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'Spodoptera frugiperda' 7108 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _pdbx_entity_src_syn.entity_id 5 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag sample _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num 42 _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific 'Saccharomyces cerevisiae' _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name ? _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id 4932 _pdbx_entity_src_syn.details ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP CFT1_YEAST Q06632 ? 1 ;MNVYDDVLDATVVSHSLATHFTTSDYEELLVVRTNILSVYRPTRDGKLYLTDEFKFHGLITDIGLIPQKDSPLSCLLLCT GVAKISILKFNTLTNSIDTLSLHYYEGKFKGKSLVELAKISTLRMDPGSSCALLFNNDIIAFLPFHVNKNDDDEEEEDED ENIDDSELIHSMNQKSQGTNTFNKRKRTKLGDKFTAPSVVLVASELYEGAKNIIDIQFLKNFTKPTIALLYQPKLVWAGN TTISKLPTQYVILTLNIQPAESATKIESTTIAFVKELPWDLHTIVPVSNGAIIVGTNELAFLDNTGVLQSTVLLNSFADK ELQKTKIINNSSLEIMFREKNTTSIWIPSSKSKNGGSNNDETLLLMDLKSNIYYIQMEAEGRLLIKFDIFKLPIVNDLLK ENSNPKCITRLNATNSNKNMDLFIGFGSGNALVLRLNNLKSTIETREAHNPSSGTNSLMDINDDDDEEMDDLYADEAPEN GLTTNDSKGTVETVQPFDIELLSSLRNVGPITSLTVGKVSSIDDVVKGLPNPNKNEYSLVATSGNGSGSHLTVIQTSVQP EIELALKFISITQIWNLKIKGRDRYLITTDSTKSRSDIYESDNNFKLHKGGRLRRDATTVYISMFGEEKRIIQVTTNHLY LYDTHFRRLTTIKFDYEVIHVSVMDPYILVTVSRGDIKIFELEEKNKRKLLKVDLPEILNEMVITSGLILKSNMCNEFLI GLSKSQEEQLLFTFVTADNQIIFFTKDHNDRIFQLNGVDQLNESLYISTYQLGDEIVPDPSIKQVMINKLGHDNKEEYLT ILTFGGEIYQYRKLPQRRSRFYRNVTRNDLAITGAPDNAYAKGVSSIERIMHYFPDYNGYSVIFVTGSVPYILIKEDDST PKIFKFGNIPLVSVTPWSERSVMCVDDIKNARVYTLTTDNMYYGNKLPLKQIKISNVLDDYKTLQKLVYHERAQLFLVSY CKRVPYEALGEDGEKVIGYDENVPHAEGFQSGILLINPKSWKVIDKIDFPKNSVVNEMRSSMIQINSKTKRKREYIIAGV ANATTEDTPPTGAFHIYDVIEVVPEPGKPDTNYKLKEIFQEEVSGTVSTVCEVSGRFMISQSQKVLVRDIQEDNSVIPVA FLDIPVFVTDSKSFGNLLIIGDAMQGFQFIGFDAEPYRMISLGRSMSKFQTMSLEFLVNGGDMYFAATDADRNVHVLKYA PDEPNSLSGQRLVHCSSFTLHSTNSCMMLLPRNEEFGSPQVPSFQNVGGQVDGSVFKIVPLSEEKYRRLYVIQQQIIDRE LQLGGLNPRMERLANDFYQMGHSMRPMLDFNVIRRFCGLAIDRRKSIAQKAGRHAHFEAWRDIINIEFSMRSLCQGK ; 1 2 UNP A0A6A5Q2R8_YEASX A0A6A5Q2R8 ? 2 ;MSLIHPDTAKYPFKFEPFLRQEYSFSLDPDRPICEFYNSREGPKSCPRGPLCPKKHVLPIFQNKIVCRHWLRGLCKKNDQ CEYLHEYNLRKMPECVFFSKNGYCTQSPDCQYLHIDPASKIPKCENYEMGFCPLGSSCPRRHIKKVFCQRYMTGFCPLGK DECDMEHPQFIIPDEGSKLRIKRDDEINTRKMDEEKERRLNAIINGEV ; 1 3 UNP CFT2_YEAST Q12102 ? 3 ;MTYKYNCCDDGSGTTVGSVVRFDNVTLLIDPGWNPSKVSYEQCIKYWEKVIPEIDVIILSQPTIECLGAHSLLYYNFTSH FISRIQVYATLPVINLGRVSTIDSYASAGVIGPYDTNKLDLEDIEISFDHIVPLKYSQLVDLRSRYDGLTLLAYNAGVCP GGSIWCISTYSEKLVYAKRWNHTRDNILNAASILDATGKPLSTLMRPSAIITTLDRFGSSQPFKKRSKIFKDTLKKGLSS DGSVIIPVDMSGKFLDLFTQVHELLFESTKINAHTQVPVLILSYARGRTLTYAKSMLEWLSPSLLKTWENRNNTSPFEIG SRIKIIAPNELSKYPGSKICFVSEVGALINEVIIKVGNSEKTTLILTKPSFECASSLDKILEIVEQDERNWKTFPEDGKS FLCDNYISIDTIKEEPLSKEETEAFKVQLKEKKRDRNKKILLVKRESKKLANGNAIIDDTNGERAMRNQDILVENVNGVP PIDHIMGGDEDDDEEEENDNLLNLLKDNSEKSAAKKNTEVPVDIIIQPSAASKHKMFPFNPAKIKKDDYGTVVDFTMFLP DDSDNVNQNSRKRPLKDGAKTTSPVNEEDNKNEEEDGYNMSDPISKRSKHRASRYSGFSGTGEAENFDNLDYLKIDKTLS KRTISTVNVQLKCSVVILNLQSLVDQRSASIIWPSLKSRKIVLSAPKQIQNEEITAKLIKKNIEVVNMPLNKIVEFSTTI ; 1 4 UNP A0A6A5Q543_YEASX A0A6A5Q543 ? 4 ;MDGHNQNQYQNQNQIQQSQQPPLKKYVTQRRSVDVSSPYINLYYNRRHGLPNLVVEPETSYTIDIMPPNAYRGRDRVINL PSKFTHLSSNKVKHVIPAIQWTPEGRRLVVATYSGEFSLWNASSFTFETLMQAHDSAVTTMKYSHDSDWMISGDADGMIK IWQPNFSMVKEIDAAHTESIRDMAFSSNDSKFVTCSDDNILKIWNFSNGKQERVLSGHHWDVKSCDWHPEMGLIASASKD NLVKLWDPRSGNCISSILKFKHTVLKTRFQPTKGNLLMAISKDKSCRVFDIRYSMKELMCVRDETDYMTLEWHPINESMF TLACYDGSLKHFDLLQNLNEPILTIPYAHDKCITSLSYNPVGHIFATAAKDRTIRFWTRARPIDPNAYDDPTYNNKKING WFFGINNDINAVREKSEFGAAPPPPATLEPHALPNMNGFINKKPRQEIPGIDSNIKSSTLPGLSI ; 1 5 PDB 7ZGR 7ZGR ? 5 ? 1 6 UNP A0A6A5PV64_YEASX A0A6A5PV64 ? 6 ;MSSTIFYRFKSQRNTSRILFDGTGLTVFDLKREIIQENKLGDGTDFQLKIYNPDTEEEYDDDAFVIPRSTSVIVKRSPAI KSFSVHSRLKGNVGAAALGNATRYVTGRPRVLQKRQHTATTTANVSGTTEEERIASMFATQENQWEQTQEEMSAATPVFF KSQTNKNSAQENEGPPPPGYMCYRCGGRDHWIKNCPTNSDPNFEGKRIRRTTGIPKKFLKSIEIDPETMTPEEMAQRKIM ITDEGKFVVQVEDKQSWEDYQRKRENRQIDGDETIWRKGHFKDLPDDLKCPLTGGLLRQPVKTSKCCNIDFSKEALENAL VESDFVCPNCETRDILLDSLVPDQDKEKEVETFLKKQEELHGSSKDGNQPETKKMKLMDPTGTAGLNNNTSLPTSVNNGG TPVPPVPLPFGIPPFPMFPMPFMPPTATITNPHQADASPKK ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7ZGR A 1 ? 1357 ? 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'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 'Zn 2' 65.409 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7ZGR _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 7ZGR _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 14830 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.537 ? 20113 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 15.516 ? 5489 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.044 ? 2273 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 2561 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7ZGR _struct.title 'Polymerase module of yeast CPF in complex with Mpe1, the yPIM of Cft2 and the pre-cleaved CYC1 RNA' _struct.pdbx_structure_determination_methodology ? _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7ZGR _struct_keywords.text ;CPF, 3'-end processing, RNA BINDING PROTEIN ; _struct_keywords.pdbx_keywords 'RNA BINDING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? 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ASP C 554 PHE C 558 5 ? 5 HELX_P HELX_P21 AC3 VAL D 35 ? HIS D 48 ? VAL D 35 HIS D 48 1 ? 14 HELX_P HELX_P22 AC4 GLU D 58 ? ILE D 65 ? GLU D 58 ILE D 65 5 ? 8 HELX_P HELX_P23 AC5 PRO D 67 ? TYR D 71 ? PRO D 67 TYR D 71 5 ? 5 HELX_P HELX_P24 AC6 ARG D 72 ? LEU D 80 ? ARG D 72 LEU D 80 5 ? 9 HELX_P HELX_P25 AC7 PHE D 402 ? ASP D 408 ? PHE D 402 ASP D 408 1 ? 7 HELX_P HELX_P26 AC8 ASP F 253 ? GLU F 265 ? ASP F 253 GLU F 265 1 ? 13 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? 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B HIS 85 B ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? ? # _struct_conn_type.id metalc _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 5 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 5 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 9 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 4 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 8 ? AC3 ? 4 ? AC4 ? 3 ? AC5 ? 4 ? AC6 ? 4 ? AC7 ? 4 ? AC8 ? 4 ? AC9 ? 4 ? 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