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'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A0A753A8N9_SALER A0A753A8N9 ? 1 ;MKKITLLLAGSALLLSGCAGVKSSFDCDATTSDTCMTMTKANQLARDKAAKQAGKPAAGGLPSLVNLPATSAVEVPSASR SAVTPPSGTRTVSTTPPVSAGTSAGVNTNTTTSTLTPRPVAGTPVTTTPSSVAYRPVVSVVTPTPSCQNVRCDNPGTVHP QRSRDQIATVWIAPWVDSDNAFHQPGRVSFVVSPADWVLPARVN ; 1 2 PDB 7OKO 7OKO ? 2 ? 1 3 UNP A0A734HNY4_SALER A0A734HNY4 ? 3 ;AQSPATISLPQGGQFRLSISNTDPNMIFIPGDKVTAITAPGGMLADKRLTTAGGVLFTSVATRTFTIFVETALGQTFSVV ATPVKGEGRVYRLMSAEPPSRPETRKWETAQAYEKLLISLNRAVLTGDIPDGYGEVKPLSDGIRLPGGFSVTPLKAWAGD QLRADRYELRNANTWGVALREQDFWKPGVRAVMFDNNAQTLMGGGRMTVTVIRGNG ; 24 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7OKO AA 1 ? 204 ? 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A0A753A8N9 1 ? 204 ? 1 204 22 1 7OKO I 1 ? 204 ? A0A753A8N9 1 ? 204 ? 1 204 23 2 7OKO J 1 ? 10 ? 7OKO 177 ? 186 ? 177 186 24 3 7OKO K 1 ? 216 ? A0A734HNY4 24 ? 239 ? 24 239 25 3 7OKO L 1 ? 216 ? A0A734HNY4 24 ? 239 ? 24 239 26 1 7OKO M 1 ? 204 ? A0A753A8N9 1 ? 204 ? 1 204 27 1 7OKO N 1 ? 204 ? A0A753A8N9 1 ? 204 ? 1 204 28 2 7OKO O 1 ? 10 ? 7OKO 177 ? 186 ? 177 186 29 3 7OKO P 1 ? 216 ? A0A734HNY4 24 ? 239 ? 24 239 30 3 7OKO Q 1 ? 216 ? A0A734HNY4 24 ? 239 ? 24 239 31 1 7OKO R 1 ? 204 ? A0A753A8N9 1 ? 204 ? 1 204 32 1 7OKO S 1 ? 204 ? A0A753A8N9 1 ? 204 ? 1 204 33 2 7OKO T 1 ? 10 ? 7OKO 177 ? 186 ? 177 186 34 3 7OKO U 1 ? 216 ? A0A734HNY4 24 ? 239 ? 24 239 35 3 7OKO V 1 ? 216 ? A0A734HNY4 24 ? 239 ? 24 239 36 1 7OKO W 1 ? 204 ? A0A753A8N9 1 ? 204 ? 1 204 37 1 7OKO X 1 ? 204 ? A0A753A8N9 1 ? 204 ? 1 204 38 2 7OKO Y 1 ? 10 ? 7OKO 177 ? 186 ? 177 186 39 3 7OKO Z 1 ? 216 ? A0A734HNY4 24 ? 239 ? 24 239 40 3 7OKO a 1 ? 216 ? A0A734HNY4 24 ? 239 ? 24 239 41 1 7OKO b 1 ? 204 ? A0A753A8N9 1 ? 204 ? 1 204 42 1 7OKO c 1 ? 204 ? A0A753A8N9 1 ? 204 ? 1 204 43 2 7OKO d 1 ? 10 ? 7OKO 177 ? 186 ? 177 186 44 3 7OKO e 1 ? 216 ? A0A734HNY4 24 ? 239 ? 24 239 45 3 7OKO f 1 ? 216 ? A0A734HNY4 24 ? 239 ? 24 239 46 1 7OKO g 1 ? 204 ? A0A753A8N9 1 ? 204 ? 1 204 47 1 7OKO h 1 ? 204 ? A0A753A8N9 1 ? 204 ? 1 204 48 2 7OKO i 1 ? 10 ? 7OKO 177 ? 186 ? 177 186 49 3 7OKO j 1 ? 216 ? A0A734HNY4 24 ? 239 ? 24 239 50 3 7OKO k 1 ? 216 ? A0A734HNY4 24 ? 239 ? 24 239 51 1 7OKO l 1 ? 204 ? A0A753A8N9 1 ? 204 ? 1 204 52 1 7OKO m 1 ? 204 ? A0A753A8N9 1 ? 204 ? 1 204 53 2 7OKO n 1 ? 10 ? 7OKO 177 ? 186 ? 177 186 54 3 7OKO o 1 ? 216 ? A0A734HNY4 24 ? 239 ? 24 239 55 3 7OKO p 1 ? 216 ? A0A734HNY4 24 ? 239 ? 24 239 56 1 7OKO q 1 ? 204 ? A0A753A8N9 1 ? 204 ? 1 204 57 1 7OKO r 1 ? 204 ? A0A753A8N9 1 ? 204 ? 1 204 58 2 7OKO s 1 ? 10 ? 7OKO 177 ? 186 ? 177 186 59 3 7OKO t 1 ? 216 ? A0A734HNY4 24 ? 239 ? 24 239 60 3 7OKO u 1 ? 216 ? A0A734HNY4 24 ? 239 ? 24 239 61 1 7OKO v 1 ? 204 ? A0A753A8N9 1 ? 204 ? 1 204 62 1 7OKO w 1 ? 204 ? A0A753A8N9 1 ? 204 ? 1 204 63 2 7OKO x 1 ? 10 ? 7OKO 177 ? 186 ? 177 186 64 3 7OKO y 1 ? 216 ? A0A734HNY4 24 ? 239 ? 24 239 65 3 7OKO z 1 ? 216 ? A0A734HNY4 24 ? 239 ? 24 239 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7OKO _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7OKO _struct.title 'Structure of the outer-membrane core complex (outer ring) from a conjugative type IV secretion system' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7OKO _struct_keywords.text 'Type IV secretion system, F plasmid, outer-membrane core complex, conjugation, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 3 ? I N N 1 ? J N N 1 ? K N N 2 ? L N N 3 ? M N N 3 ? N N N 3 ? O N N 3 ? P N N 1 ? Q N N 1 ? R N N 2 ? S N N 3 ? T N N 3 ? U N N 1 ? V N N 1 ? W N N 2 ? X N N 3 ? Y N N 3 ? Z N N 1 ? AA N N 1 ? BA N N 2 ? CA N N 3 ? DA N N 3 ? EA N N 1 ? FA N N 1 ? GA N N 2 ? HA N N 3 ? IA N N 3 ? JA N N 1 ? KA N N 1 ? LA N N 2 ? MA N N 3 ? NA N N 3 ? OA N N 1 ? PA N N 1 ? QA N N 2 ? RA N N 3 ? SA N N 3 ? TA N N 1 ? UA N N 1 ? VA N N 2 ? WA N N 3 ? XA N N 3 ? YA N N 1 ? ZA N N 1 ? AB N N 2 ? BB N N 3 ? CB N N 3 ? DB N N 1 ? EB N N 1 ? FB N N 2 ? GB N N 3 ? HB N N 3 ? IB N N 1 ? JB N N 1 ? KB N N 2 ? LB N N 3 ? MB N N 3 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 PRO G 102 ? ALA G 110 ? PRO 3 125 ALA 3 133 1 ? 9 HELX_P HELX_P2 2 TYR G 113 ? THR G 126 ? TYR 3 136 THR 3 149 1 ? 14 HELX_P HELX_P3 1 GLU H 114 ? VAL H 124 ? GLU 4 137 VAL 4 147 1 ? 11 HELX_P HELX_P4 2 THR H 126 ? THR H 126 ? THR 4 149 THR 4 149 1 ? 1 HELX_P HELX_P5 1 GLU M 114 ? VAL M 124 ? GLU 9 137 VAL 9 147 1 ? 11 HELX_P HELX_P6 2 THR M 126 ? THR M 126 ? THR 9 149 THR 9 149 1 ? 1 HELX_P HELX_P7 1 PRO L 102 ? ALA L 110 ? PRO 8 125 ALA 8 133 1 ? 9 HELX_P HELX_P8 2 TYR L 113 ? THR L 126 ? TYR 8 136 THR 8 149 1 ? 14 HELX_P HELX_P9 1 PRO N 102 ? ALA N 110 ? PRO A 125 ALA A 133 1 ? 9 HELX_P HELX_P10 2 TYR N 113 ? THR N 126 ? TYR A 136 THR A 149 1 ? 14 HELX_P HELX_P11 1 GLU O 114 ? VAL O 124 ? GLU B 137 VAL B 147 1 ? 11 HELX_P HELX_P12 2 THR O 126 ? THR O 126 ? THR B 149 THR B 149 1 ? 1 HELX_P HELX_P13 1 GLU T 114 ? VAL T 124 ? GLU G 137 VAL G 147 1 ? 11 HELX_P HELX_P14 2 THR T 126 ? THR T 126 ? THR G 149 THR G 149 1 ? 1 HELX_P HELX_P15 1 PRO S 102 ? ALA S 110 ? PRO F 125 ALA F 133 1 ? 9 HELX_P HELX_P16 2 TYR S 113 ? THR S 126 ? TYR F 136 THR F 149 1 ? 14 HELX_P HELX_P17 1 PRO X 102 ? ALA X 110 ? PRO K 125 ALA K 133 1 ? 9 HELX_P HELX_P18 2 TYR X 113 ? THR X 126 ? TYR K 136 THR K 149 1 ? 14 HELX_P HELX_P19 1 GLU Y 114 ? VAL Y 124 ? GLU L 137 VAL L 147 1 ? 11 HELX_P HELX_P20 2 THR Y 126 ? THR Y 126 ? THR L 149 THR L 149 1 ? 1 HELX_P HELX_P21 1 GLU DA 114 ? VAL DA 124 ? GLU Q 137 VAL Q 147 1 ? 11 HELX_P HELX_P22 2 THR DA 126 ? THR DA 126 ? THR Q 149 THR Q 149 1 ? 1 HELX_P HELX_P23 1 PRO CA 102 ? ALA CA 110 ? PRO P 125 ALA P 133 1 ? 9 HELX_P HELX_P24 2 TYR CA 113 ? THR CA 126 ? TYR P 136 THR P 149 1 ? 14 HELX_P HELX_P25 1 PRO HA 102 ? ALA HA 110 ? PRO U 125 ALA U 133 1 ? 9 HELX_P HELX_P26 2 TYR HA 113 ? THR HA 126 ? TYR U 136 THR U 149 1 ? 14 HELX_P HELX_P27 1 GLU IA 114 ? VAL IA 124 ? GLU V 137 VAL V 147 1 ? 11 HELX_P HELX_P28 2 THR IA 126 ? THR IA 126 ? THR V 149 THR V 149 1 ? 1 HELX_P HELX_P29 1 PRO MA 102 ? ALA MA 110 ? PRO Z 125 ALA Z 133 1 ? 9 HELX_P HELX_P30 2 TYR MA 113 ? THR MA 126 ? TYR Z 136 THR Z 149 1 ? 14 HELX_P HELX_P31 1 GLU NA 114 ? VAL NA 124 ? GLU a 137 VAL a 147 1 ? 11 HELX_P HELX_P32 2 THR NA 126 ? THR NA 126 ? THR a 149 THR a 149 1 ? 1 HELX_P HELX_P33 1 PRO RA 102 ? ALA RA 110 ? PRO e 125 ALA e 133 1 ? 9 HELX_P HELX_P34 2 TYR RA 113 ? THR RA 126 ? TYR e 136 THR e 149 1 ? 14 HELX_P HELX_P35 1 GLU SA 114 ? VAL SA 124 ? GLU f 137 VAL f 147 1 ? 11 HELX_P HELX_P36 2 THR SA 126 ? THR SA 126 ? THR f 149 THR f 149 1 ? 1 HELX_P HELX_P37 1 GLU XA 114 ? VAL XA 124 ? GLU k 137 VAL k 147 1 ? 11 HELX_P HELX_P38 2 THR XA 126 ? THR XA 126 ? THR k 149 THR k 149 1 ? 1 HELX_P HELX_P39 1 PRO WA 102 ? ALA WA 110 ? PRO j 125 ALA j 133 1 ? 9 HELX_P HELX_P40 2 TYR WA 113 ? THR WA 126 ? TYR j 136 THR j 149 1 ? 14 HELX_P HELX_P41 1 PRO BB 102 ? ALA BB 110 ? PRO o 125 ALA o 133 1 ? 9 HELX_P HELX_P42 2 TYR BB 113 ? THR BB 126 ? TYR o 136 THR o 149 1 ? 14 HELX_P HELX_P43 1 GLU CB 114 ? VAL CB 124 ? GLU p 137 VAL p 147 1 ? 11 HELX_P HELX_P44 2 THR CB 126 ? THR CB 126 ? THR p 149 THR p 149 1 ? 1 HELX_P HELX_P45 1 GLU HB 114 ? VAL HB 124 ? GLU u 137 VAL u 147 1 ? 11 HELX_P HELX_P46 2 THR HB 126 ? THR HB 126 ? THR u 149 THR u 149 1 ? 1 HELX_P HELX_P47 1 PRO GB 102 ? ALA GB 110 ? PRO t 125 ALA t 133 1 ? 9 HELX_P HELX_P48 2 TYR GB 113 ? THR GB 126 ? 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