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'Stahlberg, H.' 4 0000-0002-1185-4592 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev J.Mol.Biol. _citation.journal_id_ASTM JMOBAK _citation.journal_id_CSD 0070 _citation.journal_id_ISSN 1089-8638 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 433 _citation.language ? _citation.page_first 166980 _citation.page_last 166980 _citation.title 'Structural Basis of Drug Recognition by the Multidrug Transporter ABCG2.' _citation.year 2021 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.jmb.2021.166980 _citation.pdbx_database_id_PubMed 33838147 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Kowal, J.' 1 ? primary 'Ni, D.' 2 ? primary 'Jackson, S.M.' 3 ? primary 'Manolaridis, I.' 4 ? primary 'Stahlberg, H.' 5 ? primary 'Locher, K.P.' 6 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'ATP-binding cassette sub-family G member 2' 72385.852 2 7.6.2.2 ? ? ? 2 polymer man '5D3(Fab) light chain variable domain' 23594.016 2 ? ? ? ? 3 polymer man '5D3(Fab) heavy chain variable domain' 23843.633 2 ? ? ? ? 4 non-polymer man "(S)-10-[(DIMETHYLAMINO)METHYL]-4-ETHYL-4,9-DIHYDROXY-1H-PYRANO[3',4':6,7]INOLIZINO[1,2-B]-QUINOLINE-3,14(4H,12H)-DIONE" 421.446 1 ? ? ? ? 5 non-polymer syn 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose 221.208 4 ? ? ? ? # _entity_name_com.entity_id 1 _entity_name_com.name ;Breast cancer resistance protein,CDw338,Mitoxantrone resistance-associated 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;DIVLTQSPSSFSVSLGDRVTISCKASGYILNRLAWYQQKPGNAPRLLISGATSLETGFPSRFSGTGSGKDYTLSISSLQT EDVGTYYCQQYWSTPWTFGGGTKLEIRRADAAPTVSIFPPSSEQLTSGGASVVCFLNNFYPKDINVKWKIDGSERQNGVL NSWTDQDSKDSTYSMSSTLTLTKDEYERHNSYTCEATHKTSTSPIVKSFNRNEC ; C,E ? 3 'polypeptide(L)' no no ;QVQLQESGPGLVKPSQSLSLTCTVTGFSITSDYAWNWIRQFPGKKLEWMGYINFDGGTTYNPSLRGRISITRDTSKNQFF LQLRSVTPEDTATYYCATFYGAKGTLDYWGQGTSVTVSSAKTTPPSVYPLAPVCGDTSGSSVTLGCLVKGYFPEPVTLTW NSGSLSSGVHTFPAVLQSDLYTLSSSVTVTSSTWPSQSITCNVAHPASSTKVDKKIEPRGP ; ;QVQLQESGPGLVKPSQSLSLTCTVTGFSITSDYAWNWIRQFPGKKLEWMGYINFDGGTTYNPSLRGRISITRDTSKNQFF LQLRSVTPEDTATYYCATFYGAKGTLDYWGQGTSVTVSSAKTTPPSVYPLAPVCGDTSGSSVTLGCLVKGYFPEPVTLTW NSGSLSSGVHTFPAVLQSDLYTLSSSVTVTSSTWPSQSITCNVAHPASSTKVDKKIEPRGP ; D,F ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 4 "(S)-10-[(DIMETHYLAMINO)METHYL]-4-ETHYL-4,9-DIHYDROXY-1H-PYRANO[3',4':6,7]INOLIZINO[1,2-B]-QUINOLINE-3,14(4H,12H)-DIONE" TTC 5 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose NAG # loop_ 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.897 ? 17175 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 5.265 ? 7412 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.050 ? 1964 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 ? 2135 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7NEZ _struct.title 'Structure of topotecan-bound ABCG2' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7NEZ _struct_keywords.text 'ABCG2, topotecan, substrate, ABC transporter, anticancer drugs, cavity 1, cryo-EM, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 3 ? E N N 2 ? F N N 3 ? G N N 4 ? H N N 5 ? I N N 5 ? J N N 5 ? 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Q9UNQ0 1 ? 655 ? 1 655 3 2 7NEZ C 1 ? 214 ? 7NEZ 1 ? 214 ? 1 214 4 3 7NEZ D 1 ? 221 ? 7NEZ 1 ? 221 ? 1 221 5 2 7NEZ E 1 ? 214 ? 7NEZ 1 ? 214 ? 1 214 6 3 7NEZ F 1 ? 221 ? 7NEZ 1 ? 221 ? 1 221 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 12120 ? 1 MORE -68 ? 1 'SSA (A^2)' 65240 ? # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support microscopy _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details cryo-EM # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 87 ? 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A CYS 592 SG ? ? ? 1_555 A CYS 608 SG ? ? A CYS 592 A CYS 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 603 SG ? ? ? 1_555 B CYS 603 SG ? ? A CYS 603 B CYS 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf3 disulf ? ? B CYS 592 SG ? ? ? 1_555 B CYS 608 SG ? ? B CYS 592 B CYS 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf4 disulf ? ? C CYS 23 SG ? ? ? 1_555 C CYS 88 SG ? ? C CYS 23 C CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf5 disulf ? ? D CYS 22 SG ? ? ? 1_555 D CYS 96 SG ? ? D CYS 22 D CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf6 disulf ? ? E CYS 23 SG ? ? ? 1_555 E CYS 88 SG ? ? E CYS 23 E CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf7 disulf ? ? F CYS 22 SG ? ? ? 1_555 F CYS 96 SG ? ? F CYS 22 F CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 CYS A 592 ? 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ALA D 34 GLN D 40 AB2 4 THR D 93 ? PHE D 99 ? THR D 93 PHE D 99 AB2 5 THR D 113 ? SER D 114 ? THR D 113 SER D 114 AB3 1 LEU E 4 ? THR E 5 ? LEU E 4 THR E 5 AB3 2 VAL E 19 ? ALA E 25 ? VAL E 19 ALA E 25 AB3 3 ASP E 70 ? ILE E 75 ? ASP E 70 ILE E 75 AB3 4 PHE E 62 ? GLY E 64 ? PHE E 62 GLY E 64 AB4 1 ARG E 45 ? ILE E 48 ? ARG E 45 ILE E 48 AB4 2 LEU E 33 ? GLN E 37 ? LEU E 33 GLN E 37 AB4 3 CYS E 88 ? GLN E 90 ? CYS E 88 GLN E 90 AB5 1 THR E 85 ? TYR E 86 ? THR E 85 TYR E 86 AB5 2 THR E 102 ? LYS E 103 ? THR E 102 LYS E 103 AB6 1 LEU F 11 ? VAL F 12 ? LEU F 11 VAL F 12 AB6 2 THR F 116 ? VAL F 117 ? THR F 116 VAL F 117 AB7 1 SER F 19 ? THR F 23 ? SER F 19 THR F 23 AB7 2 GLN F 78 ? LEU F 83 ? GLN F 78 LEU F 83 AB7 3 ILE F 68 ? ASP F 73 ? ILE F 68 ASP F 73 AB8 1 THR F 58 ? TYR F 60 ? THR F 58 TYR F 60 AB8 2 LEU F 46 ? ILE F 52 ? LEU F 46 ILE F 52 AB8 3 ALA F 34 ? GLN F 40 ? ALA F 34 GLN F 40 AB8 4 THR F 93 ? PHE F 99 ? THR F 93 PHE F 99 AB8 5 LEU F 106 ? TRP F 109 ? 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