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_refine.ls_d_res_high . _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_extinction_coef ? _refine.ls_extinction_coef_esd ? _refine.ls_extinction_expression ? _refine.ls_extinction_method ? _refine.ls_goodness_of_fit_all ? _refine.ls_goodness_of_fit_all_esd ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs_esd ? _refine.ls_hydrogen_treatment ? _refine.ls_matrix_type ? _refine.ls_number_constraints ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_work ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_Fsqd_factor_obs ? _refine.ls_R_I_factor_obs ? _refine.ls_redundancy_reflns_all ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.ls_restrained_S_all ? _refine.ls_restrained_S_obs ? _refine.ls_shift_over_esd_max ? _refine.ls_shift_over_esd_mean ? _refine.ls_structure_factor_coef ? _refine.ls_weighting_details ? _refine.ls_weighting_scheme ? _refine.ls_wR_factor_all ? _refine.ls_wR_factor_obs ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.occupancy_max ? _refine.occupancy_min ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.pdbx_R_complete ? _refine.ls_R_factor_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_ref ? _refine.ls_shift_over_su_max ? _refine.ls_shift_over_su_max_lt ? _refine.ls_shift_over_su_mean ? _refine.ls_shift_over_su_mean_lt ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_ls_sigma_Fsqd ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method NONE _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.8024 ? 3517 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0532 ? 374 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0076 ? 459 ? f_plane_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 12.4315 ? 923 ? f_dihedral_angle_d ? ? # _struct.entry_id 7MJI _struct.title 'Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 N501Y mutant spike protein ectodomain bound to VH ab8 (focused refinement of RBD and VH ab8)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7MJI _struct_keywords.text 'SARS-CoV-2, glycoprotein, fusion protein, viral protein, VH ab8, neutralizing antibody, Viral Protein-Immune System complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'Viral Protein/Immune System' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP SPIKE_SARS2 P0DTC2 ? 1 ;MFVFLVLLPLVSSQCVNLTTRTQLPPAYTNSFTRGVYYPDKVFRSSVLHSTQDLFLPFFSNVTWFHAIHVSGTNGTKRFD NPVLPFNDGVYFASTEKSNIIRGWIFGTTLDSKTQSLLIVNNATNVVIKVCEFQFCNDPFLGVYYHKNNKSWMESEFRVY SSANNCTFEYVSQPFLMDLEGKQGNFKNLREFVFKNIDGYFKIYSKHTPINLVRDLPQGFSALEPLVDLPIGINITRFQT LLALHRSYLTPGDSSSGWTAGAAAYYVGYLQPRTFLLKYNENGTITDAVDCALDPLSETKCTLKSFTVEKGIYQTSNFRV QPTESIVRFPNITNLCPFGEVFNATRFASVYAWNRKRISNCVADYSVLYNSASFSTFKCYGVSPTKLNDLCFTNVYADSF VIRGDEVRQIAPGQTGKIADYNYKLPDDFTGCVIAWNSNNLDSKVGGNYNYLYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAGSTPC NGVEGFNCYFPLQSYGFQPTNGVGYQPYRVVVLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKNKCVNFNFNGLTGTGVLTESNKKFL PFQQFGRDIADTTDAVRDPQTLEILDITPCSFGGVSVITPGTNTSNQVAVLYQDVNCTEVPVAIHADQLTPTWRVYSTGS NVFQTRAGCLIGAEHVNNSYECDIPIGAGICASYQTQTNSPRRARSVASQSIIAYTMSLGAENSVAYSNNSIAIPTNFTI SVTTEILPVSMTKTSVDCTMYICGDSTECSNLLLQYGSFCTQLNRALTGIAVEQDKNTQEVFAQVKQIYKTPPIKDFGGF NFSQILPDPSKPSKRSFIEDLLFNKVTLADAGFIKQYGDCLGDIAARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDEMIAQYTSALLAG TITSGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKLIANQFNSAIGKIQDSLSSTASALGKLQDVVNQNAQALN TLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRV DFCGKGYHLMSFPQSAPHGVVFLHVTYVPAQEKNFTTAPAICHDGKAHFPREGVFVSNGTHWFVTQRNFYEPQIITTDNT FVSGNCDVVIGIVNNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDL QELGKYEQ ; 1 2 PDB 7MJI 7MJI ? 2 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7MJI B 1 ? 1208 ? P0DTC2 1 ? 1208 ? 1 1208 2 2 7MJI E 1 ? 145 ? 7MJI 22 ? 166 ? 22 166 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 7MJI TYR B 501 ? UNP P0DTC2 ASN 501 'engineered mutation' 501 1 1 7MJI GLY B 682 ? UNP P0DTC2 ARG 682 conflict 682 2 1 7MJI SER B 683 ? UNP P0DTC2 ARG 683 conflict 683 3 1 7MJI SER B 685 ? UNP P0DTC2 ARG 685 conflict 685 4 1 7MJI PRO B 817 ? UNP P0DTC2 PHE 817 conflict 817 5 1 7MJI PRO B 892 ? UNP P0DTC2 ALA 892 conflict 892 6 1 7MJI PRO B 899 ? UNP P0DTC2 ALA 899 conflict 899 7 1 7MJI PRO B 942 ? UNP P0DTC2 ALA 942 conflict 942 8 1 7MJI PRO B 986 ? UNP P0DTC2 LYS 986 conflict 986 9 1 7MJI PRO B 987 ? UNP P0DTC2 VAL 987 conflict 987 10 1 7MJI GLY B 1209 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1209 11 1 7MJI SER B 1210 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1210 12 1 7MJI GLY B 1211 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1211 13 1 7MJI TYR B 1212 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1212 14 1 7MJI ILE B 1213 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1213 15 1 7MJI PRO B 1214 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1214 16 1 7MJI GLU B 1215 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1215 17 1 7MJI ALA B 1216 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1216 18 1 7MJI PRO B 1217 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1217 19 1 7MJI ARG B 1218 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1218 20 1 7MJI ASP B 1219 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1219 21 1 7MJI GLY B 1220 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1220 22 1 7MJI GLN B 1221 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1221 23 1 7MJI ALA B 1222 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1222 24 1 7MJI TYR B 1223 ? UNP P0DTC2 ? ? 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'expression tag' 1287 89 1 7MJI LYS B 1288 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1288 90 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 PHE A 338 ? ASN A 343 ? PHE B 338 ASN B 343 1 ? 6 HELX_P HELX_P2 AA2 TYR A 365 ? ASN A 370 ? TYR B 365 ASN B 370 1 ? 6 HELX_P HELX_P3 AA3 SER A 383 ? ASP A 389 ? SER B 383 ASP B 389 5 ? 7 HELX_P HELX_P4 AA4 ARG A 403 ? ILE A 410 ? ARG B 403 ILE B 410 5 ? 8 HELX_P HELX_P5 AA5 GLY A 416 ? ASN A 422 ? GLY B 416 ASN B 422 1 ? 7 HELX_P HELX_P6 AA6 SER A 438 ? SER A 443 ? SER B 438 SER B 443 1 ? 6 HELX_P HELX_P7 AA7 THR B 28 ? TYR B 32 ? THR E 49 TYR E 53 5 ? 5 HELX_P HELX_P8 AA8 LEU B 63 ? SER B 65 ? LEU E 84 SER E 86 5 ? 3 HELX_P HELX_P9 AA9 ARG B 86 ? THR B 90 ? ARG E 107 THR E 111 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 336 SG ? ? ? 1_555 A CYS 361 SG ? ? B CYS 336 B CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 379 SG ? ? ? 1_555 A CYS 432 SG ? ? B CYS 379 B CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf3 disulf ? ? A CYS 391 SG ? ? ? 1_555 A CYS 525 SG ? ? B CYS 391 B CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf4 disulf ? ? A CYS 480 SG ? ? ? 1_555 A CYS 488 SG ? ? B CYS 480 B CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf5 disulf ? ? B CYS 22 SG ? ? ? 1_555 B CYS 95 SG ? ? E CYS 43 E CYS 116 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? ? covale1 covale one ? A ASN 343 ND2 ? ? ? 1_555 C NAG . C1 ? ? B ASN 343 B NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? N-Glycosylation # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 NAG C . ? 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AA7 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 4 5 ? anti-parallel AA6 5 6 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ASN A 354 ? 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MET E 55 GLN E 60 AA6 5 LEU B 45 ? MET B 51 ? LEU E 66 MET E 72 AA6 6 THR B 57 ? TYR B 59 ? THR E 78 TYR E 80 AA7 1 LEU B 11 ? VAL B 12 ? LEU E 32 VAL E 33 AA7 2 THR B 118 ? VAL B 122 ? THR E 139 VAL E 143 AA7 3 ALA B 91 ? ASP B 98 ? ALA E 112 ASP E 119 AA7 4 MET B 111 ? TRP B 114 ? MET E 132 TRP E 135 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N ILE A 358 ? N ILE B 358 O VAL A 395 ? O VAL B 395 AA1 2 3 N PHE A 392 ? N PHE B 392 O VAL A 524 ? O VAL B 524 AA1 3 4 O CYS A 525 ? O CYS B 525 N CYS A 361 ? N CYS B 361 AA2 1 2 N ILE A 358 ? N ILE B 358 O VAL A 395 ? O VAL B 395 AA2 2 3 N ILE A 402 ? N ILE B 402 O TYR A 508 ? O TYR B 508 AA2 3 4 O LEU A 513 ? O LEU B 513 N CYS A 432 ? N CYS B 432 AA2 4 5 O VAL A 433 ? O VAL B 433 N LYS A 378 ? N LYS B 378 AA3 1 2 N TYR A 453 ? N TYR B 453 O GLN A 493 ? O GLN B 493 AA4 1 2 N TYR A 473 ? N TYR B 473 O TYR A 489 ? O TYR B 489 AA5 1 2 N SER B 7 ? N SER E 28 O SER B 21 ? O SER E 42 AA5 2 3 N LEU B 18 ? N LEU E 39 O MET B 82 ? O MET E 103 AA5 3 4 O TYR B 79 ? O TYR E 100 N SER B 70 ? N SER E 91 AA6 1 2 N VAL B 12 ? N VAL E 33 O THR B 121 ? O THR E 142 AA6 2 3 O THR B 118 ? O THR E 139 N TYR B 93 ? N TYR E 114 AA6 3 4 O ALA B 96 ? O ALA E 117 N SER B 35 ? N SER E 56 AA6 4 5 N ARG B 38 ? N ARG E 59 O GLU B 46 ? O GLU E 67 AA6 5 6 N ARG B 50 ? N ARG E 71 O SER B 58 ? O SER E 79 AA7 1 2 N VAL B 12 ? N VAL E 33 O THR B 121 ? O THR E 142 AA7 2 3 O THR B 118 ? O THR E 139 N TYR B 93 ? N TYR E 114 AA7 3 4 N ARG B 97 ? N ARG E 118 O VAL B 113 ? 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