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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.604 ? 27339 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 4.497 ? 2700 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.044 ? 3105 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 3459 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7KDD _struct.title 'HCMV postfusion gB in complex with SM5-1 Fab' _struct.pdbx_descriptor 'Envelope glycoprotein B, SM5-1 Fab antibody heavy chain, SM5-1 Fab antibody light chain' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7KDD _struct_keywords.text 'fusogen, postfusion, HCMV, gB, antibody, VIRAL PROTEIN, VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 1 ? E N N 2 ? F N N 3 ? 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VAL B 392 SER B 407 1 ? 16 HELX_P HELX_P16 AB7 VAL D 480 ? SER D 521 ? VAL B 480 SER B 521 1 ? 42 HELX_P HELX_P17 AB8 ASN D 524 ? ASN D 534 ? ASN B 524 ASN B 534 1 ? 11 HELX_P HELX_P18 AB9 ASP D 638 ? ILE D 642 ? ASP B 638 ILE B 642 5 ? 5 HELX_P HELX_P19 AC1 SER D 668 ? SER D 674 ? SER B 668 SER B 674 1 ? 7 HELX_P HELX_P20 AC2 LEU D 680 ? GLN D 692 ? LEU B 680 GLN B 692 1 ? 13 HELX_P HELX_P21 AC3 GLN E 62 ? GLN E 65 ? GLN F 62 GLN F 65 5 ? 4 HELX_P HELX_P22 AC4 ARG E 87 ? THR E 91 ? ARG F 87 THR F 91 5 ? 5 HELX_P HELX_P23 AC5 PRO G 172 ? SER G 183 ? PRO C 172 SER C 183 1 ? 12 HELX_P HELX_P24 AC6 ARG G 203 ? SER G 205 ? ARG C 203 SER C 205 5 ? 3 HELX_P HELX_P25 AC7 ASP G 338 ? THR G 343 ? ASP C 338 THR C 343 1 ? 6 HELX_P HELX_P26 AC8 LEU G 389 ? CYS G 391 ? LEU C 389 CYS C 391 5 ? 3 HELX_P HELX_P27 AC9 VAL G 392 ? SER G 407 ? VAL C 392 SER C 407 1 ? 16 HELX_P HELX_P28 AD1 VAL G 480 ? SER G 521 ? VAL C 480 SER C 521 1 ? 42 HELX_P HELX_P29 AD2 ASN G 524 ? ASN G 534 ? 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ARG H 87 THR H 91 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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D CYS 574 SG ? ? ? 1_555 D CYS 611 SG ? ? B CYS 574 B CYS 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf11 disulf ? ? E CYS 22 SG ? ? ? 1_555 E CYS 96 SG ? ? F CYS 22 F CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf12 disulf ? ? F CYS 22 SG ? ? ? 1_555 F CYS 89 SG ? ? G CYS 22 G CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf13 disulf ? ? G CYS 111 SG ? ? ? 1_555 G CYS 507 SG ? ? C CYS 111 C CYS 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf14 disulf ? ? G CYS 185 SG ? ? ? 1_555 G CYS 250 SG ? ? C CYS 185 C CYS 250 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf15 disulf ? ? G CYS 344 SG ? ? ? 1_555 G CYS 391 SG ? ? C CYS 344 C CYS 391 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf16 disulf ? ? G CYS 574 SG ? ? ? 1_555 G CYS 611 SG ? ? C CYS 574 C CYS 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf17 disulf ? ? H CYS 22 SG ? ? ? 1_555 H CYS 96 SG ? ? H CYS 22 H CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf18 disulf ? ? I CYS 22 SG ? ? ? 1_555 I CYS 89 SG ? ? I CYS 22 I CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? covale1 covale one ? 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N-Glycosylation covale9 covale one ? A ASN 555 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? A ASN 555 A NAG 1009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? A ASN 586 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? A ASN 586 A NAG 1010 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? D ASN 281 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? B ASN 281 B NAG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? D ASN 286 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? B ASN 286 B NAG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? D ASN 302 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? B ASN 302 B NAG 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? D ASN 341 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? B ASN 341 B NAG 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.460 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? D ASN 383 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? B ASN 383 B NAG 1005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? D ASN 405 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? B ASN 405 B NAG 1006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? D ASN 409 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? B ASN 409 B NAG 1007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale18 covale one ? D ASN 417 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? B ASN 417 B NAG 1008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale19 covale one ? D ASN 555 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? B ASN 555 B NAG 1009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale20 covale one ? D ASN 586 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? B ASN 586 B NAG 1010 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale21 covale one ? G ASN 281 ND2 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? C ASN 281 C NAG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale22 covale one ? G ASN 286 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? C ASN 286 C NAG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale23 covale one ? G ASN 302 ND2 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? C ASN 302 C NAG 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale24 covale one ? G ASN 341 ND2 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? C ASN 341 C NAG 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale25 covale one ? G ASN 383 ND2 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? C ASN 383 C NAG 1005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale26 covale one ? G ASN 405 ND2 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? C ASN 405 C NAG 1006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale27 covale one ? G ASN 409 ND2 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? C ASN 409 C NAG 1007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale28 covale one ? G ASN 417 ND2 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? C ASN 417 C NAG 1008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale29 covale one ? G ASN 555 ND2 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? C ASN 555 C NAG 1009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale30 covale one ? G ASN 586 ND2 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? C ASN 586 C NAG 1010 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation metalc1 metalc ? ? A ASP 509 OD2 ? ? ? 1_555 T CA . CA ? ? 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A CA 1011 C ASP 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.775 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? metalc ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 TYR 261 A . ? TYR 261 A PRO 262 A ? PRO 262 A 1 3.55 2 TYR 261 D . ? TYR 261 B PRO 262 D ? PRO 262 B 1 1.41 3 TYR 261 G . ? TYR 261 C PRO 262 G ? 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AH1 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA2 1 2 ? parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA3 4 5 ? anti-parallel AA3 5 6 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA4 5 6 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 4 5 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA7 5 6 ? parallel AA7 6 7 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA8 4 5 ? anti-parallel AA8 5 6 ? anti-parallel AA8 6 7 ? anti-parallel AA9 1 2 ? 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