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_pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf REL _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7MYZ _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2021-05-22 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Fenalti, G.' 1 0000-0001-6554-2351 'Villanueva, N.' 2 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Nat Commun' 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'Hadjivassiliou, H.' 12 ? primary 'Zhu, D.' 13 ? primary 'Chamberlain, P.P.' 14 0000-0002-6407-7344 primary 'Cho, H.' 15 ? primary 'Hariharan, K.' 16 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Fusion protein of Leukocyte surface antigen CD47 an Soluble cytochrome b562' 46644.930 2 ? ? ? ? 2 polymer man 'B6H12 Fab heavy chain' 23264.068 2 ? ? ? ? 3 polymer man 'B6H12 Fab light chain' 23270.766 2 ? ? ? ? 4 non-polymer man 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose 221.208 7 ? ? ? ? 5 non-polymer syn GLYCEROL 92.094 1 ? ? ? ? 6 water nat water 18.015 3 ? ? ? ? # _entity_name_com.entity_id 1 _entity_name_com.name ;Antigenic surface determinant protein OA3,Integrin-associated protein,IAP,Protein MER6,Cytochrome b-562,Antigenic surface determinant protein OA3,Integrin-associated protein,IAP,Protein MER6 ; # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;QLLFNKTKSVEFTFCNDTVVIPCFVTNMEAQNTTEVYVKWKFKGRDIYTFDGALNKSTVPTDFSSAKIEVSQLLKGDASL KMDKSDAVSHTGNYTCEVTELTREGETIIELKYRVVSWFSPNENILIVIFPIFAILLFWGQFGIKTLKYRSGADLEDNWE TLNDNLKVIEKADNAAQVKDALTKMRAAALDAQKATPPKLEDKSPDSPEMKDFRHGFDILVGQIDDALKLANEGKVKEAQ AAAEQLKTTRNAYIQKYLGMDEKTIALLVAGLVITVIVIVGAILFVPGEYSLKNATGLGLIVTSTGILILLHYYVFSTAI GLTSFVIAILVIQVIAYILAVVGLSLCIAACIPMHGPLLISGLSILALAQLLGLVYMKFVASNQKTIQPPRKAVEEPLNA FKESKGMMNDEHHHHHHHHHH ; ;QLLFNKTKSVEFTFCNDTVVIPCFVTNMEAQNTTEVYVKWKFKGRDIYTFDGALNKSTVPTDFSSAKIEVSQLLKGDASL KMDKSDAVSHTGNYTCEVTELTREGETIIELKYRVVSWFSPNENILIVIFPIFAILLFWGQFGIKTLKYRSGADLEDNWE TLNDNLKVIEKADNAAQVKDALTKMRAAALDAQKATPPKLEDKSPDSPEMKDFRHGFDILVGQIDDALKLANEGKVKEAQ AAAEQLKTTRNAYIQKYLGMDEKTIALLVAGLVITVIVIVGAILFVPGEYSLKNATGLGLIVTSTGILILLHYYVFSTAI GLTSFVIAILVIQVIAYILAVVGLSLCIAACIPMHGPLLISGLSILALAQLLGLVYMKFVASNQKTIQPPRKAVEEPLNA FKESKGMMNDEHHHHHHHHHH ; C,D ? 2 'polypeptide(L)' no no ;EVKLVESGGDLVKPGGSLKLSCAASGFTFSGYGMSWVRQTPDKRLEWVATITSGGTYTYYPDSVKGRFTISRDNAKNTLY LQIDSLKSEDTAIYFCARSLAGNAMDYWGQGTSVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWN SGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKS ; ;EVKLVESGGDLVKPGGSLKLSCAASGFTFSGYGMSWVRQTPDKRLEWVATITSGGTYTYYPDSVKGRFTISRDNAKNTLY LQIDSLKSEDTAIYFCARSLAGNAMDYWGQGTSVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWN SGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKS ; H,I ? 3 'polypeptide(L)' no no ;DIVMTQSPATLSVTPGDRVSLSCRASQTISDYLHWYQQKSHESPRLLIKFASQSISGIPSRFSGSGSGSDFTLSINSVEP EDVGVYYCQNGHGFPRTFGGGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQ ESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGE ; ;DIVMTQSPATLSVTPGDRVSLSCRASQTISDYLHWYQQKSHESPRLLIKFASQSISGIPSRFSGSGSGSDFTLSINSVEP 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L 6240 ? ? 3 'X-RAY DIFFRACTION' 2 ? ? 0.080 ? 0.050 6 'interatomic distance' ? M 6240 ? ? 3 # _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_ls_shell.d_res_high 3.4000 _refine_ls_shell.d_res_low 3.4880 _refine_ls_shell.number_reflns_all 2034 _refine_ls_shell.number_reflns_obs ? _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 103 _refine_ls_shell.number_reflns_R_work 1931 _refine_ls_shell.percent_reflns_obs 73.5100 _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free ? _refine_ls_shell.R_factor_all ? _refine_ls_shell.R_factor_obs ? _refine_ls_shell.R_factor_R_free 0.2650 _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error 0.0000 _refine_ls_shell.R_factor_R_work 0.2820 _refine_ls_shell.redundancy_reflns_all ? _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs ? _refine_ls_shell.wR_factor_all ? _refine_ls_shell.wR_factor_obs ? _refine_ls_shell.wR_factor_R_free ? _refine_ls_shell.wR_factor_R_work ? _refine_ls_shell.pdbx_R_complete ? _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used 20 _refine_ls_shell.pdbx_phase_error ? _refine_ls_shell.pdbx_fsc_work ? _refine_ls_shell.pdbx_fsc_free ? # loop_ _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom.id _struct_ncs_dom.details 1 1 C 1 2 D 2 1 H 2 2 I 3 1 L 3 2 M # loop_ _struct_ncs_dom_lim.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom_lim.dom_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_component_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_refine_code _struct_ncs_dom_lim.selection_details 1 1 0 A GLN 1 . A VAL 116 . C GLN 1 C VAL 116 0 ? 1 2 0 B GLN 1 . B VAL 116 . D GLN 1 D VAL 116 0 ? 2 1 0 C GLU 1 . C SER 220 . H GLU 1 H SER 220 0 ? 2 2 0 D GLU 1 . D SER 220 . I GLU 1 I SER 220 0 ? 3 1 0 E ASP 1 . E GLU 213 . L ASP 1 L GLU 213 0 ? 3 2 0 F ASP 1 . F GLU 213 . M ASP 1 M GLU 213 0 ? # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details 1 ? 2 ? 3 ? # _struct.entry_id 7MYZ _struct.title 'Structure of the full length 5-TM receptor CD47 bound to Fab B6H12' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7MYZ _struct_keywords.text '5-TM receptor, immune receptor, phagocytosis inhibitor, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 2 ? E N N 3 ? F N N 3 ? G N N 4 ? H N N 4 ? I N N 4 ? J N N 4 ? K N N 4 ? L N N 4 ? M N N 4 ? N N N 5 ? O N N 6 ? P N N 6 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP CD47_HUMAN Q08722 ? 1 ;QLLFNKTKSVEFTFCNDTVVIPCFVTNMEAQNTTEVYVKWKFKGRDIYTFDGALNKSTVPTDFSSAKIEVSQLLKGDASL KMDKSDAVSHTGNYTCEVTELTREGETIIELKYRVVSWFSPNENILIVIFPIFAILLFWGQFGIKTLKYRSG ; 19 2 UNP C562_ECOLX P0ABE7 ? 1 ;ADLEDNMETLNDNLKVIEKADNAAQVKDALTKMRAAALDAQKATPPKLEDKSPDSPEMKDFRHGFDILVGQIDDALKLAN EGKVKEAQAAAEQLKTTRNAYHQKY ; 23 3 UNP CD47_HUMAN Q08722 ? 1 ;GMDEKTIALLVAGLVITVIVIVGAILFVPGEYSLKNATGLGLIVTSTGILILLHYYVFSTAIGLTSFVIAILVIQVIAYI LAVVGLSLCIAACIPMHGPLLISGLSILALAQLLGLVYMKFVASNQKTIQPPRKAVEEPLNAFKESKGMMNDE ; 171 4 PDB 7MYZ 7MYZ ? 2 ? 1 5 PDB 7MYZ 7MYZ ? 3 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7MYZ C 1 ? 152 E Q08722 19 ? 170 ? 1 147 2 2 7MYZ C 153 F 257 F P0ABE7 23 ? 127 ? 147 151 3 3 7MYZ C 259 H 411 ? Q08722 171 ? 323 ? 151 305 4 1 7MYZ D 1 ? 152 ? Q08722 19 ? 170 ? 1 152 5 2 7MYZ D 153 ? 257 ? P0ABE7 23 ? 127 ? 153 257 6 3 7MYZ D 259 ? 411 ? Q08722 171 ? 323 ? 259 411 7 4 7MYZ H 1 ? 220 ? 7MYZ 1 ? 220 ? 1 220 8 4 7MYZ I 1 ? 220 ? 7MYZ 1 ? 220 ? 1 220 9 5 7MYZ L 1 ? 213 ? 7MYZ 1 ? 213 ? 1 213 10 5 7MYZ M 1 ? 213 ? 7MYZ 1 ? 213 ? 1 213 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 2 7MYZ TRP C 159 L UNP P0ABE7 MET 29 conflict 147 1 2 7MYZ ILE C 254 C UNP P0ABE7 HIS 124 conflict 151 2 2 7MYZ LEU C 258 G UNP P0ABE7 ? ? linker 151 3 3 7MYZ HIS C 412 ? UNP Q08722 ? ? 'expression tag' 306 4 3 7MYZ HIS C 413 ? UNP Q08722 ? ? 'expression tag' 307 5 3 7MYZ HIS C 414 ? UNP Q08722 ? ? 'expression tag' 308 6 3 7MYZ HIS C 415 ? UNP Q08722 ? ? 'expression tag' 309 7 3 7MYZ HIS C 416 ? UNP Q08722 ? ? 'expression tag' 310 8 3 7MYZ HIS C 417 ? UNP Q08722 ? ? 'expression tag' 311 9 3 7MYZ HIS C 418 ? UNP Q08722 ? ? 'expression tag' 312 10 3 7MYZ HIS C 419 ? UNP Q08722 ? ? 'expression tag' 313 11 3 7MYZ HIS C 420 ? UNP Q08722 ? ? 'expression tag' 314 12 3 7MYZ HIS C 421 ? UNP Q08722 ? ? 'expression tag' 315 13 5 7MYZ TRP D 159 ? UNP P0ABE7 MET 29 conflict 159 14 5 7MYZ ILE D 254 ? UNP P0ABE7 HIS 124 conflict 254 15 5 7MYZ LEU D 258 ? UNP P0ABE7 ? ? linker 258 16 6 7MYZ HIS D 412 ? UNP Q08722 ? ? 'expression tag' 412 17 6 7MYZ HIS D 413 ? UNP Q08722 ? ? 'expression tag' 413 18 6 7MYZ HIS D 414 ? UNP Q08722 ? ? 'expression tag' 414 19 6 7MYZ HIS D 415 ? UNP Q08722 ? ? 'expression tag' 415 20 6 7MYZ HIS D 416 ? UNP Q08722 ? ? 'expression tag' 416 21 6 7MYZ HIS D 417 ? UNP Q08722 ? ? 'expression tag' 417 22 6 7MYZ HIS D 418 ? UNP Q08722 ? ? 'expression tag' 418 23 6 7MYZ HIS D 419 ? UNP Q08722 ? ? 'expression tag' 419 24 6 7MYZ HIS D 420 ? UNP Q08722 ? ? 'expression tag' 420 25 6 7MYZ HIS D 421 ? UNP Q08722 ? ? 'expression tag' 421 26 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_and_software_defined_assembly PISA trimeric 3 2 author_and_software_defined_assembly PISA trimeric 3 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 6430 ? 1 MORE -17 ? 1 'SSA (A^2)' 30710 ? 2 'ABSA (A^2)' 5970 ? 2 MORE -21 ? 2 'SSA (A^2)' 23300 ? # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,C,E,G,H,I,J,N,P 2 1 B,D,F,K,L,M,O # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'surface plasmon resonance' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASN A 32 ? GLU A 35 ? ASN C 32 GLU C 35 5 ? 4 HELX_P HELX_P2 AA2 PRO A 60 ? SER A 64 ? PRO C 60 SER C 64 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 AA3 GLU A 69 ? GLY A 76 ? GLU C 69 GLY C 76 5 ? 8 HELX_P HELX_P4 AA4 LYS A 84 ? HIS A 90 ? LYS C 84 HIS C 90 1 ? 7 HELX_P HELX_P5 AA5 ILE A 125 ? LEU A 147 ? ILE C 125 LEU C 147 1 ? 23 HELX_P HELX_P6 AA6 ILE A 265 ? PHE A 285 ? ILE C 159 PHE C 179 1 ? 21 HELX_P HELX_P7 AA7 SER A 291 ? TYR A 313 ? SER C 185 TYR C 207 1 ? 23 HELX_P HELX_P8 AA8 PHE A 325 ? VAL A 342 ? PHE C 219 VAL C 236 1 ? 18 HELX_P HELX_P9 AA9 HIS A 355 ? ALA A 381 ? HIS C 249 ALA C 275 1 ? 27 HELX_P HELX_P10 AB1 ASN B 32 ? GLU B 35 ? ASN D 32 GLU D 35 5 ? 4 HELX_P HELX_P11 AB2 PRO B 60 ? SER B 64 ? PRO D 60 SER D 64 5 ? 5 HELX_P HELX_P12 AB3 GLU B 69 ? GLY B 76 ? GLU D 69 GLY D 76 5 ? 8 HELX_P HELX_P13 AB4 LYS B 84 ? HIS B 90 ? LYS D 84 HIS D 90 1 ? 7 HELX_P HELX_P14 AB5 THR C 28 ? TYR C 32 ? THR H 28 TYR H 32 5 ? 5 HELX_P HELX_P15 AB6 PRO C 61 ? LYS C 65 ? PRO H 61 LYS H 65 5 ? 5 HELX_P HELX_P16 AB7 LYS C 87 ? THR C 91 ? LYS H 87 THR H 91 5 ? 5 HELX_P HELX_P17 AB8 ALA C 101 ? ASN C 103 ? ALA H 101 ASN H 103 5 ? 3 HELX_P HELX_P18 AB9 SER C 161 ? ALA C 163 ? SER H 161 ALA H 163 5 ? 3 HELX_P HELX_P19 AC1 LYS C 206 ? ASN C 209 ? LYS H 206 ASN H 209 5 ? 4 HELX_P HELX_P20 AC2 THR D 28 ? TYR D 32 ? THR I 28 TYR I 32 5 ? 5 HELX_P HELX_P21 AC3 PRO D 61 ? LYS D 65 ? PRO I 61 LYS I 65 5 ? 5 HELX_P HELX_P22 AC4 LYS D 87 ? THR D 91 ? LYS I 87 THR I 91 5 ? 5 HELX_P HELX_P23 AC5 ALA D 101 ? ASN D 103 ? ALA I 101 ASN I 103 5 ? 3 HELX_P HELX_P24 AC6 SER D 161 ? ALA D 163 ? SER I 161 ALA I 163 5 ? 3 HELX_P HELX_P25 AC7 LYS D 206 ? ASN D 209 ? LYS I 206 ASN I 209 5 ? 4 HELX_P HELX_P26 AC8 SER E 121 ? GLY E 128 ? SER L 121 GLY L 128 1 ? 8 HELX_P HELX_P27 AC9 LYS E 183 ? HIS E 189 ? LYS L 183 HIS L 189 1 ? 7 HELX_P HELX_P28 AD1 PHE F 50 ? SER F 52 ? PHE M 50 SER M 52 5 ? 3 HELX_P HELX_P29 AD2 SER F 121 ? GLY F 128 ? SER M 121 GLY M 128 1 ? 8 HELX_P HELX_P30 AD3 LYS F 183 ? LYS F 188 ? LYS M 183 LYS M 188 1 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 15 SG ? ? ? 1_555 A CYS 351 SG ? ? C CYS 15 C CYS 245 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 23 SG ? ? ? 1_555 A CYS 96 SG ? ? C CYS 23 C CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.070 ? ? disulf3 disulf ? ? B CYS 23 SG ? ? ? 1_555 B CYS 96 SG ? ? D CYS 23 D CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? ? disulf4 disulf ? ? C CYS 22 SG ? ? ? 1_555 C CYS 96 SG ? ? H CYS 22 H CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? ? disulf5 disulf ? ? C CYS 145 SG ? ? ? 1_555 C CYS 201 SG ? ? H CYS 145 H CYS 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.020 ? ? disulf6 disulf ? ? D CYS 22 SG ? ? ? 1_555 D CYS 96 SG ? ? I CYS 22 I CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? ? disulf7 disulf ? ? D CYS 145 SG ? ? ? 1_555 D CYS 201 SG ? ? I CYS 145 I CYS 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? ? disulf8 disulf ? ? E CYS 23 SG ? ? ? 1_555 E CYS 88 SG ? ? L CYS 23 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.059 ? ? disulf9 disulf ? ? E CYS 134 SG ? ? ? 1_555 E CYS 194 SG ? ? L CYS 134 L CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.057 ? ? disulf10 disulf ? ? F CYS 23 SG ? ? ? 1_555 F CYS 88 SG ? ? M CYS 23 M CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? ? disulf11 disulf ? ? F CYS 134 SG ? ? ? 1_555 F CYS 194 SG ? ? M CYS 134 M CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? covale1 covale one ? A ASN 16 ND2 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? C ASN 16 C NAG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 32 ND2 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? C ASN 32 C NAG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 55 ND2 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? C ASN 55 C NAG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.420 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? A ASN 93 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? C ASN 93 C NAG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? B ASN 16 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? D ASN 16 D NAG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? B ASN 32 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? D ASN 32 D NAG 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? B ASN 93 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? D ASN 93 D NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 NAG G . ? ASN A 16 ? NAG C 401 ? 1_555 ASN C 16 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 2 NAG H . ? ASN A 55 ? NAG C 402 ? 1_555 ASN C 55 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 3 NAG I . ? ASN A 32 ? NAG C 403 ? 1_555 ASN C 32 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 4 NAG J . ? ASN A 93 ? NAG C 404 ? 1_555 ASN C 93 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 5 NAG K . ? ASN B 93 ? NAG D 501 ? 1_555 ASN D 93 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 6 NAG L . ? ASN B 16 ? NAG D 502 ? 1_555 ASN D 16 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 7 NAG M . ? ASN B 32 ? NAG D 503 ? 1_555 ASN D 32 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 8 CYS A 15 ? CYS A 351 ? CYS C 15 ? 1_555 CYS C 245 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 9 CYS A 23 ? CYS A 96 ? CYS C 23 ? 1_555 CYS C 96 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 10 CYS B 23 ? CYS B 96 ? CYS D 23 ? 1_555 CYS D 96 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 11 CYS C 22 ? CYS C 96 ? CYS H 22 ? 1_555 CYS H 96 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 12 CYS C 145 ? CYS C 201 ? CYS H 145 ? 1_555 CYS H 201 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 13 CYS D 22 ? CYS D 96 ? CYS I 22 ? 1_555 CYS I 96 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 14 CYS D 145 ? CYS D 201 ? CYS I 145 ? 1_555 CYS I 201 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 15 CYS E 23 ? CYS E 88 ? CYS L 23 ? 1_555 CYS L 88 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 16 CYS E 134 ? CYS E 194 ? CYS L 134 ? 1_555 CYS L 194 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 17 CYS F 23 ? CYS F 88 ? CYS M 23 ? 1_555 CYS M 88 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 18 CYS F 134 ? CYS F 194 ? CYS M 134 ? 1_555 CYS M 194 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PHE 151 C . ? PHE 151 H PRO 152 C ? PRO 152 H 1 3.31 2 GLU 153 C . ? GLU 153 H PRO 154 C ? PRO 154 H 1 -10.19 3 PHE 151 D . ? PHE 151 I PRO 152 D ? PRO 152 I 1 -7.06 4 GLU 153 D . ? GLU 153 I PRO 154 D ? PRO 154 I 1 -8.54 5 SER 7 E . ? SER 7 L PRO 8 E ? PRO 8 L 1 2.80 6 PHE 94 E . ? PHE 94 L PRO 95 E ? PRO 95 L 1 -4.83 7 TYR 140 E . ? TYR 140 L PRO 141 E ? PRO 141 L 1 5.52 8 SER 7 F . ? SER 7 M PRO 8 F ? PRO 8 M 1 -0.57 9 PHE 94 F . ? PHE 94 M PRO 95 F ? PRO 95 M 1 1.88 10 TYR 140 F . ? TYR 140 M PRO 141 F ? PRO 141 M 1 4.14 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 6 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 6 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 6 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 3 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 6 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 3 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 12 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 3 ? AC3 ? 4 ? AC4 ? 4 ? AC5 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 2 ? parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA3 4 5 ? anti-parallel AA3 5 6 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 4 5 ? anti-parallel AA6 5 6 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB3 4 5 ? anti-parallel AB3 5 6 ? anti-parallel AB4 1 2 ? parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AB9 4 5 ? anti-parallel AB9 5 6 ? parallel AB9 6 7 ? anti-parallel AB9 7 8 ? parallel AB9 8 9 ? anti-parallel AB9 9 10 ? anti-parallel AB9 10 11 ? anti-parallel AB9 11 12 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 SER A 9 ? 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THR H 112 VAL H 116 AA6 3 ALA C 92 ? SER C 99 ? ALA H 92 SER H 99 AA6 4 GLY C 33 ? GLN C 39 ? GLY H 33 GLN H 39 AA6 5 LEU C 45 ? ILE C 51 ? LEU H 45 ILE H 51 AA6 6 THR C 58 ? TYR C 59 ? THR H 58 TYR H 59 AA7 1 LEU C 11 ? VAL C 12 ? LEU H 11 VAL H 12 AA7 2 THR C 112 ? VAL C 116 ? THR H 112 VAL H 116 AA7 3 ALA C 92 ? SER C 99 ? ALA H 92 SER H 99 AA7 4 MET C 105 ? TRP C 108 ? MET H 105 TRP H 108 AA8 1 SER C 125 ? LEU C 129 ? SER H 125 LEU H 129 AA8 2 THR C 140 ? TYR C 150 ? THR H 140 TYR H 150 AA8 3 TYR C 181 ? PRO C 190 ? TYR H 181 PRO H 190 AA8 4 VAL C 168 ? THR C 170 ? VAL H 168 THR H 170 AA9 1 SER C 125 ? LEU C 129 ? SER H 125 LEU H 129 AA9 2 THR C 140 ? TYR C 150 ? THR H 140 TYR H 150 AA9 3 TYR C 181 ? PRO C 190 ? TYR H 181 PRO H 190 AA9 4 VAL C 174 ? LEU C 175 ? VAL H 174 LEU H 175 AB1 1 THR C 156 ? TRP C 159 ? THR H 156 TRP H 159 AB1 2 TYR C 199 ? HIS C 205 ? TYR H 199 HIS H 205 AB1 3 THR C 210 ? VAL C 216 ? THR H 210 VAL H 216 AB2 1 LYS D 3 ? SER D 7 ? LYS I 3 SER I 7 AB2 2 LEU D 18 ? SER D 25 ? LEU I 18 SER I 25 AB2 3 THR D 78 ? ILE D 83 ? THR I 78 ILE I 83 AB2 4 PHE D 68 ? ASP D 73 ? PHE I 68 ASP I 73 AB3 1 LEU D 11 ? VAL D 12 ? LEU I 11 VAL I 12 AB3 2 THR D 112 ? VAL D 116 ? THR I 112 VAL I 116 AB3 3 ALA D 92 ? SER D 99 ? ALA I 92 SER I 99 AB3 4 GLY D 33 ? GLN D 39 ? GLY I 33 GLN I 39 AB3 5 LEU D 45 ? ILE D 51 ? LEU I 45 ILE I 51 AB3 6 THR D 58 ? TYR D 59 ? THR I 58 TYR I 59 AB4 1 LEU D 11 ? VAL D 12 ? LEU I 11 VAL I 12 AB4 2 THR D 112 ? VAL D 116 ? THR I 112 VAL I 116 AB4 3 ALA D 92 ? SER D 99 ? ALA I 92 SER I 99 AB4 4 MET D 105 ? TRP D 108 ? MET I 105 TRP I 108 AB5 1 SER D 125 ? LEU D 129 ? SER I 125 LEU I 129 AB5 2 THR D 140 ? TYR D 150 ? THR I 140 TYR I 150 AB5 3 TYR D 181 ? PRO D 190 ? TYR I 181 PRO I 190 AB5 4 VAL D 168 ? THR D 170 ? VAL I 168 THR I 170 AB6 1 SER D 125 ? LEU D 129 ? SER I 125 LEU I 129 AB6 2 THR D 140 ? TYR D 150 ? THR I 140 TYR I 150 AB6 3 TYR D 181 ? PRO D 190 ? TYR I 181 PRO I 190 AB6 4 VAL D 174 ? LEU D 175 ? VAL I 174 LEU I 175 AB7 1 THR D 156 ? TRP D 159 ? THR I 156 TRP I 159 AB7 2 TYR D 199 ? HIS D 205 ? TYR I 199 HIS I 205 AB7 3 THR D 210 ? VAL D 216 ? THR I 210 VAL I 216 AB8 1 MET E 4 ? SER E 7 ? MET L 4 SER L 7 AB8 2 VAL E 19 ? ALA E 25 ? VAL L 19 ALA L 25 AB8 3 ASP E 70 ? ILE E 75 ? ASP L 70 ILE L 75 AB8 4 PHE E 62 ? GLY E 66 ? PHE L 62 GLY L 66 AB9 1 GLN E 53 ? SER E 54 ? GLN L 53 SER L 54 AB9 2 ARG E 45 ? LYS E 49 ? ARG L 45 LYS L 49 AB9 3 LEU E 33 ? GLN E 38 ? LEU L 33 GLN L 38 AB9 4 GLY E 84 ? ASN E 90 ? GLY L 84 ASN L 90 AB9 5 THR E 102 ? ILE E 106 ? THR L 102 ILE L 106 AB9 6 THR E 10 ? VAL E 13 ? THR L 10 VAL L 13 AB9 7 THR F 10 ? VAL F 13 ? THR M 10 VAL M 13 AB9 8 THR F 102 ? ILE F 106 ? THR M 102 ILE M 106 AB9 9 GLY F 84 ? ASN F 90 ? GLY M 84 ASN M 90 AB9 10 LEU F 33 ? GLN F 38 ? LEU M 33 GLN M 38 AB9 11 ARG F 45 ? LYS F 49 ? ARG M 45 LYS M 49 AB9 12 GLN F 53 ? SER F 54 ? GLN M 53 SER M 54 AC1 1 SER E 114 ? PHE E 118 ? SER L 114 PHE L 118 AC1 2 THR E 129 ? PHE E 139 ? THR L 129 PHE L 139 AC1 3 TYR E 173 ? SER E 182 ? TYR L 173 SER L 182 AC1 4 SER E 159 ? VAL E 163 ? SER L 159 VAL L 163 AC2 1 LYS E 145 ? VAL E 150 ? LYS L 145 VAL L 150 AC2 2 VAL E 191 ? THR E 197 ? VAL L 191 THR L 197 AC2 3 VAL E 205 ? ASN E 210 ? VAL L 205 ASN L 210 AC3 1 MET F 4 ? SER F 7 ? MET M 4 SER M 7 AC3 2 VAL F 19 ? ALA F 25 ? VAL M 19 ALA M 25 AC3 3 ASP F 70 ? ILE F 75 ? ASP M 70 ILE M 75 AC3 4 PHE F 62 ? GLY F 66 ? PHE M 62 GLY M 66 AC4 1 SER F 114 ? PHE F 118 ? SER M 114 PHE M 118 AC4 2 THR F 129 ? PHE F 139 ? THR M 129 PHE M 139 AC4 3 TYR F 173 ? SER F 182 ? TYR M 173 SER M 182 AC4 4 SER F 159 ? VAL F 163 ? SER M 159 VAL M 163 AC5 1 LYS F 145 ? VAL F 150 ? LYS M 145 VAL M 150 AC5 2 VAL F 191 ? THR F 197 ? VAL M 191 THR M 197 AC5 3 VAL F 205 ? ASN F 210 ? 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