HEADER PROTEIN BINDING 17-AUG-22 7YUI TITLE CRYSTAL STRUCTURE OF HOIL-1L(195-423) IN COMPLEX WITH THE LINEAR TITLE 2 TETRA-UBIQUITIN COMPND MOL_ID: 1; COMPND 2 MOLECULE: POLYUBIQUITIN-C; COMPND 3 CHAIN: A; COMPND 4 ENGINEERED: YES; COMPND 5 MOL_ID: 2; COMPND 6 MOLECULE: RANBP-TYPE AND C3HC4-TYPE ZINC FINGER-CONTAINING PROTEIN 1; COMPND 7 CHAIN: B; COMPND 8 EC: 2.3.2.31; COMPND 9 ENGINEERED: YES SOURCE MOL_ID: 1; SOURCE 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: HOMO SAPIENS; SOURCE 3 ORGANISM_COMMON: HUMAN; SOURCE 4 ORGANISM_TAXID: 9606; SOURCE 5 GENE: UBC; SOURCE 6 EXPRESSION_SYSTEM: ESCHERICHIA COLI; SOURCE 7 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID: 562; SOURCE 8 MOL_ID: 2; SOURCE 9 ORGANISM_SCIENTIFIC: HOMO SAPIENS; SOURCE 10 ORGANISM_COMMON: HUMAN; SOURCE 11 ORGANISM_TAXID: 9606; SOURCE 12 GENE: RBCK1; SOURCE 13 EXPRESSION_SYSTEM: ESCHERICHIA COLI; SOURCE 14 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID: 562 KEYWDS E3, UBIQUITINATION, PROTEIN BINDING EXPDTA X-RAY DIFFRACTION AUTHOR L.XIAO,L.PAN REVDAT 2 13-MAR-24 7YUI 1 AUTHOR JRNL REVDAT 1 30-AUG-23 7YUI 0 JRNL AUTH X.XU,Y.WANG,Y.ZHANG,Y.WANG,Y.YIN,C.PENG,X.GONG,M.LI,Y.ZHANG, JRNL AUTH 2 M.ZHANG,Y.TANG,X.ZHOU,H.LIU,L.PAN JRNL TITL MECHANISTIC INSIGHTS INTO THE ENZYMATIC ACTIVITY OF E3 JRNL TITL 2 LIGASE HOIL-1L AND ITS REGULATION BY THE LINEAR UBIQUITIN JRNL TITL 3 CHAIN BINDING. JRNL REF SCI ADV V. 9 I4599 2023 JRNL REFN ESSN 2375-2548 JRNL PMID 37831767 JRNL DOI 10.1126/SCIADV.ADI4599 REMARK 2 REMARK 2 RESOLUTION. 2.60 ANGSTROMS. REMARK 3 REMARK 3 REFINEMENT. REMARK 3 PROGRAM : PHENIX 1.14_3260 REMARK 3 AUTHORS : PAUL ADAMS,PAVEL AFONINE,VINCENT CHEN,IAN REMARK 3 : DAVIS,KRESHNA GOPAL,RALF GROSSE-KUNSTLEVE, REMARK 3 : LI-WEI HUNG,ROBERT IMMORMINO,TOM IOERGER, REMARK 3 : AIRLIE MCCOY,ERIK MCKEE,NIGEL MORIARTY, REMARK 3 : REETAL PAI,RANDY READ,JANE RICHARDSON, REMARK 3 : DAVID RICHARDSON,TOD ROMO,JIM SACCHETTINI, REMARK 3 : NICHOLAS SAUTER,JACOB SMITH,LAURENT REMARK 3 : STORONI,TOM TERWILLIGER,PETER ZWART REMARK 3 REMARK 3 REFINEMENT TARGET : ML REMARK 3 REMARK 3 DATA USED IN REFINEMENT. REMARK 3 RESOLUTION RANGE HIGH (ANGSTROMS) : 2.60 REMARK 3 RESOLUTION RANGE LOW (ANGSTROMS) : 71.59 REMARK 3 MIN(FOBS/SIGMA_FOBS) : 1.350 REMARK 3 COMPLETENESS FOR RANGE (%) : 99.4 REMARK 3 NUMBER OF REFLECTIONS : 19690 REMARK 3 REMARK 3 FIT TO DATA USED IN REFINEMENT. REMARK 3 R VALUE (WORKING + TEST SET) : 0.205 REMARK 3 R VALUE (WORKING SET) : 0.203 REMARK 3 FREE R VALUE : 0.258 REMARK 3 FREE R VALUE TEST SET SIZE (%) : 4.780 REMARK 3 FREE R VALUE TEST SET COUNT : 942 REMARK 3 REMARK 3 FIT TO DATA USED IN REFINEMENT (IN BINS). REMARK 3 BIN RESOLUTION RANGE COMPL. NWORK NFREE RWORK RFREE REMARK 3 1 71.5870 - 4.9707 0.99 2841 131 0.1769 0.2103 REMARK 3 2 4.9707 - 3.9455 1.00 2720 126 0.1669 0.1947 REMARK 3 3 3.9455 - 3.4467 1.00 2682 128 0.1893 0.2669 REMARK 3 4 3.4467 - 3.1316 1.00 2656 152 0.2349 0.2936 REMARK 3 5 3.1316 - 2.9071 1.00 2645 123 0.2545 0.3312 REMARK 3 6 2.9071 - 2.7357 1.00 2634 144 0.2648 0.3495 REMARK 3 7 2.7357 - 2.5990 0.97 2570 138 0.2948 0.3605 REMARK 3 REMARK 3 BULK SOLVENT MODELLING. REMARK 3 METHOD USED : FLAT BULK SOLVENT MODEL REMARK 3 SOLVENT RADIUS : 1.11 REMARK 3 SHRINKAGE RADIUS : 0.90 REMARK 3 K_SOL : NULL REMARK 3 B_SOL : NULL REMARK 3 REMARK 3 ERROR ESTIMATES. REMARK 3 COORDINATE ERROR (MAXIMUM-LIKELIHOOD BASED) : 0.350 REMARK 3 PHASE ERROR (DEGREES, MAXIMUM-LIKELIHOOD BASED) : 27.380 REMARK 3 REMARK 3 B VALUES. REMARK 3 FROM WILSON PLOT (A**2) : NULL REMARK 3 MEAN B VALUE (OVERALL, A**2) : 57.76 REMARK 3 OVERALL ANISOTROPIC B VALUE. REMARK 3 B11 (A**2) : NULL REMARK 3 B22 (A**2) : NULL REMARK 3 B33 (A**2) : NULL REMARK 3 B12 (A**2) : NULL REMARK 3 B13 (A**2) : NULL REMARK 3 B23 (A**2) : NULL REMARK 3 REMARK 3 TWINNING INFORMATION. REMARK 3 FRACTION: NULL REMARK 3 OPERATOR: NULL REMARK 3 REMARK 3 DEVIATIONS FROM IDEAL VALUES. REMARK 3 RMSD COUNT REMARK 3 BOND : NULL NULL REMARK 3 ANGLE : NULL NULL REMARK 3 CHIRALITY : NULL NULL REMARK 3 PLANARITY : NULL NULL REMARK 3 DIHEDRAL : NULL NULL REMARK 3 REMARK 3 TLS DETAILS REMARK 3 NUMBER OF TLS GROUPS : 9 REMARK 3 TLS GROUP : 1 REMARK 3 SELECTION: CHAIN 'A' AND (RESID 0 THROUGH 54 ) REMARK 3 ORIGIN FOR THE GROUP (A): -27.7562 14.9979 -2.0350 REMARK 3 T TENSOR REMARK 3 T11: 0.2863 T22: 0.3032 REMARK 3 T33: 0.2142 T12: 0.0180 REMARK 3 T13: -0.0129 T23: -0.0000 REMARK 3 L TENSOR REMARK 3 L11: 3.5009 L22: 1.7110 REMARK 3 L33: 2.1060 L12: -0.6974 REMARK 3 L13: -0.4829 L23: -0.0864 REMARK 3 S TENSOR REMARK 3 S11: 0.1723 S12: -0.1681 S13: -0.0503 REMARK 3 S21: -0.1285 S22: -0.0674 S23: 0.1777 REMARK 3 S31: -0.0605 S32: -0.0911 S33: -0.0675 REMARK 3 TLS GROUP : 2 REMARK 3 SELECTION: CHAIN 'A' AND (RESID 55 THROUGH 153 ) REMARK 3 ORIGIN FOR THE GROUP (A): -6.6173 12.7325 -16.1490 REMARK 3 T TENSOR REMARK 3 T11: 0.3447 T22: 0.2781 REMARK 3 T33: 0.2824 T12: 0.0086 REMARK 3 T13: -0.0086 T23: -0.0075 REMARK 3 L TENSOR REMARK 3 L11: 3.8342 L22: 0.6116 REMARK 3 L33: 1.7761 L12: -0.0218 REMARK 3 L13: -1.4917 L23: -0.0821 REMARK 3 S TENSOR REMARK 3 S11: -0.0869 S12: 0.1188 S13: -0.2895 REMARK 3 S21: -0.0655 S22: -0.0769 S23: -0.1175 REMARK 3 S31: 0.1862 S32: 0.0565 S33: 0.1059 REMARK 3 TLS GROUP : 3 REMARK 3 SELECTION: CHAIN 'A' AND (RESID 154 THROUGH 234 ) REMARK 3 ORIGIN FOR THE GROUP (A): 16.7608 5.5905 -47.6788 REMARK 3 T TENSOR REMARK 3 T11: 0.5157 T22: 0.5838 REMARK 3 T33: 0.6975 T12: 0.1453 REMARK 3 T13: 0.0400 T23: -0.0648 REMARK 3 L TENSOR REMARK 3 L11: 2.3170 L22: 1.0755 REMARK 3 L33: 2.8698 L12: -0.8590 REMARK 3 L13: -1.8046 L23: 0.7643 REMARK 3 S TENSOR REMARK 3 S11: -0.0869 S12: 0.2362 S13: 0.1349 REMARK 3 S21: -0.0735 S22: -0.1968 S23: 0.5879 REMARK 3 S31: -0.1221 S32: -0.8182 S33: 0.2335 REMARK 3 TLS GROUP : 4 REMARK 3 SELECTION: CHAIN 'A' AND (RESID 235 THROUGH 304 ) REMARK 3 ORIGIN FOR THE GROUP (A): 42.7632 14.8549 -62.6222 REMARK 3 T TENSOR REMARK 3 T11: 0.5017 T22: 0.4069 REMARK 3 T33: 0.6510 T12: 0.0453 REMARK 3 T13: 0.0210 T23: 0.1186 REMARK 3 L TENSOR REMARK 3 L11: 3.1992 L22: 1.9797 REMARK 3 L33: 2.4374 L12: -0.5638 REMARK 3 L13: -0.0357 L23: 0.4588 REMARK 3 S TENSOR REMARK 3 S11: 0.1252 S12: 0.4958 S13: 0.7867 REMARK 3 S21: -0.2466 S22: -0.0845 S23: 0.1174 REMARK 3 S31: -0.4939 S32: -0.2120 S33: -0.1179 REMARK 3 TLS GROUP : 5 REMARK 3 SELECTION: CHAIN 'B' AND (RESID 193 THROUGH 233 ) REMARK 3 ORIGIN FOR THE GROUP (A): -19.9673 21.3670 -22.9291 REMARK 3 T TENSOR REMARK 3 T11: 0.3629 T22: 0.4772 REMARK 3 T33: 0.2752 T12: 0.1098 REMARK 3 T13: 0.0002 T23: 0.0234 REMARK 3 L TENSOR REMARK 3 L11: 6.4518 L22: 3.7641 REMARK 3 L33: 4.4790 L12: 0.7419 REMARK 3 L13: -1.3898 L23: -0.2183 REMARK 3 S TENSOR REMARK 3 S11: 0.4840 S12: 0.9767 S13: 0.4567 REMARK 3 S21: -0.6437 S22: -0.0554 S23: 0.1331 REMARK 3 S31: 0.0750 S32: -0.0597 S33: -0.2979 REMARK 3 TLS GROUP : 6 REMARK 3 SELECTION: CHAIN 'B' AND (RESID 234 THROUGH 270 ) REMARK 3 ORIGIN FOR THE GROUP (A): 9.5036 20.5349 -29.9803 REMARK 3 T TENSOR REMARK 3 T11: 0.4080 T22: 0.3953 REMARK 3 T33: 0.4097 T12: -0.0246 REMARK 3 T13: 0.0251 T23: 0.0285 REMARK 3 L TENSOR REMARK 3 L11: 3.5966 L22: 4.1410 REMARK 3 L33: 4.4623 L12: -2.4398 REMARK 3 L13: -4.0133 L23: 3.0092 REMARK 3 S TENSOR REMARK 3 S11: 0.4368 S12: 0.3338 S13: 0.7614 REMARK 3 S21: -0.4982 S22: -0.0421 S23: -0.4527 REMARK 3 S31: -0.2668 S32: -0.0823 S33: -0.3497 REMARK 3 TLS GROUP : 7 REMARK 3 SELECTION: CHAIN 'B' AND (RESID 271 THROUGH 300 ) REMARK 3 ORIGIN FOR THE GROUP (A): 31.9452 -4.2218 -38.2002 REMARK 3 T TENSOR REMARK 3 T11: 0.4107 T22: 0.4271 REMARK 3 T33: 0.3629 T12: -0.0280 REMARK 3 T13: 0.0994 T23: -0.0851 REMARK 3 L TENSOR REMARK 3 L11: 3.7503 L22: 2.5962 REMARK 3 L33: 5.0515 L12: 0.2159 REMARK 3 L13: -1.3952 L23: -0.5339 REMARK 3 S TENSOR REMARK 3 S11: 0.0306 S12: -0.4272 S13: 0.0311 REMARK 3 S21: 0.5337 S22: 0.0787 S23: 0.0675 REMARK 3 S31: -0.1388 S32: 0.1482 S33: -0.0339 REMARK 3 TLS GROUP : 8 REMARK 3 SELECTION: CHAIN 'B' AND (RESID 301 THROUGH 399 ) REMARK 3 ORIGIN FOR THE GROUP (A): 45.8791 -0.4042 -58.6577 REMARK 3 T TENSOR REMARK 3 T11: 0.3361 T22: 0.2343 REMARK 3 T33: 0.3895 T12: 0.0063 REMARK 3 T13: 0.0007 T23: 0.0013 REMARK 3 L TENSOR REMARK 3 L11: 3.9463 L22: 0.7975 REMARK 3 L33: 2.5924 L12: 0.9318 REMARK 3 L13: -2.0649 L23: -0.2786 REMARK 3 S TENSOR REMARK 3 S11: 0.1208 S12: -0.0036 S13: 0.2804 REMARK 3 S21: -0.0053 S22: 0.0143 S23: 0.1311 REMARK 3 S31: -0.0859 S32: 0.0559 S33: -0.1188 REMARK 3 TLS GROUP : 9 REMARK 3 SELECTION: CHAIN 'B' AND (RESID 400 THROUGH 424 ) REMARK 3 ORIGIN FOR THE GROUP (A): 69.4131 -2.4271 -80.8469 REMARK 3 T TENSOR REMARK 3 T11: 0.3630 T22: 0.4513 REMARK 3 T33: 0.4309 T12: 0.0040 REMARK 3 T13: -0.0054 T23: 0.0857 REMARK 3 L TENSOR REMARK 3 L11: 8.4214 L22: 6.6725 REMARK 3 L33: 5.4203 L12: -6.6287 REMARK 3 L13: -1.8197 L23: 1.7767 REMARK 3 S TENSOR REMARK 3 S11: 0.4934 S12: 0.3930 S13: -0.0110 REMARK 3 S21: -0.5333 S22: -0.4116 S23: -0.4362 REMARK 3 S31: -0.0519 S32: 0.5918 S33: -0.1265 REMARK 3 REMARK 3 NCS DETAILS REMARK 3 NUMBER OF NCS GROUPS : NULL REMARK 3 REMARK 3 OTHER REFINEMENT REMARKS: NULL REMARK 4 REMARK 4 7YUI COMPLIES WITH FORMAT V. 3.30, 13-JUL-11 REMARK 100 REMARK 100 THIS ENTRY HAS BEEN PROCESSED BY PDBJ ON 20-AUG-22. REMARK 100 THE DEPOSITION ID IS D_1300031649. REMARK 200 REMARK 200 EXPERIMENTAL DETAILS REMARK 200 EXPERIMENT TYPE : X-RAY DIFFRACTION REMARK 200 DATE OF DATA COLLECTION : 06-JUN-21 REMARK 200 TEMPERATURE (KELVIN) : 100 REMARK 200 PH : NULL REMARK 200 NUMBER OF CRYSTALS USED : 1 REMARK 200 REMARK 200 SYNCHROTRON (Y/N) : Y REMARK 200 RADIATION SOURCE : NFPSS REMARK 200 BEAMLINE : BL17B REMARK 200 X-RAY GENERATOR MODEL : NULL REMARK 200 MONOCHROMATIC OR LAUE (M/L) : M REMARK 200 WAVELENGTH OR RANGE (A) : 0.978560 REMARK 200 MONOCHROMATOR : NULL REMARK 200 OPTICS : NULL REMARK 200 REMARK 200 DETECTOR TYPE : CCD REMARK 200 DETECTOR MANUFACTURER : RAYONIX MX-300 REMARK 200 INTENSITY-INTEGRATION SOFTWARE : XDS REMARK 200 DATA SCALING SOFTWARE : AIMLESS REMARK 200 REMARK 200 NUMBER OF UNIQUE REFLECTIONS : 19702 REMARK 200 RESOLUTION RANGE HIGH (A) : 2.599 REMARK 200 RESOLUTION RANGE LOW (A) : 71.590 REMARK 200 REJECTION CRITERIA (SIGMA(I)) : NULL REMARK 200 REMARK 200 OVERALL. REMARK 200 COMPLETENESS FOR RANGE (%) : 99.5 REMARK 200 DATA REDUNDANCY : 13.10 REMARK 200 R MERGE (I) : 0.14900 REMARK 200 R SYM (I) : NULL REMARK 200 FOR THE DATA SET : 13.7000 REMARK 200 REMARK 200 IN THE HIGHEST RESOLUTION SHELL. REMARK 200 HIGHEST RESOLUTION SHELL, RANGE HIGH (A) : 2.60 REMARK 200 HIGHEST RESOLUTION SHELL, RANGE LOW (A) : 2.64 REMARK 200 COMPLETENESS FOR SHELL (%) : NULL REMARK 200 DATA REDUNDANCY IN SHELL : NULL REMARK 200 R MERGE FOR SHELL (I) : 1.15100 REMARK 200 R SYM FOR SHELL (I) : NULL REMARK 200 FOR SHELL : NULL REMARK 200 REMARK 200 DIFFRACTION PROTOCOL: SINGLE WAVELENGTH REMARK 200 METHOD USED TO DETERMINE THE STRUCTURE: MOLECULAR REPLACEMENT REMARK 200 SOFTWARE USED: PHASER REMARK 200 STARTING MODEL: 7R71, 3B08 REMARK 200 REMARK 200 REMARK: NULL REMARK 280 REMARK 280 CRYSTAL REMARK 280 SOLVENT CONTENT, VS (%): 49.72 REMARK 280 MATTHEWS COEFFICIENT, VM (ANGSTROMS**3/DA): 2.45 REMARK 280 REMARK 280 CRYSTALLIZATION CONDITIONS: 0.2 M LITHIUM CHLORIDE, 0.1 M TRIS(PH REMARK 280 8), 20 %(W/V)PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, REMARK 280 TEMPERATURE 289K REMARK 290 REMARK 290 CRYSTALLOGRAPHIC SYMMETRY REMARK 290 SYMMETRY OPERATORS FOR SPACE GROUP: P 21 21 21 REMARK 290 REMARK 290 SYMOP SYMMETRY REMARK 290 NNNMMM OPERATOR REMARK 290 1555 X,Y,Z REMARK 290 2555 -X+1/2,-Y,Z+1/2 REMARK 290 3555 -X,Y+1/2,-Z+1/2 REMARK 290 4555 X+1/2,-Y+1/2,-Z REMARK 290 REMARK 290 WHERE NNN -> OPERATOR NUMBER REMARK 290 MMM -> TRANSLATION VECTOR REMARK 290 REMARK 290 CRYSTALLOGRAPHIC SYMMETRY TRANSFORMATIONS REMARK 290 THE FOLLOWING TRANSFORMATIONS OPERATE ON THE ATOM/HETATM REMARK 290 RECORDS IN THIS ENTRY TO PRODUCE CRYSTALLOGRAPHICALLY REMARK 290 RELATED MOLECULES. REMARK 290 SMTRY1 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 REMARK 290 SMTRY2 1 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 REMARK 290 SMTRY3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 REMARK 290 SMTRY1 2 -1.000000 0.000000 0.000000 29.25000 REMARK 290 SMTRY2 2 0.000000 -1.000000 0.000000 0.00000 REMARK 290 SMTRY3 2 0.000000 0.000000 1.000000 58.71950 REMARK 290 SMTRY1 3 -1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 REMARK 290 SMTRY2 3 0.000000 1.000000 0.000000 45.15200 REMARK 290 SMTRY3 3 0.000000 0.000000 -1.000000 58.71950 REMARK 290 SMTRY1 4 1.000000 0.000000 0.000000 29.25000 REMARK 290 SMTRY2 4 0.000000 -1.000000 0.000000 45.15200 REMARK 290 SMTRY3 4 0.000000 0.000000 -1.000000 0.00000 REMARK 290 REMARK 290 REMARK: NULL REMARK 300 REMARK 300 BIOMOLECULE: 1 REMARK 300 SEE REMARK 350 FOR THE AUTHOR PROVIDED AND/OR PROGRAM REMARK 300 GENERATED ASSEMBLY INFORMATION FOR THE STRUCTURE IN REMARK 300 THIS ENTRY. THE REMARK MAY ALSO PROVIDE INFORMATION ON REMARK 300 BURIED SURFACE AREA. REMARK 350 REMARK 350 COORDINATES FOR A COMPLETE MULTIMER REPRESENTING THE KNOWN REMARK 350 BIOLOGICALLY SIGNIFICANT OLIGOMERIZATION STATE OF THE REMARK 350 MOLECULE CAN BE GENERATED BY APPLYING BIOMT TRANSFORMATIONS REMARK 350 GIVEN BELOW. BOTH NON-CRYSTALLOGRAPHIC AND REMARK 350 CRYSTALLOGRAPHIC OPERATIONS ARE GIVEN. REMARK 350 REMARK 350 BIOMOLECULE: 1 REMARK 350 AUTHOR DETERMINED BIOLOGICAL UNIT: DIMERIC REMARK 350 SOFTWARE DETERMINED QUATERNARY STRUCTURE: DIMERIC REMARK 350 SOFTWARE USED: PISA REMARK 350 TOTAL BURIED SURFACE AREA: 5920 ANGSTROM**2 REMARK 350 SURFACE AREA OF THE COMPLEX: 29100 ANGSTROM**2 REMARK 350 CHANGE IN SOLVENT FREE ENERGY: -32.0 KCAL/MOL REMARK 350 APPLY THE FOLLOWING TO CHAINS: A, B REMARK 350 BIOMT1 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 REMARK 350 BIOMT2 1 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 REMARK 350 BIOMT3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 REMARK 465 REMARK 465 MISSING RESIDUES REMARK 465 THE FOLLOWING RESIDUES WERE NOT LOCATED IN THE REMARK 465 EXPERIMENT. (M=MODEL NUMBER; RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN REMARK 465 IDENTIFIER; SSSEQ=SEQUENCE NUMBER; I=INSERTION CODE.) REMARK 465 REMARK 465 M RES C SSSEQI REMARK 465 GLY A -3 REMARK 465 PRO A -2 REMARK 465 GLY A -1 REMARK 465 GLY B 191 REMARK 465 SER B 192 REMARK 470 REMARK 470 MISSING ATOM REMARK 470 THE FOLLOWING RESIDUES HAVE MISSING ATOMS (M=MODEL NUMBER; REMARK 470 RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN IDENTIFIER; SSEQ=SEQUENCE NUMBER; REMARK 470 I=INSERTION CODE): REMARK 470 M RES CSSEQI ATOMS REMARK 470 LYS A 215 CG CD CE NZ REMARK 500 REMARK 500 GEOMETRY AND STEREOCHEMISTRY REMARK 500 SUBTOPIC: CLOSE CONTACTS IN SAME ASYMMETRIC UNIT REMARK 500 REMARK 500 THE FOLLOWING ATOMS ARE IN CLOSE CONTACT. REMARK 500 REMARK 500 ATM1 RES C SSEQI ATM2 RES C SSEQI DISTANCE REMARK 500 OG1 THR A 142 O HOH A 401 1.81 REMARK 500 O HOH A 440 O HOH B 631 1.97 REMARK 500 N THR B 346 O HOH B 601 2.03 REMARK 500 O HOH A 418 O HOH B 629 2.04 REMARK 500 O ASP A 52 O HOH A 402 2.08 REMARK 500 O HOH B 630 O HOH B 634 2.09 REMARK 500 O ASP A 210 O HOH A 403 2.13 REMARK 500 O GLN A 214 OG SER A 217 2.15 REMARK 500 O GLU A 64 O HOH A 404 2.16 REMARK 500 REMARK 500 REMARK: NULL REMARK 500 REMARK 500 GEOMETRY AND STEREOCHEMISTRY REMARK 500 SUBTOPIC: TORSION ANGLES REMARK 500 REMARK 500 TORSION ANGLES OUTSIDE THE EXPECTED RAMACHANDRAN REGIONS: REMARK 500 (M=MODEL NUMBER; RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN IDENTIFIER; REMARK 500 SSEQ=SEQUENCE NUMBER; I=INSERTION CODE). REMARK 500 REMARK 500 STANDARD TABLE: REMARK 500 FORMAT:(10X,I3,1X,A3,1X,A1,I4,A1,4X,F7.2,3X,F7.2) REMARK 500 REMARK 500 EXPECTED VALUES: GJ KLEYWEGT AND TA JONES (1996). PHI/PSI- REMARK 500 CHOLOGY: RAMACHANDRAN REVISITED. 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ANISOU 2717 CG GLN B 231 10478 9930 12101 1272 3418 3812 C ANISOU 2718 CD GLN B 231 10997 9957 13156 1142 3747 3864 C ANISOU 2719 OE1 GLN B 231 11765 10508 14235 857 3929 3492 O ANISOU 2720 NE2 GLN B 231 10294 9116 12564 1342 3807 4303 N ANISOU 2721 N PRO B 232 8773 9092 9914 805 2814 2141 N ANISOU 2722 CA PRO B 232 7782 8186 9046 625 2682 1638 C ANISOU 2723 C PRO B 232 6884 6965 8691 362 2937 1454 C ANISOU 2724 O PRO B 232 6979 6842 9083 236 3274 1622 O ANISOU 2725 CB PRO B 232 7707 8513 8727 583 2662 1487 C ANISOU 2726 CG PRO B 232 7209 8179 7820 785 2696 1854 C ANISOU 2727 CD PRO B 232 7044 7672 7849 837 2907 2294 C ANISOU 2728 N ASP B 233 6162 6209 8083 259 2785 1097 N ANISOU 2729 CA ASP B 233 6925 6698 9294 -12 2999 836 C ANISOU 2730 C ASP B 233 7705 7750 10190 -293 3069 544 C ANISOU 2731 O ASP B 233 8285 8679 10589 -254 3030 613 O ANISOU 2732 CB ASP B 233 7164 6859 9551 -17 2819 578 C ANISOU 2733 CG ASP B 233 8983 9051 10958 85 2429 436 C ANISOU 2734 OD1 ASP B 233 9705 10054 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O HOH B 610 47.540 -7.933 -53.801 1.00 45.54 O HETATM 4331 O HOH B 611 -13.513 20.474 -12.389 1.00 39.15 O HETATM 4332 O HOH B 612 70.544 3.833 -64.299 1.00 51.26 O HETATM 4333 O HOH B 613 28.820 -13.004 -47.144 1.00 37.44 O HETATM 4334 O HOH B 614 67.240 -7.029 -84.362 1.00 40.69 O HETATM 4335 O HOH B 615 38.098 -9.965 -57.339 1.00 34.38 O HETATM 4336 O HOH B 616 46.270 -4.048 -73.755 1.00 49.26 O HETATM 4337 O HOH B 617 23.361 -16.920 -47.647 1.00 43.85 O HETATM 4338 O HOH B 618 1.782 29.714 -26.812 1.00 47.25 O HETATM 4339 O HOH B 619 -17.819 23.747 -18.226 1.00 51.80 O HETATM 4340 O HOH B 620 -6.500 21.235 -22.899 1.00 47.46 O HETATM 4341 O HOH B 621 77.748 -5.118 -77.895 1.00 40.34 O HETATM 4342 O HOH B 622 43.559 2.681 -38.820 1.00 49.56 O HETATM 4343 O HOH B 623 75.326 6.677 -82.650 1.00 42.64 O HETATM 4344 O HOH B 624 -16.668 11.805 -27.440 1.00 57.74 O HETATM 4345 O HOH B 625 3.968 19.004 -24.217 1.00 31.68 O HETATM 4346 O HOH B 626 39.555 5.460 -39.091 1.00 52.80 O HETATM 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