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'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP NMDZ1_RAT P35439 ? 1 ;MSTMHLLTFALLFSCSFARAACDPKIVNIGAVLSTRKHEQMFREAVNQANKRHGSWKIQLNATSVTHKPNAIQMALSVCE DLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTPVSYTAGFYRIPVLGLTTRMSIYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYNW NHIILLVSDDHEGRAAQKRLETLLEERESKAEKVLQFDPGTKNVTALLMEARELEARVIILSASEDDAATVYRAAAMLNM TGSGYVWLVGEREISGNALRYAPDGIIGLQLINGKNESAHISDAVGVVAQAVHELLEKENITDPPRGCVGNTNIWKTGPL FKRVLMSSKYADGVTGRVEFNEDGDRKFANYSIMNLQNRKLVQVGIYNGTHVIPNDRKIIWPGGETEKPRGYQMSTRLKI VTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVA DGKFGTQERVNNSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKEIPRSTLDSFMQPFQS TLWLLVGLSVHVVAVMLYLLDRFSPFGRFKVNSEEEEEDALTLSSAMWFSWGVLLNSGIGEGAPRSFSARILGMVWAGFA MIIVASYTANLAAFLVLDRPEERITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQA VRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQECDS RSNAPATLTFENMAGVFMLVAGGIVAGIFLIFIEIAYKRHKDARRKQ ; 1 2 UNP NMDE3_RAT Q00961 ? 2 ;MGGALGPALLLTSLLGAWARLGAGQGEQAVTVAVVFGSSGPLQTQARTRLTSQNFLDLPLEIQPLTVGVNNTNPSSILTQ ICGLLGAARVHGIVFEDNVDTEAVAQLLDFVSSQTHVPILSISGGSAVVLTPKEPGSAFLQLGVSLEQQLQVLFKVLEEY DWSAFAVITSLHPGHALFLEGVRAVADASYLSWRLLDVLTLELGPGGPRARTQRLLRQVDAPVLVAYCSREEAEVLFAEA AQAGLVGPGHVWLVPNLALGSTDAPPAAFPVGLISVVTESWRLSLRQKVRDGVAILALGAHSYRRQYGTLPAPAGDCRSH PGPVSPAREAFYRHLLNVTWEGRDFSFSPGGYLVRPTMVVIALNRHRLWEMVGRWDHGVLYMKYPVWPRYSTSLQPVVDS RHLTVATLEERPFVIVESPDPGTGGCVPNTVPCRRQSNHTFSSGDLTPYTKLCCKGFCIDILKKLAKVVKFSYDLYLVTN GKHGKRVRGVWNGMIGEVYYKRADMAIGSLTINEERSEIIDFSVPFVETGISVMVSRSNGTVSPSAFLEPYSPAVWVMMF VMCLTVVAITVFMFEYFSPVSYNQNLTKGKKPGGPSFTIGKSVWLLWALVFNNSVPIENPRGTTSKIMVLVWAFFAVIFL ASYTANLAAFMIQEQYIDTVSGLSDKKFQRPQDQYPPFRFGTVPNGSTERNIRSNYRDMHTHMVKFNQRSVEDALTSLKM GKLDAFIYDAAVLNYMAGKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIAMQKDSHWKRAIDLALLQLLGDGETQKLETVWLSGICQN ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7YFH A 1 ? 847 ? 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'expression tag' 854 7 1 7YFH PRO A 855 ? UNP P35439 ? ? 'expression tag' 855 8 1 7YFH ALA A 856 ? UNP P35439 ? ? 'expression tag' 856 9 1 7YFH ALA A 857 ? UNP P35439 ? ? 'expression tag' 857 10 1 7YFH ALA A 858 ? UNP P35439 ? ? 'expression tag' 858 11 1 7YFH HIS A 859 ? UNP P35439 ? ? 'expression tag' 859 12 1 7YFH HIS A 860 ? UNP P35439 ? ? 'expression tag' 860 13 1 7YFH HIS A 861 ? UNP P35439 ? ? 'expression tag' 861 14 1 7YFH HIS A 862 ? UNP P35439 ? ? 'expression tag' 862 15 1 7YFH HIS A 863 ? UNP P35439 ? ? 'expression tag' 863 16 1 7YFH HIS A 864 ? UNP P35439 ? ? 'expression tag' 864 17 1 7YFH HIS A 865 ? UNP P35439 ? ? 'expression tag' 865 18 1 7YFH HIS A 866 ? UNP P35439 ? ? 'expression tag' 866 19 3 7YFH LEU C 848 ? UNP P35439 ? ? 'expression tag' 848 20 3 7YFH GLU C 849 ? UNP P35439 ? ? 'expression tag' 849 21 3 7YFH VAL C 850 ? UNP P35439 ? ? 'expression tag' 850 22 3 7YFH LEU C 851 ? UNP P35439 ? ? 'expression tag' 851 23 3 7YFH PHE C 852 ? UNP P35439 ? ? 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'expression tag' 866 38 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 IWB non-polymer . 'methyl 4-[(2~{R})-3-ethanoyl-1-[2-(2-methyl-1~{H}-indol-3-yl)ethyl]-4-oxidanyl-5-oxidanylidene-2~{H}-pyrrol-2-yl]benzoate' ? 'C25 H24 N2 O5' 432.468 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MAN 'D-saccharide, alpha linking' . alpha-D-mannopyranose 'alpha-D-mannose; D-mannose; mannose' 'C6 H12 O6' 180.156 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;N-acetyl-beta-D-glucosamine; 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-glucose; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE ; 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7YFH _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7YFH _struct.title 'Structure of the Rat GluN1-GluN2C NMDA receptor in complex with glycine, glutamate and (R)-PYD-106' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7YFH _struct_keywords.text 'NMDA receptor, GluN2C, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 3 ? F N N 3 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 4 ? J N N 4 ? K N N 4 ? L N N 3 ? M N N 4 ? N N N 4 ? O N N 4 ? P N N 4 ? Q N N 4 ? R N N 4 ? S N N 3 ? T N N 4 ? U N N 4 ? V N N 5 ? W N N 5 ? X N N 5 ? Y N N 5 ? Z N N 6 ? AA N N 5 ? BA N N 5 ? CA N N 7 ? DA N N 8 ? EA N N 5 ? FA N N 5 ? GA N N 5 ? HA N N 5 ? IA N N 5 ? JA N N 6 ? KA N N 5 ? LA N N 5 ? MA N N 7 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 LYS A 37 ? HIS A 53 ? LYS A 37 HIS A 53 1 ? 17 HELX_P HELX_P2 AA2 ASN A 70 ? 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SER B 145 ASP B 161 1 ? 17 HELX_P HELX_P31 AD4 GLY B 174 ? ALA B 188 ? GLY B 174 ALA B 188 1 ? 15 HELX_P HELX_P32 AD5 ARG B 211 ? ARG B 217 ? ARG B 211 ARG B 217 1 ? 7 HELX_P HELX_P33 AD6 SER B 229 ? ALA B 243 ? SER B 229 ALA B 243 1 ? 15 HELX_P HELX_P34 AD7 SER B 280 ? ARG B 282 ? SER B 280 ARG B 282 5 ? 3 HELX_P HELX_P35 AD8 SER B 284 ? GLY B 308 ? SER B 284 GLY B 308 1 ? 25 HELX_P HELX_P36 AD9 SER B 325 ? ASN B 337 ? SER B 325 ASN B 337 1 ? 13 HELX_P HELX_P37 AE1 GLY B 456 ? LYS B 470 ? GLY B 456 LYS B 470 1 ? 15 HELX_P HELX_P38 AE2 ASN B 492 ? TYR B 500 ? ASN B 492 TYR B 500 1 ? 9 HELX_P HELX_P39 AE3 ASN B 513 ? GLU B 518 ? ASN B 513 GLU B 518 1 ? 6 HELX_P HELX_P40 AE4 ASP B 665 ? ARG B 670 ? ASP B 665 ARG B 670 1 ? 6 HELX_P HELX_P41 AE5 SER B 687 ? TYR B 696 ? SER B 687 TYR B 696 1 ? 10 HELX_P HELX_P42 AE6 TYR B 696 ? PHE B 706 ? TYR B 696 PHE B 706 1 ? 11 HELX_P HELX_P43 AE7 SER B 710 ? GLY B 721 ? SER B 710 GLY B 721 1 ? 12 HELX_P HELX_P44 AE8 ALA B 730 ? LYS B 739 ? 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THR C 317 SER C 327 1 ? 11 HELX_P HELX_P59 AG5 GLY C 457 ? ASN C 471 ? GLY C 457 ASN C 471 1 ? 15 HELX_P HELX_P60 AG6 ASN C 499 ? SER C 507 ? ASN C 499 SER C 507 1 ? 9 HELX_P HELX_P61 AG7 ASN C 520 ? GLN C 525 ? ASN C 520 GLN C 525 1 ? 6 HELX_P HELX_P62 AG8 ASP C 669 ? ASN C 674 ? ASP C 669 ASN C 674 1 ? 6 HELX_P HELX_P63 AG9 SER C 687 ? GLN C 696 ? SER C 687 GLN C 696 1 ? 10 HELX_P HELX_P64 AH1 LEU C 699 ? HIS C 709 ? LEU C 699 HIS C 709 1 ? 11 HELX_P HELX_P65 AH2 SER C 713 ? ASP C 723 ? SER C 713 ASP C 723 1 ? 11 HELX_P HELX_P66 AH3 SER C 733 ? CYS C 744 ? SER C 733 CYS C 744 1 ? 12 HELX_P HELX_P67 AH4 TRP C 768 ? ASN C 782 ? TRP C 768 ASN C 782 1 ? 15 HELX_P HELX_P68 AH5 GLY C 783 ? TRP C 792 ? GLY C 783 TRP C 792 1 ? 10 HELX_P HELX_P69 AH6 PRO D 41 ? ARG D 49 ? PRO D 41 ARG D 49 1 ? 9 HELX_P HELX_P70 AH7 ASN D 73 ? ARG D 89 ? ASN D 73 ARG D 89 1 ? 17 HELX_P HELX_P71 AH8 ALA D 103 ? HIS D 116 ? ALA D 103 HIS D 116 1 ? 14 HELX_P HELX_P72 AH9 GLY D 124 ? VAL D 128 ? 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