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D0LZ73 1 ? 131 ? 801 931 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details decameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 10 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 14670 ? 1 MORE -57 ? 1 'SSA (A^2)' 59080 ? # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support none _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'Isolated pentameric vertex of icosahedral shell' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 LYS A 5 ? ALA A 9 ? LYS A 5 ALA A 9 5 ? 5 HELX_P HELX_P2 AA2 VAL A 12 ? LEU A 31 ? VAL A 12 LEU A 31 1 ? 20 HELX_P HELX_P3 AA3 ALA A 32 ? VAL A 37 ? ALA A 32 VAL A 37 1 ? 6 HELX_P HELX_P4 AA4 VAL A 86 ? VAL A 92 ? VAL A 86 VAL A 92 1 ? 7 HELX_P HELX_P5 AA5 ALA A 93 ? GLY A 95 ? ALA A 93 GLY A 95 5 ? 3 HELX_P HELX_P6 AA6 LEU A 101 ? GLY A 122 ? LEU A 101 GLY A 122 1 ? 22 HELX_P HELX_P7 AA7 TRP A 123 ? GLY A 127 ? TRP A 123 GLY A 127 5 ? 5 HELX_P HELX_P8 AA8 GLY A 130 ? THR A 135 ? GLY A 130 THR A 135 1 ? 6 HELX_P HELX_P9 AA9 SER A 144 ? SER A 146 ? SER A 144 SER A 146 5 ? 3 HELX_P HELX_P10 AB1 ASP A 147 ? ALA A 162 ? ASP A 147 ALA A 162 1 ? 16 HELX_P HELX_P11 AB2 GLY A 173 ? ALA A 183 ? GLY A 173 ALA A 183 1 ? 11 HELX_P HELX_P12 AB3 VAL A 190 ? VAL A 198 ? VAL A 190 VAL A 198 1 ? 9 HELX_P HELX_P13 AB4 GLU A 256 ? GLY A 258 ? GLU A 256 GLY A 258 5 ? 3 HELX_P HELX_P14 AB5 LYS B 5 ? ALA B 9 ? LYS B 5 ALA B 9 5 ? 5 HELX_P HELX_P15 AB6 VAL B 12 ? LEU B 31 ? VAL B 12 LEU B 31 1 ? 20 HELX_P HELX_P16 AB7 ALA B 32 ? VAL B 37 ? ALA B 32 VAL B 37 1 ? 6 HELX_P HELX_P17 AB8 VAL B 86 ? VAL B 92 ? VAL B 86 VAL B 92 1 ? 7 HELX_P HELX_P18 AB9 ALA B 93 ? GLY B 95 ? ALA B 93 GLY B 95 5 ? 3 HELX_P HELX_P19 AC1 LEU B 101 ? GLY B 122 ? LEU B 101 GLY B 122 1 ? 22 HELX_P HELX_P20 AC2 TRP B 123 ? GLY B 127 ? TRP B 123 GLY B 127 5 ? 5 HELX_P HELX_P21 AC3 GLY B 130 ? THR B 135 ? GLY B 130 THR B 135 1 ? 6 HELX_P HELX_P22 AC4 SER B 144 ? SER B 146 ? SER B 144 SER B 146 5 ? 3 HELX_P HELX_P23 AC5 ASP B 147 ? ALA B 162 ? ASP B 147 ALA B 162 1 ? 16 HELX_P HELX_P24 AC6 GLY B 173 ? ALA B 183 ? GLY B 173 ALA B 183 1 ? 11 HELX_P HELX_P25 AC7 VAL B 190 ? VAL B 198 ? VAL B 190 VAL B 198 1 ? 9 HELX_P HELX_P26 AC8 GLU B 256 ? GLY B 258 ? GLU B 256 GLY B 258 5 ? 3 HELX_P HELX_P27 AC9 LYS C 5 ? ALA C 9 ? LYS C 5 ALA C 9 5 ? 5 HELX_P HELX_P28 AD1 VAL C 12 ? LEU C 31 ? VAL C 12 LEU C 31 1 ? 20 HELX_P HELX_P29 AD2 ALA C 32 ? VAL C 37 ? ALA C 32 VAL C 37 1 ? 6 HELX_P HELX_P30 AD3 VAL C 86 ? VAL C 92 ? VAL C 86 VAL C 92 1 ? 7 HELX_P HELX_P31 AD4 ALA C 93 ? GLY C 95 ? ALA C 93 GLY C 95 5 ? 3 HELX_P HELX_P32 AD5 LEU C 101 ? GLY C 122 ? LEU C 101 GLY C 122 1 ? 22 HELX_P HELX_P33 AD6 TRP C 123 ? GLY C 127 ? TRP C 123 GLY C 127 5 ? 5 HELX_P HELX_P34 AD7 GLY C 130 ? THR C 135 ? GLY C 130 THR C 135 1 ? 6 HELX_P HELX_P35 AD8 SER C 144 ? SER C 146 ? SER C 144 SER C 146 5 ? 3 HELX_P HELX_P36 AD9 ASP C 147 ? ALA C 162 ? ASP C 147 ALA C 162 1 ? 16 HELX_P HELX_P37 AE1 GLY C 173 ? ALA C 183 ? GLY C 173 ALA C 183 1 ? 11 HELX_P HELX_P38 AE2 VAL C 190 ? VAL C 198 ? VAL C 190 VAL C 198 1 ? 9 HELX_P HELX_P39 AE3 GLU C 256 ? GLY C 258 ? GLU C 256 GLY C 258 5 ? 3 HELX_P HELX_P40 AE4 LYS D 5 ? ALA D 9 ? LYS D 5 ALA D 9 5 ? 5 HELX_P HELX_P41 AE5 VAL D 12 ? LEU D 31 ? VAL D 12 LEU D 31 1 ? 20 HELX_P HELX_P42 AE6 ALA D 32 ? VAL D 37 ? ALA D 32 VAL D 37 1 ? 6 HELX_P HELX_P43 AE7 VAL D 86 ? VAL D 92 ? VAL D 86 VAL D 92 1 ? 7 HELX_P HELX_P44 AE8 ALA D 93 ? GLY D 95 ? ALA D 93 GLY D 95 5 ? 3 HELX_P HELX_P45 AE9 LEU D 101 ? GLY D 122 ? LEU D 101 GLY D 122 1 ? 22 HELX_P HELX_P46 AF1 TRP D 123 ? GLY D 127 ? TRP D 123 GLY D 127 5 ? 5 HELX_P HELX_P47 AF2 GLY D 130 ? THR D 135 ? GLY D 130 THR D 135 1 ? 6 HELX_P HELX_P48 AF3 SER D 144 ? SER D 146 ? SER D 144 SER D 146 5 ? 3 HELX_P HELX_P49 AF4 ASP D 147 ? ALA D 162 ? ASP D 147 ALA D 162 1 ? 16 HELX_P HELX_P50 AF5 GLY D 173 ? ALA D 183 ? GLY D 173 ALA D 183 1 ? 11 HELX_P HELX_P51 AF6 VAL D 190 ? VAL D 198 ? VAL D 190 VAL D 198 1 ? 9 HELX_P HELX_P52 AF7 GLU D 256 ? GLY D 258 ? GLU D 256 GLY D 258 5 ? 3 HELX_P HELX_P53 AF8 LYS E 5 ? ALA E 9 ? LYS E 5 ALA E 9 5 ? 5 HELX_P HELX_P54 AF9 VAL E 12 ? LEU E 31 ? VAL E 12 LEU E 31 1 ? 20 HELX_P HELX_P55 AG1 ALA E 32 ? VAL E 37 ? ALA E 32 VAL E 37 1 ? 6 HELX_P HELX_P56 AG2 VAL E 86 ? VAL E 92 ? VAL E 86 VAL E 92 1 ? 7 HELX_P HELX_P57 AG3 ALA E 93 ? GLY E 95 ? ALA E 93 GLY E 95 5 ? 3 HELX_P HELX_P58 AG4 LEU E 101 ? GLY E 122 ? LEU E 101 GLY E 122 1 ? 22 HELX_P HELX_P59 AG5 TRP E 123 ? GLY E 127 ? TRP E 123 GLY E 127 5 ? 5 HELX_P HELX_P60 AG6 GLY E 130 ? THR E 135 ? GLY E 130 THR E 135 1 ? 6 HELX_P HELX_P61 AG7 SER E 144 ? SER E 146 ? SER E 144 SER E 146 5 ? 3 HELX_P HELX_P62 AG8 ASP E 147 ? ALA E 162 ? ASP E 147 ALA E 162 1 ? 16 HELX_P HELX_P63 AG9 GLY E 173 ? ALA E 183 ? GLY E 173 ALA E 183 1 ? 11 HELX_P HELX_P64 AH1 VAL E 190 ? VAL E 198 ? VAL E 190 VAL E 198 1 ? 9 HELX_P HELX_P65 AH2 GLU E 256 ? GLY E 258 ? GLU E 256 GLY E 258 5 ? 3 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 4 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 5 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 5 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 4 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 5 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 5 ? AC2 ? 2 ? AC3 ? 4 ? AC4 ? 4 ? AC5 ? 2 ? AC6 ? 5 ? 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ALA B 76 ASP B 85 AA7 1 ASP B 38 ? ARG B 40 ? ASP B 38 ARG B 40 AA7 2 TYR B 222 ? VAL B 226 ? TYR B 222 VAL B 226 AA7 3 LYS B 241 ? VAL B 254 ? LYS B 241 VAL B 254 AA7 4 SER B 231 ? HIS B 237 ? SER B 231 HIS B 237 AA8 1 ALA B 49 ? PRO B 57 ? ALA B 49 PRO B 57 AA8 2 LYS B 68 ? PRO B 74 ? LYS B 68 PRO B 74 AA9 1 LEU B 140 ? ALA B 141 ? LEU B 140 ALA B 141 AA9 2 ALA B 260 ? ARG B 264 ? ALA B 260 ARG B 264 AA9 3 ALA B 212 ? SER B 216 ? ALA B 212 SER B 216 AA9 4 TYR B 168 ? LEU B 172 ? TYR B 168 LEU B 172 AA9 5 VAL B 204 ? ARG B 205 ? VAL B 204 ARG B 205 AB1 1 THR B 184 ? GLN B 185 ? THR B 184 GLN B 185 AB1 2 TYR B 188 ? PRO B 189 ? TYR B 188 PRO B 189 AB2 1 ASP C 38 ? ARG C 40 ? ASP C 38 ARG C 40 AB2 2 TYR C 222 ? VAL C 226 ? TYR C 222 VAL C 226 AB2 3 LYS C 241 ? VAL C 254 ? LYS C 241 VAL C 254 AB2 4 ALA C 76 ? ASP C 85 ? ALA C 76 ASP C 85 AB3 1 ASP C 38 ? ARG C 40 ? ASP C 38 ARG C 40 AB3 2 TYR C 222 ? VAL C 226 ? TYR C 222 VAL C 226 AB3 3 LYS C 241 ? VAL C 254 ? 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pentamer of the Haliangium ochraceum encapsulin from symmetry expansion of icosahedral single particle reconstruction ; # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.name 1 1 150 mM NaCl 'Sodium Chloride' 1 2 20 mM ? 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