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EMDB EMD-30528 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2020-12-16 2 'Structure model' 1 1 2020-12-23 3 'Structure model' 1 2 2024-03-27 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Database references' 2 3 'Structure model' 'Data collection' 3 3 'Structure model' 'Database references' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 2 'Structure model' citation 2 2 'Structure model' citation_author 3 3 'Structure model' chem_comp_atom 4 3 'Structure model' chem_comp_bond 5 3 'Structure model' database_2 # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 2 'Structure model' '_citation.page_first' 2 2 'Structure model' '_citation.page_last' 3 2 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_PubMed' 4 2 'Structure model' '_citation.title' 5 2 'Structure model' '_citation_author.name' 6 3 'Structure model' '_database_2.pdbx_DOI' 7 3 'Structure model' '_database_2.pdbx_database_accession' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7D0A _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2020-09-09 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBJ _pdbx_database_status.process_site PDBJ _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'cryo EM map of the Acinetobacter MlaFEDB complex in ADP-vanadate trapped Vclose conformation' _pdbx_database_related.db_id EMD-30528 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Zhang, Y.Y.' 1 ? 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;MNTIAWLGRLVIERIRGIGVAALMLLQIIFSLPSAGGFGRFVYQMHRVGVMSLLIITVSGLFIGLVLGLQGYSILVNVGS ESMLGTMVSLTLLRELAPVVAALLFAGRAGSALTAEIGSMKQSEQLASMEMIGVDPLKQIVSPRLWAGIVSLPMLTVIFA AIGIVGGKLVGVDFLGVDEGSFWSGMQNNVQFGHDVVNGIIKSIVFALLCTWIAVFQGYACDPTPEGIATAMTRTVVYSS LCVLGFDFVLTAVMFGGI ; A,D ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MMNNKTPLSTQSLIEVKNLSFNRGERVIYDNISLNIRRGQITAIMGPSGTGKTTLLRLIGGQLVPDQGEVLLDGKDIAQM SRQELFAARARMGMLFQSGALFTDMSVYENVAFPIRAHTKLSENLIAELVALKLESVGLRGTEQLMPTELSGGMNRRVAL ARAIALDPDLIMYDEPFAGQDPIVKGVLTRLIRSLREALDLTTIIVSHDVPETLSIADYIYVVAEGKIQGEGTPEELQAY ASPFVKQFLTGSAEGPVEYQFSHQAYLDNEVRP ; ;MMNNKTPLSTQSLIEVKNLSFNRGERVIYDNISLNIRRGQITAIMGPSGTGKTTLLRLIGGQLVPDQGEVLLDGKDIAQM SRQELFAARARMGMLFQSGALFTDMSVYENVAFPIRAHTKLSENLIAELVALKLESVGLRGTEQLMPTELSGGMNRRVAL ARAIALDPDLIMYDEPFAGQDPIVKGVLTRLIRSLREALDLTTIIVSHDVPETLSIADYIYVVAEGKIQGEGTPEELQAY ASPFVKQFLTGSAEGPVEYQFSHQAYLDNEVRP ; B,E ? 3 'polypeptide(L)' no no ;VVQYLNQELVVSGKIDFENAEQQYQAGLAIIKKQTSFPLIVDLKQLEHGNTLALAVLVQWLRQTPQKSGLHFKNVPEKML KIIQACHLQEDLHLVLEHHHHHH ; ;VVQYLNQELVVSGKIDFENAEQQYQAGLAIIKKQTSFPLIVDLKQLEHGNTLALAVLVQWLRQTPQKSGLHFKNVPEKML KIIQACHLQEDLHLVLEHHHHHH ; C,F ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MKSRTSELAVGIFVIIFGIALFFLAMKVSGLVGTNLSDGYTMKAQFDNVNGLKPRAKVTMSGVTIGRVDSITLDPVTRLA TVTFDLDGKLTSFNAEQLKEVQKNALDELRYSSDYTQATPAQQKTMEQQLISNMNSITSIDEDAYIMVATNGLLGEKYLK IVPGGGLNYLKRGDTISNTQGTMDLEDLISKFITGGGAGKVAAGSSSAEEKAPASTDSSAQPSFVE ; ;MKSRTSELAVGIFVIIFGIALFFLAMKVSGLVGTNLSDGYTMKAQFDNVNGLKPRAKVTMSGVTIGRVDSITLDPVTRLA TVTFDLDGKLTSFNAEQLKEVQKNALDELRYSSDYTQATPAQQKTMEQQLISNMNSITSIDEDAYIMVATNGLLGEKYLK IVPGGGLNYLKRGDTISNTQGTMDLEDLISKFITGGGAGKVAAGSSSAEEKAPASTDSSAQPSFVE ; G,H,I,J,K,L ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 5 "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" ADP 6 'VANADATE ION' VO4 # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ASN n 1 3 THR n 1 4 ILE n 1 5 ALA n 1 6 TRP n 1 7 LEU n 1 8 GLY n 1 9 ARG n 1 10 LEU n 1 11 VAL n 1 12 ILE n 1 13 GLU 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L GLN 122 CD 396 1 Y 1 L GLN 122 ? OE1 ? L GLN 122 OE1 397 1 Y 1 L GLN 122 ? NE2 ? L GLN 122 NE2 398 1 Y 1 L GLN 123 ? CG ? L GLN 123 CG 399 1 Y 1 L GLN 123 ? CD ? L GLN 123 CD 400 1 Y 1 L GLN 123 ? OE1 ? L GLN 123 OE1 401 1 Y 1 L GLN 123 ? NE2 ? L GLN 123 NE2 402 1 Y 1 L LYS 124 ? CG ? L LYS 124 CG 403 1 Y 1 L LYS 124 ? CD ? L LYS 124 CD 404 1 Y 1 L LYS 124 ? CE ? L LYS 124 CE 405 1 Y 1 L LYS 124 ? NZ ? L LYS 124 NZ 406 1 Y 1 L THR 125 ? OG1 ? L THR 125 OG1 407 1 Y 1 L THR 125 ? CG2 ? L THR 125 CG2 408 1 Y 1 L MET 126 ? CG ? L MET 126 CG 409 1 Y 1 L MET 126 ? SD ? L MET 126 SD 410 1 Y 1 L MET 126 ? CE ? L MET 126 CE 411 1 Y 1 L GLU 127 ? CG ? L GLU 127 CG 412 1 Y 1 L GLU 127 ? CD ? L GLU 127 CD 413 1 Y 1 L GLU 127 ? OE1 ? L GLU 127 OE1 414 1 Y 1 L GLU 127 ? OE2 ? L GLU 127 OE2 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 7D0A _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7D0A _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7D0A _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7D0A _struct.title 'Acinetobacter MlaFEDB complex in ADP-vanadate trapped Vclose conformation' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7D0A _struct_keywords.text 'MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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'expression tag' 103 20 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support microscopy _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASN A 2 ? LEU A 7 ? ASN A 2 LEU A 7 1 ? 6 HELX_P HELX_P2 AA2 ARG A 9 ? PHE A 30 ? ARG A 9 PHE A 30 1 ? 22 HELX_P HELX_P3 AA3 GLY A 36 ? VAL A 48 ? GLY A 36 VAL A 48 1 ? 13 HELX_P HELX_P4 AA4 VAL A 48 ? VAL A 76 ? VAL A 48 VAL A 76 1 ? 29 HELX_P HELX_P5 AA5 MET A 83 ? GLU A 95 ? MET A 83 GLU A 95 1 ? 13 HELX_P HELX_P6 AA6 GLU A 95 ? LEU A 113 ? GLU A 95 LEU A 113 1 ? 19 HELX_P HELX_P7 AA7 THR A 114 ? SER A 123 ? THR A 114 SER A 123 1 ? 10 HELX_P HELX_P8 AA8 GLU A 124 ? GLY A 133 ? GLU A 124 GLY A 133 1 ? 10 HELX_P HELX_P9 AA9 ASP A 135 ? ILE A 140 ? ASP A 135 ILE A 140 1 ? 6 HELX_P HELX_P10 AB1 VAL A 141 ? LEU A 152 ? VAL A 141 LEU A 152 1 ? 12 HELX_P HELX_P11 AB2 LEU A 152 ? LEU A 175 ? LEU A 152 LEU A 175 1 ? 24 HELX_P HELX_P12 AB3 ASP A 178 ? VAL A 190 ? ASP A 178 VAL A 190 1 ? 13 HELX_P HELX_P13 AB4 GLN A 191 ? ALA A 220 ? GLN A 191 ALA A 220 1 ? 30 HELX_P HELX_P14 AB5 GLU A 226 ? PHE A 246 ? GLU A 226 PHE A 246 1 ? 21 HELX_P HELX_P15 AB6 PHE A 246 ? PHE A 255 ? 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TYR L 111 THR L 116 1 ? 6 HELX_P HELX_P86 AJ5 LYS L 124 ? ASN L 135 ? LYS L 124 ASN L 135 1 ? 12 HELX_P HELX_P87 AJ6 ASP L 184 ? ILE L 193 ? ASP L 184 ILE L 193 1 ? 10 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 4 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 6 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 8 ? AA9 ? 6 ? AB1 ? 8 ? AB2 ? 7 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 2 ? 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