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VCP ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 'Biological sequence' 1 370 Rat ? Nsfl1c ? ? ? ? ? ? 'Rattus norvegicus' 10116 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP TERA_HUMAN P55072 ? 1 ;MASGADSKGDDLSTAILKQKNRPNRLIVDEAINEDNSVVSLSQPKMDELQLFRGDTVLLKGKKRREAVCIVLSDDTCSDE KIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGNLFEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRA VEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRG ILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEV ERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVA NETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIG GLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVR EIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLD QLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAM EVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGGTGGSVYTEDN DDDLYG ; 1 2 UNP NSF1C_RAT O35987 ? 2 ;MAEERQDALREFVAVTGAEEDRARFFLESAGWDLQIALASFYEDGGDEDIVTISQATPSSVSRGTAPSDNRVTSFRDLIH DQDEEEEEEEGQRFYAGGSERSGQQIVGPPRKKSPNELVDDLFKGAKEHGAVAVERVTKSPGETSKPRPFAGGGYRLGAA PEEESAYVAGERRRHSGQDVHVVLKLWKTGFSLDNGDLRSYQDPSNAQFLESIRRGEVPAELRRLAHGGQVNLDMEDHRD EDFVKPKGAFKAFTGEGQKLGSTAPQVLNTSSPAQQAENEAKASSSILINEAEPTTNIQIRLADGGRLVQKFNHSHRISD IRLFIVDARPAMAATSFVLMTTFPNKELADENQTLKEANLLNAVIVQRLT ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7R7T A 1 ? 806 ? P55072 1 ? 806 ? 1 806 2 1 7R7T F 1 ? 806 ? P55072 1 ? 806 ? 1 805 3 1 7R7T E 1 ? 806 ? P55072 1 ? 806 ? 1 806 4 1 7R7T D 1 ? 806 ? P55072 1 ? 806 ? 1 806 5 1 7R7T C 1 ? 806 ? P55072 1 ? 806 ? 1 806 6 1 7R7T B 1 ? 806 ? P55072 1 ? 806 ? 1 806 7 2 7R7T I 1 ? 370 ? O35987 1 ? 370 ? 1 370 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 7R7T HIS A 155 ? UNP P55072 ARG 155 'engineered mutation' 155 1 2 7R7T HIS F 155 ? UNP P55072 ARG 155 'engineered mutation' 155 2 3 7R7T HIS E 155 ? UNP P55072 ARG 155 'engineered mutation' 155 3 4 7R7T HIS D 155 ? UNP P55072 ARG 155 'engineered mutation' 155 4 5 7R7T HIS C 155 ? UNP P55072 ARG 155 'engineered mutation' 155 5 6 7R7T HIS B 155 ? UNP P55072 ARG 155 'engineered mutation' 155 6 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ADP non-polymer n "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N5 O10 P2' 427.201 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7R7T _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 7R7T _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 35947 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 1.002 ? 48593 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 19.649 ? 4987 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.059 ? 5470 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.008 ? 6370 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7R7T _struct.title 'p47-bound p97-R155H mutant with ADP' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7R7T _struct_keywords.text 'AAA+ ATPase, MOTOR PROTEIN, HYDROLASE, HYDROLASE-Lipid Binding Protein complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'HYDROLASE/Lipid Binding Protein' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 2 ? H N N 3 ? I N N 3 ? J N N 3 ? K N N 3 ? L N N 3 ? M N N 3 ? N N N 3 ? O N N 3 ? P N N 3 ? Q N N 3 ? R N N 3 ? S N N 3 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 42 ? LEU A 49 ? SER A 42 LEU A 49 1 ? 8 HELX_P HELX_P2 AA2 GLY A 61 ? ARG A 65 ? GLY A 61 ARG A 65 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 AA3 ARG A 86 ? ASN A 91 ? ARG A 86 ASN A 91 1 ? 6 HELX_P HELX_P4 AA4 GLU A 192 ? LEU A 198 ? GLU A 192 LEU A 198 1 ? 7 HELX_P HELX_P5 AA5 CYS A 209 ? GLU A 221 ? CYS A 209 GLU A 221 1 ? 13 HELX_P HELX_P6 AA6 LEU A 229 ? GLY A 234 ? LEU A 229 GLY A 234 1 ? 6 HELX_P HELX_P7 AA7 LYS A 251 ? ARG A 256 ? LYS A 251 ARG A 256 1 ? 6 HELX_P HELX_P8 AA8 GLY A 271 ? LYS A 277 ? GLY A 271 LYS A 277 1 ? 7 HELX_P HELX_P9 AA9 LEU A 286 ? ASN A 296 ? LEU A 286 ASN A 296 1 ? 11 HELX_P HELX_P10 AB1 GLU A 305 ? ALA A 310 ? GLU A 305 ALA A 310 1 ? 6 HELX_P HELX_P11 AB2 GLU A 319 ? GLY A 334 ? GLU A 319 GLY A 334 1 ? 16 HELX_P HELX_P12 AB3 ASP A 354 ? ARG A 359 ? ASP A 354 ARG A 359 5 ? 6 HELX_P HELX_P13 AB4 ASP A 373 ? GLU A 379 ? ASP A 373 GLU A 379 1 ? 7 HELX_P HELX_P14 AB5 ILE A 380 ? THR A 385 ? ILE A 380 THR A 385 1 ? 6 HELX_P HELX_P15 AB6 LEU A 396 ? ASN A 401 ? LEU A 396 ASN A 401 1 ? 6 HELX_P HELX_P16 AB7 VAL A 407 ? LYS A 426 ? VAL A 407 LYS A 426 1 ? 20 HELX_P HELX_P17 AB8 THR A 448 ? GLN A 458 ? THR A 448 GLN A 458 1 ? 11 HELX_P HELX_P18 AB9 LEU A 482 ? HIS A 499 ? LEU A 482 HIS A 499 1 ? 18 HELX_P HELX_P19 AC1 GLY A 521 ? GLN A 536 ? GLY A 521 GLN A 536 1 ? 16 HELX_P HELX_P20 AC2 LYS A 543 ? GLU A 554 ? LYS A 543 GLU A 554 1 ? 12 HELX_P HELX_P21 AC3 GLU A 556 ? ALA A 569 ? GLU A 556 ALA A 569 1 ? 14 HELX_P HELX_P22 AC4 ASP A 580 ? ASN A 589 ? ASP A 580 ASN A 589 1 ? 10 HELX_P HELX_P23 AC5 ASP A 598 ? GLY A 610 ? ASP A 598 GLY A 610 1 ? 13 HELX_P HELX_P24 AC6 ARG A 625 ? ILE A 629 ? ARG A 625 ILE A 629 5 ? 5 HELX_P HELX_P25 AC7 ASP A 649 ? ARG A 662 ? ASP A 649 ARG A 662 1 ? 14 HELX_P HELX_P26 AC8 ASP A 671 ? THR A 679 ? ASP A 671 THR A 679 1 ? 9 HELX_P HELX_P27 AC9 SER A 683 ? GLU A 712 ? SER A 683 GLU A 712 1 ? 30 HELX_P HELX_P28 AD1 ARG A 732 ? MET A 740 ? ARG A 732 MET A 740 1 ? 9 HELX_P HELX_P29 AD2 SER A 748 ? GLN A 763 ? SER A 748 GLN A 763 1 ? 16 HELX_P HELX_P30 AD3 SER B 42 ? LEU B 49 ? SER F 42 LEU F 49 1 ? 8 HELX_P HELX_P31 AD4 ARG B 86 ? ASN B 91 ? ARG F 86 ASN F 91 1 ? 6 HELX_P HELX_P32 AD5 GLU B 192 ? ASN B 199 ? GLU F 192 ASN F 199 1 ? 8 HELX_P HELX_P33 AD6 CYS B 209 ? LEU B 222 ? CYS F 209 LEU F 222 1 ? 14 HELX_P HELX_P34 AD7 ALA B 228 ? GLY B 234 ? ALA F 228 GLY F 234 1 ? 7 HELX_P HELX_P35 AD8 GLY B 250 ? ALA B 259 ? GLY F 250 ALA F 259 1 ? 10 HELX_P HELX_P36 AD9 ASN B 270 ? SER B 276 ? ASN F 270 SER F 276 1 ? 7 HELX_P HELX_P37 AE1 LEU B 286 ? GLU B 294 ? LEU F 286 GLU F 294 1 ? 9 HELX_P HELX_P38 AE2 GLU B 305 ? ALA B 310 ? GLU F 305 ALA F 310 1 ? 6 HELX_P HELX_P39 AE3 GLU B 319 ? GLY B 334 ? GLU F 319 GLY F 334 1 ? 16 HELX_P HELX_P40 AE4 THR B 375 ? THR B 385 ? THR F 375 THR F 385 1 ? 11 HELX_P HELX_P41 AE5 VAL B 407 ? LYS B 426 ? VAL F 407 LYS F 426 1 ? 20 HELX_P HELX_P42 AE6 GLU B 440 ? SER B 444 ? GLU F 440 SER F 444 1 ? 5 HELX_P HELX_P43 AE7 THR B 448 ? SER B 457 ? THR F 448 SER F 457 1 ? 10 HELX_P HELX_P44 AE8 LEU B 482 ? VAL B 493 ? LEU F 482 VAL F 493 1 ? 12 HELX_P HELX_P45 AE9 VAL B 493 ? HIS B 499 ? VAL F 493 HIS F 499 1 ? 7 HELX_P HELX_P46 AF1 HIS B 499 ? GLY B 507 ? HIS F 499 GLY F 507 1 ? 9 HELX_P HELX_P47 AF2 GLY B 523 ? CYS B 535 ? GLY F 523 CYS F 535 1 ? 13 HELX_P HELX_P48 AF3 LYS B 543 ? GLY B 553 ? 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