 3 24 3.1100 - 3.0700 1.00 2960 156 0.3173 0.3686 REMARK 3 25 3.0700 - 3.0300 1.00 2954 172 0.3081 0.3253 REMARK 3 26 3.0300 - 2.9900 1.00 2942 155 0.3157 0.3587 REMARK 3 27 2.9900 - 2.9500 1.00 2996 156 0.3222 0.3334 REMARK 3 28 2.9500 - 2.9200 1.00 2990 150 0.3332 0.3456 REMARK 3 29 2.9200 - 2.8800 1.00 2953 163 0.3314 0.3630 REMARK 3 30 2.8800 - 2.8500 1.00 2962 163 0.3243 0.3666 REMARK 3 REMARK 3 BULK SOLVENT MODELLING. REMARK 3 METHOD USED : FLAT BULK SOLVENT MODEL REMARK 3 SOLVENT RADIUS : 1.11 REMARK 3 SHRINKAGE RADIUS : 0.90 REMARK 3 K_SOL : NULL REMARK 3 B_SOL : NULL REMARK 3 REMARK 3 ERROR ESTIMATES. REMARK 3 COORDINATE ERROR (MAXIMUM-LIKELIHOOD BASED) : 0.440 REMARK 3 PHASE ERROR (DEGREES, MAXIMUM-LIKELIHOOD BASED) : 27.150 REMARK 3 REMARK 3 B VALUES. REMARK 3 FROM WILSON PLOT (A**2) : 55.01 REMARK 3 MEAN B VALUE (OVERALL, A**2) : 64.15 REMARK 3 OVERALL ANISOTROPIC B VALUE. REMARK 3 B11 (A**2) : NULL REMARK 3 B22 (A**2) : NULL REMARK 3 B33 (A**2) : NULL REMARK 3 B12 (A**2) : NULL REMARK 3 B13 (A**2) : NULL REMARK 3 B23 (A**2) : NULL REMARK 3 REMARK 3 TWINNING INFORMATION. REMARK 3 FRACTION: NULL REMARK 3 OPERATOR: NULL REMARK 3 REMARK 3 DEVIATIONS FROM IDEAL VALUES. REMARK 3 RMSD COUNT REMARK 3 BOND : NULL NULL REMARK 3 ANGLE : NULL NULL REMARK 3 CHIRALITY : NULL NULL REMARK 3 PLANARITY : NULL NULL REMARK 3 DIHEDRAL : NULL NULL REMARK 3 REMARK 3 TLS DETAILS REMARK 3 NUMBER OF TLS GROUPS : 1 REMARK 3 TLS GROUP : 1 REMARK 3 SELECTION: ALL REMARK 3 ORIGIN FOR THE GROUP (A): 45.2613 33.1567 -0.7999 REMARK 3 T TENSOR REMARK 3 T11: 0.3385 T22: 0.3591 REMARK 3 T33: 0.3931 T12: -0.0577 REMARK 3 T13: -0.0213 T23: 0.0166 REMARK 3 L TENSOR REMARK 3 L11: 0.0570 L22: 0.1319 REMARK 3 L33: 0.5516 L12: -0.0654 REMARK 3 L13: -0.0667 L23: 0.1173 REMARK 3 S TENSOR REMARK 3 S11: -0.0307 S12: 0.0307 S13: 0.0150 REMARK 3 S21: -0.0609 S22: -0.0008 S23: 0.0022 REMARK 3 S31: 0.0236 S32: -0.1683 S33: 0.0231 REMARK 3 REMARK 3 NCS DETAILS REMARK 3 NUMBER OF NCS GROUPS : 3 REMARK 3 NCS GROUP : 1 REMARK 3 NCS OPERATOR : 1 REMARK 3 REFERENCE SELECTION: (CHAIN A AND (RESID 334 THROUGH 345 OR REMARK 3 (RESID 346 AND (NAME N OR NAME CA OR NAME REMARK 3 C OR NAME O OR NAME CB )) OR RESID 347 REMARK 3 THROUGH 527)) REMARK 3 SELECTION : (CHAIN B AND RESID 334 THROUGH 527) REMARK 3 ATOM PAIRS NUMBER : 3651 REMARK 3 RMSD : NULL REMARK 3 NCS OPERATOR : 2 REMARK 3 REFERENCE SELECTION: (CHAIN A AND (RESID 334 THROUGH 345 OR REMARK 3 (RESID 346 AND (NAME N OR NAME CA OR NAME REMARK 3 C OR NAME O OR NAME CB )) OR RESID 347 REMARK 3 THROUGH 527)) REMARK 3 SELECTION : CHAIN G REMARK 3 ATOM PAIRS NUMBER : 3651 REMARK 3 RMSD : NULL REMARK 3 NCS OPERATOR : 3 REMARK 3 REFERENCE SELECTION: (CHAIN A AND (RESID 334 THROUGH 345 OR REMARK 3 (RESID 346 AND (NAME N OR NAME CA OR NAME REMARK 3 C OR NAME O OR NAME CB )) OR RESID 347 REMARK 3 THROUGH 527)) REMARK 3 SELECTION : (CHAIN J AND (RESID 334 THROUGH 345 OR REMARK 3 (RESID 346 AND (NAME N OR NAME CA OR NAME REMARK 3 C OR NAME O OR NAME CB )) OR RESID 347 REMARK 3 THROUGH 527)) REMARK 3 ATOM PAIRS NUMBER : 3651 REMARK 3 RMSD : NULL REMARK 3 NCS GROUP : 2 REMARK 3 NCS OPERATOR : 1 REMARK 3 REFERENCE SELECTION: (CHAIN C AND (RESID 1 THROUGH 74 OR REMARK 3 (RESID 75 AND (NAME N OR NAME CA OR NAME REMARK 3 C OR NAME O OR NAME CB )) OR RESID 76 REMARK 3 THROUGH 131 OR RESID 137 THROUGH 219)) REMARK 3 SELECTION : (CHAIN E AND (RESID 1 THROUGH 131 OR REMARK 3 RESID 137 THROUGH 219)) REMARK 3 ATOM PAIRS NUMBER : 3858 REMARK 3 RMSD : NULL REMARK 3 NCS OPERATOR : 2 REMARK 3 REFERENCE SELECTION: (CHAIN C AND (RESID 1 THROUGH 74 OR REMARK 3 (RESID 75 AND (NAME N OR NAME CA OR NAME REMARK 3 C OR NAME O OR NAME CB )) OR RESID 76 REMARK 3 THROUGH 131 OR RESID 137 THROUGH 219)) REMARK 3 SELECTION : (CHAIN H AND (RESID 1 THROUGH 74 OR REMARK 3 (RESID 75 AND (NAME N OR NAME CA OR NAME REMARK 3 C OR NAME O OR NAME CB )) OR RESID 76 REMARK 3 THROUGH 131 OR RESID 137 THROUGH 219)) REMARK 3 ATOM PAIRS NUMBER : 3858 REMARK 3 RMSD : NULL REMARK 3 NCS OPERATOR : 3 REMARK 3 REFERENCE SELECTION: (CHAIN C AND (RESID 1 THROUGH 74 OR REMARK 3 (RESID 75 AND (NAME N OR NAME CA OR NAME REMARK 3 C OR NAME O OR NAME CB )) OR RESID 76 REMARK 3 THROUGH 131 OR RESID 137 THROUGH 219)) REMARK 3 SELECTION : (CHAIN K AND (RESID 1 THROUGH 74 OR REMARK 3 (RESID 75 AND (NAME N OR NAME CA OR NAME REMARK 3 C OR NAME O OR NAME CB )) OR RESID 76 REMARK 3 THROUGH 131 OR RESID 137 THROUGH 219)) REMARK 3 ATOM PAIRS NUMBER : 3858 REMARK 3 RMSD : NULL REMARK 3 NCS GROUP : 3 REMARK 3 NCS OPERATOR : 1 REMARK 3 REFERENCE SELECTION: CHAIN D REMARK 3 SELECTION : (CHAIN F AND RESID 2 THROUGH 212) REMARK 3 ATOM PAIRS NUMBER : 3904 REMARK 3 RMSD : NULL REMARK 3 NCS OPERATOR : 2 REMARK 3 REFERENCE SELECTION: CHAIN D REMARK 3 SELECTION : (CHAIN I AND RESID 2 THROUGH 212) REMARK 3 ATOM PAIRS NUMBER : 3904 REMARK 3 RMSD : NULL REMARK 3 NCS OPERATOR : 3 REMARK 3 REFERENCE SELECTION: CHAIN D REMARK 3 SELECTION : CHAIN L REMARK 3 ATOM PAIRS NUMBER : 3904 REMARK 3 RMSD : NULL REMARK 3 REMARK 3 OTHER REFINEMENT REMARKS: NULL REMARK 4 REMARK 4 7YCN COMPLIES WITH FORMAT V. 3.30, 13-JUL-11 REMARK 100 REMARK 100 THIS ENTRY HAS BEEN PROCESSED BY PDBJ ON 12-JUL-22. REMARK 100 THE DEPOSITION ID IS D_1300030666. REMARK 200 REMARK 200 EXPERIMENTAL DETAILS REMARK 200 EXPERIMENT TYPE : X-RAY DIFFRACTION REMARK 200 DATE OF DATA COLLECTION : 14-MAR-22 REMARK 200 TEMPERATURE (KELVIN) : 100 REMARK 200 PH : 7.0 REMARK 200 NUMBER OF CRYSTALS USED : 1 REMARK 200 REMARK 200 SYNCHROTRON (Y/N) : Y REMARK 200 RADIATION SOURCE : NSRRC REMARK 200 BEAMLINE : BL15A1 REMARK 200 X-RAY GENERATOR MODEL : NULL REMARK 200 MONOCHROMATIC OR LAUE (M/L) : M REMARK 200 WAVELENGTH OR RANGE (A) : 1 REMARK 200 MONOCHROMATOR : NULL REMARK 200 OPTICS : NULL REMARK 200 REMARK 200 DETECTOR TYPE : CCD REMARK 200 DETECTOR MANUFACTURER : RAYONIX MX300HE REMARK 200 INTENSITY-INTEGRATION SOFTWARE : MOSFLM REMARK 200 DATA SCALING SOFTWARE : AIMLESS 0.7.4 REMARK 200 REMARK 200 NUMBER OF UNIQUE REFLECTIONS : 94154 REMARK 200 RESOLUTION RANGE HIGH (A) : 2.850 REMARK 200 RESOLUTION RANGE LOW (A) : 34.050 REMARK 200 REJECTION CRITERIA (SIGMA(I)) : NULL REMARK 200 REMARK 200 OVERALL. REMARK 200 COMPLETENESS FOR RANGE (%) : 99.9 REMARK 200 DATA REDUNDANCY : 3.800 REMARK 200 R MERGE (I) : 0.15100 REMARK 200 R SYM (I) : NULL REMARK 200 FOR THE DATA SET : 6.6000 REMARK 200 REMARK 200 IN THE HIGHEST RESOLUTION SHELL. REMARK 200 HIGHEST RESOLUTION SHELL, RANGE HIGH (A) : 2.85 REMARK 200 HIGHEST RESOLUTION SHELL, RANGE LOW (A) : 2.90 REMARK 200 COMPLETENESS FOR SHELL (%) : 100.0 REMARK 200 DATA REDUNDANCY IN SHELL : 3.70 REMARK 200 R MERGE FOR SHELL (I) : 0.71200 REMARK 200 R SYM FOR SHELL (I) : NULL REMARK 200 FOR SHELL : NULL REMARK 200 REMARK 200 DIFFRACTION PROTOCOL: SINGLE WAVELENGTH REMARK 200 METHOD USED TO DETERMINE THE STRUCTURE: MOLECULAR REPLACEMENT REMARK 200 SOFTWARE USED: PHASER REMARK 200 STARTING MODEL: 6ZER REMARK 200 REMARK 200 REMARK: NULL REMARK 280 REMARK 280 CRYSTAL REMARK 280 SOLVENT CONTENT, VS (%): 65.28 REMARK 280 MATTHEWS COEFFICIENT, VM (ANGSTROMS**3/DA): 3.54 REMARK 280 REMARK 280 CRYSTALLIZATION CONDITIONS: 0.2M AMMONIUM CITRATE TRIBASIC PH 7.0, REMARK 280 0.1M IMIDAZOLE PH 7.0, 20% W/V POLYETHYLENE GLYCOL MONOMETHYL REMARK 280 ETHER, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293.15K REMARK 290 REMARK 290 CRYSTALLOGRAPHIC SYMMETRY REMARK 290 SYMMETRY OPERATORS FOR SPACE GROUP: C 1 2 1 REMARK 290 REMARK 290 SYMOP SYMMETRY REMARK 290 NNNMMM OPERATOR REMARK 290 1555 X,Y,Z REMARK 290 2555 -X,Y,-Z REMARK 290 3555 X+1/2,Y+1/2,Z REMARK 290 4555 -X+1/2,Y+1/2,-Z REMARK 290 REMARK 290 WHERE NNN -> OPERATOR NUMBER REMARK 290 MMM -> TRANSLATION VECTOR REMARK 290 REMARK 290 CRYSTALLOGRAPHIC SYMMETRY TRANSFORMATIONS REMARK 290 THE FOLLOWING TRANSFORMATIONS OPERATE ON THE ATOM/HETATM REMARK 290 RECORDS IN THIS ENTRY TO PRODUCE CRYSTALLOGRAPHICALLY REMARK 290 RELATED MOLECULES. REMARK 290 SMTRY1 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 REMARK 290 SMTRY2 1 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 REMARK 290 SMTRY3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 REMARK 290 SMTRY1 2 -1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 REMARK 290 SMTRY2 2 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 REMARK 290 SMTRY3 2 0.000000 0.000000 -1.000000 0.00000 REMARK 290 SMTRY1 3 1.000000 0.000000 0.000000 96.50950 REMARK 290 SMTRY2 3 0.000000 1.000000 0.000000 112.57500 REMARK 290 SMTRY3 3 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 REMARK 290 SMTRY1 4 -1.000000 0.000000 0.000000 96.50950 REMARK 290 SMTRY2 4 0.000000 1.000000 0.000000 112.57500 REMARK 290 SMTRY3 4 0.000000 0.000000 -1.000000 0.00000 REMARK 290 REMARK 290 REMARK: NULL REMARK 300 REMARK 300 BIOMOLECULE: 1, 2, 3, 4 REMARK 300 SEE REMARK 350 FOR THE AUTHOR PROVIDED AND/OR PROGRAM REMARK 300 GENERATED ASSEMBLY INFORMATION FOR THE STRUCTURE IN REMARK 300 THIS ENTRY. THE REMARK MAY ALSO PROVIDE INFORMATION ON REMARK 300 BURIED SURFACE AREA. REMARK 350 REMARK 350 COORDINATES FOR A COMPLETE MULTIMER REPRESENTING THE KNOWN REMARK 350 BIOLOGICALLY SIGNIFICANT OLIGOMERIZATION STATE OF THE REMARK 350 MOLECULE CAN BE GENERATED BY APPLYING BIOMT TRANSFORMATIONS REMARK 350 GIVEN BELOW. BOTH NON-CRYSTALLOGRAPHIC AND REMARK 350 CRYSTALLOGRAPHIC OPERATIONS ARE GIVEN. REMARK 350 REMARK 350 BIOMOLECULE: 1 REMARK 350 AUTHOR DETERMINED BIOLOGICAL UNIT: TRIMERIC REMARK 350 SOFTWARE DETERMINED QUATERNARY STRUCTURE: TRIMERIC REMARK 350 SOFTWARE USED: PISA REMARK 350 TOTAL BURIED SURFACE AREA: 5580 ANGSTROM**2 REMARK 350 SURFACE AREA OF THE COMPLEX: 28390 ANGSTROM**2 REMARK 350 CHANGE IN SOLVENT FREE ENERGY: -33.0 KCAL/MOL REMARK 350 APPLY THE FOLLOWING TO CHAINS: J, K, L REMARK 350 BIOMT1 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 REMARK 350 BIOMT2 1 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 REMARK 350 BIOMT3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 REMARK 350 REMARK 350 BIOMOLECULE: 2 REMARK 350 AUTHOR DETERMINED BIOLOGICAL UNIT: TRIMERIC REMARK 350 SOFTWARE DETERMINED QUATERNARY STRUCTURE: TRIMERIC REMARK 350 SOFTWARE USED: PISA REMARK 350 TOTAL BURIED SURFACE AREA: 5510 ANGSTROM**2 REMARK 350 SURFACE AREA OF THE COMPLEX: 28360 ANGSTROM**2 REMARK 350 CHANGE IN SOLVENT FREE ENERGY: -35.0 KCAL/MOL REMARK 350 APPLY THE FOLLOWING TO CHAINS: A, E, F REMARK 350 BIOMT1 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 REMARK 350 BIOMT2 1 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 REMARK 350 BIOMT3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 REMARK 350 REMARK 350 BIOMOLECULE: 3 REMARK 350 AUTHOR DETERMINED BIOLOGICAL UNIT: TRIMERIC REMARK 350 SOFTWARE DETERMINED QUATERNARY STRUCTURE: TRIMERIC REMARK 350 SOFTWARE USED: PISA REMARK 350 TOTAL BURIED SURFACE AREA: 5730 ANGSTROM**2 REMARK 350 SURFACE AREA OF THE COMPLEX: 28360 ANGSTROM**2 REMARK 350 CHANGE IN SOLVENT FREE ENERGY: -31.0 KCAL/MOL REMARK 350 APPLY THE FOLLOWING TO CHAINS: B, C, D REMARK 350 BIOMT1 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 REMARK 350 BIOMT2 1 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 REMARK 350 BIOMT3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 REMARK 350 REMARK 350 BIOMOLECULE: 4 REMARK 350 AUTHOR DETERMINED BIOLOGICAL UNIT: TRIMERIC REMARK 350 SOFTWARE DETERMINED QUATERNARY STRUCTURE: TRIMERIC REMARK 350 SOFTWARE USED: PISA REMARK 350 TOTAL BURIED SURFACE AREA: 5510 ANGSTROM**2 REMARK 350 SURFACE AREA OF THE COMPLEX: 28170 ANGSTROM**2 REMARK 350 CHANGE IN SOLVENT FREE ENERGY: -37.0 KCAL/MOL REMARK 350 APPLY THE FOLLOWING TO CHAINS: G, H, I REMARK 350 BIOMT1 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 REMARK 350 BIOMT2 1 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 REMARK 350 BIOMT3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 REMARK 465 REMARK 465 MISSING RESIDUES REMARK 465 THE FOLLOWING RESIDUES WERE NOT LOCATED IN THE REMARK 465 EXPERIMENT. (M=MODEL NUMBER; RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN REMARK 465 IDENTIFIER; SSSEQ=SEQUENCE NUMBER; I=INSERTION CODE.) REMARK 465 REMARK 465 M RES C SSSEQI REMARK 465 THR J 333 REMARK 465 SER K 130 REMARK 465 THR K 131 REMARK 465 SER K 132 REMARK 465 SER K 215 REMARK 465 CYS K 216 REMARK 465 ASP K 217 REMARK 465 LYS K 218 REMARK 465 THR K 219 REMARK 465 HIS K 220 REMARK 465 ALA L 1 REMARK 465 THR L 209 REMARK 465 GLU L 210 REMARK 465 CYS L 211 REMARK 465 THR A 333 REMARK 465 SER E 128 REMARK 465 LYS E 129 REMARK 465 SER E 130 REMARK 465 CYS E 220 REMARK 465 ASP E 221 REMARK 465 LYS E 222 REMARK 465 THR E 223 REMARK 465 HIS E 224 REMARK 465 ALA F 1 REMARK 465 THR B 333 REMARK 465 CYS C 220 REMARK 465 ASP C 221 REMARK 465 LYS C 222 REMARK 465 THR C 223 REMARK 465 HIS C 224 REMARK 465 ALA D 1 REMARK 465 THR D 209 REMARK 465 GLU D 210 REMARK 465 CYS D 211 REMARK 465 THR G 333 REMARK 465 THR H 131 REMARK 465 SER H 132 REMARK 465 CYS H 220 REMARK 465 ASP H 221 REMARK 465 LYS H 222 REMARK 465 THR H 223 REMARK 465 HIS H 224 REMARK 465 ALA I 1 REMARK 465 GLU I 212 REMARK 465 CYS I 213 REMARK 470 REMARK 470 MISSING ATOM REMARK 470 THE FOLLOWING RESIDUES HAVE MISSING ATOMS (M=MODEL NUMBER; REMARK 470 RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN IDENTIFIER; SSEQ=SEQUENCE NUMBER; REMARK 470 I=INSERTION CODE): REMARK 470 M RES CSSEQI ATOMS REMARK 470 GLN K 1 CG CD OE1 NE2 REMARK 470 GLN E 1 CG CD OE1 NE2 REMARK 470 LYS E 75 CG CD CE NZ REMARK 470 ARG B 346 CG CD NE CZ NH1 NH2 REMARK 470 GLN C 1 CG CD OE1 NE2 REMARK 470 ARG G 346 CG CD NE CZ NH1 NH2 REMARK 470 GLN H 1 CG CD OE1 NE2 REMARK 470 LYS H 129 CG CD CE NZ REMARK 500 REMARK 500 GEOMETRY AND STEREOCHEMISTRY REMARK 500 SUBTOPIC: CLOSE CONTACTS IN SAME ASYMMETRIC UNIT REMARK 500 REMARK 500 THE FOLLOWING ATOMS ARE IN CLOSE CONTACT. REMARK 500 REMARK 500 ATM1 RES C SSEQI ATM2 RES C SSEQI DISTANCE REMARK 500 O VAL K 100B OH TYR L 91 1.96 REMARK 500 O VAL C 100B OH TYR D 91 2.01 REMARK 500 O SER H 130 N GLY H 133 2.08 REMARK 500 O VAL H 100B OH TYR I 91 2.11 REMARK 500 REMARK 500 REMARK: NULL REMARK 500 REMARK 500 GEOMETRY AND STEREOCHEMISTRY REMARK 500 SUBTOPIC: CLOSE CONTACTS REMARK 500 REMARK 500 THE FOLLOWING ATOMS THAT ARE RELATED BY CRYSTALLOGRAPHIC REMARK 500 SYMMETRY ARE IN CLOSE CONTACT. AN ATOM LOCATED WITHIN 0.15 REMARK 500 ANGSTROMS OF A SYMMETRY RELATED ATOM IS ASSUMED TO BE ON A REMARK 500 SPECIAL POSITION AND IS, THEREFORE, LISTED IN REMARK 375 REMARK 500 INSTEAD OF REMARK 500. ATOMS WITH NON-BLANK ALTERNATE REMARK 500 LOCATION INDICATORS ARE NOT INCLUDED IN THE CALCULATIONS. REMARK 500 REMARK 500 DISTANCE CUTOFF: REMARK 500 2.2 ANGSTROMS FOR CONTACTS NOT INVOLVING HYDROGEN ATOMS REMARK 500 1.6 ANGSTROMS FOR CONTACTS INVOLVING HYDROGEN ATOMS REMARK 500 REMARK 500 ATM1 RES C SSEQI ATM2 RES C SSEQI SSYMOP DISTANCE REMARK 500 OG SER C 130 OH TYR G 449 1556 1.94 REMARK 500 REMARK 500 REMARK: NULL REMARK 500 REMARK 500 GEOMETRY AND STEREOCHEMISTRY REMARK 500 SUBTOPIC: TORSION ANGLES REMARK 500 REMARK 500 TORSION ANGLES OUTSIDE THE EXPECTED RAMACHANDRAN REGIONS: REMARK 500 (M=MODEL NUMBER; RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN IDENTIFIER; REMARK 500 SSEQ=SEQUENCE NUMBER; I=INSERTION CODE). REMARK 500 REMARK 500 STANDARD TABLE: REMARK 500 FORMAT:(10X,I3,1X,A3,1X,A1,I4,A1,4X,F7.2,3X,F7.2) REMARK 500 REMARK 500 EXPECTED VALUES: GJ KLEYWEGT AND TA JONES (1996). PHI/PSI- REMARK 500 CHOLOGY: RAMACHANDRAN REVISITED. STRUCTURE 4, 1395 - 1400 REMARK 500 REMARK 500 M RES CSSEQI PSI PHI REMARK 500 PRO J 337 49.86 -84.30 REMARK 500 ALA J 352 51.56 -107.10 REMARK 500 ASN J 422 -51.34 -131.83 REMARK 500 ASP J 428 34.62 -97.27 REMARK 500 ASN J 481 44.85 -96.17 REMARK 500 LEU J 517 59.42 -140.62 REMARK 500 ALA K 9 -121.84 32.32 REMARK 500 SER K 15 -13.38 81.98 REMARK 500 SER K 128 118.11 -22.61 REMARK 500 ASP K 144 70.76 60.82 REMARK 500 PHE K 146 135.48 -171.09 REMARK 500 SER K 161 -73.50 -75.66 REMARK 500 SER K 188 41.63 -86.70 REMARK 500 ASP L 51 -47.33 70.77 REMARK 500 ASN L 52 10.19 -149.71 REMARK 500 SER L 90 -147.25 -139.19 REMARK 500 ALA L 157 -72.62 -83.72 REMARK 500 SER L 190 126.91 -170.80 REMARK 500 GLU L 198 -112.48 51.86 REMARK 500 PRO A 337 49.43 -86.38 REMARK 500 ALA A 352 52.86 -109.03 REMARK 500 SER A 373 52.00 -90.98 REMARK 500 PHE A 400 -168.79 -167.77 REMARK 500 ASP A 428 39.03 -99.24 REMARK 500 HIS A 519 -18.28 72.22 REMARK 500 ALA E 9 -124.60 33.38 REMARK 500 SER E 15 -13.65 80.87 REMARK 500 ALA E 114 125.20 -39.56 REMARK 500 SER E 132 -71.50 -60.91 REMARK 500 ASP E 144 74.43 59.53 REMARK 500 SER E 161 -73.66 -79.30 REMARK 500 PHE F 3 68.36 34.64 REMARK 500 ASP F 51 -49.10 70.70 REMARK 500 ASN F 52 10.45 -148.38 REMARK 500 SER F 90 -149.04 -136.26 REMARK 500 ALA F 157 -70.16 -88.71 REMARK 500 SER F 190 135.11 -170.46 REMARK 500 GLU F 198 -115.99 51.56 REMARK 500 ASN B 343 33.84 -98.36 REMARK 500 ALA B 352 52.22 -105.45 REMARK 500 SER B 373 58.31 -91.24 REMARK 500 ASP B 428 38.43 -99.10 REMARK 500 CYS B 480 -48.09 74.31 REMARK 500 HIS B 519 32.07 -98.16 REMARK 500 SER C 15 -13.04 85.07 REMARK 500 GLU C 16 -169.93 -74.13 REMARK 500 THR C 116 108.51 -44.29 REMARK 500 SER C 128 56.77 35.52 REMARK 500 ASP C 144 70.53 59.84 REMARK 500 PHE C 146 138.43 -171.13 REMARK 500 REMARK 500 THIS ENTRY HAS 75 RAMACHANDRAN OUTLIERS. REMARK 500 REMARK 500 REMARK: NULL DBREF 7YCN J 333 527 UNP P0DTC2 SPIKE_SARS2 333 527 DBREF 7YCN K 1 220 PDB 7YCN 7YCN 1 220 DBREF 7YCN L 1 211 PDB 7YCN 7YCN 1 211 DBREF 7YCN A 333 527 UNP P0DTC2 SPIKE_SARS2 333 527 DBREF 7YCN E 1 224 PDB 7YCN 7YCN 1 224 DBREF 7YCN F 1 215 PDB 7YCN 7YCN 1 215 DBREF 7YCN B 333 527 UNP P0DTC2 SPIKE_SARS2 333 527 DBREF 7YCN C 1 224 PDB 7YCN 7YCN 1 224 DBREF 7YCN D 1 211 PDB 7YCN 7YCN 1 211 DBREF 7YCN G 333 527 UNP P0DTC2 SPIKE_SARS2 333 527 DBREF 7YCN H 1 224 PDB 7YCN 7YCN 1 224 DBREF 7YCN I 1 213 PDB 7YCN 7YCN 1 213 SEQRES 1 J 195 THR ASN LEU CYS PRO PHE GLY GLU VAL PHE ASN ALA THR SEQRES 2 J 195 ARG PHE ALA SER VAL TYR ALA TRP ASN ARG LYS ARG ILE SEQRES 3 J 195 SER ASN CYS VAL ALA ASP TYR SER VAL LEU TYR ASN SER SEQRES 4 J 195 ALA SER PHE SER THR PHE LYS CYS TYR GLY VAL SER PRO SEQRES 5 J 195 THR LYS LEU ASN ASP LEU CYS PHE THR ASN VAL TYR ALA SEQRES 6 J 195 ASP SER PHE VAL ILE ARG GLY ASP GLU VAL ARG GLN ILE SEQRES 7 J 195 ALA PRO GLY GLN THR GLY LYS ILE ALA ASP TYR ASN TYR SEQRES 8 J 195 LYS LEU PRO ASP ASP PHE THR GLY CYS VAL ILE ALA TRP SEQRES 9 J 195 ASN SER ASN ASN LEU ASP SER LYS VAL GLY GLY ASN TYR SEQRES 10 J 195 ASN TYR LEU TYR ARG LEU PHE ARG LYS SER ASN LEU LYS SEQRES 11 J 195 PRO PHE GLU ARG ASP ILE SER THR GLU ILE TYR GLN ALA SEQRES 12 J 195 GLY SER THR PRO CYS ASN GLY VAL GLU GLY PHE ASN CYS SEQRES 13 J 195 TYR PHE PRO LEU GLN SER TYR GLY PHE GLN PRO THR ASN SEQRES 14 J 195 GLY VAL GLY TYR GLN PRO TYR ARG VAL VAL VAL LEU SER SEQRES 15 J 195 PHE GLU LEU LEU HIS ALA PRO ALA THR VAL CYS GLY PRO SEQRES 1 K 228 GLN VAL GLN LEU VAL GLU TRP GLY ALA GLY LEU LEU LYS SEQRES 2 K 228 PRO SER GLU THR LEU SER LEU THR CYS ALA VAL TYR GLY SEQRES 3 K 228 GLY SER PHE SER GLY TYR TYR TRP SER TRP ILE ARG GLN SEQRES 4 K 228 PRO PRO GLY LYS GLY LEU GLU TRP ILE GLY LEU ILE ASN SEQRES 5 K 228 HIS SER GLY SER THR ASN TYR ASN PRO SER LEU LYS SER SEQRES 6 K 228 ARG VAL THR ILE SER LEU ASP THR SER LYS ASN GLN PHE SEQRES 7 K 228 SER LEU LYS LEU 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PRO THR THR VAL ILE TYR GLU SEQRES 5 L 216 ASP ASN GLN ARG PRO SER GLY VAL PRO ASP ARG PHE SER SEQRES 6 L 216 GLY SER ILE ASP SER SER SER ASN SER ALA SER LEU THR SEQRES 7 L 216 ILE SER GLY LEU ARG THR GLU ASP GLU ALA ASP TYR TYR SEQRES 8 L 216 CYS GLN SER TYR ASP SER GLY ILE TRP VAL PHE GLY GLY SEQRES 9 L 216 GLY THR LYS LEU THR VAL LEU GLY GLN PRO LYS ALA ALA SEQRES 10 L 216 PRO SER VAL THR LEU PHE PRO PRO SER SER GLU GLU LEU SEQRES 11 L 216 GLN ALA ASN LYS ALA THR LEU VAL CYS LEU ILE SER ASP SEQRES 12 L 216 PHE TYR PRO GLY ALA VAL THR VAL ALA TRP LYS ALA ASP SEQRES 13 L 216 SER SER PRO VAL LYS ALA GLY VAL GLU THR THR THR PRO SEQRES 14 L 216 SER LYS GLN SER ASN ASN LYS TYR ALA ALA SER SER TYR SEQRES 15 L 216 LEU SER LEU THR PRO GLU GLN TRP LYS SER HIS ARG SER SEQRES 16 L 216 TYR SER CYS GLN VAL THR HIS GLU GLY SER THR VAL GLU SEQRES 17 L 216 LYS THR VAL ALA PRO THR GLU CYS SEQRES 1 A 195 THR ASN LEU CYS PRO PHE GLY GLU VAL PHE ASN ALA THR SEQRES 2 A 195 ARG PHE ALA SER VAL TYR ALA TRP ASN ARG LYS ARG ILE SEQRES 3 A 195 SER ASN CYS VAL ALA ASP TYR SER VAL LEU TYR ASN SER SEQRES 4 A 195 ALA SER PHE SER THR PHE LYS CYS TYR GLY VAL SER PRO SEQRES 5 A 195 THR LYS LEU ASN ASP LEU CYS PHE THR ASN VAL TYR ALA SEQRES 6 A 195 ASP SER PHE VAL ILE ARG GLY ASP GLU VAL ARG GLN ILE SEQRES 7 A 195 ALA PRO GLY GLN THR GLY LYS ILE ALA ASP TYR ASN TYR SEQRES 8 A 195 LYS LEU PRO ASP ASP PHE THR GLY CYS VAL ILE ALA TRP SEQRES 9 A 195 ASN SER ASN ASN LEU ASP SER LYS VAL GLY GLY ASN TYR SEQRES 10 A 195 ASN TYR LEU TYR ARG LEU PHE ARG LYS SER ASN LEU LYS SEQRES 11 A 195 PRO PHE GLU ARG ASP ILE SER THR GLU ILE TYR GLN ALA SEQRES 12 A 195 GLY SER THR PRO CYS ASN GLY VAL GLU GLY PHE ASN CYS SEQRES 13 A 195 TYR PHE PRO LEU GLN SER TYR GLY PHE GLN PRO THR ASN SEQRES 14 A 195 GLY VAL GLY TYR GLN PRO TYR ARG VAL VAL VAL LEU SER SEQRES 15 A 195 PHE GLU LEU LEU HIS ALA PRO ALA THR VAL CYS GLY PRO SEQRES 1 E 228 GLN VAL GLN LEU VAL GLU TRP GLY ALA GLY LEU LEU LYS SEQRES 2 E 228 PRO SER GLU THR LEU SER LEU THR CYS ALA VAL TYR GLY SEQRES 3 E 228 GLY SER PHE SER GLY TYR TYR TRP SER TRP ILE ARG GLN SEQRES 4 E 228 PRO PRO GLY LYS GLY LEU GLU TRP ILE GLY LEU ILE ASN SEQRES 5 E 228 HIS SER GLY SER THR ASN TYR ASN PRO SER LEU LYS SER SEQRES 6 E 228 ARG VAL THR ILE SER LEU ASP THR SER LYS ASN GLN PHE SEQRES 7 E 228 SER LEU LYS LEU THR SER VAL THR ALA ALA ASP THR ALA SEQRES 8 E 228 VAL TYR TYR CYS ALA ARG GLY LEU GLY ILE PHE GLY VAL SEQRES 9 E 228 VAL THR LEU SER ASP VAL TRP GLY GLN GLY THR THR VAL SEQRES 10 E 228 THR VAL SER SER ALA SER THR LYS GLY PRO SER VAL PHE SEQRES 11 E 228 PRO LEU ALA PRO SER SER LYS SER THR SER GLY GLY THR SEQRES 12 E 228 ALA ALA LEU GLY CYS LEU VAL LYS ASP TYR PHE PRO GLU SEQRES 13 E 228 PRO VAL THR VAL SER TRP ASN SER GLY ALA LEU THR SER SEQRES 14 E 228 GLY VAL HIS THR PHE PRO ALA VAL LEU GLN SER SER GLY SEQRES 15 E 228 LEU TYR SER LEU SER SER VAL VAL THR VAL PRO SER SER SEQRES 16 E 228 SER LEU GLY THR GLN THR TYR ILE CYS ASN VAL ASN HIS SEQRES 17 E 228 LYS PRO SER ASN THR LYS VAL ASP LYS LYS VAL GLU PRO SEQRES 18 E 228 LYS SER CYS ASP LYS THR HIS SEQRES 1 F 216 ALA ASN PHE MET LEU THR GLN PRO HIS SER VAL SER GLU SEQRES 2 F 216 SER PRO GLY LYS THR VAL THR ILE SER CYS THR GLY SER SEQRES 3 F 216 SER GLY SER ILE ALA SER ASN TYR VAL GLN TRP TYR GLN SEQRES 4 F 216 GLN ARG PRO GLY SER ALA PRO THR THR VAL ILE TYR GLU SEQRES 5 F 216 ASP ASN GLN ARG PRO SER GLY VAL PRO ASP ARG PHE SER SEQRES 6 F 216 GLY SER ILE ASP SER SER SER ASN SER ALA SER LEU THR SEQRES 7 F 216 ILE SER GLY LEU ARG THR GLU ASP GLU ALA ASP TYR TYR SEQRES 8 F 216 CYS GLN SER TYR ASP SER GLY ILE TRP VAL PHE GLY GLY SEQRES 9 F 216 GLY THR LYS LEU THR VAL LEU GLY GLN PRO LYS ALA ALA SEQRES 10 F 216 PRO SER VAL THR LEU PHE PRO PRO SER SER GLU GLU LEU SEQRES 11 F 216 GLN ALA ASN LYS ALA THR LEU VAL CYS LEU ILE SER ASP SEQRES 12 F 216 PHE TYR PRO GLY ALA VAL THR VAL ALA TRP LYS ALA ASP SEQRES 13 F 216 SER SER PRO VAL LYS ALA GLY VAL GLU THR THR THR PRO SEQRES 14 F 216 SER LYS GLN SER ASN ASN LYS TYR ALA ALA SER SER TYR SEQRES 15 F 216 LEU SER LEU THR PRO GLU GLN TRP LYS SER HIS ARG SER SEQRES 16 F 216 TYR SER CYS GLN VAL THR HIS GLU GLY SER THR VAL GLU SEQRES 17 F 216 LYS THR VAL ALA PRO THR GLU CYS SEQRES 1 B 195 THR ASN LEU CYS PRO PHE GLY GLU VAL PHE ASN ALA THR SEQRES 2 B 195 ARG PHE ALA SER VAL TYR ALA TRP ASN ARG LYS ARG ILE SEQRES 3 B 195 SER ASN CYS VAL ALA ASP TYR SER VAL LEU TYR ASN SER SEQRES 4 B 195 ALA SER PHE SER THR PHE LYS CYS TYR GLY VAL SER PRO SEQRES 5 B 195 THR LYS LEU ASN ASP LEU CYS PHE THR ASN VAL TYR ALA SEQRES 6 B 195 ASP SER PHE VAL ILE ARG GLY ASP GLU VAL ARG GLN ILE SEQRES 7 B 195 ALA PRO GLY GLN THR GLY LYS ILE ALA ASP TYR ASN TYR SEQRES 8 B 195 LYS LEU PRO ASP ASP PHE THR GLY CYS VAL ILE ALA TRP SEQRES 9 B 195 ASN SER ASN ASN LEU ASP SER LYS VAL GLY GLY ASN TYR SEQRES 10 B 195 ASN TYR LEU TYR ARG LEU PHE ARG LYS SER ASN LEU LYS SEQRES 11 B 195 PRO PHE GLU ARG ASP ILE SER THR GLU ILE TYR GLN ALA SEQRES 12 B 195 GLY SER THR PRO CYS ASN GLY VAL GLU GLY PHE ASN CYS SEQRES 13 B 195 TYR PHE PRO LEU GLN SER TYR GLY PHE GLN PRO THR ASN SEQRES 14 B 195 GLY VAL GLY TYR GLN PRO TYR ARG VAL VAL VAL LEU SER SEQRES 15 B 195 PHE GLU LEU LEU HIS ALA PRO ALA THR VAL CYS GLY PRO SEQRES 1 C 228 GLN VAL GLN LEU VAL GLU TRP GLY ALA GLY LEU LEU LYS SEQRES 2 C 228 PRO SER GLU THR LEU SER LEU THR CYS ALA VAL TYR GLY SEQRES 3 C 228 GLY SER PHE SER GLY TYR TYR TRP SER TRP ILE ARG GLN SEQRES 4 C 228 PRO PRO GLY LYS GLY LEU GLU TRP ILE GLY LEU ILE ASN SEQRES 5 C 228 HIS SER GLY SER THR ASN TYR ASN PRO SER LEU LYS SER SEQRES 6 C 228 ARG VAL THR ILE SER LEU ASP THR SER LYS ASN GLN PHE SEQRES 7 C 228 SER LEU LYS LEU THR SER VAL THR ALA ALA ASP THR ALA SEQRES 8 C 228 VAL TYR TYR CYS ALA ARG GLY LEU GLY ILE PHE GLY VAL SEQRES 9 C 228 VAL THR LEU SER ASP VAL TRP GLY GLN GLY THR THR VAL SEQRES 10 C 228 THR VAL SER SER ALA SER THR LYS GLY PRO SER VAL PHE SEQRES 11 C 228 PRO LEU ALA PRO SER SER LYS SER THR SER GLY GLY THR SEQRES 12 C 228 ALA ALA LEU GLY 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SER J 359 7371 9080 9058 183 -124 -627 C ANISOU 213 O SER J 359 7191 9016 8950 155 -126 -665 O ANISOU 214 CB SER J 359 7392 9036 9027 162 -82 -593 C ANISOU 215 OG SER J 359 8077 9882 9775 171 -81 -641 O ANISOU 216 N ASN J 360 7500 9162 9127 258 -140 -617 N ANISOU 217 CA ASN J 360 7091 8838 8728 325 -163 -651 C ANISOU 218 C ASN J 360 6723 8522 8423 289 -179 -673 C ANISOU 219 O ASN J 360 6927 8864 8692 286 -185 -718 O ANISOU 220 CB ASN J 360 7797 9682 9457 370 -158 -690 C ANISOU 221 CG ASN J 360 9042 10868 10623 425 -146 -670 C ANISOU 222 OD1 ASN J 360 9288 11039 10793 493 -157 -653 O ANISOU 223 ND2 ASN J 360 8889 10750 10486 395 -123 -671 N ANISOU 224 N CYS J 361 6871 8558 8550 259 -185 -641 N ANISOU 225 CA CYS J 361 7219 8932 8946 226 -201 -657 C ANISOU 226 C CYS J 361 6863 8443 8539 235 -214 -620 C ANISOU 227 O CYS J 361 6772 8237 8383 245 -206 -580 O ANISOU 228 CB CYS J 361 7142 8890 8934 134 -186 -667 C ANISOU 229 SG CYS J 361 6997 8610 8756 65 -159 -617 S ANISOU 230 N VAL J 362 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ANISOU 503 CZ TYR J 396 8624 9745 10080 -94 32 -399 C ANISOU 504 OH TYR J 396 9550 10689 10968 -33 34 -404 O ANISOU 505 N ALA J 397 4291 5396 5941 -367 13 -425 N ANISOU 506 CA ALA J 397 3572 4638 5236 -424 14 -424 C ANISOU 507 C ALA J 397 3147 4213 4820 -491 44 -426 C ANISOU 508 O ALA J 397 3366 4529 5085 -517 57 -462 O ANISOU 509 CB ALA J 397 3106 4251 4819 -421 -2 -460 C ANISOU 510 N ASP J 398 3441 4398 5067 -518 54 -390 N ANISOU 511 CA ASP J 398 3393 4328 5016 -582 83 -388 C ANISOU 512 C ASP J 398 3551 4433 5173 -635 84 -387 C ANISOU 513 O ASP J 398 3872 4674 5466 -624 66 -365 O ANISOU 514 CB ASP J 398 3349 4192 4915 -580 94 -348 C ANISOU 515 CG ASP J 398 3923 4792 5474 -522 90 -343 C ANISOU 516 OD1 ASP J 398 3948 4922 5536 -495 90 -373 O ANISOU 517 OD2 ASP J 398 4091 4874 5591 -502 86 -308 O ANISOU 518 N SER J 399 3256 4179 4905 -694 107 -412 N ANISOU 519 CA SER J 399 3291 4154 4930 -746 110 -413 C ANISOU 520 C SER J 399 3345 4177 4968 -814 144 -413 C ANISOU 521 O SER J 399 3467 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ANISOU 1194 CA GLU J 484 5636 5357 6277 -1787 943 -211 C ANISOU 1195 C GLU J 484 6011 5552 6527 -1821 974 -180 C ANISOU 1196 O GLU J 484 5799 5314 6280 -1897 1023 -195 O ANISOU 1197 CB GLU J 484 5198 4923 5865 -1816 931 -235 C ANISOU 1198 CG GLU J 484 5243 5133 6025 -1792 902 -269 C ANISOU 1199 CD GLU J 484 5635 5495 6422 -1818 888 -286 C ANISOU 1200 OE1 GLU J 484 5982 5733 6724 -1777 854 -258 O ANISOU 1201 OE2 GLU J 484 4858 4807 5694 -1881 912 -328 O ANISOU 1202 N GLY J 485 6256 5668 6700 -1768 946 -138 N ANISOU 1203 CA GLY J 485 7184 6418 7502 -1794 972 -108 C ANISOU 1204 C GLY J 485 7231 6349 7482 -1722 934 -63 C ANISOU 1205 O GLY J 485 6837 5994 7134 -1661 886 -57 O ANISOU 1206 N PHE J 486 7501 6480 7643 -1731 957 -34 N ANISOU 1207 CA PHE J 486 7903 6773 7975 -1665 924 8 C ANISOU 1208 C PHE J 486 8036 7016 8182 -1597 888 14 C ANISOU 1209 O PHE J 486 8323 7397 8514 -1602 907 2 O ANISOU 1210 CB PHE J 486 8376 7101 8326 -1685 958 35 C ANISOU 1211 CG PHE J 486 9135 7739 9002 -1620 926 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ANISOU 1371 C GLN J 506 4416 3982 5379 -1146 214 -250 C ANISOU 1372 O GLN J 506 4551 4150 5533 -1094 197 -227 O ANISOU 1373 CB GLN J 506 4507 3893 5366 -1138 193 -239 C ANISOU 1374 CG GLN J 506 5325 4577 6096 -1179 209 -241 C ANISOU 1375 CD GLN J 506 5414 4626 6168 -1144 178 -241 C ANISOU 1376 OE1 GLN J 506 5055 4364 5882 -1123 155 -262 O ANISOU 1377 NE2 GLN J 506 5459 4525 6113 -1133 178 -217 N ANISOU 1378 N PRO J 507 4086 3754 5114 -1187 227 -290 N ANISOU 1379 CA PRO J 507 3983 3803 5104 -1164 220 -308 C ANISOU 1380 C PRO J 507 4185 4066 5353 -1097 179 -306 C ANISOU 1381 O PRO J 507 4359 4224 5527 -1090 160 -317 O ANISOU 1382 CB PRO J 507 4330 4237 5499 -1228 243 -355 C ANISOU 1383 CG PRO J 507 4791 4610 5913 -1265 246 -366 C ANISOU 1384 CD PRO J 507 4801 4454 5820 -1255 248 -324 C ANISOU 1385 N TYR J 508 3869 3817 5074 -1049 166 -293 N ANISOU 1386 CA TYR J 508 3723 3737 4974 -987 131 -293 C ANISOU 1387 C TYR J 508 3652 3808 4981 -975 132 -318 C ANISOU 1388 O TYR J 508 3650 3835 4985 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O ANISOU 1661 CB THR K 17 5510 5199 6574 -164 -533 -540 C ANISOU 1662 OG1 THR K 17 5913 5526 6934 -227 -519 -562 O ANISOU 1663 CG2 THR K 17 4962 4756 6099 -176 -524 -541 C ANISOU 1664 N LEU K 18 5149 4857 6216 -63 -530 -443 N ANISOU 1665 CA LEU K 18 5308 5089 6415 -18 -537 -421 C ANISOU 1666 C LEU K 18 4452 4341 5632 -29 -537 -447 C ANISOU 1667 O LEU K 18 4088 4001 5293 -79 -524 -467 O ANISOU 1668 CB LEU K 18 5050 4802 6139 -16 -522 -383 C ANISOU 1669 CG LEU K 18 4185 4013 5315 18 -523 -363 C ANISOU 1670 CD1 LEU K 18 4609 4452 5734 75 -542 -356 C ANISOU 1671 CD2 LEU K 18 3940 3730 5044 18 -510 -327 C ANISOU 1672 N SER K 19 4282 4235 5491 18 -553 -449 N ANISOU 1673 CA SER K 19 4338 4393 5609 23 -556 -470 C ANISOU 1674 C SER K 19 4526 4619 5808 74 -560 -443 C ANISOU 1675 O SER K 19 5123 5199 6383 119 -574 -430 O ANISOU 1676 CB SER K 19 4286 4383 5576 29 -574 -510 C ANISOU 1677 OG SER K 19 5688 5764 6974 -27 -568 -540 O ANISOU 1678 N LEU K 20 4054 4195 5368 67 -548 -434 N ANISOU 1679 CA 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ANISOU 8897 C ALA F 127 15640 10845 12625 -419 504 524 C ANISOU 8898 O ALA F 127 15526 10813 12530 -328 458 537 O ANISOU 8899 CB ALA F 127 13871 9239 10990 -488 532 528 C ANISOU 8900 N ASN F 128 16812 11953 13779 -449 513 509 N ANISOU 8901 CA ASN F 128 16943 12100 13909 -376 469 507 C ANISOU 8902 C ASN F 128 16048 11456 13210 -336 416 499 C ANISOU 8903 O ASN F 128 16110 11562 13264 -241 369 508 O ANISOU 8904 CB ASN F 128 17073 12055 13835 -273 456 533 C ANISOU 8905 CG ASN F 128 18164 12871 14713 -306 506 539 C ANISOU 8906 OD1 ASN F 128 17862 12489 14386 -358 527 523 O ANISOU 8907 ND2 ASN F 128 19537 14102 15937 -288 531 560 N ANISOU 8908 N LYS F 129 14200 9772 11537 -412 424 480 N ANISOU 8909 CA LYS F 129 13510 9321 11040 -392 381 470 C ANISOU 8910 C LYS F 129 13105 9034 10791 -481 394 441 C ANISOU 8911 O LYS F 129 13495 9341 11154 -566 439 428 O ANISOU 8912 CB LYS F 129 13486 9392 11068 -385 378 482 C ANISOU 8913 CG LYS F 129 14150 9960 11590 -301 366 510 C ANISOU 8914 CD LYS F 129 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ANISOU15829 O CYS G 525 8974 7719 8528 -818 564 345 O ANISOU15830 CB CYS G 525 8262 6906 7714 -875 660 358 C ANISOU15831 SG CYS G 525 9468 8019 8846 -906 697 373 S ANISOU15832 N GLY G 526 10097 8805 9573 -814 596 352 N ANISOU15833 CA GLY G 526 10035 8808 9557 -797 584 337 C ANISOU15834 C GLY G 526 10009 8853 9597 -811 612 317 C ANISOU15835 O GLY G 526 9700 8549 9304 -838 640 314 O ANISOU15836 N PRO G 527 9156 8057 8782 -793 604 303 N ANISOU15837 CA PRO G 527 8343 7322 8033 -801 630 282 C ANISOU15838 C PRO G 527 7994 6984 7663 -807 669 277 C ANISOU15839 O PRO G 527 8210 7266 7931 -820 695 260 O ANISOU15840 CB PRO G 527 8856 7886 8587 -773 604 269 C ANISOU15841 CG PRO G 527 8293 7276 7998 -760 564 282 C ANISOU15842 CD PRO G 527 9186 8093 8813 -766 567 302 C TER 15843 PRO G 527 ANISOU15844 N GLN H 1 13071 11726 11852 -415 847 245 N ANISOU15845 CA GLN H 1 13556 12284 12434 -433 838 239 C ANISOU15846 C GLN H 1 14480 13202 13369 -412 806 230 C ANISOU15847 O GLN H 1 15073 13849 13987 -378 812 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207 13701 9555 8606 -3007 314 -723 O ANISOU19063 CB ALA I 207 14646 11067 9871 -3067 217 -774 C ANISOU19064 N PRO I 208 14547 10629 9612 -3109 304 -749 N ANISOU19065 CA PRO I 208 14857 10710 9751 -3168 349 -758 C ANISOU19066 C PRO I 208 15956 11684 10677 -3272 361 -804 C ANISOU19067 O PRO I 208 15221 11085 9973 -3345 336 -844 O ANISOU19068 CB PRO I 208 13487 9438 8462 -3228 355 -768 C ANISOU19069 CG PRO I 208 13537 9734 8729 -3160 318 -747 C ANISOU19070 CD PRO I 208 14012 10320 9251 -3127 282 -753 C ANISOU19071 N THR I 211 18139 13605 12673 -3276 401 -798 N ANISOU19072 CA THR I 211 18800 14102 13143 -3373 420 -839 C ANISOU19073 C THR I 211 19364 14483 13567 -3451 465 -851 C ANISOU19074 O THR I 211 20311 15216 14316 -3513 495 -873 O ANISOU19075 CB THR I 211 18968 14097 13185 -3300 427 -822 C ANISOU19076 OG1 THR I 211 19419 14411 13459 -3399 441 -865 O ANISOU19077 CG2 THR I 211 18544 13467 12677 -3206 461 -777 C TER 19078 THR I 211 HETATM19079 C1 NAG J 601 90.836 54.465 24.966 1.00127.63 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-64 -752 N HETATM19088 O3 NAG J 601 88.291 56.811 26.596 1.00130.70 O ANISOU19088 O3 NAG J 601 15558 16662 17440 -834 -127 -753 O HETATM19089 O4 NAG J 601 89.485 55.643 28.844 1.00134.65 O ANISOU19089 O4 NAG J 601 15940 17291 17928 -743 -177 -820 O HETATM19090 O5 NAG J 601 90.892 53.581 26.129 1.00135.32 O ANISOU19090 O5 NAG J 601 15957 17460 17997 -743 -125 -812 O HETATM19091 O6 NAG J 601 91.994 52.199 28.163 1.00123.16 O ANISOU19091 O6 NAG J 601 14311 16047 16436 -631 -174 -872 O HETATM19092 O7 NAG J 601 90.085 58.117 22.713 1.00116.41 O ANISOU19092 O7 NAG J 601 13765 14842 15624 -1049 -12 -767 O HETATM19093 C1 NAG B 601 17.323 -8.389 1.647 1.00 30.00 C HETATM19094 C2 NAG B 601 17.297 -8.844 3.105 1.00 30.00 C HETATM19095 C3 NAG B 601 15.874 -9.209 3.493 1.00 30.00 C HETATM19096 C4 NAG B 601 14.963 -8.017 3.255 1.00 30.00 C HETATM19097 C5 NAG B 601 15.065 -7.593 1.796 1.00 30.00 C HETATM19098 C6 NAG B 601 14.186 -6.382 1.505 1.00 30.00 C HETATM19099 C7 NAG B 601 19.352 -9.936 3.826 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