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'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP NMDZ1_RAT P35439 ? 1 ;MSTMHLLTFALLFSCSFARAACDPKIVNIGAVLSTRKHEQMFREAVNQANKRHGSWKIQLNATSVTHKPNAIQMALSVCE DLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTPVSYTAGFYRIPVLGLTTRMSIYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYNW NHIILLVSDDHEGRAAQKRLETLLEERESKAEKVLQFDPGTKNVTALLMEARELEARVIILSASEDDAATVYRAAAMLNM TGSGYVWLVGEREISGNALRYAPDGIIGLQLINGKNESAHISDAVGVVAQAVHELLEKENITDPPRGCVGNTNIWKTGPL FKRVLMSSKYADGVTGRVEFNEDGDRKFANYSIMNLQNRKLVQVGIYNGTHVIPNDRKIIWPGGETEKPRGYQMSTRLKI VTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVA DGKFGTQERVNNSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKEIPRSTLDSFMQPFQS TLWLLVGLSVHVVAVMLYLLDRFSPFGRFKVNSEEEEEDALTLSSAMWFSWGVLLNSGIGEGAPRSFSARILGMVWAGFA MIIVASYTANLAAFLVLDRPEERITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQA VRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQEC ; 1 2 UNP G3V9C5_RAT G3V9C5 ? 2 ;MGRLGYWTLLVLPALLVWRDPAQNAAAEKGPPALNIAVLLGHSHDVTERELRNLWGPEQATGLPLDVNVVALLMNRTDPK SLITHVCDLMSGARIHGLVFGDDTDQEAVAQMLDFISSQTFIPILGIHGGASMIMADKDPTSTFFQFGASIQQQATVMLK IMQDYDWHVFSLVTTIFPGYRDFISFIKTTVDNSFVGWDMQNVITLDTSFEDAKTQVQLKKIHSSVILLYCSKDEAVLIL SEARSLGLTGYDFFWIVPSLVSGNTELIPKEFPSGLISVSYDDWDYSLEARVRDGLGILTTAASSMLEKFSYIPEAKASC YGQAEKPETPLHTLHQFMVNVTWDGKDLSFTEEGYQVHPRLVVIVLNKDREWEKVGKWENQTLSLRHAVWPRYKSFSDCE PDDNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLV TNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRSNGTVSPSAFLEPFSASVWVM MFVMLLIVSAIAVFVFEYFSPVGYNRNLAKGKAPHGPSFTIGKAIWLLWGLVFNNSVPVQNPKGTTSKIMVSVWAFFAVI FLASYTANLAAFMIQEEFVDQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSL KTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC HNEKNEVMSSQLDIDNMAGVFYMLAAAMALSLITFIW ; 1 3 UNP NMDE3_RAT Q00961 ? 3 ;MGGALGPALLLTSLLGAWARLGAGQGEQAVTVAVVFGSSGPLQTQARTRLTSQNFLDLPLEIQPLTVGVNNTNPSSILTQ ICGLLGAARVHGIVFEDNVDTEAVAQLLDFVSSQTHVPILSISGGSAVVLTPKEPGSAFLQLGVSLEQQLQVLFKVLEEY DWSAFAVITSLHPGHALFLEGVRAVADASYLSWRLLDVLTLELGPGGPRARTQRLLRQVDAPVLVAYCSREEAEVLFAEA AQAGLVGPGHVWLVPNLALGSTDAPPAAFPVGLISVVTESWRLSLRQKVRDGVAILALGAHSYRRQYGTLPAPAGDCRSH PGPVSPAREAFYRHLLNVTWEGRDFSFSPGGYLVRPTMVVIALNRHRLWEMVGRWDHGVLYMKYPVWPRYSTSLQPVVDS RHLTVATLEERPFVIVESPDPGTGGCVPNTVPCRRQSNHTFSSGDLTPYTKLCCKGFCIDILKKLAKVVKFSYDLYLVTN GKHGKRVRGVWNGMIGEVYYKRADMAIGSLTINEERSEIIDFSVPFVETGISVMVSRSNGTVSPSAFLEPYSPAVWVMMF VMCLTVVAITVFMFEYFSPVSYNQNLTKGKKPGGPSFTIGKSVWLLWALVFNNSVPIENPRGTTSKIMVLVWAFFAVIFL ASYTANLAAFMIQEQYIDTVSGLSDKKFQRPQDQYPPFRFGTVPNGSTERNIRSNYRDMHTHMVKFNQRSVEDALTSLKM GKLDAFIYDAAVLNYMAGKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIAMQKDSHWKRAIDLALLQLLGDGETQKLETVWLSGICQN EKNEVMSSKLDIDNMAGVFYMLLVAMGLALLVFAW ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7YFI A 1 ? 798 ? 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'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;N-acetyl-beta-D-glucosamine; 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-glucose; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE ; 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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ASN A 499 SER A 507 1 ? 9 HELX_P HELX_P16 AB7 ASN A 520 ? GLN A 525 ? ASN A 520 GLN A 525 1 ? 6 HELX_P HELX_P17 AB8 THR A 550 ? GLN A 556 ? THR A 550 GLN A 556 5 ? 7 HELX_P HELX_P18 AB9 LEU A 562 ? SER A 584 ? LEU A 562 SER A 584 1 ? 23 HELX_P HELX_P19 AC1 LEU A 603 ? VAL A 613 ? LEU A 603 VAL A 613 1 ? 11 HELX_P HELX_P20 AC2 SER A 628 ? LEU A 655 ? SER A 628 LEU A 655 1 ? 28 HELX_P HELX_P21 AC3 ASP A 669 ? ASN A 674 ? ASP A 669 ASN A 674 1 ? 6 HELX_P HELX_P22 AC4 SER A 687 ? GLN A 696 ? SER A 687 GLN A 696 1 ? 10 HELX_P HELX_P23 AC5 LEU A 699 ? LYS A 708 ? LEU A 699 LYS A 708 1 ? 10 HELX_P HELX_P24 AC6 SER A 713 ? ASP A 723 ? SER A 713 ASP A 723 1 ? 11 HELX_P HELX_P25 AC7 SER A 733 ? LYS A 743 ? SER A 733 LYS A 743 1 ? 11 HELX_P HELX_P26 AC8 TRP A 768 ? ASN A 782 ? TRP A 768 ASN A 782 1 ? 15 HELX_P HELX_P27 AC9 GLY A 783 ? VAL A 793 ? GLY A 783 VAL A 793 1 ? 11 HELX_P HELX_P28 AD1 HIS B 43 ? VAL B 47 ? HIS B 42 VAL B 46 5 ? 5 HELX_P HELX_P29 AD2 THR B 48 ? ASN B 54 ? 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ASP B 667 ARG B 672 1 ? 6 HELX_P HELX_P44 AE8 PRO B 674 ? TYR B 677 ? PRO B 673 TYR B 676 5 ? 4 HELX_P HELX_P45 AE9 GLY B 689 ? TYR B 699 ? GLY B 688 TYR B 698 1 ? 11 HELX_P HELX_P46 AF1 TYR B 699 ? THR B 707 ? TYR B 698 THR B 706 1 ? 9 HELX_P HELX_P47 AF2 ARG B 708 ? ASN B 710 ? ARG B 707 ASN B 709 5 ? 3 HELX_P HELX_P48 AF3 GLY B 713 ? THR B 723 ? GLY B 712 THR B 722 1 ? 11 HELX_P HELX_P49 AF4 ALA B 733 ? ASP B 743 ? ALA B 732 ASP B 742 1 ? 11 HELX_P HELX_P50 AF5 PRO B 771 ? ASP B 786 ? PRO B 770 ASP B 785 1 ? 16 HELX_P HELX_P51 AF6 GLY B 787 ? LEU B 797 ? GLY B 786 LEU B 796 1 ? 11 HELX_P HELX_P52 AF7 ILE B 815 ? THR B 835 ? ILE B 814 THR B 834 1 ? 21 HELX_P HELX_P53 AF8 THR C 35 ? ASN C 50 ? THR C 35 ASN C 50 1 ? 16 HELX_P HELX_P54 AF9 ASN C 70 ? LEU C 82 ? ASN C 70 LEU C 82 1 ? 13 HELX_P HELX_P55 AG1 ILE C 83 ? SER C 85 ? ILE C 83 SER C 85 5 ? 3 HELX_P HELX_P56 AG2 PRO C 104 ? TYR C 114 ? PRO C 104 TYR C 114 1 ? 11 HELX_P HELX_P57 AG3 SER C 126 ? ASP C 130 ? 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LEU D 203 GLY D 207 5 ? 5 HELX_P HELX_P86 AJ5 ALA D 210 ? ARG D 217 ? ALA D 210 ARG D 217 1 ? 8 HELX_P HELX_P87 AJ6 SER D 229 ? GLY D 244 ? SER D 229 GLY D 244 1 ? 16 HELX_P HELX_P88 AJ7 PRO D 255 ? GLY D 260 ? PRO D 255 GLY D 260 1 ? 6 HELX_P HELX_P89 AJ8 SER D 284 ? TYR D 307 ? SER D 284 TYR D 307 1 ? 24 HELX_P HELX_P90 AJ9 SER D 325 ? LEU D 335 ? SER D 325 LEU D 335 1 ? 11 HELX_P HELX_P91 AK1 GLY D 456 ? LYS D 470 ? GLY D 456 LYS D 470 1 ? 15 HELX_P HELX_P92 AK2 GLY D 493 ? TYR D 500 ? GLY D 493 TYR D 500 1 ? 8 HELX_P HELX_P93 AK3 ASN D 513 ? GLU D 518 ? ASN D 513 GLU D 518 1 ? 6 HELX_P HELX_P94 AK4 LYS D 601 ? PHE D 611 ? LYS D 601 PHE D 611 1 ? 11 HELX_P HELX_P95 AK5 GLY D 622 ? GLN D 653 ? GLY D 622 GLN D 653 1 ? 32 HELX_P HELX_P96 AK6 ASP D 665 ? ARG D 670 ? ASP D 665 ARG D 670 1 ? 6 HELX_P HELX_P97 AK7 GLY D 686 ? TYR D 696 ? GLY D 686 TYR D 696 1 ? 11 HELX_P HELX_P98 AK8 TYR D 696 ? LYS D 705 ? TYR D 696 LYS D 705 1 ? 10 HELX_P HELX_P99 AK9 SER D 710 ? GLY D 721 ? 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A ASN 368 ND2 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? A ASN 368 F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? A ASN 440 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? A ASN 440 A NAG 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? A ASN 471 ND2 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? A ASN 471 G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.476 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? A ASN 491 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? A ASN 491 A NAG 807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? A ASN 771 ND2 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? A ASN 771 H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? B ASN 76 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? B ASN 75 B NAG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? B ASN 341 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? B ASN 340 B NAG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? B ASN 381 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? B ASN 380 B NAG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? B ASN 444 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? B ASN 443 B NAG 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? B ASN 445 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? B ASN 444 B NAG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? B ASN 688 ND2 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? B ASN 687 I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? N-Glycosylation covale18 covale one ? C ASN 61 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? C ASN 61 K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale19 covale one ? C ASN 203 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? C ASN 203 L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? N-Glycosylation covale20 covale one ? C ASN 239 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? C ASN 239 C NAG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? N-Glycosylation covale21 covale one ? C ASN 276 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? C ASN 276 J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? N-Glycosylation covale22 covale one ? C ASN 350 ND2 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? 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D ASN 438 ND2 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? D ASN 438 D NAG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? N-Glycosylation covale31 covale one ? D ASN 685 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? D ASN 685 O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale32 covale both ? E NAG . O4 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? E NAG 1 E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale33 covale both ? F NAG . O4 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? F NAG 1 F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale34 covale both ? G NAG . O4 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? G NAG 1 G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? ? covale35 covale both ? H NAG . O4 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? H NAG 1 H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale36 covale both ? I NAG . O4 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? I NAG 1 I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale37 covale both ? J NAG . O4 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? J NAG 1 J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? ? covale38 covale both ? J NAG . O4 ? ? ? 1_555 J MAN . C1 ? ? 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