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GLY F 479 ASN F 487 1 ? 9 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? 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ZN ? ? D CYS 898 D ZN 1503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? ? hydrog1 hydrog ? ? A DC 9 N3 ? ? ? 1_555 B DG 31 N1 ? ? N DC 9 T DG 31 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? A DC 9 N4 ? ? ? 1_555 B DG 31 O6 ? ? N DC 9 T DG 31 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? A DC 9 O2 ? ? ? 1_555 B DG 31 N2 ? ? N DC 9 T DG 31 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? A DG 10 N1 ? ? ? 1_555 B DC 30 N3 ? ? N DG 10 T DC 30 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? A DG 10 N2 ? ? ? 1_555 B DC 30 O2 ? ? N DG 10 T DC 30 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? A DG 10 O6 ? ? ? 1_555 B DC 30 N4 ? ? N DG 10 T DC 30 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? A DT 11 N3 ? ? ? 1_555 B DA 29 N1 ? ? N DT 11 T DA 29 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? A DT 11 O4 ? ? ? 1_555 B DA 29 N6 ? ? N DT 11 T DA 29 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? A DC 12 N3 ? ? ? 1_555 B DG 28 N1 ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 "O3'" ? C G 14 ? R G 14 ? 1_555 MG ? K MG . ? D MG 1501 ? 1_555 OD1 ? G ASP 460 ? D ASP 460 ? 1_555 114.1 ? 2 "O3'" ? C G 14 ? R G 14 ? 1_555 MG ? K MG . ? D MG 1501 ? 1_555 OD2 ? G ASP 460 ? D ASP 460 ? 1_555 164.8 ? 3 OD1 ? G ASP 460 ? D ASP 460 ? 1_555 MG ? K MG . ? D MG 1501 ? 1_555 OD2 ? G ASP 460 ? D ASP 460 ? 1_555 53.1 ? 4 "O3'" ? C G 14 ? R G 14 ? 1_555 MG ? K MG . ? D MG 1501 ? 1_555 OD2 ? G ASP 462 ? D ASP 462 ? 1_555 96.2 ? 5 OD1 ? G ASP 460 ? D ASP 460 ? 1_555 MG ? K MG . ? D MG 1501 ? 1_555 OD2 ? G ASP 462 ? D ASP 462 ? 1_555 139.0 ? 6 OD2 ? G ASP 460 ? D ASP 460 ? 1_555 MG ? K MG . ? D MG 1501 ? 1_555 OD2 ? G ASP 462 ? D ASP 462 ? 1_555 98.9 ? 7 N ? G CYS 72 ? D CYS 72 ? 1_555 ZN ? L ZN . ? D ZN 1502 ? 1_555 SG ? G CYS 88 ? D CYS 88 ? 1_555 101.6 ? 8 SG ? G CYS 814 ? D CYS 814 ? 1_555 ZN ? M ZN . ? D ZN 1503 ? 1_555 SG ? G CYS 888 ? D CYS 888 ? 1_555 114.0 ? 9 SG ? G CYS 814 ? D CYS 814 ? 1_555 ZN ? M ZN . ? D ZN 1503 ? 1_555 SG ? G CYS 895 ? D CYS 895 ? 1_555 110.4 ? 10 SG ? G CYS 888 ? D CYS 888 ? 1_555 ZN ? M ZN . ? D ZN 1503 ? 1_555 SG ? G CYS 895 ? D CYS 895 ? 1_555 105.3 ? 11 SG ? G CYS 814 ? D CYS 814 ? 1_555 ZN ? M ZN . ? D ZN 1503 ? 1_555 SG ? G CYS 898 ? D CYS 898 ? 1_555 108.6 ? 12 SG ? G CYS 888 ? D CYS 888 ? 1_555 ZN ? M ZN . ? D ZN 1503 ? 1_555 SG ? G CYS 898 ? D CYS 898 ? 1_555 114.4 ? 13 SG ? G CYS 895 ? D CYS 895 ? 1_555 ZN ? M ZN . ? D ZN 1503 ? 1_555 SG ? G CYS 898 ? 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PRO 290 F 1 2.02 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 4 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 4 ? AB2 ? 3 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 5 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 6 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 2 ? AC3 ? 2 ? AC4 ? 2 ? AC5 ? 8 ? AC6 ? 4 ? AC7 ? 2 ? AC8 ? 2 ? AC9 ? 2 ? AD1 ? 6 ? AD2 ? 3 ? AD3 ? 2 ? AD4 ? 2 ? AD5 ? 2 ? AD6 ? 3 ? AD7 ? 2 ? AD8 ? 3 ? AD9 ? 2 ? AE1 ? 2 ? AE2 ? 2 ? AE3 ? 5 ? AE4 ? 4 ? AE5 ? 2 ? AE6 ? 3 ? AE7 ? 3 ? AE8 ? 4 ? AE9 ? 3 ? AF1 ? 4 ? AF2 ? 2 ? AF3 ? 2 ? AF4 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB4 4 5 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? parallel AB8 4 5 ? anti-parallel AB8 5 6 ? anti-parallel AB9 1 2 ? parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC5 4 5 ? parallel AC5 5 6 ? anti-parallel AC5 6 7 ? parallel AC5 7 8 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD1 4 5 ? anti-parallel AD1 5 6 ? parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD8 1 2 ? parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE3 3 4 ? anti-parallel AE3 4 5 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE4 2 3 ? anti-parallel AE4 3 4 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE6 2 3 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE7 2 3 ? anti-parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE8 2 3 ? anti-parallel AE8 3 4 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AE9 2 3 ? anti-parallel AF1 1 2 ? anti-parallel AF1 2 3 ? anti-parallel AF1 3 4 ? anti-parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF4 2 3 ? parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 LEU D 13 ? 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VAL B 90 ARG B 91 AA7 2 GLU E 122 ? ILE E 123 ? GLU B 122 ILE B 123 AA8 1 GLY E 108 ? THR E 111 ? GLY B 108 THR B 111 AA8 2 VAL E 129 ? LEU E 133 ? VAL B 129 LEU B 133 AA9 1 TYR E 152 ? VAL E 153 ? TYR B 152 VAL B 153 AA9 2 ALA E 175 ? CYS E 176 ? ALA B 175 CYS B 176 AB1 1 ILE F 59 ? GLN F 60 ? ILE C 59 GLN C 60 AB1 2 SER F 66 ? LEU F 75 ? SER C 66 LEU C 75 AB1 3 SER F 93 ? TYR F 105 ? SER C 93 TYR C 105 AB1 4 VAL F 114 ? PRO F 128 ? VAL C 114 PRO C 128 AB2 1 PHE F 136 ? VAL F 137 ? PHE C 136 VAL C 137 AB2 2 GLU F 142 ? ILE F 145 ? GLU C 142 ILE C 145 AB2 3 SER F 512 ? PHE F 514 ? SER C 512 PHE C 514 AB3 1 ARG F 451 ? ARG F 454 ? ARG C 451 ARG C 454 AB3 2 SER F 147 ? ARG F 151 ? SER C 147 ARG C 151 AB3 3 ILE F 530 ? SER F 531 ? ILE C 530 SER C 531 AB4 1 GLY F 154 ? ASP F 158 ? GLY C 154 ASP C 158 AB4 2 ASN F 173 ? ILE F 177 ? ASN C 173 ILE C 177 AB4 3 LEU F 184 ? PHE F 188 ? LEU C 184 PHE C 188 AB4 4 LEU F 194 ? ARG F 197 ? LEU C 194 ARG C 197 AB4 5 LEU F 204 ? PRO F 205 ? LEU C 204 PRO C 205 AB5 1 LEU F 284 ? ILE F 285 ? LEU C 284 ILE C 285 AB5 2 GLN F 238 ? GLU F 240 ? GLN C 238 GLU C 240 AB5 3 LYS F 227 ? GLU F 231 ? LYS C 227 GLU C 231 AB5 4 ARG F 332 ? LEU F 336 ? ARG C 332 LEU C 336 AB6 1 ILE F 255 ? ALA F 257 ? ILE C 255 ALA C 257 AB6 2 LYS F 260 ? VAL F 263 ? LYS C 260 VAL C 263 AB7 1 TYR F 301 ? ASP F 303 ? TYR C 301 ASP C 303 AB7 2 GLU F 308 ? CYS F 311 ? GLU C 308 CYS C 311 AB8 1 VAL F 599 ? LEU F 606 ? VAL C 599 LEU C 606 AB8 2 THR F 589 ? VAL F 594 ? THR C 589 VAL C 594 AB8 3 TYR F 652 ? MET F 653 ? TYR C 652 MET C 653 AB8 4 ILE F 616 ? ALA F 617 ? ILE C 616 ALA C 617 AB8 5 LEU F 633 ? ARG F 637 ? LEU C 633 ARG C 637 AB8 6 SER F 643 ? SER F 646 ? SER C 643 SER C 646 AB9 1 VAL F 700 ? GLY F 701 ? VAL C 700 GLY C 701 AB9 2 ILE F 1182 ? ALA F 1183 ? ILE C 1182 ALA C 1183 AC1 1 ASP F 749 ? ASN F 752 ? ASP C 749 ASN C 752 AC1 2 ARG F 731 ? VAL F 736 ? ARG C 731 VAL C 736 AC1 3 GLY F 722 ? VAL F 727 ? GLY C 722 VAL C 727 AC1 4 PRO F 776 ? 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_em_admin.current_status REL _em_admin.deposition_date 2021-10-09 _em_admin.deposition_site PDBE _em_admin.last_update 2024-07-17 _em_admin.map_release_date 2022-03-23 _em_admin.title ;CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound to NusA and NusG (NusA and NusG elongation complex in more-swiveled conformation) ; # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details ? # _em_entity_assembly_naturalsource.id 2 _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.cell ? _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location ? _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id 562 _em_entity_assembly_naturalsource.organ ? _em_entity_assembly_naturalsource.organelle ? _em_entity_assembly_naturalsource.organism 'Escherichia coli' _em_entity_assembly_naturalsource.strain ? _em_entity_assembly_naturalsource.tissue ? # 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_em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'SYMMETRY DETERMINATION' ? ? ? 1 1 1 2 'IMAGE ACQUISITION' ? ? ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? ? ? 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? ? ? ? ? ? 8 'MODEL REFINEMENT' ? ? ? ? ? ? 9 OTHER ? ? ? ? ? ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? ? ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? ? ? 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 7PY7 'double helix' 7PY7 'a-form double helix' 7PY7 'b-form double helix' 7PY7 'mismatched base pair' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A DC 9 1_555 B DG 31 1_555 0.197 -0.147 -0.104 0.158 -0.126 -0.037 1 N_DC9:DG31_T N 9 ? 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