data_7E8S # _entry.id 7E8S # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.354 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 7E8S pdb_00007e8s 10.2210/pdb7e8s/pdb WWPDB D_1300020863 ? ? EMDB EMD-31021 ? ? # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Intact of TRAPPII_state I.' _pdbx_database_related.db_id EMD-31021 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7E8S _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2021-03-02 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBJ _pdbx_database_status.process_site PDBJ _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Mi, C.C.' 1 ? 'Sui, S.F.' 2 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Sci Adv' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2375-2548 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 8 _citation.language ? _citation.page_first eabi5603 _citation.page_last eabi5603 _citation.title 'Structural basis for assembly of TRAPPII complex and specific activation of GTPase Ypt31/32.' _citation.year 2022 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1126/sciadv.abi5603 _citation.pdbx_database_id_PubMed 35080977 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Mi, C.' 1 0000-0001-8962-9507 primary 'Zhang, L.' 2 0000-0002-5207-7750 primary 'Huang, G.' 3 0000-0001-8667-0758 primary 'Shao, G.' 4 ? primary 'Yang, F.' 5 ? primary 'You, X.' 6 0000-0002-9181-8646 primary 'Dong, M.Q.' 7 0000-0002-6094-1182 primary 'Sun, S.' 8 0000-0002-9807-626X primary 'Sui, S.F.' 9 0000-0001-5253-2592 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'TRAPP-associated protein TCA17' 17371.008 2 ? ? ? ? 2 polymer man 'Trafficking protein particle complex subunit 33' 30786.176 2 ? ? ? ? 3 polymer man 'Trafficking protein particle complex subunit BET3' 22152.445 4 ? ? ? ? 4 polymer man 'Trafficking protein particle complex subunit BET5' 18453.875 2 ? ? ? ? 5 polymer man 'Trafficking protein particle complex subunit 23' 24889.262 2 ? ? ? ? 6 polymer man 'Trafficking protein particle complex subunit 31' 31743.639 2 ? ? ? ? 7 polymer man 'Trafficking protein particle complex subunit 20' 19721.154 2 ? ? ? ? 8 polymer man 'Trafficking protein particle complex II-specific subunit 130' 128225.062 2 ? ? ? ? 9 polymer man 'Trafficking protein particle complex II-specific subunit 120' 147807.281 2 ? ? ? ? 10 polymer man 'Trafficking protein particle complex II-specific subunit 65' 63434.473 2 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 '17 kDa TRAPP complex-associated protein' 2 'TRAPP subunit 33,Transport protein particle 33 kDa subunit' 3 'TRAPP subunit BET3,Transport protein particle 22 kDa subunit' 4 'TRAPP subunit BET5,Transport protein particle 18 kDa subunit' 5 'TRAPP subunit 23,Transport protein particle 23 kDa subunit' 6 'TRAPP subunit 31,Transport protein particle 31 kDa subunit' 7 'TRAPP subunit 20,Transport protein particle 20 kDa subunit' 8 'TRAPP II-specific subunit 130,Transport protein particle 130 kDa 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INNMIKRLKIEEHHTVDIIRSHNLIHELYKADEEEKEKVLARLRNIGFQIGLKLSELLIFSNNPNLKFKEMDLLLIMKFI CRDVWKQIFGKQIDNLKTNHRGTFYLLDYDYRPIQSFSLEEDAKNEELKMIEPFLEIPVGIIRGVLSSLGYSSEEVICLA SFIDRPTDRPKTAFPKGVSFHVQVTMPQ ; ;MSSTHSNNVGHPQSSPQGPLTEQQRAQQQYQIFENSLPKVSQSVYQMLLNEMVPLAMGIERQISGDVISSDSNVTSENGN INNMIKRLKIEEHHTVDIIRSHNLIHELYKADEEEKEKVLARLRNIGFQIGLKLSELLIFSNNPNLKFKEMDLLLIMKFI CRDVWKQIFGKQIDNLKTNHRGTFYLLDYDYRPIQSFSLEEDAKNEELKMIEPFLEIPVGIIRGVLSSLGYSSEEVICLA SFIDRPTDRPKTAFPKGVSFHVQVTMPQ ; B,M ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MVSTTQSRSLKAMGEEIWKNKTEKINTELFTLTYGSIVAQLCQDYERDFNKVNDHLYSMGYNIGCRLIEDFLARTALPRC ENLVKTSEVLSKCAFKIFLNITPNITNWSHNKDTFSLILDENPLADFVELPMDAMKSLWYSNILCGVLKGSLEMVQLDCD VWFVSDILRGDSQTEIKVKLNRILKDEIPIGED ; ;MVSTTQSRSLKAMGEEIWKNKTEKINTELFTLTYGSIVAQLCQDYERDFNKVNDHLYSMGYNIGCRLIEDFLARTALPRC ENLVKTSEVLSKCAFKIFLNITPNITNWSHNKDTFSLILDENPLADFVELPMDAMKSLWYSNILCGVLKGSLEMVQLDCD VWFVSDILRGDSQTEIKVKLNRILKDEIPIGED ; C,F,N,Q ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MGIYSFWIFDRHCNCIFDREWTLASNSASGTINSKQNEEDAKLLYGMIFSLRSITQKLSKGSVKNDIRSISTGKYRVHTY CTASGLWFVLLSDFKQQSYTQVLQYIYSHIYVKYVSNNLLSPYDFAENENEMRGQGTRKITNRNFISVLESFLAPMVNQ ; ;MGIYSFWIFDRHCNCIFDREWTLASNSASGTINSKQNEEDAKLLYGMIFSLRSITQKLSKGSVKNDIRSISTGKYRVHTY CTASGLWFVLLSDFKQQSYTQVLQYIYSHIYVKYVSNNLLSPYDFAENENEMRGQGTRKITNRNFISVLESFLAPMVNQ ; D,O ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MAIETILVINKSGGLIYQRNFTNDEQKLNSNEYLILASTLHGVFAIASQLTPKALQLTQQTNIENTIPYIPYVGMSSNRS DTRNGGGNNNKHTNNEKLGSFKGDDFFKEPFTNWNKSGLRQLCTDQFTMFIYQTLTGLKFVAISSSVMPQRQPTIATTDK PDRPKSTSNLAIQIADNFLRKVYCLYSDYVMKDPSYSMEMPIRSNLFDEKVKKMVENLQ ; ;MAIETILVINKSGGLIYQRNFTNDEQKLNSNEYLILASTLHGVFAIASQLTPKALQLTQQTNIENTIPYIPYVGMSSNRS DTRNGGGNNNKHTNNEKLGSFKGDDFFKEPFTNWNKSGLRQLCTDQFTMFIYQTLTGLKFVAISSSVMPQRQPTIATTDK PDRPKSTSNLAIQIADNFLRKVYCLYSDYVMKDPSYSMEMPIRSNLFDEKVKKMVENLQ ; E,P ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MSQRIIQPSASDQQFPGKSDGYEYTVGPKQAITSEASTTYIPSRIYSESLLFKRQEASLSAMAFLFQEMISQLHRTCKTA GDFETKLSDYGHNIGIRLLELLNFRASSSPSSLPRASAFLSQNESSSKLSNASNSPGMLANSSTATSASANERLQEKQTE SLSNYITKMRRRDLKILDILQFIHGTLWSYLFNHVSDDLVKSSERDNEYMIVDNFPTLTQFIPGENVSCEYFVCGIIKGF LFNAGFPCGVTAHRMPQGGHSQRTVYLIQFDRQVLDREGLRFG ; ;MSQRIIQPSASDQQFPGKSDGYEYTVGPKQAITSEASTTYIPSRIYSESLLFKRQEASLSAMAFLFQEMISQLHRTCKTA GDFETKLSDYGHNIGIRLLELLNFRASSSPSSLPRASAFLSQNESSSKLSNASNSPGMLANSSTATSASANERLQEKQTE SLSNYITKMRRRDLKILDILQFIHGTLWSYLFNHVSDDLVKSSERDNEYMIVDNFPTLTQFIPGENVSCEYFVCGIIKGF LFNAGFPCGVTAHRMPQGGHSQRTVYLIQFDRQVLDREGLRFG ; G,R ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MPQYFAIIGKKDNPVYEIEFTNAENPQGFPQDLKELNPFILHASLDIVEDLQWQINPTSQLNGNGGNGSNGGGGFLRSRA VNNTDNCYLGKVDHFYGLAITAYISYSGMKFVMIHGNSANSSVVIDDNNMRSFYQEVHELYVKTLMNPFYKITDPIRSPA FDSRVRTLARKHLSK ; ;MPQYFAIIGKKDNPVYEIEFTNAENPQGFPQDLKELNPFILHASLDIVEDLQWQINPTSQLNGNGGNGSNGGGGFLRSRA VNNTDNCYLGKVDHFYGLAITAYISYSGMKFVMIHGNSANSSVVIDDNNMRSFYQEVHELYVKTLMNPFYKITDPIRSPA FDSRVRTLARKHLSK ; H,S ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MDKEIYCGSVPVSYFDPFDLFESLRPEFQQILPLDNIHWKAFDGTVRTVNRLPIELIPEGRGEADKSNDEQPFIRFLIVN CISIDQYRAKVRPLVRQWLPNLESVSSSTGEKMIYKPIILLYANSEVVDSNLFKSVSLMEKFGKDFPHVQTLEVRSVYRS PKERQEFWNQFSQKIKASVLSIFQKRLTHLQHSLANLQKGNNFEEQLLTREKLYELYVVFNILEDASLELQKIKKEILRR NMNMPDGKLQVPFESSSKSDESLGSIIIEGTLDKFQLHKYFFIRRLRLLKLEDQTLTAFVGAFQLIKNFIESISIEYRKS VRLLEFKHYFITSMLSYFEFENVSNPLLCEIKAELLMLKRDNWVQGVMATSGYRLMDKNYPNSDVKYKFDLLKETFVDET VFQENFLTLTKEILSLFNKCEGKRQRIVDILSIEIGLLYYQGKKYEEAVSLFLSCYEYYTQTNKNSIGLKILQVFIDSLS HCPKLDVLQIDGESVSASAVLTNAFLNILKLCKDNDSKEIWWKKFMDLQMKNNIHLMYPLDGLFEVTLNSKVHLARANVS AIEVNLKSYGFPEDISTKTMRLSLKNMGGDVIVFGASDFLLKKGENKLILECRDIMYGEFSLLSFEIIVEGITFVKEFPE NQDEFIVVPEIYCKESTKVLVKQAHNLNLGEYALELKSVQSDALESLQVEVEVQKNIGNMKNLPVSFSMDEIQARKRYNT PFENVRLEYYLLDQITAFDLIIKTSFTKKNDQGTFGETKKVRIQCYLQLSVSVEDIFKKDIFFFKFLLNSSVREEPVILY SSELSAPDTRNDYNIRGDYIATTPALITFDGNESFINCYEITANNNFDSKDIFNLKVRYNTLKEQLDCFITDAVLIEGDV EWFILFEKWKTFWELEILKKLKYDYDAFKENRIIRLLKTSIDLNKTKSKIRNLCIEKAVLDKILICLNKVSRGIAVCNTD 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SSELSAPDTRNDYNIRGDYIATTPALITFDGNESFINCYEITANNNFDSKDIFNLKVRYNTLKEQLDCFITDAVLIEGDV EWFILFEKWKTFWELEILKKLKYDYDAFKENRIIRLLKTSIDLNKTKSKIRNLCIEKAVLDKILICLNKVSRGIAVCNTD MDEYVRNLVPKQLTVPVQLPGFEQFFHVQFEQMETSHDALHDTIATIGNSLSYTVIVENLSGQWGQDVIDDGGYIFEILS SNEWLIHGQKRCAIKEKRKEFEVHLIPLKKGYLNFPRVEITNINGKSCRVDHSNAFESILIF ; I,T ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MNILKHFPSYVGPSKIRTLVIPIGHWTRKEFNNAVQKLSEFNEIHLSDVTPIDSPIFTPQGFPHGKLFFDFLTIDHDDAL ELFLYDFEPFRKTFVIIGLVNDYSDPLTNLNFMKEKYPTLISPNLVYASSTPTKELEQTIDTMENVFASSPDMQKNIETI MCDIARNFLTALNSYYSSYKHVTLRSPGAIGGNAVLKTTLIRQNSYTSSSSSTPMSAVQSSVSSSSKAGSVTTASKRLSS FEMTTNSLKRSASLKLATTLSTSENRSQQKSLGRQMKILGNFQLLAGRYVDALNSFVDAITTLYKVRDYLWLGSALDGIS ICFLLLSYLGLSYQIPQIVSLICPVEKLNFESSSTGISPVDSNSKATASTTASSTPRNSISIAAMQSPRNSIMSLSAPAL NIDVENINLPLLIKCISDKVLYYYDLSLMHNSEYAPQVVYCEFLLKTLTFMTSCYKSSEFSKDVLDNIVKNQHRALSDIP NSPMFPRFEVYFYSNKLFELQLKEMQVEAQIKIYSTMAEVYRLLGYKRKQLFVLRLLMVALLATPNKIAWHPDYRTLIDT IIELLNINESEAKINVDDPSQSTWLILQKKILQLCIKVSRKINDFEYVAKFSSILITKYTHLLNQSEQDALFKEYIQPSI TNESITSYWDPFILREVVINRILDSDPTSNEIPLESDVSSLESLENRQKTQDINPQEVFNPFKRVQPTSFVSNNSTKVPI LVFLVGDKAEFTCRVQNPFKFDFTINDIQLDEEISEFCEIDRKAVSYSGPYNVKAESIRSITLPLIIKKPTYKKIYEISC LKISILKLPLQKFDIINDSRRSNPVEEEAEYSKCIYGKLKIKILPEQPQLELLSTSKMTRNSWMMLDGTKTDFHITVRNK SLSCAINHIKIIPMNNIEQMLKPDYWKKMPPDDLYIMEKQLDWLSKSCVRIIKLPTVIKPNETITFDLELDNTAVPFNFT GFDLLIEYGMSATDESCIYLKKLSIPYEVTLRRTIEVPSMDIIPLNELFSSQVENVDWIEYVMSKIRAESNLHSRDFILL LLDFRNSWIDGIKLNVQFEDFTSNEYHVEASHTSRIIVPIKKIDYKKYNFENTPIPRIFPGRQFIQSGLNEEQTIEMRQK FWCREHIISKLKCNWKLTTDQSVTGSVDFNKFIEKFDHKMVYTIYPGRLFYGVQLLLDEPKVKVGEIINLKIITEPTSTC RRKQNSTVNFLDIVIFDSKTSKILPRSNRRILYNGSLTKPISTTKVSEINLEIIPIEKGRYEFSVCISKSNNQDGIIQFD SENVILSVI ; ;MNILKHFPSYVGPSKIRTLVIPIGHWTRKEFNNAVQKLSEFNEIHLSDVTPIDSPIFTPQGFPHGKLFFDFLTIDHDDAL ELFLYDFEPFRKTFVIIGLVNDYSDPLTNLNFMKEKYPTLISPNLVYASSTPTKELEQTIDTMENVFASSPDMQKNIETI MCDIARNFLTALNSYYSSYKHVTLRSPGAIGGNAVLKTTLIRQNSYTSSSSSTPMSAVQSSVSSSSKAGSVTTASKRLSS FEMTTNSLKRSASLKLATTLSTSENRSQQKSLGRQMKILGNFQLLAGRYVDALNSFVDAITTLYKVRDYLWLGSALDGIS 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'polypeptide(L)' no no ;MECFVPLRCDLDGSNIEQLRQSHLSRKFIIFDEQLNLWLWFQGNSQENKRFVLQNMIILINEAQVTRTSTIDDYFTQVEN NENLWRLKNDCCSKILFKSNVVMNNGYNNQIKFVFEYKSVDANFNNQDSLQDPQAKYTLDKYSSEEILPSFEPVYSWSSA ATKSSKNTNNHLEKNNRATHRVSSKNSEVHEADVSRNPNTFTLKLQYPIFSLLNMRLRNISLKSEHCILSSLDFQTSKAS EQLTKKFIYPQEHNSFLKLNFQEISYKLIDGTSQIELDPICPLKVPLTAFSYDSISATFKLVLLPKSTQPHRVKITLAYE LELHPNLKLPVRTSWETEVTLKRSMPISSTSSQYSSNNNNTNHSASFNGAANNVNSGGLANLRLGGVSSSRFSLGAASTT SLVNSKLSNVKFKFINSNIKVIKGEKFTMRLQIINSSSSPLDLVVYYNNTINPIPSANNVRNSNGINNCGMNNGTIPNSP LTLENQYQLHNKYRKIAEGIILLSNDYKIPVVPPRETYFADLRFIGIMSGYYGTLSGLKVLDLNTNELIEVGNGASVLIQ ; ;MECFVPLRCDLDGSNIEQLRQSHLSRKFIIFDEQLNLWLWFQGNSQENKRFVLQNMIILINEAQVTRTSTIDDYFTQVEN NENLWRLKNDCCSKILFKSNVVMNNGYNNQIKFVFEYKSVDANFNNQDSLQDPQAKYTLDKYSSEEILPSFEPVYSWSSA ATKSSKNTNNHLEKNNRATHRVSSKNSEVHEADVSRNPNTFTLKLQYPIFSLLNMRLRNISLKSEHCILSSLDFQTSKAS EQLTKKFIYPQEHNSFLKLNFQEISYKLIDGTSQIELDPICPLKVPLTAFSYDSISATFKLVLLPKSTQPHRVKITLAYE LELHPNLKLPVRTSWETEVTLKRSMPISSTSSQYSSNNNNTNHSASFNGAANNVNSGGLANLRLGGVSSSRFSLGAASTT 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'Saccharomyces cerevisiae' 4932 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP TCA17_YEAST P32613 ? 1 ;MSLRPCFVSLIDESDKPILIYVPNEAENEMNDVLKYNVLSNISLDYFESALVEWHSLDSKPLLKSIFQLEGVSVFAMLIK QTGLKIVIGFEQKSLSGADDEFEAINQIFETVRKIYIRVKCNPLLVSGDEKSIIKSLERKFDELFISTEVEL ; 1 2 UNP TRS33_YEAST Q99394 ? 2 ;MSSTHSNNVGHPQSSPQGPLTEQQRAQQQYQIFENSLPKVSQSVYQMLLNEMVPLAMGIERQISGDVISSDSNVTSENGN INNMIKRLKIEEHHTVDIIRSHNLIHELYKADEEEKEKVLARLRNIGFQIGLKLSELLIFSNNPNLKFKEMDLLLIMKFI CRDVWKQIFGKQIDNLKTNHRGTFYLLDYDYRPIQSFSLEEDAKNEELKMIEPFLEIPVGIIRGVLSSLGYSSEEVICLA SFIDRPTDRPKTAFPKGVSFHVQVTMPQ ; 1 3 UNP BET3_YEAST P36149 ? 3 ;MVSTTQSRSLKAMGEEIWKNKTEKINTELFTLTYGSIVAQLCQDYERDFNKVNDHLYSMGYNIGCRLIEDFLARTALPRC ENLVKTSEVLSKCAFKIFLNITPNITNWSHNKDTFSLILDENPLADFVELPMDAMKSLWYSNILCGVLKGSLEMVQLDCD VWFVSDILRGDSQTEIKVKLNRILKDEIPIGED ; 1 4 UNP BET5_YEAST Q03630 ? 4 ;MGIYSFWIFDRHCNCIFDREWTLASNSASGTINSKQNEEDAKLLYGMIFSLRSITQKLSKGSVKNDIRSISTGKYRVHTY CTASGLWFVLLSDFKQQSYTQVLQYIYSHIYVKYVSNNLLSPYDFAENENEMRGQGTRKITNRNFISVLESFLAPMVNQ ; 1 5 UNP TRS23_YEAST Q03784 ? 5 ;MAIETILVINKSGGLIYQRNFTNDEQKLNSNEYLILASTLHGVFAIASQLTPKALQLTQQTNIENTIPYIPYVGMSSNRS DTRNGGGNNNKHTNNEKLGSFKGDDFFKEPFTNWNKSGLRQLCTDQFTMFIYQTLTGLKFVAISSSVMPQRQPTIATTDK PDRPKSTSNLAIQIADNFLRKVYCLYSDYVMKDPSYSMEMPIRSNLFDEKVKKMVENLQ ; 1 6 UNP TRS31_YEAST Q03337 ? 6 ;MSQRIIQPSASDQQFPGKSDGYEYTVGPKQAITSEASTTYIPSRIYSESLLFKRQEASLSAMAFLFQEMISQLHRTCKTA GDFETKLSDYGHNIGIRLLELLNFRASVSPSSLPRASAFLSQNESSSKLSNASNSPGMLANSSTATSASANERLQEKQTE SLSNYITKMRRRDLKILDILQFIHGTLWSYLFNHVSDDLVKSSERDNEYMIVDNFPTLTQFIPGENVSCEYFVCGIIKGF LFNAGFPCGVTAHRMPQGGHSQRTVYLIQFDRQVLDREGLRFG ; 1 7 UNP TRS20_YEAST P38334 ? 7 ;MPQYFAIIGKKDNPVYEIEFTNAENPQGFPQDLKELNPFILHASLDIVEDLQWQINPTSQLNGNGGNGSNGGGGFLRSRA VNNTDNCYLGKVDHFYGLAITAYISYSGMKFVMIHGNSANSSVVIDDNNMRSFYQEVHELYVKTLMNPFYKITDPIRSPA FDSRVRTLARKHLSK ; 1 8 UNP TR130_YEAST Q03660 ? 8 ;MDKEIYCGSVPVSYFDPFDLFESLRPEFQQILPLDNIHWKAFDGTVRTVNRLPIELIPEGRGEADKSNDEQPFIRFLIVN CISIDQYRAKVRPLVRQWLPNLESVSSSTGEKMIYKPIILLYANSEVVDSNLFKSVSLMEKFGKDFPHVQTLEVRSVYRS PKERQEFWNQFSQKIKASVLSIFQKRLTHLQHSLANLQKGNNFEEQLLTREKLYELYVVFNILEDASLELQKIKKEILRR NMNMPDGKLQVPFESSSKSDESLGSIIIEGTLDKFQLHKYFFIRRLRLLKLEDQTLTAFVGAFQLIKNFIESISIEYRKS VRLLEFKHYFITSMLSYFEFENVSNPLLCEIKAELLMLKRDNWVQGVMATSGYRLMDKNYPNSDVKYKFDLLKETFVDET VFQENFLTLTKEILSLFNKCEGKRQRIVDILSIEIGLLYYQGKKYEEAVSLFLSCYEYYTQTNWNSIGLKILQVFIDSLS HCPKLDVLQIDGESVSASAVLTNAFLNILKLCKDNDSKEIWWKKFMDLQMKNNIHLMYPLDGLFEVTLNSKVHLARANVS AIEVNLKSYGFPEDISTKTMRLSLKNMGGDVIVFGASDFLLKKGENKLILECRDIMYGEFSLLSFEIIVEGITFVKEFPE NQDEFIVVPEIYCKESTKVLVKQAHNLNLGEYALELKSVQSDALESLQVEVEVQKNIGNMKNLPVSFSMDEIQARKRYNT PFENVRLEYYLLDQITAFDLIIKTSFTKKNDQGTFGETKKVRIQCYLQLSVSVEDIFKKDIFFFKFLLNSSVREEPVILY SSELSAPDTRNDYNIRGDYIATTPALITFDGNESFINCYEITANNNFDSKDIFNLKVRYNTLKEQLDCFITDAVLIEGDV EWFILFEKWKTFWELEILKKLKYDYDAFKENRIIRLLKTSIDLNKTKSKIRNLCIEKAVLDKILICLNKVSRGIAVCNTD MDEYVRNLVPKQLTVPVQLPGFEQFFHVQFEQMETSHDALHDTIATIGNSLSYTVIVENLSGQWGQDVIDDGGYIFEILS SNEWLIHGQKRCAIKEKRKEFEVHLIPLKKGYLNFPRVEITNINGKSCRVDHSNAFESILIF ; 1 9 UNP TR120_YEAST Q04183 ? 9 ;MNILKHFPSYVGPSKIRTLVIPIGHWTRKEFNNAVQKLSEFNEIHLSDVTPIDSPIFTPQGFPHGKLFFDFLTIDHDDAL ELFLYDFEPFRKTFVIIGLVNDYSDPLTNLNFMKEKYPTLISPNLVYASSTPTKELEQTIDTMENVFASSPDMQKNIETI MCDIARNFLTALNSYYSSYKHVTLRSPGAIGGNAVLKTTLIRQNSYTSSSSSTPMSAVQSSVSSSSKAGSVTTASKRLSS FEMTTNSLKRSASLKLATTLSTSENRSQQKSLGRQMKILGNFQLLAGRYVDALNSFVDAITTLYKVRDYLWLGSALDGIS ICFLLLSYLGLSYQIPQIVSLICPVEKLNFESSSTGISPVDSNSKATASTTASSTPRNSISIAAMQSPRNSIMSLSAPAL NIDVENINLPLLIKCISDKVLYYYDLSLMHNSEYAPQVVYCEFLLKTLTFMTSCYKSSEFSKDVLDNIVKNQHRALSDIP NSPMFPRFEVYFYSNKLFELQLKEMQVEAQIKIYSTMAEVYRLLGYKRKQLFVLRLLMVALLATPNKIAWHPDYRTLIDT IIELLNINESEAKINVDDPSQSTWLILQKKILQLCIKVSRKINDFEYVAKFSSILITKYTHLLNQSEQDALFKEYIQPSI TNESITSYWDPFILREVVINRILDSDPTSNEIPLESDVSSLESLENRQKTQDINPQEVFNPFKRVQPTSFVSNNSTKVPI LVFLVGDKAEFTCRVQNPFKFDFTINDIQLDEEISEFCEIDRKAVSYSGPYNVKAESIRSITLPLIIKKPTYKKIYEISC LKISILKLPLQKFDIINDSRRSNPVEEEAEYSKCIYGKLKIKILPEQPQLELLSTSKMTRNSWMMLDGTKTDFHITVRNK SLSCAINHIKIIPMNNIEQMLKPDYWKKMPPDDLYIMEKQLDWLSKSCVRIIKLPTVIKPNETITFDLELDNTAVPFNFT GFDLLIEYGMSATDESCIYLKKLSIPYEVTLRRTIEVPSMDIIPLNELFSSQVENVDWIEYVMSKIRAESNLHSRDFILL LLDFRNSWIDGIKLNVQFEDFTSNEYHVEASHTSRIIVPIKKIDYKKYNFENTPIPRIYPGRQFIQSGLNEEQTIEMRQK FWCREHIISKLKCNWKLTTDQSVTGSVDFNKFIEKFDHKMVYTIYPGRLFYGVQLLLDEPKVKVGEIINLKIITEPTSTC RRKQNSTVNFLDIVIFDSKTSKILPRSNRRILYNGSLTKPISTTKVSEINLEIIPIEKGRYEFSVCISKSNNQDGIIQFD SENVILSVI ; 1 10 UNP TRS65_YEAST P32893 ? 10 ;MECFVPLRCDLDGSNIEQLRQSHLSRKFIIFDEQLNLWLWFQGNSQENKRFVLQNMIILINEAQVTRTSTIDDYFTQVEN NENLWRLKNDCCSKILFKSNVVMNNGYNNQIKFVFEYKSVDANFNNQDSLQDPQAKYTLDKYSSEEILPSFEPVYSWSSA ATKSSKNTNNHLEKNNRATHRVSSKNSEVHEADVSRNPNTFTLKLQYPIFSLLNMRLRNISLKSEHCILSSLDFQTSKAS EQLTKKFIYPQEHNSFLKLNFQEISYKLIDGTSQIELDPICPLKVPLTAFSYDSISATFKLVLLPKSTQPHRVKITLAYE LELHPNLKLPVRTSWETEVTLKRSMPISSTSSQYSSNNNNTNHSASFNGAANNVNSGGLANLRLGGVSSSRFSLGAASTT SLVNSKLSNVKFKFINSNIKVIKGEKFTMRLQIINSSSSPLDLVVYYNNTINPIPSANNVRNSNGINNCGMNNGTIPNSP LTLENQYQLHNKYRKIAEGIILLSNDYKIPVVPPRETYFADLRFIGIMSGYYGTLSGLKVLDLNTNELIEVGNGASVLIQ ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7E8S A 1 ? 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P32893 1 ? 560 ? 1 560 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 7 7E8S SER G 108 ? UNP Q03337 VAL 108 conflict 108 1 9 7E8S LYS I 464 ? UNP Q03660 TRP 464 conflict 464 2 10 7E8S PHE J 1099 ? UNP Q04183 TYR 1099 conflict 1099 3 18 7E8S SER R 108 ? UNP Q03337 VAL 108 conflict 108 4 20 7E8S LYS T 464 ? UNP Q03660 TRP 464 conflict 464 5 21 7E8S PHE U 1099 ? UNP Q04183 TYR 1099 conflict 1099 6 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7E8S _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7E8S _struct.title 'Intact TRAPPII (state I).' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7E8S _struct_keywords.text 'Complex, TRANSPORT PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'TRANSPORT PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 3 ? G N N 6 ? H N N 7 ? I N N 8 ? J N N 9 ? K N N 10 ? L N N 1 ? M N N 2 ? N N N 3 ? O N N 4 ? P N N 5 ? Q N N 3 ? R N N 6 ? S N N 7 ? T N N 8 ? U N N 9 ? V N N 10 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 VAL A 33 ? TYR A 46 ? VAL A 33 TYR A 46 1 ? 14 HELX_P HELX_P2 AA2 ASP A 100 ? LYS A 120 ? ASP A 100 LYS A 120 1 ? 21 HELX_P HELX_P3 AA3 LYS A 131 ? PHE A 145 ? 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