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EMDB EMD-23563 ? ? # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Quantitative analysis of chlorophyll types in cryo-EM maps of photosystem I adapted to far-red light' _pdbx_database_related.db_id EMD-23563 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7LX0 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2021-03-02 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Gisriel, C.J.' 1 0000-0002-8011-0052 'Wang, J.' 2 0000-0002-4504-8038 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country ? _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'BBA Adv' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2667-1603 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 1 _citation.language ? _citation.page_first 100019 _citation.page_last ? _citation.title 'Quantitative assessment of chlorophyll types in cryo-EM maps of photosystem I acclimated to far-red light' _citation.year 2021 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.bbadva.2021.100019 _citation.pdbx_database_id_PubMed ? _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Gisriel, C.J.' 1 ? primary 'Huang, H.L.' 2 ? primary 'Reiss, K.M.' 3 ? primary 'Flesher, D.A.' 4 ? primary 'Batista, V.S.' 5 ? primary 'Bryant, D.A.' 6 ? primary 'Brudvig, G.W.' 7 ? primary 'Wang, J.' 8 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 7LX0 _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7LX0 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1' 87627.914 3 1.97.1.12 ? ? ? 2 polymer nat 'Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2' 83450.969 3 1.97.1.12 ? ? ? 3 polymer nat 'Photosystem I iron-sulfur center' 8853.221 3 1.97.1.12 ? ? ? 4 polymer nat 'Photosystem I protein PsaD' 17776.348 3 ? ? ? ? 5 polymer nat 'Photosystem I reaction center subunit IV' 8070.138 3 ? ? ? ? 6 polymer nat 'Photosystem I reaction center protein PsaF subunit III' 17788.021 3 ? ? ? ? 7 polymer nat 'photosystem I subunit VIII' 7735.956 3 ? ? ? ? 8 polymer nat 'Photosystem I reaction centre 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2 'PsaB, photosystem I core protein PsaB' 3 'PSI-C, Photosystem I subunit VII, PsaC' 10 'PSI-L,Photosystem I reaction center subunit XI' 11 PSI-M # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MTLTPEREQEVRVVVDNDPVPTSFQKWSQPGHFDRTLAKGAKTTTWIWNLHANAHDFDTHTSDLEDISRKIFAAHFGHLA VVFIWLSGMYFHGARFSNFEAWMANPTGIKPSAQVVWPIFGQEILNGDMGGGFHGIQITSGLFQMWRAAGFTNTFQLYCT AIGGLVMAALMLFAGWFHYHKRAPKLEWFQNTQSMLNHHLAGLLGLGSLGWTGHLIHVSLPTNKLLDTGVALKDIPLPHE FILNPSLMNKLYPHADWGFVKGVVPFFTLQWGHFTDFLTFKGGLNPVTGGLWLTDVAHHHLAIAVMFIIAGHMYRTNWGI GHSIKEMLDDARTPNMLPFLSFIGPVGHKGLFEVLTTSWHAQLSINLAMLGSLSIIIAHHMYAMPPYPYLATDYGTVVSL FTHHVWIGGFLIVGGAAHAAIYMVRDYDPEQNFNNVLDRVLRHRDAIISHLAWVCQFLGFHSFAMYCHNDTMRAFGRPQD MFSDTGIQLQPVFAQWLQHIHTMTIGNPSLQVAAPLGHAFGGLRNLELTGLGTAAPNLHDPVSYAFGGGVVAVGGKVAMM 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MFLFSGRGYWQELIESIVWAHNKLKVAPAIQPRALSIIHGRAVGVAHYLLGGIVTTWAFFLARMTAFG ; G,a,A ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MATKFPKFSQDLANDPTTRRIFYAIATAHDFESHDGMTEENLYQRIFASHFGHLAIIFLWASGILFHVAWQGNFEVWIKD PVHVRPIAHAIWDAQFGPGAIKAFTQAGARNPVDICYSGVYHWWYTIGLRTNTELYVGALFLILLAAVFLFAGWLHLQPR YRPNLGWFKNSEARLNHHLAGLFGVSSLAWAGHLVHVAIPESRGQHVGWDNFLSTPPHPAGLWAFFTGNWGAYAQNPDTA EHVFSTSQGAGTAILTFLGGFHPQTQSLWLTDMAHHHLAIAVVLIIAGHMYRTNWRIGHSIKEMMDSKTFFGRKVEGPFN LPHQGLYETVNNSLHFQLSLALACLGVASSLTAQHMYSMPPYAFIAKDFTTMAALYTHHQYIAGFLMVGAFSHAAIFWIK DYDPEQNKGNVLERVLKHKEAIIAHLSWVSLFLGFHTLGLYVHNDVEVAFGAADKQILIEPVFAQFIQSANGKILYGFHT LLSNPDSIAFTAWPNHANVWLPGWLDAINNGTNSLFLTIGPGDFYVHHAIALGLHVTTLILVKGALDARGSKLMPDKKDF GYAFPCDGPGRGGTCDISAWDASYLAVFWMLNTLGWVTFYWHWKHLSIWQGNVAQFNESSTYLMGWFRDYLWANSAQLIN GYNPYGTNNLAVWAWMFLFGHLAWAVSFMFLITWRGYWQELIETLAWAHEQTPLSFGYWRDKPVALSIVQARLVGLTHFT VGYIATYGAFLIASTASKFGQ ; ;MATKFPKFSQDLANDPTTRRIFYAIATAHDFESHDGMTEENLYQRIFASHFGHLAIIFLWASGILFHVAWQGNFEVWIKD PVHVRPIAHAIWDAQFGPGAIKAFTQAGARNPVDICYSGVYHWWYTIGLRTNTELYVGALFLILLAAVFLFAGWLHLQPR YRPNLGWFKNSEARLNHHLAGLFGVSSLAWAGHLVHVAIPESRGQHVGWDNFLSTPPHPAGLWAFFTGNWGAYAQNPDTA EHVFSTSQGAGTAILTFLGGFHPQTQSLWLTDMAHHHLAIAVVLIIAGHMYRTNWRIGHSIKEMMDSKTFFGRKVEGPFN LPHQGLYETVNNSLHFQLSLALACLGVASSLTAQHMYSMPPYAFIAKDFTTMAALYTHHQYIAGFLMVGAFSHAAIFWIK DYDPEQNKGNVLERVLKHKEAIIAHLSWVSLFLGFHTLGLYVHNDVEVAFGAADKQILIEPVFAQFIQSANGKILYGFHT LLSNPDSIAFTAWPNHANVWLPGWLDAINNGTNSLFLTIGPGDFYVHHAIALGLHVTTLILVKGALDARGSKLMPDKKDF GYAFPCDGPGRGGTCDISAWDASYLAVFWMLNTLGWVTFYWHWKHLSIWQGNVAQFNESSTYLMGWFRDYLWANSAQLIN GYNPYGTNNLAVWAWMFLFGHLAWAVSFMFLITWRGYWQELIETLAWAHEQTPLSFGYWRDKPVALSIVQARLVGLTHFT VGYIATYGAFLIASTASKFGQ ; H,b,B ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MSHTVKIYDTCIGCTQCVRACPTDVLEMVPWDGCRAGQIASSPRTEDCVGCKRCETACPTDFLSIRVYLGAETTRSMGLA Y ; ;MSHTVKIYDTCIGCTQCVRACPTDVLEMVPWDGCRAGQIASSPRTEDCVGCKRCETACPTDFLSIRVYLGAETTRSMGLA Y ; N,c,C ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MSPSAVLGCRKNVERRFMAETLSGQTPIFGGSTGGLLKKAEVEEKYAITWTSPKEQVFEMPTGGAAIMRQGQNLLYLARK EQCIALGGQLRKFKITDYKIYRIYPNGETVYIHPADGVFPEKVNQGREKVRYNDRRIGQNPSPSKVKFSGIATYDAPNS ; ;MSPSAVLGCRKNVERRFMAETLSGQTPIFGGSTGGLLKKAEVEEKYAITWTSPKEQVFEMPTGGAAIMRQGQNLLYLARK EQCIALGGQLRKFKITDYKIYRIYPNGETVYIHPADGVFPEKVNQGREKVRYNDRRIGQNPSPSKVKFSGIATYDAPNS ; O,d,D ? 5 'polypeptide(L)' no no MVQRGSKVRILRPESYWFQDVGTVASIEQGGTSRYPVIVRFDKVNYAGVNTNNFAQDELVEVEAPKAKAKKA MVQRGSKVRILRPESYWFQDVGTVASIEQGGTSRYPVIVRFDKVNYAGVNTNNFAQDELVEVEAPKAKAKKA P,e,E ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MKRIFALILAIFIWFSAVSTALAENTTLVPCYKSPAFVERMKNAPDSYYTTKPLKAYSQLLCGEDGLPRIALDRLSLAVD VAIPIAIFLYTAGFIGWSGRSYLQAIKKQDKAEEKEVFIDVPLFISCMVMALFWPMAVIKELLAGELVAKDEEIPISVR ; ;MKRIFALILAIFIWFSAVSTALAENTTLVPCYKSPAFVERMKNAPDSYYTTKPLKAYSQLLCGEDGLPRIALDRLSLAVD VAIPIAIFLYTAGFIGWSGRSYLQAIKKQDKAEEKEVFIDVPLFISCMVMALFWPMAVIKELLAGELVAKDEEIPISVR ; Q,f,F ? 7 'polypeptide(L)' no no MMVDMTQLTGDYAASWLPWIMIPLVFYILPFPVFAILFLWIQKEASEEIKETDNNLAEIGELEVPNS MMVDMTQLTGDYAASWLPWIMIPLVFYILPFPVFAILFLWIQKEASEEIKETDNNLAEIGELEVPNS R,i,I ? 8 'polypeptide(L)' no no MEARYLFRYLSSAPVVATLALIIISVILIVLNYLFPGLQYGTFFHSLP MEARYLFRYLSSAPVVATLALIIISVILIVLNYLFPGLQYGTFFHSLP S,j,J ? 9 'polypeptide(L)' no no ;(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)VAAMAFGHVIGVAIVLGLTNIGKI ; XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXVAAMAFGHVIGVAIVLGLTNIGKI T,k,K ? 10 'polypeptide(L)' no no ;MSNTVDTVDNDIIKPFKGDPCLGNLSTPINDSPLAKAFINNLPAYRKGLTPFMRGLEIGMAHGYFLVGPEVVIGPLRESA HGANLSGLITAIYIAVSACLGISIFAITTFQGNPKGSYSSYSKDSLRPLRTREEWSQLNGGIFLGAMGGAIFAYLLLENF DALDAILRGAVNAS ; ;MSNTVDTVDNDIIKPFKGDPCLGNLSTPINDSPLAKAFINNLPAYRKGLTPFMRGLEIGMAHGYFLVGPEVVIGPLRESA HGANLSGLITAIYIAVSACLGISIFAITTFQGNPKGSYSSYSKDSLRPLRTREEWSQLNGGIFLGAMGGAIFAYLLLENF DALDAILRGAVNAS ; U,l,L ? 11 'polypeptide(L)' no no MSISDTQVYIALVVALVPGFLAWRLATELYK MSISDTQVYIALVVALVPGFLAWRLATELYK V,m,M ? 12 'polypeptide(L)' no no ;MPGKESTALPRLHTLPTSLPLATQNHENIFNESGELGHLFGISEEVLKLGVHFMAKADTTADLPVAKSTTAKPPYTFRTA WALLLLAINFIVAAYYFHIIE ; ;MPGKESTALPRLHTLPTSLPLATQNHENIFNESGELGHLFGISEEVLKLGVHFMAKADTTADLPVAKSTTAKPPYTFRTA WALLLLAINFIVAAYYFHIIE ; W,x,X ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 THR n 1 3 LEU n 1 4 THR n 1 5 PRO n 1 6 GLU n 1 7 ARG n 1 8 GLU n 1 9 GLN n 1 10 GLU n 1 11 VAL n 1 12 ARG n 1 13 VAL n 1 14 VAL n 1 15 VAL n 1 16 ASP n 1 17 ASN n 1 18 ASP n 1 19 PRO n 1 20 VAL n 1 21 PRO n 1 22 THR n 1 23 SER n 1 24 PHE n 1 25 GLN n 1 26 LYS n 1 27 TRP n 1 28 SER n 1 29 GLN n 1 30 PRO n 1 31 GLY n 1 32 HIS n 1 33 PHE n 1 34 ASP n 1 35 ARG n 1 36 THR n 1 37 LEU n 1 38 ALA n 1 39 LYS n 1 40 GLY n 1 41 ALA n 1 42 LYS n 1 43 THR n 1 44 THR n 1 45 THR n 1 46 TRP n 1 47 ILE n 1 48 TRP n 1 49 ASN n 1 50 LEU n 1 51 HIS n 1 52 ALA n 1 53 ASN n 1 54 ALA n 1 55 HIS n 1 56 ASP n 1 57 PHE n 1 58 ASP n 1 59 THR n 1 60 HIS n 1 61 THR n 1 62 SER n 1 63 ASP n 1 64 LEU n 1 65 GLU n 1 66 ASP n 1 67 ILE n 1 68 SER n 1 69 ARG n 1 70 LYS n 1 71 ILE n 1 72 PHE n 1 73 ALA n 1 74 ALA n 1 75 HIS n 1 76 PHE n 1 77 GLY n 1 78 HIS n 1 79 LEU n 1 80 ALA n 1 81 VAL n 1 82 VAL n 1 83 PHE n 1 84 ILE n 1 85 TRP n 1 86 LEU n 1 87 SER n 1 88 GLY n 1 89 MET n 1 90 TYR n 1 91 PHE n 1 92 HIS n 1 93 GLY n 1 94 ALA n 1 95 ARG n 1 96 PHE n 1 97 SER n 1 98 ASN n 1 99 PHE n 1 100 GLU n 1 101 ALA n 1 102 TRP n 1 103 MET n 1 104 ALA n 1 105 ASN n 1 106 PRO n 1 107 THR n 1 108 GLY n 1 109 ILE n 1 110 LYS n 1 111 PRO n 1 112 SER n 1 113 ALA n 1 114 GLN n 1 115 VAL n 1 116 VAL n 1 117 TRP n 1 118 PRO n 1 119 ILE n 1 120 PHE n 1 121 GLY n 1 122 GLN n 1 123 GLU n 1 124 ILE n 1 125 LEU n 1 126 ASN n 1 127 GLY n 1 128 ASP n 1 129 MET n 1 130 GLY n 1 131 GLY n 1 132 GLY n 1 133 PHE n 1 134 HIS n 1 135 GLY n 1 136 ILE n 1 137 GLN n 1 138 ILE n 1 139 THR n 1 140 SER n 1 141 GLY n 1 142 LEU n 1 143 PHE n 1 144 GLN n 1 145 MET n 1 146 TRP n 1 147 ARG n 1 148 ALA n 1 149 ALA n 1 150 GLY n 1 151 PHE n 1 152 THR n 1 153 ASN n 1 154 THR n 1 155 PHE n 1 156 GLN n 1 157 LEU n 1 158 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'Fischerella thermalis PCC 7521' 98439 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP G6FME9_9CYAN G6FME9 ? 1 ;MTLTPEREQEVRVVVDNDPVPTSFQKWSQPGHFDRTLAKGAKTTTWIWNLHANAHDFDTHTSDLEDISRKIFAAHFGHLA VVFIWLSGMYFHGARFSNFEAWMANPTGIKPSAQVVWPIFGQEILNGDMGGGFHGIQITSGLFQMWRAAGFTNTFQLYCT AIGGLVMAALMLFAGWFHYHKRAPKLEWFQNTQSMLNHHLAGLLGLGSLGWTGHLIHVSLPTNKLLDTGVALKDIPLPHE FILNPSLMNKLYPHADWGFVKGVVPFFTLQWGHFTDFLTFKGGLNPVTGGLWLTDVAHHHLAIAVMFIIAGHMYRTNWGI GHSIKEMLDDARTPNMLPFLSFIGPVGHKGLFEVLTTSWHAQLSINLAMLGSLSIIIAHHMYAMPPYPYLATDYGTVVSL FTHHVWIGGFLIVGGAAHAAIYMVRDYDPEQNFNNVLDRVLRHRDAIISHLAWVCQFLGFHSFAMYCHNDTMRAFGRPQD MFSDTGIQLQPVFAQWLQHIHTMTIGNPSLQVAAPLGHAFGGLRNLELTGLGTAAPNLHDPVSYAFGGGVVAVGGKVAMM PITLGTADFLIHHIHAFTIHVTVLVLLKGVLFARSSRLIPDKANLGFRFPCDGPGRGGTCQVSAWDHVFLGLFWMYNSLS MVIFHFFWKMQSDVWGTVGADGVVTHITGGNFATSSITNNGWLRDFLWAQSTQVITSYNTSLSAYGLMFLGGHFIFGFSL MFLFSGRGYWQELIESIVWAHNKLKVAPAIQPRALSIIHGRAVGVAHYLLGGIVTTWAFFLARMTAFG ; 1 2 UNP A0A2N6KXB6_9CYAN A0A2N6KXB6 ? 2 ;MATKFPKFSQDLANDPTTRRIFYAIATAHDFESHDGMTEENLYQRIFASHFGHLAIIFLWASGILFHVAWQGNFEVWIKD PVHVRPIAHAIWDAQFGPGAIKAFTQAGARNPVDICYSGVYHWWYTIGLRTNTELYVGALFLILLAAVFLFAGWLHLQPR YRPNLGWFKNSEARLNHHLAGLFGVSSLAWAGHLVHVAIPESRGQHVGWDNFLSTPPHPAGLWAFFTGNWGAYAQNPDTA EHVFSTSQGAGTAILTFLGGFHPQTQSLWLTDMAHHHLAIAVVLIIAGHMYRTNWRIGHSIKEMMDSKTFFGRKVEGPFN LPHQGLYETVNNSLHFQLSLALACLGVASSLTAQHMYSMPPYAFIAKDFTTMAALYTHHQYIAGFLMVGAFSHAAIFWIK DYDPEQNKGNVLERVLKHKEAIIAHLSWVSLFLGFHTLGLYVHNDVEVAFGAADKQILIEPVFAQFIQSANGKILYGFHT LLSNPDSIAFTAWPNHANVWLPGWLDAINNGTNSLFLTIGPGDFYVHHAIALGLHVTTLILVKGALDARGSKLMPDKKDF GYAFPCDGPGRGGTCDISAWDASYLAVFWMLNTLGWVTFYWHWKHLSIWQGNVAQFNESSTYLMGWFRDYLWANSAQLIN GYNPYGTNNLAVWAWMFLFGHLAWAVSFMFLITWRGYWQELIETLAWAHEQTPLSFGYWRDKPVALSIVQARLVGLTHFT VGYIATYGAFLIASTASKFGQ ; 1 3 UNP G6FW50_9CYAN G6FW50 ? 3 ;MSHTVKIYDTCIGCTQCVRACPTDVLEMVPWDGCRAGQIASSPRTEDCVGCKRCETACPTDFLSIRVYLGAETTRSMGLA Y ; 1 4 UNP G6FW99_9CYAN G6FW99 ? 4 ;MSPSAVLGCRKNVERRFMAETLSGQTPIFGGSTGGLLKKAEVEEKYAITWTSPKEQVFEMPTGGAAIMRQGQNLLYLARK EQCIALGGQLRKFKITDYKIYRIYPNGETVYIHPADGVFPEKVNQGREKVRYNDRRIGQNPSPSKVKFSGIATYDAPNS ; 1 5 UNP G6FQU3_9CYAN G6FQU3 ? 5 MVQRGSKVRILRPESYWFQDVGTVASIEQGGTSRYPVIVRFDKVNYAGVNTNNFAQDELVEVEAPKAKAKKA 1 6 UNP G6FMD3_9CYAN G6FMD3 ? 6 ;MKRIFALILAIFIWFSAVSTALAENTTLVPCYKSPAFVERMKNAPDSYYTTKPLKAYSQLLCGEDGLPRIALDRLSLAVD VAIPIAIFLYTAGFIGWSGRSYLQAIKKQDKAEEKEVFIDVPLFISCMVMALFWPMAVIKELLAGELVAKDEEIPISVR ; 1 7 UNP A0A2N6MR25_9CYAN A0A2N6MR25 ? 7 MVDMTQLTGDYAASWLPWIMIPLVFYILPFPVFAILFLWIQKEASEEIKETDNNLAEIGELEVPNS 1 8 UNP G6FMD2_9CYAN G6FMD2 ? 8 MEARYLFRYLSSAPVVATLALIIISVILIVLNYLFPGLQYGTFFHSLP 1 9 PDB 7LX0 7LX0 ? 9 ? 1 10 UNP A0A2N6L446_9CYAN A0A2N6L446 ? 10 ;MSNTVDTVDNDIIKPFKGDPCLGNLSTPINDSPLAKAFINNLPAYRKGLTPFMRGLEIGMAHGYFLVGPEVVIGPLRESA HGANLSGLITAIYIAVSACLGISIFAITTFQGNPKGSYSSYSKDSLRPLRTREEWSQLNGGIFLGAMGGAIFAYLLLENF DALDAILRGAVNAS ; 1 11 UNP G6FWT6_9CYAN G6FWT6 ? 11 MSISDTQVYIALVVALVPGFLAWRLATELYK 1 12 UNP G6FSH2_9CYAN G6FSH2 ? 12 ;MPGKESTALPRLHTLPTSLPLATQNHENIFNESGELGHLFGISEEVLKLGVHFMAKADTTADLPVAKSTTAKPPYTFRTA WALLLLAINFIVAAYYFHIIE ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7LX0 G 1 ? 788 ? 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G6FSH2 1 ? 101 ? 1 101 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 7 7LX0 MET R 1 ? UNP A0A2N6MR25 ? ? 'initiating methionine' 1 1 19 7LX0 MET i 1 ? UNP A0A2N6MR25 ? ? 'initiating methionine' 1 2 31 7LX0 MET I 1 ? UNP A0A2N6MR25 ? ? 'initiating methionine' 1 3 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 BCR non-polymer . BETA-CAROTENE ? 'C40 H56' 536.873 CA non-polymer . 'CALCIUM ION' ? 'Ca 2' 40.078 CL0 non-polymer . 'CHLOROPHYLL A ISOMER' ? 'C55 H72 Mg N4 O5 2' 893.489 CLA non-polymer . 'CHLOROPHYLL A' ? 'C55 H72 Mg N4 O5' 893.489 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 F6C non-polymer . 'Chlorophyll F' ;[methyl 9-ethenyl-14-ethyl-8-formyl-4,13,18-trimethyl-20-oxo-3-{3-oxo-3-[(3,7,11,15-tetramethylhexadec-2-en-1-yl)oxy]propyl}-3,4,23,25-tetradehydro-24,26-dihydrophorbine-21-carboxylatato(2-)-kappa~4~N~23~,N~24~,N~25~,N~26~]magnesium ; 'C55 H68 Mg N4 O6' 905.457 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LHG non-polymer . 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE ? 'C38 H75 O10 P' 722.970 LMG non-polymer . 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE ? 'C45 H86 O10' 787.158 LMT D-saccharide . DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE ? 'C24 H46 O11' 510.615 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PQN non-polymer . PHYLLOQUINONE 'VITAMIN K1; 2-METHYL-3-PHYTYL-1,4-NAPHTHOQUINONE' 'C31 H46 O2' 450.696 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 SF4 non-polymer . 'IRON/SULFUR CLUSTER' ? 'Fe4 S4' 351.640 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 UNK 'L-peptide linking' . UNKNOWN ? 'C4 H9 N O2' 103.120 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7LX0 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7LX0 _struct.title 'Quantitative assessment of chlorophyll types in cryo-EM maps of photosystem I acclimated to far-red light' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7LX0 _struct_keywords.text 'Photosystem I, Photosynthesis, Far-red light, Chlorophyll f' _struct_keywords.pdbx_keywords PHOTOSYNTHESIS # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? 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ARG J 4 SER J 11 1 ? 8 HELX_P HELX_P287 BF8 ALA FA 13 ? ILE FA 24 ? ALA J 13 ILE J 24 1 ? 12 HELX_P HELX_P288 BF9 SER FA 25 ? LEU FA 34 ? SER J 25 LEU J 34 1 ? 10 HELX_P HELX_P289 BG1 UNK GA 6 ? UNK GA 15 ? UNK K 30 UNK K 39 1 ? 10 HELX_P HELX_P290 BG2 ALA GA 27 ? GLY GA 42 ? ALA K 70 GLY K 85 1 ? 16 HELX_P HELX_P291 BG3 LYS HA 17 ? ASP HA 19 ? LYS L 17 ASP L 19 5 ? 3 HELX_P HELX_P292 BG4 SER HA 32 ? ASN HA 40 ? SER L 32 ASN L 40 1 ? 9 HELX_P HELX_P293 BG5 THR HA 50 ? VAL HA 67 ? THR L 50 VAL L 67 1 ? 18 HELX_P HELX_P294 BG6 VAL HA 67 ? VAL HA 72 ? VAL L 67 VAL L 72 1 ? 6 HELX_P HELX_P295 BG7 ALA HA 80 ? PHE HA 110 ? ALA L 80 PHE L 110 1 ? 31 HELX_P HELX_P296 BG8 GLU HA 133 ? ASN HA 159 ? GLU L 133 ASN L 159 1 ? 27 HELX_P HELX_P297 BG9 ASN HA 159 ? LEU HA 167 ? ASN L 159 LEU L 167 1 ? 9 HELX_P HELX_P298 BH1 SER IA 4 ? ALA IA 15 ? SER M 4 ALA M 15 1 ? 12 HELX_P HELX_P299 BH2 ALA IA 15 ? LEU IA 29 ? ALA M 15 LEU M 29 1 ? 15 HELX_P HELX_P300 BH3 TRP JA 81 ? PHE JA 97 ? 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FE2 ? ? a CYS 620 a SF4 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.198 ? ? metalc25 metalc ? ? WG SF4 . FE4 ? ? ? 1_555 N CYS 566 SG ? ? a SF4 3001 b CYS 566 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.221 ? ? metalc26 metalc ? ? WG SF4 . FE1 ? ? ? 1_555 N CYS 575 SG ? ? a SF4 3001 b CYS 575 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.202 ? ? metalc27 metalc ? ? N ASP 93 OD1 ? ? ? 1_555 PH CLA . MG ? ? b ASP 93 b CLA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.840 ? ? metalc28 metalc ? ? N ASN 471 OD1 ? ? ? 1_555 OI CLA . MG ? ? b ASN 471 b CLA 1231 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.901 ? ? metalc29 metalc ? ? O CYS 11 SG ? ? ? 1_555 KJ SF4 . FE4 ? ? c CYS 11 c SF4 3003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.268 ? ? metalc30 metalc ? ? O CYS 14 SG ? ? ? 1_555 KJ SF4 . FE3 ? ? c CYS 14 c SF4 3003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.218 ? ? metalc31 metalc ? ? O CYS 17 SG ? ? ? 1_555 KJ SF4 . FE2 ? ? c CYS 17 c SF4 3003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.251 ? ? metalc32 metalc ? ? O CYS 21 SG ? ? ? 1_555 JJ SF4 . FE2 ? ? c CYS 21 c SF4 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? ? metalc33 metalc ? ? O CYS 48 SG ? ? ? 1_555 JJ SF4 . FE4 ? ? c CYS 48 c SF4 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.239 ? ? metalc34 metalc ? ? O CYS 51 SG ? ? ? 1_555 JJ SF4 . FE1 ? ? c CYS 51 c SF4 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.255 ? ? metalc35 metalc ? ? O CYS 54 SG ? ? ? 1_555 JJ SF4 . FE3 ? ? c CYS 54 c SF4 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.243 ? ? metalc36 metalc ? ? O CYS 58 SG ? ? ? 1_555 KJ SF4 . FE1 ? ? c CYS 58 c SF4 3003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? ? metalc37 metalc ? ? V GLU 57 OE1 ? ? ? 1_555 QJ CLA . MG ? ? l GLU 57 l CLA 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.878 ? ? metalc38 metalc ? ? V GLU 78 OE2 ? ? ? 1_555 PJ CA . CA ? ? l GLU 78 l CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.783 ? ? metalc39 metalc ? ? Y GLN 122 OE1 ? ? ? 1_555 HK CLA . MG ? ? A GLN 122 A CLA 1107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.875 ? ? metalc40 metalc ? ? Y ASP 480 OD1 ? ? ? 1_555 JO CA . CA ? ? A ASP 480 L CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.213 ? ? metalc41 metalc ? ? Y ASP 480 OD2 ? ? ? 1_555 JO CA . CA ? ? A ASP 480 L CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.947 ? ? metalc42 metalc ? ? 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C CYS 17 C SF4 3003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.251 ? ? metalc51 metalc ? ? AA CYS 21 SG ? ? ? 1_555 DO SF4 . FE2 ? ? C CYS 21 C SF4 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? ? metalc52 metalc ? ? AA CYS 48 SG ? ? ? 1_555 DO SF4 . FE4 ? ? C CYS 48 C SF4 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.240 ? ? metalc53 metalc ? ? AA CYS 51 SG ? ? ? 1_555 DO SF4 . FE1 ? ? C CYS 51 C SF4 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.255 ? ? metalc54 metalc ? ? AA CYS 54 SG ? ? ? 1_555 DO SF4 . FE3 ? ? C CYS 54 C SF4 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.243 ? ? metalc55 metalc ? ? AA CYS 58 SG ? ? ? 1_555 EO SF4 . FE1 ? ? C CYS 58 C SF4 3003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? ? metalc56 metalc ? ? HA GLU 57 OE1 ? ? ? 1_555 KO CLA . MG ? ? L GLU 57 L CLA 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.880 ? ? metalc57 metalc ? ? HA GLU 78 OE2 ? ? ? 1_555 JO CA . CA ? ? L GLU 78 L CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.782 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? metalc ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PHE 5 B . ? PHE 5 H PRO 6 B ? PRO 6 H 1 -3.16 2 HIS 113 D . ? HIS 113 O PRO 114 D ? PRO 114 O 1 -8.54 3 PHE 5 N . ? PHE 5 b PRO 6 N ? 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