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EMD-12377 'other EM volume' PDB . 7NJK unspecified EMDB 'Mycobacterium smegmatis ATP synthase Fo domain state 1' EMD-12434 'associated EM volume' # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Montgomery, M.G.' 1 0000-0001-6142-9423 'Petri, J.' 2 ? 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'This alignment is incorrect. The initial 13 residues in the model should align with residues 53-65.' 2 polymer man 'ATP synthase epsilon chain' 13277.741 1 ? ? ? ? 3 polymer man 'ATP synthase subunit c' 8597.982 9 ? ? ? 'Uniprot A0R205. The crossref box is missing below.' 4 polymer man 'ATP synthase subunit a' 27568.482 1 ? ? ? 'A0R206. The crossref box is missing below.' 5 polymer man 'ATP synthase subunit b' 19018.170 1 ? ? ? 'uniprot A0R204. The crossref box is missing below.' 6 polymer man 'ATP synthase subunit b-delta' 47504.723 1 ? ? ? 'uniprot A0R203. The crossref box is missing.' # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'ATP synthase F1 sector gamma subunit,F-ATPase gamma subunit' 2 'ATP synthase F1 sector epsilon subunit,F-ATPase epsilon subunit' 3 'ATP synthase F(0) sector subunit c,F-type ATPase subunit c,F-ATPase subunit c,Lipid-binding protein' 4 'ATP synthase F0 sector subunit a,F-ATPase subunit 6' 5 'ATP synthase F(0) sector subunit b,ATPase subunit I,F-type ATPase subunit b,F-ATPase subunit b' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MAATLRELRGRIRSAGSIKKITKAQELIATSRIAKAQARVEAARPYAAEITNMLTELAGASALDHPLLVERKQPKRAGVL VVSSDRGLCGAYNANVLRRAEELFSLLRDEGKDPVLYVVGRKALGYFSFRQRTVVESWTGFSERPTYENAREIADTLVNA FMAGADDEGDDAGADGILGVDELHIVFTEFRSMLSQTAVARRAAPMEVEYVGEVETGPRTLYSFEPDPETLFDALLPRYI 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;MSIFIGQLIGFAVIAFIIVKWVVPPVRTLMRNQQEAVRAALAESAEAAKKLADADAMHAKALADAKAESEKVTEEAKQDS ERIAAQLSEQAGSEAERIKAQGAQQIQLMRQQLIRQLRTGLGAEAVNKAAEIVRAHVADPQAQSATVDRFLSELEQMAPS SVVIDTAATSRLRAASRQSLAALVEKFDSVAGGLDADGLTNLADELASVAKLLLSETALNKHLAEPTDDSAPKVRLLERL LSDKVSATTLDLLRTAVSNRWSTESNLIDAVEHTARLALLKRAEIAGEVDEVEEQLFRFGRVLDAEPRLSALLSDYTTPA EGRVALLDKALTGRPGVNQTAAALLSQTVGLLRGERADEAVIDLAELAVSRRGEVVAHVSAAAELSDAQRTRLTEVLSRI YGRPVSVQLHVDPELLGGLSITVGDEVIDGSIASRLAAAQTGLPD ; ;MSIFIGQLIGFAVIAFIIVKWVVPPVRTLMRNQQEAVRAALAESAEAAKKLADADAMHAKALADAKAESEKVTEEAKQDS ERIAAQLSEQAGSEAERIKAQGAQQIQLMRQQLIRQLRTGLGAEAVNKAAEIVRAHVADPQAQSATVDRFLSELEQMAPS SVVIDTAATSRLRAASRQSLAALVEKFDSVAGGLDADGLTNLADELASVAKLLLSETALNKHLAEPTDDSAPKVRLLERL LSDKVSATTLDLLRTAVSNRWSTESNLIDAVEHTARLALLKRAEIAGEVDEVEEQLFRFGRVLDAEPRLSALLSDYTTPA EGRVALLDKALTGRPGVNQTAAALLSQTVGLLRGERADEAVIDLAELAVSRRGEVVAHVSAAAELSDAQRTRLTEVLSRI YGRPVSVQLHVDPELLGGLSITVGDEVIDGSIASRLAAAQTGLPD ; d ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id 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ALA n 1 175 ASP n 1 176 GLY n 1 177 ILE n 1 178 LEU n 1 179 GLY n 1 180 VAL n 1 181 ASP n 1 182 GLU n 1 183 LEU n 1 184 HIS n 1 185 ILE n 1 186 VAL n 1 187 PHE n 1 188 THR n 1 189 GLU n 1 190 PHE n 1 191 ARG n 1 192 SER n 1 193 MET n 1 194 LEU n 1 195 SER n 1 196 GLN n 1 197 THR n 1 198 ALA n 1 199 VAL n 1 200 ALA n 1 201 ARG n 1 202 ARG n 1 203 ALA n 1 204 ALA n 1 205 PRO n 1 206 MET n 1 207 GLU n 1 208 VAL n 1 209 GLU n 1 210 TYR n 1 211 VAL n 1 212 GLY n 1 213 GLU n 1 214 VAL n 1 215 GLU n 1 216 THR n 1 217 GLY n 1 218 PRO n 1 219 ARG n 1 220 THR n 1 221 LEU n 1 222 TYR n 1 223 SER n 1 224 PHE n 1 225 GLU n 1 226 PRO n 1 227 ASP n 1 228 PRO n 1 229 GLU n 1 230 THR n 1 231 LEU n 1 232 PHE n 1 233 ASP n 1 234 ALA n 1 235 LEU n 1 236 LEU n 1 237 PRO n 1 238 ARG n 1 239 TYR n 1 240 ILE n 1 241 ALA n 1 242 THR n 1 243 ARG n 1 244 VAL n 1 245 TYR n 1 246 ALA n 1 247 ALA n 1 248 LEU n 1 249 LEU n 1 250 GLU n 1 251 ALA n 1 252 ALA n 1 253 ALA n 1 254 SER n 1 255 GLU n 1 256 SER n 1 257 ALA 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_exptl.entry_id 7NK9 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7NK9 _struct.title 'Mycobacterium smegmatis ATP synthase Fo domain state 1' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7NK9 _struct_keywords.text 'complex, synthase, HYDROLASE' _struct_keywords.pdbx_keywords HYDROLASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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'expression tag' 180 10 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetradecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 14 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 43180 ? 1 MORE -451 ? 1 'SSA (A^2)' 40240 ? # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N # loop_ _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 1 1 'gel filtration' ? 2 1 'mass spectrometry' ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 MET A 53 ? 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GLN I 46 ? ASP R 4 GLN R 46 1 ? 43 HELX_P HELX_P17 AB8 ALA I 49 ? PHE I 80 ? ALA R 49 PHE R 80 1 ? 32 HELX_P HELX_P18 AB9 ASP J 4 ? GLN J 46 ? ASP S 4 GLN S 46 1 ? 43 HELX_P HELX_P19 AC1 ALA J 49 ? PHE J 80 ? ALA S 49 PHE S 80 1 ? 32 HELX_P HELX_P20 AC2 ASP K 4 ? GLN K 46 ? ASP T 4 GLN T 46 1 ? 43 HELX_P HELX_P21 AC3 ALA K 49 ? ALA K 81 ? ALA T 49 ALA T 81 1 ? 33 HELX_P HELX_P22 AC4 ASN L 28 ? VAL L 53 ? ASN a 28 VAL a 53 1 ? 26 HELX_P HELX_P23 AC5 SER L 60 ? ILE L 81 ? SER a 60 ILE a 81 1 ? 22 HELX_P HELX_P24 AC6 PHE L 88 ? LEU L 106 ? PHE a 88 LEU a 106 1 ? 19 HELX_P HELX_P25 AC7 ALA L 107 ? LEU L 109 ? ALA a 107 LEU a 109 5 ? 3 HELX_P HELX_P26 AC8 ALA L 126 ? SER L 129 ? ALA a 126 SER a 129 5 ? 4 HELX_P HELX_P27 AC9 ASP L 130 ? GLY L 154 ? ASP a 130 GLY a 154 1 ? 25 HELX_P HELX_P28 AD1 VAL L 156 ? GLY L 165 ? VAL a 156 GLY a 165 1 ? 10 HELX_P HELX_P29 AD2 VAL L 167 ? PHE L 169 ? VAL a 167 PHE a 169 5 ? 3 HELX_P HELX_P30 AD3 LEU L 170 ? MET L 205 ? 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ALA a 120 GLU a 122 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N SER A 223 ? 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