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D SER 420 O # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 7LO5 _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7LO5 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7LO5 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7LO5 _struct.title 'cryoEM structure DrdV-DNA complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7LO5 _struct_keywords.text 'inhibitor, Complex, endonuclease, methyl transferase, TypeIIL RM system, HYDROLASE, HYDROLASE-DNA complex' _struct_keywords.pdbx_keywords HYDROLASE/DNA # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 2 ? F N N 3 ? G N N 2 ? H N N 3 ? I N N 2 ? J N N 3 ? K N N 2 ? L N N 3 ? M N N 4 ? N N N 5 ? O N N 4 ? P N N 5 ? Q N N 4 ? R N N 5 ? S N N 5 ? T N N 4 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A0A345IJ72_9DEIO A0A345IJ72 ? 1 ;MSLQLVKKFQKRLEDIVAYGGTRNESSVRAAFQQLLSDWAEGSGLRLITEVTQKAVAGNNVRPDGTLKDSLQQSRGYWES KDEADTLDDEIQKKLAKGYPRDNIIFEDSRLAVLMQNGEEVQRVDMGDAGALAGLLKLFFEFEPPQVLEFRKAVDHFKDE MPHLLKILREAADAAEQKADYRGERDHFVEIAKEAINPDFSPRDAREMLIQHILTGDLFTSVFDNAQYHEDNNIAQQLQQ LAATFYKGPVKRDIAERTKRYYGAIQAAAAQIADHHEKQRFLKALYENFYRAYNPAGAERLGIFYTPGEIVRFMIEATDT LLEKHFQKELADKGVEILDPATGTGTFITELIDFLPKAKLEQKYREELHCNELALLPYYIANLNIEATYAQKMGRYEEFR NIVLVDTLDNTGFGVHGQQSGLFGSVTAENLERAKRQNARPVRVIIGNPPYRANQANENDNNKNREYKEIDRRIKATYVA ASTAQKTKLYDMYSRFLRWATDRLKEDGIVAFVSNSSFIDSRTFDGFRKEVVKDFDHIYILDMKGNANTSGERRKREGGN VFNDQIKVGVAVYFLVRSAAGKRKSKDTKIWYHAVPDFWRAREKLEWLKTTKFEDIEFDHIRPDAKHNWLGQVDEENDWN EFLPVADKDTKQAKGLGQERAIFKLYSLGVVTNRDEWVYSRAEDELADKVRYFIGRYNEIIKLPLGDLMSRNWEGDIKMT RATIADAQSRKSYSLEKNSIVPSLYRPFDVLKMYFSKNLNEMQYQMPSIFPKGVGENVVIALSGSPAAKPFQVLATDILP SLDLLEKTQCLPFYRYTMNGERLNNITDYALKAFQTHYADTSISREDIFHYVYAVLHHPAYREKYALNLRQEFPRIPFYP EFGRWAAWGRELMALHIGFESVAPYPLKRTDEPPKNDTPEALALAKKARLKVQRDAAKQPTGAVELDGLTTLAGIPAAAW AYKLGNRSALEWVLERHKETTPKDATIREKFNTYRFADHKERVIDLLARVTTVSVETVRIVGEMPAETM ; 1 2 PDB 7LO5 7LO5 ? 2 ? 1 3 PDB 7LO5 7LO5 ? 3 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7LO5 A 1 ? 1029 ? 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A0A345IJ72 1 ? 1029 ? 1 1029 5 2 7LO5 E 1 ? 29 ? 7LO5 1 ? 29 ? 1 29 6 3 7LO5 F 1 ? 29 ? 7LO5 1 ? 29 ? 1 29 7 2 7LO5 G 1 ? 29 ? 7LO5 1 ? 29 ? 1 29 8 3 7LO5 H 1 ? 29 ? 7LO5 1 ? 29 ? 1 29 9 2 7LO5 I 1 ? 29 ? 7LO5 1 ? 29 ? 1 29 10 3 7LO5 J 1 ? 29 ? 7LO5 1 ? 29 ? 1 29 11 2 7LO5 K 1 ? 29 ? 7LO5 1 ? 29 ? 1 29 12 3 7LO5 L 1 ? 29 ? 7LO5 1 ? 29 ? 1 29 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 2 ? GLY A 20 ? SER A 2 GLY A 20 1 ? 19 HELX_P HELX_P2 AA2 ASN A 24 ? ARG A 29 ? ASN A 24 ARG A 29 1 ? 6 HELX_P HELX_P3 AA3 ARG A 29 ? SER A 43 ? ARG A 29 SER A 43 1 ? 15 HELX_P HELX_P4 AA4 THR A 86 ? LYS A 97 ? THR A 86 LYS A 97 1 ? 12 HELX_P HELX_P5 AA5 ASP A 128 ? PHE A 140 ? ASP A 128 PHE A 140 1 ? 13 HELX_P HELX_P6 AA6 PRO A 144 ? ALA A 175 ? PRO A 144 ALA A 175 1 ? 32 HELX_P HELX_P7 AA7 LYS A 178 ? LYS A 193 ? LYS A 178 LYS A 193 1 ? 16 HELX_P HELX_P8 AA8 SER A 201 ? VAL A 222 ? SER A 201 VAL A 222 1 ? 22 HELX_P HELX_P9 AA9 ALA A 226 ? ASN A 232 ? ALA A 226 ASN A 232 1 ? 7 HELX_P HELX_P10 AB1 ASN A 232 ? ALA A 243 ? ASN A 232 ALA A 243 1 ? 12 HELX_P HELX_P11 AB2 LYS A 247 ? ALA A 270 ? LYS A 247 ALA A 270 1 ? 24 HELX_P HELX_P12 AB3 ASP A 274 ? TYR A 293 ? ASP A 274 TYR A 293 1 ? 20 HELX_P HELX_P13 AB4 ASN A 294 ? GLY A 302 ? ASN A 294 GLY A 302 1 ? 9 HELX_P HELX_P14 AB5 PRO A 307 ? GLN A 327 ? PRO A 307 GLN A 327 1 ? 21 HELX_P HELX_P15 AB6 GLY A 345 ? LEU A 355 ? 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ARG A 674 VAL A 678 1 ? 5 HELX_P HELX_P30 AD3 ALA A 682 ? ILE A 701 ? ALA A 682 ILE A 701 1 ? 20 HELX_P HELX_P31 AD4 PRO A 704 ? SER A 710 ? PRO A 704 SER A 710 1 ? 7 HELX_P HELX_P32 AD5 THR A 720 ? SER A 729 ? THR A 720 SER A 729 1 ? 10 HELX_P HELX_P33 AD6 GLU A 736 ? ASN A 738 ? GLU A 736 ASN A 738 5 ? 3 HELX_P HELX_P34 AD7 GLN A 765 ? PHE A 770 ? GLN A 765 PHE A 770 1 ? 6 HELX_P HELX_P35 AD8 THR A 827 ? TYR A 838 ? THR A 827 TYR A 838 1 ? 12 HELX_P HELX_P36 AD9 SER A 844 ? HIS A 858 ? SER A 844 HIS A 858 1 ? 15 HELX_P HELX_P37 AE1 HIS A 858 ? TYR A 865 ? HIS A 858 TYR A 865 1 ? 8 HELX_P HELX_P38 AE2 TYR A 865 ? ARG A 870 ? TYR A 865 ARG A 870 1 ? 6 HELX_P HELX_P39 AE3 PHE A 882 ? GLY A 898 ? PHE A 882 GLY A 898 1 ? 17 HELX_P HELX_P40 AE4 THR A 918 ? LYS A 926 ? THR A 918 LYS A 926 1 ? 9 HELX_P HELX_P41 AE5 PRO A 956 ? TYR A 962 ? PRO A 956 TYR A 962 5 ? 7 HELX_P HELX_P42 AE6 SER A 968 ? ARG A 976 ? SER A 968 ARG A 976 1 ? 9 HELX_P HELX_P43 AE7 ASP A 984 ? PHE A 991 ? 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H DG 9 ? 1_555 152.3 ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 SER 785 A . ? SER 785 A PRO 786 A ? PRO 786 A 1 -7.50 2 SER 785 B . ? SER 785 B PRO 786 B ? PRO 786 B 1 -18.21 3 SER 785 C . ? SER 785 C PRO 786 C ? PRO 786 C 1 -13.76 4 SER 785 D . ? SER 785 D PRO 786 D ? PRO 786 D 1 -10.46 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 6 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 5 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 3 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 6 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 9 ? AB3 ? 4 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 6 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 9 ? AC2 ? 4 ? AC3 ? 3 ? AC4 ? 2 ? AC5 ? 3 ? AC6 ? 2 ? AC7 ? 6 ? AC8 ? 2 ? AC9 ? 4 ? AD1 ? 5 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 3 ? AD4 ? 2 ? AD5 ? 2 ? 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VAL A 793 THR A 796 AA6 1 TYR A 679 ? SER A 680 ? TYR A 679 SER A 680 AA6 2 VAL A 750 ? TYR A 754 ? VAL A 750 TYR A 754 AA6 3 ILE A 740 ? LEU A 744 ? ILE A 740 LEU A 744 AA7 1 TYR A 814 ? TYR A 816 ? TYR A 814 TYR A 816 AA7 2 ARG A 822 ? ASN A 824 ? ARG A 822 ASN A 824 AA8 1 LYS A 908 ? ASP A 911 ? LYS A 908 ASP A 911 AA8 2 THR A 950 ? ALA A 953 ? THR A 950 ALA A 953 AA8 3 PRO A 940 ? ASP A 947 ? PRO A 940 ASP A 947 AA8 4 ALA A 928 ? ARG A 934 ? ALA A 928 ARG A 934 AA9 1 ARG B 46 ? THR B 49 ? ARG B 46 THR B 49 AA9 2 GLY B 65 ? LYS B 68 ? GLY B 65 LYS B 68 AA9 3 SER B 74 ? SER B 80 ? SER B 74 SER B 80 AA9 4 ASN B 103 ? GLU B 107 ? ASN B 103 GLU B 107 AA9 5 LEU B 111 ? GLN B 116 ? LEU B 111 GLN B 116 AA9 6 GLU B 119 ? ASP B 125 ? GLU B 119 ASP B 125 AB1 1 GLN B 53 ? LYS B 54 ? GLN B 53 LYS B 54 AB1 2 ASN B 60 ? VAL B 61 ? ASN B 60 VAL B 61 AB2 1 ILE B 402 ? LEU B 404 ? ILE B 402 LEU B 404 AB2 2 LEU B 368 ? GLU B 372 ? LEU B 368 GLU B 372 AB2 3 GLU B 336 ? ASP B 339 ? 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