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H N N 3 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 LEU A 223 ? VAL A 230 ? LEU A 219 VAL A 226 1 ? 8 HELX_P HELX_P2 AA2 TYR A 237 ? ASN A 244 ? TYR A 233 ASN A 240 1 ? 8 HELX_P HELX_P3 AA3 ASN A 249 ? ASP A 269 ? ASN A 245 ASP A 265 1 ? 21 HELX_P HELX_P4 AA4 ASP A 269 ? PHE A 288 ? ASP A 265 PHE A 284 1 ? 20 HELX_P HELX_P5 AA5 ILE A 297 ? GLU A 310 ? ILE A 293 GLU A 306 1 ? 14 HELX_P HELX_P6 AA6 GLU A 310 ? 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The predicted model for the 6-helix bundle domain, containing residues 246 to 498, that matched our experimental density best was subsequently fitted similar as CRYZL1 and GATD1 using rigid body fit. Manual model building for the regions N- and C-terminal 6-helix bundle, which comprise residues 218 to 245 and 499 to 552, respectively, was further guided by secondary structure predictions of individual trRosetta runs for these regions, that include the vertical helix as well as the beginning of the two terminal coiled-coils of PPP1r21. With the resulting combined model, containing residues 2 to 349, 218 to 552 and 8 to 217 of CRYZL1, PPP1r21 and GATD1, respectively, a restrained refinement in PHENIX was performed. In the next step, the model was further refined using a combination of manual building in COOT and real-space refinement in PHENIX. ; _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_protocol ? _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 7ND2 _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.num_particles 18300 _em_3d_reconstruction.resolution 4.0 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 7.5 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # loop_ _em_entity_assembly.id _em_entity_assembly.parent_id _em_entity_assembly.details _em_entity_assembly.name _em_entity_assembly.source _em_entity_assembly.type _em_entity_assembly.entity_id_list _em_entity_assembly.synonym _em_entity_assembly.oligomeric_details 1 0 ? 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