data_7ZX8 # _entry.id 7ZX8 # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.364 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 7ZX8 pdb_00007zx8 10.2210/pdb7zx8/pdb WWPDB D_1292123111 ? ? 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'Urlaub, H.' 7 ? 'Dienemann, C.' 8 ? 'Vannini, A.' 9 ? 'Cramer, P.' 10 ? # loop_ _citation.abstract _citation.abstract_id_CAS _citation.book_id_ISBN _citation.book_publisher _citation.book_publisher_city _citation.book_title _citation.coordinate_linkage _citation.country _citation.database_id_Medline _citation.details _citation.id _citation.journal_abbrev _citation.journal_id_ASTM _citation.journal_id_CSD _citation.journal_id_ISSN _citation.journal_full _citation.journal_issue _citation.journal_volume _citation.language _citation.page_first _citation.page_last _citation.title _citation.year _citation.database_id_CSD _citation.pdbx_database_id_DOI _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_patent _citation.unpublished_flag ? ? ? ? ? ? ? US ? ? primary Nat.Struct.Mol.Biol. ? ? 1545-9985 ? ? 29 ? 1159 1169 'Structural basis of SNAPc-dependent snRNA transcription initiation by RNA polymerase II.' 2022 ? 10.1038/s41594-022-00857-w 36424526 ? ? ? ? ? ? ? ? ? US ? ? 1 Biorxiv ? ? 2692-8205 ? ? ? ? ? ? 'Structural basis of SNAPc-dependent snRNA transcription initiation by RNA polymerase II' 2022 ? 10.1101/2022.09.21.508861 ? ? ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Rengachari, S.' 1 ? primary 'Schilbach, S.' 2 ? primary 'Kaliyappan, T.' 3 ? primary 'Gouge, J.' 4 ? primary 'Zumer, K.' 5 ? primary 'Schwarz, J.' 6 ? primary 'Urlaub, H.' 7 ? primary 'Dienemann, C.' 8 ? primary 'Vannini, A.' 9 ? primary 'Cramer, P.' 10 ? 1 'Rengachari, S.' 11 ? 1 'Schilbach, S.' 12 ? 1 'Kaliyappan, T.' 13 ? 1 'Gouge, J.' 14 ? 1 'Zumer, K.' 15 ? 1 'Schwarz, J.' 16 ? 1 'Urlaub, H.' 17 ? 1 'Dienemann, C.' 18 ? 1 'Vannini, A.' 19 ? 1 'Cramer, P.' 20 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 7ZX8 _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 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subunit RPABC2,RPB6 homolog' 9 'RNA polymerase II subunit B9,DNA-directed RNA polymerase II subunit I,RNA polymerase II 14.5 kDa subunit,RPB14.5' 13 'General transcription factor TFIIB,S300-II' 15 'TATA sequence-binding protein,TATA-binding factor,TATA-box factor,Transcription initiation factor TFIID TBP subunit' 16 ;General transcription factor IIF 74 kDa subunit,Transcription initiation factor IIF subunit alpha,TFIIF-alpha,Transcription initiation factor RAP74 ; 17 ;ATP-dependent helicase GTF2F2,General transcription factor IIF 30 kDa subunit,Transcription initiation factor IIF subunit beta,TFIIF-beta,Transcription initiation factor RAP30 ; 19 'General transcription factor IIA subunit 1,TFIIAL,Transcription initiation factor TFIIA 42 kDa subunit,TFIIA-42' 20 ;General transcription factor IIA subunit 2,TFIIA p12 subunit,TFIIA-12,TFIIAS,Transcription initiation factor IIA gamma chain,TFIIA-gamma ; 21 ;SNAPc subunit 1,Proximal sequence element-binding transcription factor subunit gamma,PSE-binding factor subunit gamma,PTF subunit gamma,Small nuclear RNA-activating complex polypeptide 1,snRNA-activating protein complex 43 kDa subunit,SNAPc 43 kDa subunit ; 22 ;SNAPc subunit 3,Proximal sequence element-binding transcription factor subunit beta,PSE-binding factor subunit beta,PTF subunit beta,Small nuclear RNA-activating complex polypeptide 3,snRNA-activating protein complex 50 kDa subunit,SNAPc 50 kDa subunit ; 23 ;SNAPc subunit 4,Proximal sequence element-binding transcription factor subunit alpha,PSE-binding factor subunit alpha,PTF subunit alpha,snRNA-activating protein complex 190 kDa subunit,SNAPc 190 kDa subunit ; 24 ;SNAPc subunit 5,Small nuclear RNA-activating complex polypeptide 5,snRNA-activating protein complex 19 kDa subunit,SNAPc 19 kDa subunit ; # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MHGGGPPSGDSACPLRTIKRVQFGVLSPDELKRMSVTEGGIKYPETTEGGRPKLGGLMDPRQGVIERTGRCQTCAGNMTE CPGHFGHIELAKPVFHVGFLVKTMKVLRCVCFFCSKLLVDSNNPKIKDILAKSKGQPKKRLTHVYDLCKGKNICEGGEEM DNKFGVEQPEGDEDLTKEKGHGGCGRYQPRIRRSGLELYAEWKHVNEDSQEKKILLSPERVHEIFKRISDEECFVLGMEP RYARPEWMIVTVLPVPPLSVRPAVVMQGSARNQDDLTHKLADIVKINNQLRRNEQNGAAAHVIAEDVKLLQFHVATMVDN ELPGLPRAMQKSGRPLKSLKQRLKGKEGRVRGNLMGKRVDFSARTVITPDPNLSIDQVGVPRSIAANMTFAEIVTPFNID RLQELVRRGNSQYPGAKYIIRDNGDRIDLRFHPKPSDLHLQTGYKVERHMCDGDIVIFNRQPTLHKMSMMGHRVRILPWS TFRLNLSVTTPYNADFDGDEMNLHLPQSLETRAEIQELAMVPRMIVTPQSNRPVMGIVQDTLTAVRKFTKRDVFLERGEV MNLLMFLSTWDGKVPQPAILKPRPLWTGKQIFSLIIPGHINCIRTHSTHPDDEDSGPYKHISPGDTKVVVENGELIMGIL CKKSLGTSAGSLVHISYLEMGHDITRLFYSNIQTVINNWLLIEGHTIGIGDSIADSKTYQDIQNTIKKAKQDVIEVIEKA HNNELEPTPGNTLRQTFENQVNRILNDARDKTGSSAQKSLSEYNNFKSMVVSGAKGSKINISQVIAVVGQQNVEGKRIPF GFKHRTLPHFIKDDYGPESRGFVENSYLAGLTPTEFFFHAMGGREGLIDTAVKTAETGYIQRRLIKSMESVMVKYDATVR 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KVGIKTIKVYCQRMQEENITRALIVVQQGMTPSAKQSLVDMAPKYILEQFLQQELLINITEHELVPEHVVMTKEEVTELL ARYKLRENQLPRIQAGDPVARYFGIKRGQVVKIIRPSETAGRYITYRLVQ ; E ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MSDNEDNFDGDDFDDVEEDEGLDDLENAEEEGQENVEILPSGERPQANQKRITTPYMTKYERARVLGTRALQIAMCAPVM VELEGETDPLLIAMKELKARKIPIIIRRYLPDGSYEDWGVDELIISD ; ;MSDNEDNFDGDDFDDVEEDEGLDDLENAEEEGQENVEILPSGERPQANQKRITTPYMTKYERARVLGTRALQIAMCAPVM VELEGETDPLLIAMKELKARKIPIIIRRYLPDGSYEDWGVDELIISD ; F ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MFYHISLEHEILLHPRYFGPNLLNTVKQKLFTEVEGTCTGKYGFVIAVTTIDNIGAGVIQPGRGFVLYPVKYKAIVFRPF KGEVVDAVVTQVNKVGLFTEIGPMSCFISRHSIPSEMEFDPNSNPPCYKTMDEDIVIQQDDEIRLKIVGTRVDKNDIFAI GSLMDDYLGLVS ; ;MFYHISLEHEILLHPRYFGPNLLNTVKQKLFTEVEGTCTGKYGFVIAVTTIDNIGAGVIQPGRGFVLYPVKYKAIVFRPF KGEVVDAVVTQVNKVGLFTEIGPMSCFISRHSIPSEMEFDPNSNPPCYKTMDEDIVIQQDDEIRLKIVGTRVDKNDIFAI GSLMDDYLGLVS ; G ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MAGILFEDIFDVKDIDPEGKKFDRVSRLHCESESFKMDLILDVNIQIYPVDLGDKFRLVIASTLYEDGTLDDGEYNPTDD RPSRADQFEYVMYGKVYRIEGDETSTEAATRLSAYVSYGGLLMRLQGDANNLHGFEVDSRVYLLMKKLAF ; ;MAGILFEDIFDVKDIDPEGKKFDRVSRLHCESESFKMDLILDVNIQIYPVDLGDKFRLVIASTLYEDGTLDDGEYNPTDD RPSRADQFEYVMYGKVYRIEGDETSTEAATRLSAYVSYGGLLMRLQGDANNLHGFEVDSRVYLLMKKLAF ; H ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MEPDGTYEPGFVGIRFCQECNNMLYPKEDKENRILLYACRNCDYQQEADNSCIYVNKITHEVDELTQIIADVSQDPTLPR TEDHPCQKCGHKEAVFFQSHSARAEDAMRLYYVCTAPHCGHRWTE ; ;MEPDGTYEPGFVGIRFCQECNNMLYPKEDKENRILLYACRNCDYQQEADNSCIYVNKITHEVDELTQIIADVSQDPTLPR TEDHPCQKCGHKEAVFFQSHSARAEDAMRLYYVCTAPHCGHRWTE ; I ? 10 'polypeptide(L)' no no MIIPVRCFTCGKIVGNKWEAYLGLLQAEYTEGDALDALGLKRYCCRRMLLAHVDLIEKLLNYAPLEK MIIPVRCFTCGKIVGNKWEAYLGLLQAEYTEGDALDALGLKRYCCRRMLLAHVDLIEKLLNYAPLEK J ? 11 'polypeptide(L)' no no ;MNAPPAFESFLLFEGEKKITINKDTKVPNACLFTINKEDHTLGNIIKSQLLKDPQVLFAGYKVPHPLEHKIIIRVQTTPD YSPQEAFTNAITDLISELSLLEERFRVAIKDKQEGIE ; ;MNAPPAFESFLLFEGEKKITINKDTKVPNACLFTINKEDHTLGNIIKSQLLKDPQVLFAGYKVPHPLEHKIIIRVQTTPD YSPQEAFTNAITDLISELSLLEERFRVAIKDKQEGIE ; K ? 12 'polypeptide(L)' no no MDTQKDVQPPKQQPMIYICGECHTENEIKSRDPIRCRECGYRIMYKKRTKRLVVFDAR MDTQKDVQPPKQQPMIYICGECHTENEIKSRDPIRCRECGYRIMYKKRTKRLVVFDAR L ? 13 'polypeptide(L)' no no ;MASTSRLDALPRVTCPNHPDAILVEDYRAGDMICPECGLVVGDRVIDVGSEWRTFSNDKATKDPSRVGDSQNPLLSDGDL STMIGKGTGAASFDEFGNSKYQNRRTMSSSDRAMMNAFKEITTMADRINLPRNIVDRTNNLFKQVYEQKSLKGRANDAIA SACLYIACRQEGVPRTFKEICAVSRISKKEIGRCFKLILKALETSVDLITTGDFMSRFCSNLCLPKQVQMAATHIARKAV ELDLVPGRSPISVAAAAIYMASQASAEKRTQKEIGDIAGVADVTIRQSYRLIYPRAPDLFPTDFKFDTPVDKLPQL ; ;MASTSRLDALPRVTCPNHPDAILVEDYRAGDMICPECGLVVGDRVIDVGSEWRTFSNDKATKDPSRVGDSQNPLLSDGDL STMIGKGTGAASFDEFGNSKYQNRRTMSSSDRAMMNAFKEITTMADRINLPRNIVDRTNNLFKQVYEQKSLKGRANDAIA SACLYIACRQEGVPRTFKEICAVSRISKKEIGRCFKLILKALETSVDLITTGDFMSRFCSNLCLPKQVQMAATHIARKAV ELDLVPGRSPISVAAAAIYMASQASAEKRTQKEIGDIAGVADVTIRQSYRLIYPRAPDLFPTDFKFDTPVDKLPQL ; M ? 14 polydeoxyribonucleotide no no ;(DG)(DC)(DA)(DA)(DG)(DT)(DG)(DA)(DC)(DC)(DG)(DT)(DG)(DT)(DG)(DT)(DG)(DT)(DA)(DA) (DA)(DG)(DA)(DG)(DT)(DG)(DA)(DG)(DG)(DC)(DG)(DT)(DA)(DT)(DG)(DA)(DG)(DG)(DC)(DT) 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(DG)(DC)(DC)(DT)(DC)(DT)(DG)(DC)(DC)(DC)(DC)(DG)(DA)(DC)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DC) (DT)(DC)(DA)(DT)(DA)(DC)(DG)(DC)(DC)(DT)(DC)(DA)(DC)(DT)(DC)(DT)(DT)(DT)(DA)(DC) (DA)(DC)(DA)(DC)(DA)(DC)(DG)(DG)(DT)(DC)(DA)(DC)(DT)(DT)(DG)(DC) ; ;ATCATGGTATCTCCCCTGCCAGGTAAGTATGAAACGTTGTGCCTCTGCCCCGACACAGCCTCATACGCCTCACTCTTTAC ACACACGGTCACTTGC ; T ? 19 'polypeptide(L)' no no ;MANSANTNTVPKLYRSVIEDVINDVRDIFLDDGVDEQVLMELKTLWENKLMQSRAVDGFHSEEQQLLLQVQQQHQPQQQQ HHHHHHHQQAQPQQTVPQQAQTQQVLIPASQQATAPQVIVPDSKLIQHMNASNMSAAATAATLALPAGVTPVQQILTNSG QLLQVVRAANGAQYIFQPQQSVVLQQQVIPQMQPGGVQAPVIQQVLAPLPGGISPQTGVIIQPQQILFTGNKTQVIPTTV AAPTPAQAQITATGQQQPQAQPAQTQAPLVLQVDGTGDTSSEEDEDEEEDYDDDEEEDKEKDGAEDGQVEEEPLNSEDDV SDEEGQELFDTENVVVCQYDKIHRSKNKWKFHLKDGIMNLNGRDYIFSKAIGDAEW ; ;MANSANTNTVPKLYRSVIEDVINDVRDIFLDDGVDEQVLMELKTLWENKLMQSRAVDGFHSEEQQLLLQVQQQHQPQQQQ HHHHHHHQQAQPQQTVPQQAQTQQVLIPASQQATAPQVIVPDSKLIQHMNASNMSAAATAATLALPAGVTPVQQILTNSG QLLQVVRAANGAQYIFQPQQSVVLQQQVIPQMQPGGVQAPVIQQVLAPLPGGISPQTGVIIQPQQILFTGNKTQVIPTTV 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24 ;MLSRLQELRKEEETLLRLKAALHDQLNRLKVEELALQSMISSRRGDEMLSSHTVPEQSHDMLVHVDNEASINQTTLELST KSHVTEEEEEEEEEESDS ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7ZX8 A 1 ? 1970 ? A0A8D1DPV6 1 ? 1970 ? 1 1970 2 2 7ZX8 B 1 ? 1174 ? I3LGP4 78 ? 1251 ? 1 1174 3 3 7ZX8 C 1 ? 275 ? I3LCH3 1 ? 275 ? 1 275 4 4 7ZX8 D 1 ? 142 ? A0A287ADR4 43 ? 184 ? 1 142 5 5 7ZX8 E 1 ? 210 ? I3LSI7 1 ? 210 ? 1 210 6 6 7ZX8 F 1 ? 127 ? F1SKN8 1 ? 127 ? 1 127 7 7 7ZX8 G 1 ? 172 ? I3LJZ9 1 ? 172 ? 1 172 8 8 7ZX8 H 1 ? 150 ? A0A4X1ULF2 1 ? 150 ? 1 150 9 9 7ZX8 I 1 ? 125 ? P60899 1 ? 125 ? 1 125 10 10 7ZX8 J 1 ? 67 ? A0A4X1VYD0 1 ? 67 ? 1 67 11 11 7ZX8 K 1 ? 117 ? A0A4X1UK25 1 ? 117 ? 1 117 12 12 7ZX8 L 1 ? 58 ? I3LN51 1 ? 58 ? 1 58 13 13 7ZX8 M 1 ? 316 ? Q00403 1 ? 316 ? 1 316 14 14 7ZX8 N 1 ? 96 ? 8452475 69796 ? 69701 ? -34 61 15 15 7ZX8 O 1 ? 339 ? P20226 1 ? 339 ? 1 339 16 16 7ZX8 Q 1 ? 517 ? P35269 1 ? 517 ? 1 517 17 17 7ZX8 R 1 ? 249 ? P13984 1 ? 249 ? 1 249 18 18 7ZX8 T 1 ? 96 ? 8452475 69701 ? 69796 ? -61 34 19 19 7ZX8 U 1 ? 376 ? P52655 1 ? 376 ? 1 376 20 20 7ZX8 V 1 ? 109 ? P52657 1 ? 109 ? 1 109 21 21 7ZX8 a 1 ? 368 ? Q16533 1 ? 368 ? 1 368 22 22 7ZX8 b 1 ? 411 ? Q92966 1 ? 411 ? 2 411 23 23 7ZX8 c 1 ? 1469 ? Q5SXM2 1 ? 1469 ? 1 1469 24 24 7ZX8 d 1 ? 98 ? O75971 1 ? 98 ? 1 98 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 'Zn 2' 65.409 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7ZX8 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 7ZX8 _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 ? 50731 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.610 ? 69015 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 18.438 ? 19551 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.095 ? 7639 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 8512 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7ZX8 _struct.title 'Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (OC)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7ZX8 _struct_keywords.text 'RNA polymerase II, Pol II, PIC, SNAPc, snRNA, U1 promoter, TRANSCRIPTION' _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSCRIPTION # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 13 ? N N N 14 ? O N N 15 ? P N N 16 ? 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ASP c 383 SER c 394 1 ? 12 HELX_P HELX_P212 AX5 ARG X 4 ? GLY X 45 ? ARG d 4 GLY d 45 1 ? 42 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? 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C CYS 94 SG ? ? ? 1_555 CA ZN . ZN ? ? C CYS 94 C ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? ? metalc20 metalc ? ? C CYS 97 SG ? ? ? 1_555 CA ZN . ZN ? ? C CYS 97 C ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.363 ? ? metalc21 metalc ? ? I CYS 17 SG ? ? ? 1_555 DA ZN . ZN ? ? I CYS 17 I ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? ? metalc22 metalc ? ? I CYS 20 SG ? ? ? 1_555 DA ZN . ZN ? ? I CYS 20 I ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? ? metalc23 metalc ? ? I CYS 39 SG ? ? ? 1_555 DA ZN . ZN ? ? I CYS 39 I ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.461 ? ? metalc24 metalc ? ? I CYS 42 SG ? ? ? 1_555 DA ZN . ZN ? ? I CYS 42 I ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.555 ? ? metalc25 metalc ? ? I CYS 86 SG ? ? ? 1_555 EA ZN . ZN ? ? I CYS 86 I ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? ? metalc26 metalc ? ? I CYS 89 SG ? ? ? 1_555 EA ZN . ZN ? ? I CYS 89 I ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? ? metalc27 metalc ? ? I CYS 114 SG ? ? ? 1_555 EA ZN . ZN ? ? I CYS 114 I ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.293 ? ? metalc28 metalc ? ? I CYS 119 SG ? ? ? 1_555 EA ZN . ZN ? ? I CYS 119 I ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.270 ? ? metalc29 metalc ? ? J CYS 7 SG ? ? ? 1_555 FA ZN . ZN ? ? J CYS 7 J ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? ? metalc30 metalc ? ? J CYS 10 SG ? ? ? 1_555 FA ZN . ZN ? ? J CYS 10 J ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.276 ? ? metalc31 metalc ? ? J CYS 44 SG ? ? ? 1_555 FA ZN . ZN ? ? J CYS 44 J ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? ? metalc32 metalc ? ? J CYS 45 SG ? ? ? 1_555 FA ZN . ZN ? ? J CYS 45 J ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.241 ? ? metalc33 metalc ? ? L CYS 19 SG ? ? ? 1_555 GA ZN . ZN ? ? L CYS 19 L ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.300 ? ? metalc34 metalc ? ? L CYS 22 SG ? ? ? 1_555 GA ZN . ZN ? ? L CYS 22 L ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? ? metalc35 metalc ? ? L CYS 36 SG ? ? ? 1_555 GA ZN . ZN ? ? L CYS 36 L ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.206 ? ? metalc36 metalc ? ? L CYS 39 SG ? ? ? 1_555 GA ZN . ZN ? ? L CYS 39 L ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.259 ? ? metalc37 metalc ? ? M CYS 15 SG ? ? ? 1_555 HA ZN . ZN ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 TYR 413 A . ? TYR 413 A PRO 414 A ? PRO 414 A 1 -2.63 2 GLN 461 A . ? GLN 461 A PRO 462 A ? PRO 462 A 1 0.64 3 LYS 581 A . ? LYS 581 A PRO 582 A ? PRO 582 A 1 1.09 4 PRO 68 U . ? 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