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_citation_author.identifier_ORCID primary 'Arellano-Santoyo, H.' 1 ? primary 'Hernandez-Lopez, R.A.' 2 ? primary 'Stokasimov, E.' 3 ? primary 'Wang, R.Y.-R.' 4 ? primary 'Pellman, D.' 5 ? primary 'Lesczhiner, A.E.' 6 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'Tubulin alpha-1B chain' 50204.445 9 ? ? ? ? 2 polymer nat 'Tubulin beta chain' 49907.770 9 ? ? ? ? 3 polymer man 'kinesin-8/ Kip3' 39900.332 9 ? ? ? ? 4 non-polymer syn "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 523.180 9 ? ? ? ? 5 non-polymer syn 'MAGNESIUM ION' 24.305 27 ? ? ? ? 6 non-polymer syn 'PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER' 521.208 9 ? ? ? ? 7 non-polymer syn 'PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER' 506.196 9 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'Alpha-tubulin ubiquitous, Tubulin K-alpha-1, Tubulin 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YGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITA SLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYR GDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYA KRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY ; A,C,E,G,I,L,N,P,R ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGSYHGDSDLQLERINVYYNEAAGNKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGP FGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKESESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYP DRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCL RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGR MSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTG EGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATADEQGEFEEEGEEDEA ; ;MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGSYHGDSDLQLERINVYYNEAAGNKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGP FGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKESESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYP 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LVDLTSQHTFATLSIIDLAGSERAAATRNRGIRLHEGANINRSLLALGNCINALCLNDGSRSCHIPYRDSKLTRLLKFSL GGNCKTVMIVCISPSSSHYDETLNTLKYANRAKEI ; K,a,b,c,d,e,f,g,h ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 4 "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" GTP 5 'MAGNESIUM ION' MG 6 'PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER' G2P 7 'PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER' ANP # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ARG n 1 3 GLU n 1 4 CYS n 1 5 ILE n 1 6 SER n 1 7 ILE n 1 8 HIS n 1 9 VAL n 1 10 GLY n 1 11 GLN n 1 12 ALA n 1 13 GLY n 1 14 VAL n 1 15 GLN n 1 16 ILE n 1 17 GLY n 1 18 ASN n 1 19 ALA n 1 20 CYS n 1 21 TRP n 1 22 GLU n 1 23 LEU n 1 24 TYR n 1 25 CYS n 1 26 LEU n 1 27 GLU n 1 28 HIS n 1 29 GLY n 1 30 ILE n 1 31 GLN n 1 32 PRO n 1 33 ASP n 1 34 GLY n 1 35 GLN n 1 36 MET n 1 37 PRO n 1 38 SER n 1 39 ASP n 1 40 LYS n 1 41 THR n 1 42 ILE n 1 43 GLY n 1 44 GLY n 1 45 GLY n 1 46 ASP n 1 47 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CC N N 5 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP TBA1B_PIG Q2XVP4 ? 1 ;MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRT GTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVD YGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITA SLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYR GDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYA KRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY ; 1 2 UNP TBB_PIG P02554 ? 2 ;MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGSYHGDSDLQLERINVYYNEAAGNKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGP FGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKESESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYP DRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCL RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGR MSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTG EGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATADEQGEFEEEGEEDEA ; 1 3 PDB 7RS6 7RS6 ? 3 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7RS6 A 1 ? 451 ? 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ASP A 306 GLY A 310 5 ? 5 HELX_P HELX_P16 AB7 VAL A 324 ? LYS A 338 ? VAL A 324 LYS A 338 1 ? 15 HELX_P HELX_P17 AB8 ALA A 383 ? ALA A 400 ? ALA A 383 ALA A 400 1 ? 18 HELX_P HELX_P18 AB9 VAL A 405 ? GLY A 410 ? VAL A 405 GLY A 410 1 ? 6 HELX_P HELX_P19 AC1 GLU A 414 ? GLY A 436 ? GLU A 414 GLY A 436 1 ? 23 HELX_P HELX_P20 AC2 GLY B 10 ? HIS B 28 ? GLY B 10 HIS B 28 1 ? 19 HELX_P HELX_P21 AC3 ASP B 41 ? ARG B 46 ? ASP B 41 ARG B 48 1 ? 6 HELX_P HELX_P22 AC4 ILE B 47 ? VAL B 49 ? ILE B 49 VAL B 51 5 ? 3 HELX_P HELX_P23 AC5 GLY B 71 ? SER B 78 ? GLY B 73 SER B 80 1 ? 8 HELX_P HELX_P24 AC6 GLY B 79 ? GLN B 83 ? GLY B 81 GLN B 85 5 ? 5 HELX_P HELX_P25 AC7 ARG B 86 ? ASP B 88 ? ARG B 88 ASP B 90 5 ? 3 HELX_P HELX_P26 AC8 THR B 107 ? CYS B 127 ? THR B 109 CYS B 129 1 ? 21 HELX_P HELX_P27 AC9 GLY B 141 ? TYR B 159 ? GLY B 143 TYR B 161 1 ? 19 HELX_P HELX_P28 AD1 VAL B 180 ? THR B 196 ? VAL B 182 THR B 198 1 ? 17 HELX_P HELX_P29 AD2 ASP B 203 ? THR B 214 ? 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parallel AB2 5 6 ? parallel AB2 6 7 ? parallel AB2 7 8 ? anti-parallel AB2 8 9 ? anti-parallel AB2 9 10 ? parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB4 1 2 ? parallel AB4 2 3 ? parallel AB4 3 4 ? parallel AB4 4 5 ? parallel AB4 5 6 ? anti-parallel AB4 6 7 ? anti-parallel AB4 7 8 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB6 1 2 ? parallel AB6 2 3 ? parallel AB6 3 4 ? parallel AB6 4 5 ? parallel AB6 5 6 ? parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? parallel AB9 1 2 ? parallel AB9 2 3 ? parallel AB9 3 4 ? parallel AB9 4 5 ? parallel AB9 5 6 ? parallel AB9 6 7 ? parallel AB9 7 8 ? anti-parallel AB9 8 9 ? anti-parallel AB9 9 10 ? parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC2 1 2 ? parallel AC2 2 3 ? parallel AC2 3 4 ? parallel AC2 4 5 ? parallel AC2 5 6 ? anti-parallel AC2 6 7 ? anti-parallel AC2 7 8 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC4 1 2 ? parallel AC4 2 3 ? parallel AC4 3 4 ? parallel AC4 4 5 ? parallel AC4 5 6 ? parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? parallel AC7 1 2 ? parallel AC7 2 3 ? parallel AC7 3 4 ? parallel AC7 4 5 ? parallel AC7 5 6 ? parallel AC7 6 7 ? parallel AC7 7 8 ? anti-parallel AC7 8 9 ? anti-parallel AC7 9 10 ? parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? parallel AC9 2 3 ? parallel AC9 3 4 ? parallel AC9 4 5 ? parallel AC9 5 6 ? anti-parallel AC9 6 7 ? anti-parallel AC9 7 8 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD2 1 2 ? parallel AD2 2 3 ? parallel AD2 3 4 ? parallel AD2 4 5 ? parallel AD2 5 6 ? parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD4 3 4 ? parallel AD5 1 2 ? parallel AD5 2 3 ? parallel AD5 3 4 ? parallel AD5 4 5 ? parallel AD5 5 6 ? parallel AD5 6 7 ? parallel AD5 7 8 ? anti-parallel AD5 8 9 ? anti-parallel AD5 9 10 ? parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD7 1 2 ? parallel AD7 2 3 ? parallel AD7 3 4 ? parallel AD7 4 5 ? parallel AD7 5 6 ? anti-parallel AD7 6 7 ? anti-parallel AD7 7 8 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD9 1 2 ? parallel AD9 2 3 ? parallel AD9 3 4 ? parallel AD9 4 5 ? parallel AD9 5 6 ? parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE2 2 3 ? anti-parallel AE2 3 4 ? parallel AE3 1 2 ? parallel AE3 2 3 ? parallel AE3 3 4 ? parallel AE3 4 5 ? parallel AE3 5 6 ? parallel AE3 6 7 ? parallel AE3 7 8 ? anti-parallel AE3 8 9 ? anti-parallel AE3 9 10 ? parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE5 1 2 ? parallel AE5 2 3 ? parallel AE5 3 4 ? parallel AE5 4 5 ? parallel AE5 5 6 ? anti-parallel AE5 6 7 ? anti-parallel AE5 7 8 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE6 2 3 ? anti-parallel AE7 1 2 ? parallel AE7 2 3 ? parallel AE7 3 4 ? parallel AE7 4 5 ? parallel AE7 5 6 ? parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AE9 2 3 ? anti-parallel AE9 3 4 ? parallel AF1 1 2 ? parallel AF1 2 3 ? parallel AF1 3 4 ? parallel AF1 4 5 ? parallel AF1 5 6 ? parallel AF1 6 7 ? parallel AF1 7 8 ? anti-parallel AF1 8 9 ? 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CD G PRO 72 ? ? 114.65 128.40 -13.75 2.10 Y 62 1 C G HIS 88 ? ? N G PRO 89 ? ? CD G PRO 89 ? ? 114.68 128.40 -13.72 2.10 Y 63 1 C G ALA 174 ? ? N G PRO 175 ? ? CD G PRO 175 ? ? 114.99 128.40 -13.41 2.10 Y 64 1 C G VAL 260 ? ? N G PRO 261 ? ? CD G PRO 261 ? ? 114.93 128.40 -13.47 2.10 Y 65 1 C G PHE 267 ? ? N G PRO 268 ? ? CD G PRO 268 ? ? 113.16 128.40 -15.24 2.10 Y 66 1 C G GLU 297 ? ? N G PRO 298 ? ? CD G PRO 298 ? ? 115.23 128.40 -13.17 2.10 Y 67 1 C G PRO 359 ? ? N G PRO 360 ? ? CA G PRO 360 ? ? 128.72 119.30 9.42 1.50 Y 68 1 C H ASP 31 ? ? N H PRO 32 ? ? CD H PRO 32 ? ? 114.04 128.40 -14.36 2.10 Y 69 1 C H GLY 81 ? ? N H PRO 82 ? ? CD H PRO 82 ? ? 115.71 128.40 -12.69 2.10 Y 70 1 C H VAL 172 ? ? N H PRO 173 ? ? CD H PRO 173 ? ? 115.52 128.40 -12.88 2.10 Y 71 1 C H THR 221 ? ? N H PRO 222 ? ? CD H PRO 222 ? ? 115.26 128.40 -13.14 2.10 Y 72 1 C H PHE 262 ? ? N H PRO 263 ? ? CD H PRO 263 ? ? 114.91 128.40 -13.49 2.10 Y 73 1 C H MET 269 ? ? N H PRO 270 ? ? CD H PRO 270 ? ? 114.87 128.40 -13.53 2.10 Y 74 1 C H VAL 288 ? ? N H PRO 289 ? ? CD H PRO 289 ? ? 115.35 128.40 -13.05 2.10 Y 75 1 C H ILE 347 ? ? N H PRO 348 ? ? CD H PRO 348 ? ? 113.57 128.40 -14.83 2.10 Y 76 1 C H PRO 359 ? ? N H PRO 360 ? ? CA H PRO 360 ? ? 128.74 119.30 9.44 1.50 Y 77 1 C c ASP 45 ? ? N c PRO 46 ? ? CD c PRO 46 ? ? 115.10 128.40 -13.30 2.10 Y 78 1 C I GLN 31 ? ? N I PRO 32 ? ? CD I PRO 32 ? ? 115.48 128.40 -12.92 2.10 Y 79 1 C I MET 36 ? ? N I PRO 37 ? ? CD I PRO 37 ? ? 112.02 128.40 -16.38 2.10 Y 80 1 C I GLU 71 ? ? N I PRO 72 ? ? CD I PRO 72 ? ? 114.73 128.40 -13.67 2.10 Y 81 1 C I HIS 88 ? ? N I PRO 89 ? ? CD I PRO 89 ? ? 114.79 128.40 -13.61 2.10 Y 82 1 C I ALA 174 ? ? N I PRO 175 ? ? CD I PRO 175 ? ? 115.02 128.40 -13.38 2.10 Y 83 1 C I VAL 260 ? ? N I PRO 261 ? ? CD I PRO 261 ? ? 114.90 128.40 -13.50 2.10 Y 84 1 C I PHE 267 ? ? N I PRO 268 ? ? CD I PRO 268 ? ? 113.18 128.40 -15.22 2.10 Y 85 1 C I GLU 297 ? ? N I PRO 298 ? ? CD I PRO 298 ? ? 115.26 128.40 -13.14 2.10 Y 86 1 C I PRO 359 ? ? N I PRO 360 ? ? CA I PRO 360 ? ? 128.63 119.30 9.33 1.50 Y 87 1 C J ASP 31 ? ? N J PRO 32 ? ? CD J PRO 32 ? ? 114.04 128.40 -14.36 2.10 Y 88 1 C J GLY 81 ? ? N J PRO 82 ? ? CD J PRO 82 ? ? 115.66 128.40 -12.74 2.10 Y 89 1 C J VAL 172 ? ? N J PRO 173 ? ? CD J PRO 173 ? ? 115.55 128.40 -12.85 2.10 Y 90 1 C J THR 221 ? ? N J PRO 222 ? ? CD J PRO 222 ? ? 115.32 128.40 -13.08 2.10 Y 91 1 C J PHE 262 ? ? N J PRO 263 ? ? CD J PRO 263 ? ? 114.90 128.40 -13.50 2.10 Y 92 1 C J MET 269 ? ? N J PRO 270 ? ? CD J PRO 270 ? ? 114.78 128.40 -13.62 2.10 Y 93 1 C J VAL 288 ? ? N J PRO 289 ? ? CD J PRO 289 ? ? 115.42 128.40 -12.98 2.10 Y 94 1 C J ILE 347 ? ? N J PRO 348 ? ? CD J PRO 348 ? ? 113.60 128.40 -14.80 2.10 Y 95 1 C J PRO 359 ? ? N J PRO 360 ? ? CA J PRO 360 ? ? 128.66 119.30 9.36 1.50 Y 96 1 C d ASP 45 ? ? N d PRO 46 ? ? CD d PRO 46 ? ? 115.12 128.40 -13.28 2.10 Y 97 1 C L GLN 31 ? ? N L PRO 32 ? ? CD L PRO 32 ? ? 115.47 128.40 -12.93 2.10 Y 98 1 C L MET 36 ? ? N L PRO 37 ? ? CD L PRO 37 ? ? 112.11 128.40 -16.29 2.10 Y 99 1 C L GLU 71 ? ? N L PRO 72 ? ? CD L PRO 72 ? ? 114.63 128.40 -13.77 2.10 Y 100 1 C L HIS 88 ? ? N L PRO 89 ? ? CD L PRO 89 ? ? 114.75 128.40 -13.65 2.10 Y 101 1 C L ALA 174 ? ? N L PRO 175 ? ? CD L PRO 175 ? ? 115.02 128.40 -13.38 2.10 Y 102 1 C L VAL 260 ? ? N L PRO 261 ? ? CD L PRO 261 ? ? 114.90 128.40 -13.50 2.10 Y 103 1 C L PHE 267 ? ? N L PRO 268 ? ? CD L PRO 268 ? ? 113.23 128.40 -15.17 2.10 Y 104 1 C L GLU 297 ? ? N L PRO 298 ? ? CD L PRO 298 ? ? 115.28 128.40 -13.12 2.10 Y 105 1 C L PRO 359 ? ? N L PRO 360 ? ? CA L PRO 360 ? ? 128.62 119.30 9.32 1.50 Y 106 1 C M ASP 31 ? ? N M PRO 32 ? ? CD M PRO 32 ? ? 114.06 128.40 -14.34 2.10 Y 107 1 C M GLY 81 ? ? N M PRO 82 ? ? CD M PRO 82 ? ? 115.68 128.40 -12.72 2.10 Y 108 1 C M VAL 172 ? ? N M PRO 173 ? ? CD M PRO 173 ? ? 115.48 128.40 -12.92 2.10 Y 109 1 C M THR 221 ? ? N M PRO 222 ? ? CD M PRO 222 ? ? 115.26 128.40 -13.14 2.10 Y 110 1 C M PHE 262 ? ? N M PRO 263 ? ? CD M PRO 263 ? ? 114.94 128.40 -13.46 2.10 Y 111 1 C M MET 269 ? ? N M PRO 270 ? ? CD M PRO 270 ? ? 114.82 128.40 -13.58 2.10 Y 112 1 C M VAL 288 ? ? N M PRO 289 ? ? CD M PRO 289 ? ? 115.36 128.40 -13.04 2.10 Y 113 1 C M ILE 347 ? ? N M PRO 348 ? ? CD M PRO 348 ? ? 113.58 128.40 -14.82 2.10 Y 114 1 C M PRO 359 ? ? N M PRO 360 ? ? CA M PRO 360 ? ? 128.71 119.30 9.41 1.50 Y 115 1 C e ASP 45 ? ? N e PRO 46 ? ? CD e PRO 46 ? ? 115.09 128.40 -13.31 2.10 Y 116 1 C N GLN 31 ? ? N N PRO 32 ? ? CD N PRO 32 ? ? 115.48 128.40 -12.92 2.10 Y 117 1 C N MET 36 ? ? N N PRO 37 ? ? CD N PRO 37 ? ? 112.05 128.40 -16.35 2.10 Y 118 1 C N GLU 71 ? ? N N PRO 72 ? ? CD N PRO 72 ? ? 114.70 128.40 -13.70 2.10 Y 119 1 C N HIS 88 ? ? N N PRO 89 ? ? CD N PRO 89 ? ? 114.67 128.40 -13.73 2.10 Y 120 1 C N ALA 174 ? ? N N PRO 175 ? ? CD N PRO 175 ? ? 114.92 128.40 -13.48 2.10 Y 121 1 C N VAL 260 ? ? N N PRO 261 ? ? CD N PRO 261 ? ? 114.91 128.40 -13.49 2.10 Y 122 1 C N PHE 267 ? ? N N PRO 268 ? ? CD N PRO 268 ? ? 113.24 128.40 -15.16 2.10 Y 123 1 C N GLU 297 ? ? N N PRO 298 ? ? CD N PRO 298 ? ? 115.33 128.40 -13.07 2.10 Y 124 1 C N PRO 359 ? ? N N PRO 360 ? ? CA N PRO 360 ? ? 128.64 119.30 9.34 1.50 Y 125 1 C O ASP 31 ? ? N O PRO 32 ? ? CD O PRO 32 ? ? 114.05 128.40 -14.35 2.10 Y 126 1 C O GLY 81 ? ? N O PRO 82 ? ? CD O PRO 82 ? ? 115.73 128.40 -12.67 2.10 Y 127 1 C O VAL 172 ? ? N O PRO 173 ? ? CD O PRO 173 ? ? 115.52 128.40 -12.88 2.10 Y 128 1 C O THR 221 ? ? N O PRO 222 ? ? CD O PRO 222 ? ? 115.27 128.40 -13.13 2.10 Y 129 1 C O PHE 262 ? ? N O PRO 263 ? ? CD O PRO 263 ? ? 114.87 128.40 -13.53 2.10 Y 130 1 C O MET 269 ? ? N O PRO 270 ? ? CD O PRO 270 ? ? 114.88 128.40 -13.52 2.10 Y 131 1 C O VAL 288 ? ? N O PRO 289 ? ? CD O PRO 289 ? ? 115.42 128.40 -12.98 2.10 Y 132 1 C O ILE 347 ? ? N O PRO 348 ? ? CD O PRO 348 ? ? 113.60 128.40 -14.80 2.10 Y 133 1 C O PRO 359 ? ? N O PRO 360 ? ? CA O PRO 360 ? ? 128.74 119.30 9.44 1.50 Y 134 1 C f ASP 45 ? ? N f PRO 46 ? ? CD f PRO 46 ? ? 115.21 128.40 -13.19 2.10 Y 135 1 C P GLN 31 ? ? N P PRO 32 ? ? CD P PRO 32 ? ? 115.42 128.40 -12.98 2.10 Y 136 1 C P MET 36 ? ? N P PRO 37 ? ? CD P PRO 37 ? ? 112.06 128.40 -16.34 2.10 Y 137 1 C P GLU 71 ? ? N P PRO 72 ? ? CD P PRO 72 ? ? 114.62 128.40 -13.78 2.10 Y 138 1 C P HIS 88 ? ? N P PRO 89 ? ? CD P PRO 89 ? ? 114.73 128.40 -13.67 2.10 Y 139 1 C P ALA 174 ? ? N P PRO 175 ? ? CD P PRO 175 ? ? 115.00 128.40 -13.40 2.10 Y 140 1 C P VAL 260 ? ? N P PRO 261 ? ? CD P PRO 261 ? ? 114.84 128.40 -13.56 2.10 Y 141 1 C P PHE 267 ? ? N P PRO 268 ? ? CD P PRO 268 ? ? 113.20 128.40 -15.20 2.10 Y 142 1 C P GLU 297 ? ? N P PRO 298 ? ? CD P PRO 298 ? ? 115.27 128.40 -13.13 2.10 Y 143 1 C P PRO 359 ? ? N P PRO 360 ? ? CA P PRO 360 ? ? 128.65 119.30 9.35 1.50 Y 144 1 C Q ASP 31 ? ? N Q PRO 32 ? ? CD Q PRO 32 ? ? 114.08 128.40 -14.32 2.10 Y 145 1 C Q GLY 81 ? ? N Q PRO 82 ? ? CD Q PRO 82 ? ? 115.63 128.40 -12.77 2.10 Y 146 1 C Q VAL 172 ? ? N Q PRO 173 ? ? CD Q PRO 173 ? ? 115.49 128.40 -12.91 2.10 Y 147 1 C Q THR 221 ? ? N Q PRO 222 ? ? CD Q PRO 222 ? ? 115.23 128.40 -13.17 2.10 Y 148 1 C Q PHE 262 ? ? N Q PRO 263 ? ? CD Q PRO 263 ? ? 114.97 128.40 -13.43 2.10 Y 149 1 C Q MET 269 ? ? N Q PRO 270 ? ? CD Q PRO 270 ? ? 114.91 128.40 -13.49 2.10 Y 150 1 C Q VAL 288 ? ? N Q PRO 289 ? ? CD Q PRO 289 ? ? 115.44 128.40 -12.96 2.10 Y 151 1 C Q ILE 347 ? ? N Q PRO 348 ? ? CD Q PRO 348 ? ? 113.55 128.40 -14.85 2.10 Y 152 1 C Q PRO 359 ? ? N Q PRO 360 ? ? CA Q PRO 360 ? ? 128.78 119.30 9.48 1.50 Y 153 1 C g ASP 45 ? ? N g PRO 46 ? ? CD g PRO 46 ? ? 115.16 128.40 -13.24 2.10 Y 154 1 C R GLN 31 ? ? N R PRO 32 ? ? CD R PRO 32 ? ? 115.43 128.40 -12.97 2.10 Y 155 1 C R MET 36 ? ? N R PRO 37 ? ? CD R PRO 37 ? ? 112.06 128.40 -16.34 2.10 Y 156 1 C R GLU 71 ? ? N R PRO 72 ? ? CD R PRO 72 ? ? 114.68 128.40 -13.72 2.10 Y 157 1 C R HIS 88 ? ? N R PRO 89 ? ? CD R PRO 89 ? ? 114.73 128.40 -13.67 2.10 Y 158 1 C R ALA 174 ? ? N R PRO 175 ? ? CD R PRO 175 ? ? 114.95 128.40 -13.45 2.10 Y 159 1 C R VAL 260 ? ? N R PRO 261 ? ? CD R PRO 261 ? ? 114.92 128.40 -13.48 2.10 Y 160 1 C R PHE 267 ? ? N R PRO 268 ? ? CD R PRO 268 ? ? 113.24 128.40 -15.16 2.10 Y 161 1 C R GLU 297 ? ? N R PRO 298 ? ? CD R PRO 298 ? ? 115.28 128.40 -13.12 2.10 Y 162 1 C R PRO 359 ? ? N R PRO 360 ? ? CA R PRO 360 ? ? 128.65 119.30 9.35 1.50 Y 163 1 C S ASP 31 ? ? N S PRO 32 ? ? CD S PRO 32 ? ? 114.06 128.40 -14.34 2.10 Y 164 1 C S GLY 81 ? ? N S PRO 82 ? ? CD S PRO 82 ? ? 115.64 128.40 -12.76 2.10 Y 165 1 C S VAL 172 ? ? N S PRO 173 ? ? CD S PRO 173 ? ? 115.51 128.40 -12.89 2.10 Y 166 1 C S THR 221 ? ? N S PRO 222 ? ? CD S PRO 222 ? ? 115.32 128.40 -13.08 2.10 Y 167 1 C S PHE 262 ? ? N S PRO 263 ? ? CD S PRO 263 ? ? 114.89 128.40 -13.51 2.10 Y 168 1 C S MET 269 ? ? N S PRO 270 ? ? CD S PRO 270 ? ? 114.82 128.40 -13.58 2.10 Y 169 1 C S VAL 288 ? ? N S PRO 289 ? ? 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? 15.29 96.14 264 1 SER e 120 ? ? 158.13 -64.63 265 1 PRO e 172 ? ? -37.51 121.27 266 1 LEU e 176 ? ? -160.49 106.78 267 1 ASN e 197 ? ? -141.62 -1.94 268 1 THR e 267 ? ? 73.43 87.01 269 1 CYS e 303 ? ? -152.01 57.64 270 1 PRO e 306 ? ? -62.75 75.02 271 1 SER e 310 ? ? 119.58 135.48 272 1 ARG N 2 ? ? -19.04 107.09 273 1 TYR N 108 ? ? -123.74 -92.64 274 1 HIS N 139 ? ? -171.20 -176.38 275 1 SER N 147 ? ? -87.87 -77.27 276 1 PRO N 173 ? ? -36.60 123.59 277 1 VAL N 182 ? ? -95.13 31.15 278 1 ALA N 247 ? ? -98.21 -62.47 279 1 HIS N 266 ? ? -116.77 77.32 280 1 PRO N 268 ? ? -31.90 103.44 281 1 GLU N 279 ? ? -172.11 -64.51 282 1 CYS N 305 ? ? -172.10 -176.35 283 1 GLN N 358 ? ? -153.73 83.81 284 1 PRO N 359 ? ? -28.05 130.37 285 1 PRO N 364 ? ? -30.41 132.85 286 1 ASP N 367 ? ? -90.46 -89.29 287 1 LEU N 368 ? ? 24.90 75.27 288 1 ASP O 39 ? ? -150.94 -1.23 289 1 PRO O 63 ? ? -36.13 126.09 290 1 PRO O 72 ? ? -35.38 141.05 291 1 SER O 97 ? ? -125.85 -80.24 292 1 HIS O 107 ? ? -127.41 -55.20 293 1 THR O 109 ? ? -110.62 -82.59 294 1 CYS O 131 ? ? -155.54 83.87 295 1 HIS O 139 ? ? -165.42 -146.68 296 1 THR O 220 ? ? -79.82 -70.76 297 1 PRO O 222 ? ? -28.40 108.02 298 1 LEU O 248 ? ? -143.57 -125.34 299 1 ASN O 249 ? ? 134.75 104.27 300 1 ASP O 251 ? ? -89.38 -109.45 301 1 LEU O 252 ? ? -99.62 -61.45 302 1 ALA O 273 ? ? -63.83 -72.39 303 1 PRO O 274 ? ? -63.47 74.24 304 1 PRO O 307 ? ? -30.43 -39.47 305 1 PRO O 348 ? ? -19.76 -75.29 306 1 PRO f 19 ? ? -59.64 170.65 307 1 LEU f 28 ? ? -51.28 106.32 308 1 THR f 111 ? ? 15.26 96.12 309 1 SER f 120 ? ? 158.19 -64.63 310 1 PRO f 172 ? ? -37.41 121.34 311 1 LEU f 176 ? ? -160.47 106.70 312 1 ASN f 197 ? ? -141.68 -1.82 313 1 THR f 267 ? ? 73.35 87.02 314 1 CYS f 303 ? ? -152.05 57.57 315 1 PRO f 306 ? ? -62.94 75.14 316 1 SER f 310 ? ? 119.53 135.42 317 1 ARG P 2 ? ? -19.07 107.09 318 1 TYR P 108 ? ? -123.79 -92.70 319 1 HIS P 139 ? ? -171.30 -176.34 320 1 SER P 147 ? ? -87.90 -77.19 321 1 PRO P 173 ? ? -36.44 123.53 322 1 VAL P 182 ? ? -95.15 31.18 323 1 ALA P 247 ? ? -98.25 -62.45 324 1 HIS P 266 ? ? -116.73 77.26 325 1 PRO P 268 ? ? -31.85 103.48 326 1 GLU P 279 ? ? -172.03 -64.46 327 1 CYS P 305 ? ? -172.08 -176.34 328 1 GLN P 358 ? ? -153.62 83.78 329 1 PRO P 359 ? ? -28.09 130.46 330 1 PRO P 364 ? ? -30.48 132.84 331 1 ASP P 367 ? ? -90.53 -89.23 332 1 LEU P 368 ? ? 24.90 75.30 333 1 ASP Q 39 ? ? -150.98 -1.08 334 1 PRO Q 63 ? ? -36.00 126.01 335 1 PRO Q 72 ? ? -35.30 141.04 336 1 SER Q 97 ? ? -125.87 -80.22 337 1 HIS Q 107 ? ? -127.31 -55.19 338 1 THR Q 109 ? ? -110.59 -82.51 339 1 CYS Q 131 ? ? -155.52 83.94 340 1 HIS Q 139 ? ? -165.43 -146.68 341 1 THR Q 220 ? ? -79.83 -70.85 342 1 PRO Q 222 ? ? -28.30 108.02 343 1 LEU Q 248 ? ? -143.69 -125.35 344 1 ASN Q 249 ? ? 134.74 104.28 345 1 ASP Q 251 ? ? -89.35 -109.40 346 1 LEU Q 252 ? ? -99.64 -61.55 347 1 ALA Q 273 ? ? -63.78 -72.52 348 1 PRO Q 274 ? ? -63.41 74.22 349 1 PRO Q 307 ? ? -30.41 -39.50 350 1 PRO Q 348 ? ? -19.66 -75.35 351 1 PRO g 19 ? ? -59.68 170.68 352 1 LEU g 28 ? ? -51.28 106.43 353 1 THR g 111 ? ? 15.28 96.10 354 1 SER g 120 ? ? 158.19 -64.65 355 1 PRO g 172 ? ? -37.34 121.33 356 1 LEU g 176 ? ? -160.42 106.69 357 1 ASN g 197 ? ? -141.64 -2.00 358 1 THR g 267 ? ? 73.30 86.98 359 1 CYS g 303 ? ? -152.02 57.60 360 1 PRO g 306 ? ? -62.78 75.11 361 1 SER g 310 ? ? 119.51 135.46 362 1 ARG R 2 ? ? -19.13 107.12 363 1 TYR R 108 ? ? -123.76 -92.73 364 1 HIS R 139 ? ? -171.21 -176.30 365 1 SER R 147 ? ? -87.85 -77.31 366 1 PRO R 173 ? ? -36.51 123.56 367 1 VAL R 182 ? ? -95.18 31.11 368 1 ALA R 247 ? ? -98.23 -62.48 369 1 HIS R 266 ? ? -116.75 77.33 370 1 PRO R 268 ? ? -31.80 103.36 371 1 GLU R 279 ? ? -172.12 -64.51 372 1 CYS R 305 ? ? -172.13 -176.31 373 1 GLN R 358 ? ? -153.67 83.82 374 1 PRO R 359 ? ? -28.04 130.34 375 1 PRO R 364 ? ? -30.28 132.79 376 1 ASP R 367 ? ? -90.60 -89.38 377 1 LEU R 368 ? ? 24.95 75.31 378 1 ASP S 39 ? ? -150.97 -1.13 379 1 PRO S 63 ? ? -36.06 126.00 380 1 PRO S 72 ? ? -35.30 140.96 381 1 SER S 97 ? ? -125.88 -80.31 382 1 HIS S 107 ? ? -127.36 -55.08 383 1 THR S 109 ? ? -110.56 -82.52 384 1 CYS S 131 ? ? -155.56 83.81 385 1 HIS S 139 ? ? -165.49 -146.70 386 1 THR S 220 ? ? -79.86 -70.78 387 1 PRO S 222 ? ? -28.53 108.09 388 1 LEU S 248 ? ? -143.68 -125.42 389 1 ASN S 249 ? ? 134.76 104.28 390 1 ASP S 251 ? ? -89.35 -109.42 391 1 LEU S 252 ? ? -99.64 -61.48 392 1 ALA S 273 ? ? -63.62 -72.56 393 1 PRO S 274 ? ? -63.44 74.18 394 1 PRO S 307 ? ? -30.41 -39.58 395 1 PRO S 348 ? ? -19.72 -75.28 396 1 PRO h 19 ? ? -59.78 170.63 397 1 LEU h 28 ? ? -51.23 106.31 398 1 THR h 111 ? ? 15.27 96.13 399 1 SER h 120 ? ? 158.17 -64.64 400 1 PRO h 172 ? ? -37.36 121.34 401 1 LEU h 176 ? ? -160.48 106.78 402 1 ASN h 197 ? ? -141.67 -1.97 403 1 THR h 267 ? ? 73.37 87.03 404 1 CYS h 303 ? ? -152.05 57.64 405 1 PRO h 306 ? ? -62.84 75.10 406 1 SER h 310 ? ? 119.45 135.42 # loop_ _pdbx_validate_peptide_omega.id _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_model_num _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_peptide_omega.label_alt_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_peptide_omega.label_alt_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.omega 1 1 PHE A 267 ? ? PRO A 268 ? ? -147.74 2 1 ASN B 249 ? ? ALA B 250 ? ? 148.70 3 1 LEU K 28 ? ? VAL K 29 ? ? 75.02 4 1 PHE C 267 ? ? PRO C 268 ? ? -147.86 5 1 ASN D 249 ? ? ALA D 250 ? ? 148.82 6 1 LEU a 28 ? ? VAL a 29 ? ? 74.99 7 1 PHE E 267 ? ? PRO E 268 ? ? -147.80 8 1 ASN F 249 ? ? ALA F 250 ? ? 148.74 9 1 LEU b 28 ? ? VAL b 29 ? ? 75.06 10 1 PHE G 267 ? ? PRO G 268 ? ? -147.76 11 1 ASN H 249 ? ? ALA H 250 ? ? 148.78 12 1 LEU c 28 ? ? VAL c 29 ? ? 75.06 13 1 PHE I 267 ? ? PRO I 268 ? ? -147.74 14 1 ASN J 249 ? ? ALA J 250 ? ? 148.75 15 1 LEU d 28 ? ? VAL d 29 ? ? 75.00 16 1 PHE L 267 ? ? PRO L 268 ? ? -147.75 17 1 ASN M 249 ? ? ALA M 250 ? ? 148.81 18 1 LEU e 28 ? ? VAL e 29 ? ? 75.06 19 1 PHE N 267 ? ? PRO N 268 ? ? -147.79 20 1 ASN O 249 ? ? ALA O 250 ? ? 148.71 21 1 LEU f 28 ? ? VAL f 29 ? ? 75.01 22 1 PHE P 267 ? ? PRO P 268 ? ? -147.68 23 1 ASN Q 249 ? ? ALA Q 250 ? ? 148.71 24 1 LEU g 28 ? ? VAL g 29 ? ? 74.96 25 1 PHE R 267 ? ? PRO R 268 ? ? -147.77 26 1 ASN S 249 ? ? ALA S 250 ? ? 148.73 27 1 LEU h 28 ? ? VAL h 29 ? ? 74.97 # loop_ _pdbx_validate_main_chain_plane.id _pdbx_validate_main_chain_plane.PDB_model_num _pdbx_validate_main_chain_plane.auth_comp_id _pdbx_validate_main_chain_plane.auth_asym_id _pdbx_validate_main_chain_plane.auth_seq_id _pdbx_validate_main_chain_plane.PDB_ins_code _pdbx_validate_main_chain_plane.label_alt_id _pdbx_validate_main_chain_plane.improper_torsion_angle 1 1 LEU K 28 ? ? -16.15 2 1 LEU a 28 ? ? -16.14 3 1 LEU b 28 ? ? -16.08 4 1 LEU c 28 ? ? -16.14 5 1 LEU d 28 ? ? -16.13 6 1 LEU e 28 ? ? -16.15 7 1 LEU f 28 ? ? -16.14 8 1 LEU g 28 ? ? -16.21 9 1 LEU h 28 ? ? -16.18 # _pdbx_entry_details.entry_id 7RS6 _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest Y _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? # _em_3d_fitting.entry_id 7RS6 _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.details ;Multiple rounds of refinement were carried out against one half map (training map), and the other half map (validation map) was used to monitor overfitting based on the procedure described in Wang et al. elife, 2016. It is to note that the molecular interactions of ligand-protein were restrained to the initial poses adapted from the high-resolution structures during structure refinement. ; _em_3d_fitting.overall_b_value 100 _em_3d_fitting.ref_protocol OTHER _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.target_criteria 'Overall correlation of the residues to the map' _em_3d_fitting.method ? # loop_ _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id _em_3d_fitting_list.id _em_3d_fitting_list.details _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id _em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id _em_3d_fitting_list.chain_id _em_3d_fitting_list.chain_residue_range _em_3d_fitting_list.source_name _em_3d_fitting_list.type _em_3d_fitting_list.accession_code 1 1 ? A ? 3JAT 1 ? ? PDB 'experimental model' 3JAT 1 2 ? B ? 3JAT 1 ? ? PDB 'experimental model' 3JAT 1 3 ? K ? 4FRZ 2 ? ? 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'Cryo-EM structure of Kip3 (AMPPNP) bound to GMPCPP-Stabilized Microtubules' 'MULTIPLE SOURCES' COMPLEX '1, 2, 3' ? ? 2 1 ? 'GMPCPP-stabilized microtubules' NATURAL COMPLEX '1, 2' ? ? 3 1 ? 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CB CG sing N N 97 ASN CB HB2 sing N N 98 ASN CB HB3 sing N N 99 ASN CG OD1 doub N N 100 ASN CG ND2 sing N N 101 ASN ND2 HD21 sing N N 102 ASN ND2 HD22 sing N N 103 ASN OXT HXT sing N N 104 ASP N CA sing N N 105 ASP N H sing N N 106 ASP N H2 sing N N 107 ASP CA C sing N N 108 ASP CA CB sing N N 109 ASP CA HA sing N N 110 ASP C O doub N N 111 ASP C OXT sing N N 112 ASP CB CG sing N N 113 ASP CB HB2 sing N N 114 ASP CB HB3 sing N N 115 ASP CG OD1 doub N N 116 ASP CG OD2 sing N N 117 ASP OD2 HD2 sing N N 118 ASP OXT HXT sing N N 119 CYS N CA sing N N 120 CYS N H sing N N 121 CYS N H2 sing N N 122 CYS CA C sing N N 123 CYS CA CB sing N N 124 CYS CA HA sing N N 125 CYS C O doub N N 126 CYS C OXT sing N N 127 CYS CB SG sing N N 128 CYS CB HB2 sing N N 129 CYS CB HB3 sing N N 130 CYS SG HG sing N N 131 CYS OXT HXT sing N N 132 G2P PG O1G sing N N 133 G2P PG O2G doub N N 134 G2P PG O3G sing N N 135 G2P PG O3B sing N N 136 G2P O3B PB sing N N 137 G2P PB O1B sing N N 138 G2P PB O2B doub N N 139 G2P PB C3A sing N N 140 G2P C3A PA sing N N 141 G2P C3A H3A1 sing N N 142 G2P C3A H3A2 sing N N 143 G2P PA O1A sing N N 144 G2P PA O2A doub N N 145 G2P PA "O5'" sing N N 146 G2P "O5'" "C5'" sing N N 147 G2P "C5'" "C4'" sing N N 148 G2P "C5'" "H5'1" sing N N 149 G2P "C5'" "H5'2" sing N N 150 G2P "C4'" "O4'" sing N N 151 G2P "C4'" "C3'" sing N N 152 G2P "C4'" "H4'" sing N N 153 G2P "O4'" "C1'" sing N N 154 G2P "C3'" "O3'" sing N N 155 G2P "C3'" "C2'" sing N N 156 G2P "C3'" "H3'" sing N N 157 G2P "O3'" HA sing N N 158 G2P "C2'" "O2'" sing N N 159 G2P "C2'" "C1'" sing N N 160 G2P "C2'" "H2'" sing N N 161 G2P "O2'" HB sing N N 162 G2P "C1'" N9 sing N N 163 G2P "C1'" "H1'" sing N N 164 G2P N9 C8 sing Y N 165 G2P N9 C4 sing Y N 166 G2P C8 N7 doub Y N 167 G2P C8 H8 sing N N 168 G2P N7 C5 sing Y N 169 G2P C5 C6 sing Y N 170 G2P C5 C4 doub Y N 171 G2P C6 O6 doub N N 172 G2P C6 N1 sing Y N 173 G2P N1 C2 sing Y N 174 G2P N1 H1 sing N N 175 G2P C2 N2 sing N N 176 G2P C2 N3 doub Y N 177 G2P N2 H2N1 sing N N 178 G2P N2 H2N2 sing N N 179 G2P N3 C4 sing Y N 180 G2P HO1 O1G sing N N 181 G2P HO2 O3G sing N N 182 G2P HO3 O1A sing N N 183 G2P HO4 O1B sing N N 184 GLN N CA sing N N 185 GLN N H sing N N 186 GLN N H2 sing N N 187 GLN CA C sing N N 188 GLN CA CB sing N N 189 GLN CA HA sing N N 190 GLN C O doub N N 191 GLN C OXT sing N N 192 GLN CB CG sing N N 193 GLN CB HB2 sing N N 194 GLN CB HB3 sing N N 195 GLN CG CD sing N N 196 GLN CG HG2 sing N N 197 GLN CG HG3 sing N N 198 GLN CD OE1 doub N N 199 GLN CD NE2 sing N N 200 GLN NE2 HE21 sing N N 201 GLN NE2 HE22 sing N N 202 GLN OXT HXT sing N N 203 GLU N CA sing N N 204 GLU N H sing N N 205 GLU N H2 sing N N 206 GLU CA C sing N N 207 GLU CA CB sing N N 208 GLU CA HA sing N N 209 GLU C O doub N N 210 GLU C OXT sing N N 211 GLU CB CG sing N N 212 GLU CB HB2 sing N N 213 GLU CB HB3 sing N N 214 GLU CG CD sing N N 215 GLU CG HG2 sing N N 216 GLU CG HG3 sing N N 217 GLU CD OE1 doub N N 218 GLU CD OE2 sing N N 219 GLU OE2 HE2 sing N N 220 GLU OXT HXT sing N N 221 GLY N CA sing N N 222 GLY N H sing N N 223 GLY N H2 sing N N 224 GLY CA C sing N N 225 GLY CA HA2 sing N N 226 GLY CA HA3 sing N N 227 GLY C O doub N N 228 GLY C OXT sing N N 229 GLY OXT HXT sing N N 230 GTP PG O1G doub N N 231 GTP PG O2G sing N N 232 GTP PG O3G sing N N 233 GTP PG O3B sing N N 234 GTP O2G HOG2 sing N N 235 GTP O3G HOG3 sing N N 236 GTP O3B PB sing N N 237 GTP PB O1B doub N N 238 GTP PB O2B sing N N 239 GTP PB O3A sing N N 240 GTP O2B HOB2 sing N N 241 GTP O3A PA sing N N 242 GTP PA O1A doub N N 243 GTP PA O2A sing N N 244 GTP PA "O5'" sing N N 245 GTP O2A HOA2 sing N N 246 GTP "O5'" "C5'" sing N N 247 GTP "C5'" "C4'" sing N N 248 GTP "C5'" "H5'" sing N N 249 GTP "C5'" "H5''" sing N N 250 GTP "C4'" "O4'" sing N N 251 GTP "C4'" "C3'" sing N N 252 GTP "C4'" "H4'" sing N N 253 GTP "O4'" "C1'" sing N N 254 GTP "C3'" "O3'" sing N N 255 GTP "C3'" "C2'" sing N N 256 GTP "C3'" "H3'" sing N N 257 GTP "O3'" "HO3'" sing N N 258 GTP "C2'" "O2'" sing N N 259 GTP "C2'" "C1'" sing N N 260 GTP "C2'" "H2'" sing N N 261 GTP "O2'" "HO2'" sing N N 262 GTP "C1'" N9 sing N N 263 GTP "C1'" "H1'" sing N N 264 GTP N9 C8 sing Y N 265 GTP N9 C4 sing Y N 266 GTP C8 N7 doub Y N 267 GTP C8 H8 sing N N 268 GTP N7 C5 sing Y N 269 GTP C5 C6 sing N N 270 GTP C5 C4 doub Y N 271 GTP C6 O6 doub N N 272 GTP C6 N1 sing N N 273 GTP N1 C2 sing N N 274 GTP N1 HN1 sing N N 275 GTP C2 N2 sing N N 276 GTP C2 N3 doub N N 277 GTP N2 HN21 sing N N 278 GTP N2 HN22 sing N N 279 GTP N3 C4 sing N N 280 HIS N CA sing N N 281 HIS N H sing N N 282 HIS N H2 sing N N 283 HIS CA C sing N N 284 HIS CA CB sing N N 285 HIS CA HA sing N N 286 HIS C O doub N N 287 HIS C OXT sing N N 288 HIS CB CG sing N N 289 HIS CB HB2 sing N N 290 HIS CB HB3 sing N N 291 HIS CG ND1 sing Y N 292 HIS CG CD2 doub Y N 293 HIS ND1 CE1 doub Y N 294 HIS ND1 HD1 sing N N 295 HIS CD2 NE2 sing Y N 296 HIS CD2 HD2 sing N N 297 HIS CE1 NE2 sing Y N 298 HIS CE1 HE1 sing N N 299 HIS NE2 HE2 sing N N 300 HIS OXT HXT sing N N 301 ILE N CA sing N N 302 ILE N H sing N N 303 ILE N H2 sing N N 304 ILE CA C sing N N 305 ILE CA CB sing N N 306 ILE CA HA sing N N 307 ILE C O doub N N 308 ILE C OXT sing N N 309 ILE CB CG1 sing N N 310 ILE CB CG2 sing N N 311 ILE CB HB sing N N 312 ILE CG1 CD1 sing N N 313 ILE CG1 HG12 sing N N 314 ILE CG1 HG13 sing N N 315 ILE CG2 HG21 sing N N 316 ILE CG2 HG22 sing N N 317 ILE CG2 HG23 sing N N 318 ILE CD1 HD11 sing N N 319 ILE CD1 HD12 sing N N 320 ILE CD1 HD13 sing N N 321 ILE OXT HXT sing N N 322 LEU N CA sing N N 323 LEU N H sing N N 324 LEU N H2 sing N N 325 LEU CA C sing N N 326 LEU CA CB sing N N 327 LEU CA HA sing N N 328 LEU C O doub N N 329 LEU C OXT sing N N 330 LEU CB CG sing N N 331 LEU CB HB2 sing N N 332 LEU CB HB3 sing N N 333 LEU CG CD1 sing N N 334 LEU CG CD2 sing N N 335 LEU CG HG sing N N 336 LEU CD1 HD11 sing N N 337 LEU CD1 HD12 sing N N 338 LEU CD1 HD13 sing N N 339 LEU CD2 HD21 sing N N 340 LEU CD2 HD22 sing N N 341 LEU CD2 HD23 sing N N 342 LEU OXT HXT sing N N 343 LYS N CA sing N N 344 LYS N H sing N N 345 LYS N H2 sing N N 346 LYS CA C sing N N 347 LYS CA CB sing N N 348 LYS CA HA sing N N 349 LYS C O doub N N 350 LYS C OXT sing N N 351 LYS CB CG sing N N 352 LYS CB HB2 sing N N 353 LYS CB HB3 sing N N 354 LYS CG CD sing N N 355 LYS CG HG2 sing N N 356 LYS CG HG3 sing N N 357 LYS CD CE sing N N 358 LYS CD HD2 sing N N 359 LYS CD HD3 sing N N 360 LYS CE NZ sing N N 361 LYS CE HE2 sing N N 362 LYS CE HE3 sing N N 363 LYS NZ HZ1 sing N N 364 LYS NZ HZ2 sing N N 365 LYS NZ HZ3 sing N N 366 LYS OXT HXT sing N N 367 MET N CA sing N N 368 MET N H sing N N 369 MET N H2 sing N N 370 MET CA C sing N N 371 MET CA CB sing N N 372 MET CA HA sing N N 373 MET C O doub N N 374 MET C OXT sing N N 375 MET CB CG sing N N 376 MET CB HB2 sing N N 377 MET CB HB3 sing N N 378 MET CG SD sing N N 379 MET CG HG2 sing N N 380 MET CG HG3 sing N N 381 MET SD CE sing N N 382 MET CE HE1 sing N N 383 MET CE HE2 sing N N 384 MET CE HE3 sing N N 385 MET OXT HXT sing N N 386 PHE N CA sing N N 387 PHE N H sing N N 388 PHE N H2 sing N N 389 PHE CA C sing N N 390 PHE CA CB sing N N 391 PHE CA HA sing N N 392 PHE C O doub N N 393 PHE C OXT sing N N 394 PHE CB CG sing N N 395 PHE CB HB2 sing N N 396 PHE CB HB3 sing N N 397 PHE CG CD1 doub Y N 398 PHE CG CD2 sing Y N 399 PHE CD1 CE1 sing Y N 400 PHE CD1 HD1 sing N N 401 PHE CD2 CE2 doub Y N 402 PHE CD2 HD2 sing N N 403 PHE CE1 CZ doub Y N 404 PHE CE1 HE1 sing N N 405 PHE CE2 CZ sing Y N 406 PHE CE2 HE2 sing N N 407 PHE CZ HZ sing N N 408 PHE OXT HXT sing N N 409 PRO N CA sing N N 410 PRO N CD sing N N 411 PRO N H sing N N 412 PRO CA C sing N N 413 PRO CA CB sing N N 414 PRO CA HA sing N N 415 PRO C O doub N N 416 PRO C OXT sing N N 417 PRO CB CG sing N N 418 PRO CB HB2 sing N N 419 PRO CB HB3 sing N N 420 PRO CG CD sing N N 421 PRO CG HG2 sing N N 422 PRO CG HG3 sing N N 423 PRO CD HD2 sing N N 424 PRO CD HD3 sing N N 425 PRO OXT HXT sing N N 426 SER N CA sing N N 427 SER N H sing N N 428 SER N H2 sing N N 429 SER CA C sing N N 430 SER CA CB sing N N 431 SER CA HA sing N N 432 SER C O doub N N 433 SER C OXT sing N N 434 SER CB OG sing N N 435 SER CB HB2 sing N N 436 SER CB HB3 sing N N 437 SER OG HG sing N N 438 SER OXT HXT sing N N 439 THR N CA sing N N 440 THR N H sing N N 441 THR N H2 sing N N 442 THR CA C sing N N 443 THR CA CB sing N N 444 THR CA HA sing N N 445 THR C O doub N N 446 THR C OXT sing N N 447 THR CB OG1 sing N N 448 THR CB CG2 sing N N 449 THR CB HB sing N N 450 THR OG1 HG1 sing N N 451 THR CG2 HG21 sing N N 452 THR CG2 HG22 sing N N 453 THR CG2 HG23 sing N N 454 THR OXT HXT sing N N 455 TRP N CA sing N N 456 TRP N H sing N N 457 TRP N H2 sing N N 458 TRP CA C sing N N 459 TRP CA CB sing N N 460 TRP CA HA sing N N 461 TRP C O doub N N 462 TRP C OXT sing N N 463 TRP CB CG sing N N 464 TRP CB HB2 sing N N 465 TRP CB HB3 sing N N 466 TRP CG CD1 doub Y N 467 TRP CG CD2 sing Y N 468 TRP CD1 NE1 sing Y N 469 TRP CD1 HD1 sing N N 470 TRP CD2 CE2 doub Y N 471 TRP CD2 CE3 sing Y N 472 TRP NE1 CE2 sing Y N 473 TRP NE1 HE1 sing N N 474 TRP CE2 CZ2 sing Y N 475 TRP CE3 CZ3 doub Y N 476 TRP CE3 HE3 sing N N 477 TRP CZ2 CH2 doub Y N 478 TRP CZ2 HZ2 sing N N 479 TRP CZ3 CH2 sing Y N 480 TRP CZ3 HZ3 sing N N 481 TRP CH2 HH2 sing N N 482 TRP OXT HXT sing N N 483 TYR N CA sing N N 484 TYR N H sing N N 485 TYR N H2 sing N N 486 TYR CA C sing N N 487 TYR CA CB sing N N 488 TYR CA HA sing N N 489 TYR C O doub N N 490 TYR C OXT sing N N 491 TYR CB CG sing N N 492 TYR CB HB2 sing N N 493 TYR CB HB3 sing N N 494 TYR CG CD1 doub Y N 495 TYR CG CD2 sing Y N 496 TYR CD1 CE1 sing Y N 497 TYR CD1 HD1 sing N N 498 TYR CD2 CE2 doub Y N 499 TYR CD2 HD2 sing N N 500 TYR CE1 CZ doub Y N 501 TYR CE1 HE1 sing N N 502 TYR CE2 CZ sing Y N 503 TYR CE2 HE2 sing N N 504 TYR CZ OH sing N N 505 TYR OH HH sing N N 506 TYR OXT HXT sing N N 507 VAL N CA sing N N 508 VAL N H sing N N 509 VAL N H2 sing N N 510 VAL CA C sing N N 511 VAL CA CB sing N N 512 VAL CA HA sing N N 513 VAL C O doub N N 514 VAL C OXT sing N N 515 VAL CB CG1 sing N N 516 VAL CB CG2 sing N N 517 VAL CB HB sing N N 518 VAL CG1 HG11 sing N N 519 VAL CG1 HG12 sing N N 520 VAL CG1 HG13 sing N N 521 VAL CG2 HG21 sing N N 522 VAL CG2 HG22 sing N N 523 VAL CG2 HG23 sing N N 524 VAL OXT HXT sing N N 525 # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details ;The contrast transfer function (CTF) was estimated using CTFFIND4 [(Rohou and Grigorieff, 2015) CTFFIND4: Fast and accurate] with a 500 um step search. A second CTFFIND run with a 100 um step search was carried out to refine the initial defocus values. Micrographs whose estimated resolution was lower than 8 Angstrom with 0.8 confidence were excluded. ; # loop_ _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id _em_entity_assembly_molwt.id _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag _em_entity_assembly_molwt.units _em_entity_assembly_molwt.value 1 1 NO ? ? 1 2 NO ? ? 1 3 NO ? ? # loop_ _em_entity_assembly_naturalsource.id _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id _em_entity_assembly_naturalsource.cell _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_naturalsource.organ _em_entity_assembly_naturalsource.organelle _em_entity_assembly_naturalsource.organism _em_entity_assembly_naturalsource.strain _em_entity_assembly_naturalsource.tissue 1 2 ? ? 9823 ? ? 'Sus scrofa' ? ? 2 3 ? ? 4932 ? ? 'Saccharomyces cerevisiae' ? ? # _em_entity_assembly_recombinant.id 1 _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id 3 _em_entity_assembly_recombinant.cell ? _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id 4932 _em_entity_assembly_recombinant.organism 'Saccharomyces cerevisiae' _em_entity_assembly_recombinant.plasmid ? _em_entity_assembly_recombinant.strain ? # _em_helical_entity.id 1 _em_helical_entity.image_processing_id 1 _em_helical_entity.angular_rotation_per_subunit -25.76 _em_helical_entity.axial_rise_per_subunit 8.90 _em_helical_entity.axial_symmetry C14 _em_helical_entity.details ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 40 _em_image_recording.average_exposure_time 5 _em_image_recording.details ;Final accumulated electron doses were 40 electrons/A2. Images were collected in super-resolution mode. The total exposure time was 5 seconds, fractionated into 20 subframes, each with an exposure time of 0.25 s. ; _em_image_recording.detector_mode SUPER-RESOLUTION _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged 1 _em_image_recording.num_real_images 643 # _em_particle_selection.id 1 _em_particle_selection.image_processing_id 1 _em_particle_selection.details ;Inspection, defocus estimation, microtubule picking, and stack creation were performed within the Appion processing environment (Lander et al., 2009). Images were selected for processing on the basis of high decoration, straight MTs, and the absence of crystalline ice. ; _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 29090 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' ? Appion ? 1 ? ? 2 'IMAGE ACQUISITION' ? ? ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? CTFFIND 4 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? Rosetta ? ? 1 ? 8 OTHER ? ? ? ? ? ? 9 'MODEL REFINEMENT' ? Rosetta ? ? 1 ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? EMAN2 ? 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? FREALIGN ? 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? ? ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? FREALIGN ? 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ;Highly purified, glycerol-free tubulin (Cytoskeleton, Inc.) was resuspended in BRB80 buffer (80 mM PIPES-KOH, pH 6.8, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 1 mM DTT) to a concentration of 10 mg/mL. GMPCPP microtubules were polymerized using GMPCPP seeds (20 uM tubulin, 1mM GMPCPP, 1mM MgCl2, 1mM DTT in BRB80). A 1 uL aliquot of seeds was transferred to a 37 C water bath. After 30 minutes, 40 uL of elongation mix (2 uM tubulin, 0.5 mM GMPCPP, 0.5 mM MgCl2, 1 mM DTT in BRB80) were added and the mixture was then incubated for additional 4.5 - 5 hours at 37 C. Purified Kip3 438 protein was buffer exchanged to cryoEM buffer (50 mM Tris-HCl, pH 8.0, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 1 mM DTT supplemented with 2mM AMPPNP) and desalted using a ZEBA spin desalting column. The protein was recovered by centrifugation at 15,000 rcf for 2 min. A final spin at 30,000 x g in a TLA 100 rotor (Beckman) for 10 min at 4 C was carried out to remove big aggregates. ; _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # _pdbx_audit_support.funding_organization 'Not funded' _pdbx_audit_support.country ? _pdbx_audit_support.grant_number ? _pdbx_audit_support.ordinal 1 # loop_ _pdbx_entity_instance_feature.ordinal _pdbx_entity_instance_feature.comp_id _pdbx_entity_instance_feature.asym_id _pdbx_entity_instance_feature.seq_num _pdbx_entity_instance_feature.auth_comp_id _pdbx_entity_instance_feature.auth_asym_id _pdbx_entity_instance_feature.auth_seq_num _pdbx_entity_instance_feature.feature_type _pdbx_entity_instance_feature.details 1 ANP ? ? ANP ? ? 'SUBJECT OF INVESTIGATION' ? 2 G2P ? ? G2P ? ? 'SUBJECT OF INVESTIGATION' ? 3 GTP ? ? GTP ? ? 'SUBJECT OF INVESTIGATION' ? 4 MG ? ? MG ? ? 'SUBJECT OF INVESTIGATION' ? # loop_ _pdbx_initial_refinement_model.id _pdbx_initial_refinement_model.type _pdbx_initial_refinement_model.source_name _pdbx_initial_refinement_model.accession_code 1 'experimental model' PDB 3JAT 2 'experimental model' PDB 4FRZ # _atom_sites.entry_id 7RS6 _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[1] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[2] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[3] ? _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 _atom_sites.solution_primary ? _atom_sites.solution_secondary ? _atom_sites.solution_hydrogens ? _atom_sites.special_details ? # loop_ _atom_type.symbol C H MG N O P S # loop_