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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.856 ? 18556 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 32.968 ? 3770 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.049 ? 2111 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.006 ? 1344 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7OHC _struct.title 'Cryo-EM structure of nucleosome core particle composed of the Widom 601 DNA sequence' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7OHC _struct_keywords.text 'nucleosome, NUCLEAR PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'NUCLEAR PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? 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THR D 87 LEU D 99 1 ? 13 HELX_P HELX_P16 AB7 PRO D 100 ? ALA D 121 ? PRO D 100 ALA D 121 1 ? 22 HELX_P HELX_P17 AB8 GLY E 44 ? SER E 57 ? GLY E 44 SER E 57 1 ? 14 HELX_P HELX_P18 AB9 ARG E 63 ? GLN E 76 ? ARG E 63 GLN E 76 1 ? 14 HELX_P HELX_P19 AC1 GLN E 85 ? ALA E 114 ? GLN E 85 ALA E 114 1 ? 30 HELX_P HELX_P20 AC2 MET E 120 ? ARG E 131 ? MET E 120 ARG E 131 1 ? 12 HELX_P HELX_P21 AC3 ARG F 23 ? ILE F 29 ? ARG F 23 ILE F 29 5 ? 7 HELX_P HELX_P22 AC4 THR F 30 ? GLY F 41 ? THR F 30 GLY F 41 1 ? 12 HELX_P HELX_P23 AC5 LEU F 49 ? ALA F 76 ? LEU F 49 ALA F 76 1 ? 28 HELX_P HELX_P24 AC6 THR F 82 ? GLY F 94 ? THR F 82 GLY F 94 1 ? 13 HELX_P HELX_P25 AC7 THR G 16 ? GLY G 22 ? THR G 16 GLY G 22 1 ? 7 HELX_P HELX_P26 AC8 PRO G 26 ? GLY G 37 ? PRO G 26 GLY G 37 1 ? 12 HELX_P HELX_P27 AC9 ALA G 45 ? ASN G 73 ? ALA G 45 ASN G 73 1 ? 29 HELX_P HELX_P28 AD1 ILE G 79 ? ASP G 90 ? ILE G 79 ASP G 90 1 ? 12 HELX_P HELX_P29 AD2 GLU G 91 ? LEU G 97 ? 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PRO H 100 LYS H 122 1 ? 23 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role hydrog1 hydrog ? ? 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J -72 ? 20 1 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 I DA 1 1_555 J DT 145 1_555 I DT 2 1_555 J DA 144 1_555 -0.376 -0.914 3.380 -1.037 1.840 29.747 -2.171 0.510 3.330 3.578 2.016 29.820 1 II_DA-72DT-71:DA71DT72_JJ I -72 ? 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J 61 ? 1 I DG 12 1_555 J DC 134 1_555 I DG 13 1_555 J DC 133 1_555 -0.259 -0.534 3.183 -0.221 6.347 34.855 -1.774 0.394 3.043 10.488 0.365 35.411 12 II_DG-61DG-60:DC60DC61_JJ I -61 ? J 61 ? I -60 ? J 60 ? 1 I DG 13 1_555 J DC 133 1_555 I DT 14 1_555 J DA 132 1_555 0.171 -0.182 3.305 1.707 1.677 35.566 -0.544 -0.028 3.298 2.742 -2.790 35.644 13 II_DG-60DT-59:DA59DC60_JJ I -60 ? J 60 ? I -59 ? J 59 ? 1 I DT 14 1_555 J DA 132 1_555 I DG 15 1_555 J DC 131 1_555 0.371 0.020 3.145 1.665 4.540 34.732 -0.624 -0.376 3.136 7.560 -2.773 35.057 14 II_DT-59DG-58:DC58DA59_JJ I -59 ? J 59 ? I -58 ? J 58 ? 1 I DG 15 1_555 J DC 131 1_555 I DC 16 1_555 J DG 130 1_555 -0.664 0.352 3.326 1.381 0.941 34.816 0.442 1.321 3.306 1.572 -2.307 34.855 15 II_DG-58DC-57:DG57DC58_JJ I -58 ? J 58 ? I -57 ? J 57 ? 1 I DC 16 1_555 J DG 130 1_555 I DC 17 1_555 J DG 129 1_555 0.422 1.889 3.445 -0.982 -2.967 41.727 2.966 -0.697 3.298 -4.158 1.376 41.838 16 II_DC-57DC-56:DG56DG57_JJ I -57 ? J 57 ? I -56 ? 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