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_citation.title 'Structural basis of human telomerase recruitment by TPP1-POT1.' _citation.year 2022 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1126/science.abn6840 _citation.pdbx_database_id_PubMed 35201900 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Sekne, Z.' 1 ? primary 'Ghanim, G.E.' 2 ? primary 'van Roon, A.M.' 3 ? primary 'Nguyen, T.H.D.' 4 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 7QXB _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? 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O14746 1 ? 1132 ? 1 1132 2 2 7QXB B 1 ? 451 ? NR_001566 1 ? 451 ? 1 451 3 3 7QXB L 1 ? 130 ? B2R5B3 1 ? 130 ? 1 130 4 4 7QXB M 1 ? 166 ? B4DR52 1 ? 166 ? 1 166 5 5 7QXB N 1 ? 30 ? 7QXB 7 ? 36 ? 7 36 6 6 7QXB O 1 ? 458 ? A0A590TQL1 87 ? 544 ? 87 544 7 7 7QXB P 1 ? 634 ? Q9NUX5 1 ? 634 ? 1 634 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight A 'RNA linking' y "ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 C 'RNA linking' y "CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O8 P' 323.197 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 G 'RNA linking' y "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7QXB _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.aniso_B[1][1] -4.41 _refine.aniso_B[1][2] 16.83 _refine.aniso_B[1][3] 11.02 _refine.aniso_B[2][2] 8.23 _refine.aniso_B[2][3] 16.28 _refine.aniso_B[3][3] -3.82 _refine.B_iso_max ? _refine.B_iso_mean 220.612 _refine.B_iso_min ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc 0.970 _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.details 'HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS' _refine.diff_density_max ? _refine.diff_density_max_esd ? _refine.diff_density_min ? _refine.diff_density_min_esd ? _refine.diff_density_rms ? _refine.diff_density_rms_esd ? _refine.entry_id 7QXB _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.ls_abs_structure_details ? _refine.ls_abs_structure_Flack ? 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G GLY 615 1211 1 Y 1 P THR 616 ? G THR 616 1212 1 Y 1 P ASP 617 ? G ASP 617 1213 1 Y 1 P ASN 618 ? G ASN 618 1214 1 Y 1 P GLN 619 ? G GLN 619 1215 1 Y 1 P ILE 620 ? G ILE 620 1216 1 Y 1 P CYS 621 ? G CYS 621 1217 1 Y 1 P TYR 622 ? G TYR 622 1218 1 Y 1 P GLN 623 ? G GLN 623 1219 1 Y 1 P ILE 624 ? G ILE 624 1220 1 Y 1 P PHE 625 ? G PHE 625 1221 1 Y 1 P ASP 626 ? G ASP 626 1222 1 Y 1 P THR 627 ? G THR 627 1223 1 Y 1 P THR 628 ? G THR 628 1224 1 Y 1 P VAL 629 ? G VAL 629 1225 1 Y 1 P ALA 630 ? G ALA 630 1226 1 Y 1 P GLU 631 ? G GLU 631 1227 1 Y 1 P ASP 632 ? G ASP 632 1228 1 Y 1 P VAL 633 ? G VAL 633 1229 1 Y 1 P ILE 634 ? G ILE 634 # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.name 1 1 20 mM C8H18N2O4S HEPES 1 2 150 mM NaCl 'sodium chloride' 1 3 10 % C3H8O3 glycerol 1 4 2 mM MgCl2 'magnesium chloride' 1 5 0.05 % ? 'IGEPAL CA630' 1 6 1 % C12H22O11 trehalose 1 7 1 mM C4H10O2S2 DTT # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details ? # _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_molwt.id 1 _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag NO _em_entity_assembly_molwt.units ? _em_entity_assembly_molwt.value ? # loop_ _em_entity_assembly_naturalsource.cell _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id _em_entity_assembly_naturalsource.id _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_naturalsource.organ _em_entity_assembly_naturalsource.organelle _em_entity_assembly_naturalsource.organism _em_entity_assembly_naturalsource.strain _em_entity_assembly_naturalsource.tissue ? ? 2 1 9606 ? ? 'Homo sapiens' ? ? ? ? 3 2 9606 ? ? 'Homo sapiens' ? ? ? ? 4 3 9606 ? ? 'Homo sapiens' ? ? ? ? 5 4 9606 ? ? 'Homo sapiens' ? ? # loop_ _em_entity_assembly_recombinant.cell _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id _em_entity_assembly_recombinant.id _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_recombinant.organism _em_entity_assembly_recombinant.plasmid _em_entity_assembly_recombinant.strain ? 2 1 32630 'synthetic construct' ? ? ? 3 2 9606 'Homo sapiens' ? ? ? 5 3 7106 Spodoptera ? ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 48 _em_image_recording.average_exposure_time 3 _em_image_recording.details 'Images were collected in movie-mode and fractionated into 48 movie frames' _em_image_recording.detector_mode ? _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K3 (6k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged 3 _em_image_recording.num_real_images 50775 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_subtomogram ? # _em_imaging_optics.id 1 _em_imaging_optics.imaging_id 1 _em_imaging_optics.chr_aberration_corrector ? _em_imaging_optics.energyfilter_lower ? _em_imaging_optics.energyfilter_name 'GIF Quantum LS' _em_imaging_optics.energyfilter_upper ? _em_imaging_optics.energyfilter_slit_width 20 _em_imaging_optics.phase_plate ? _em_imaging_optics.sph_aberration_corrector ? _em_imaging_optics.details ? # _em_particle_selection.id 1 _em_particle_selection.image_processing_id 1 _em_particle_selection.details ? _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 21589656 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' ? RELION 4.0 1 ? ? 2 'IMAGE ACQUISITION' ? EPU 2.13.0.3175REL ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? CTFFIND 4 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? 'UCSF ChimeraX' ? ? 1 ? 8 'MODEL FITTING' ? 'UCSF Chimera' ? ? 1 ? 9 'MODEL FITTING' ? Coot ? ? 1 ? 10 OTHER ? ? ? ? ? ? 11 'MODEL REFINEMENT' ? REFMAC 5.8 ? 1 ? 12 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 4 1 ? ? 13 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 4 1 ? ? 14 CLASSIFICATION ? RELION 4 1 ? ? 15 RECONSTRUCTION ? RELION 4.0 1 ? ? 16 'VOLUME SELECTION' ? ? ? 1 1 1 17 'SERIES ALIGNMENT' ? ? ? 1 1 1 18 'MOLECULAR REPLACEMENT' ? ? ? 1 1 1 19 'LATTICE DISTORTION CORRECTION' ? ? ? 1 1 1 20 'SYMMETRY DETERMINATION' ? ? ? 1 1 1 21 'CRYSTALLOGRAPHY MERGING' ? ? ? 1 1 1 # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 7QXB 'double helix' 7QXB 'a-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 B U 29 1_555 B G 197 1_555 -1.511 1.556 2.405 18.543 -32.553 49.486 1 B_U29:G197_B B 29 ? B 197 ? ? ? 1 B G 30 1_555 B G 193 1_555 -5.550 -0.478 0.529 7.566 29.576 -99.249 2 B_G30:G193_B B 30 ? B 193 ? 7 4 1 B U 32 1_555 B C 192 1_555 -1.452 -0.738 0.170 -14.830 7.735 33.587 3 B_U32:C192_B B 32 ? B 192 ? ? ? 1 B G 33 1_555 B C 191 1_555 -0.266 -0.221 -0.443 -6.512 -11.982 1.250 4 B_G33:C191_B B 33 ? B 191 ? 19 1 1 B G 34 1_555 B C 190 1_555 -0.275 -0.171 -0.178 -3.493 -11.229 -0.623 5 B_G34:C190_B B 34 ? B 190 ? 19 1 1 B C 35 1_555 B G 189 1_555 0.272 -0.137 -0.007 -3.034 -20.965 0.977 6 B_C35:G189_B B 35 ? B 189 ? 19 1 1 B C 36 1_555 B G 188 1_555 -0.287 0.679 -0.380 -5.867 -8.532 2.665 7 B_C36:G188_B B 36 ? B 188 ? 19 1 1 B A 37 1_555 B U 187 1_555 -0.171 0.262 0.722 23.447 4.329 -16.369 8 B_A37:U187_B B 37 ? B 187 ? 20 1 1 B C 50 1_555 E DG 24 1_555 0.272 -0.218 0.131 12.719 -23.301 -2.133 9 B_C50:DG30_N B 50 ? N 30 ? 19 1 1 B C 51 1_555 E DG 23 1_555 -0.130 -0.059 0.352 3.652 -13.684 -1.640 10 B_C51:DG29_N B 51 ? N 29 ? 19 1 1 B C 52 1_555 E DG 22 1_555 0.550 0.004 0.519 -0.678 -13.523 2.226 11 B_C52:DG28_N B 52 ? N 28 ? 19 1 1 B U 53 1_555 E DA 21 1_555 0.042 0.105 -0.019 12.255 -4.072 -3.758 12 B_U53:DA27_N B 53 ? N 27 ? 20 1 1 B G 58 1_555 E DG 17 1_555 -2.243 -0.637 1.258 24.143 10.952 110.468 13 B_G58:DG23_N B 58 ? N 23 ? ? 2 1 B G 64 1_555 B C 145 1_555 -0.119 -0.118 -0.013 6.837 -13.233 2.494 14 B_G64:C145_B B 64 ? B 145 ? 19 1 1 B G 65 1_555 B C 144 1_555 -0.007 -0.091 -0.289 -14.914 -16.893 -0.570 15 B_G65:C144_B B 65 ? B 144 ? 19 1 1 B C 66 1_555 B G 143 1_555 -0.350 -0.134 -0.012 -8.081 -14.437 -1.823 16 B_C66:G143_B B 66 ? B 143 ? 19 1 1 B G 67 1_555 B C 141 1_555 -0.086 -0.122 -0.244 -3.516 8.211 1.263 17 B_G67:C141_B B 67 ? B 141 ? 19 1 1 B U 68 1_555 B G 140 1_555 2.217 -0.500 -0.335 -4.767 -22.475 4.443 18 B_U68:G140_B B 68 ? B 140 ? 28 1 1 B A 69 1_555 B U 139 1_555 0.459 0.109 -0.208 -14.171 -2.089 11.638 19 B_A69:U139_B B 69 ? 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