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A 1 59 ASN 59 58 58 ASN ASN H . n A 1 60 TYR 60 59 59 TYR TYR H . n A 1 61 ALA 61 60 60 ALA ALA H . n A 1 62 GLN 62 61 61 GLN GLN H . n A 1 63 LYS 63 62 62 LYS LYS H . n A 1 64 PHE 64 63 63 PHE PHE H . n A 1 65 GLN 65 64 64 GLN GLN H . n A 1 66 GLY 66 65 65 GLY GLY H . n A 1 67 ARG 67 66 66 ARG ARG H . n A 1 68 VAL 68 67 67 VAL VAL H . n A 1 69 THR 69 68 68 THR THR H . n A 1 70 ILE 70 69 69 ILE ILE H . n A 1 71 THR 71 70 70 THR THR H . n A 1 72 ALA 72 71 71 ALA ALA H . n A 1 73 ASP 73 72 72 ASP ASP H . n A 1 74 LYS 74 73 73 LYS LYS H . n A 1 75 SER 75 74 74 SER SER H . n A 1 76 THR 76 75 75 THR THR H . n A 1 77 SER 77 76 76 SER SER H . n A 1 78 THR 78 77 77 THR THR H . n A 1 79 ALA 79 78 78 ALA ALA H . n A 1 80 PHE 80 79 79 PHE PHE H . n A 1 81 MET 81 80 80 MET MET H . n A 1 82 GLU 82 81 81 GLU GLU H . n A 1 83 LEU 83 82 82 LEU LEU H . n A 1 84 SER 84 82 82 SER SER H A n A 1 85 SER 85 82 82 SER SER H B n A 1 86 LEU 86 82 82 LEU LEU H C n A 1 87 ARG 87 83 83 ARG ARG H . n A 1 88 SER 88 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'expression tag' 1280 83 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLN A 62 ? GLN A 65 ? GLN H 61 GLN H 64 5 ? 4 HELX_P HELX_P2 AA2 LYS A 74 ? THR A 76 ? LYS H 73 THR H 75 5 ? 3 HELX_P HELX_P3 AA3 SER B 30 ? SER B 32 ? SER L 29 SER L 31 5 ? 3 HELX_P HELX_P4 AA4 GLU B 80 ? PHE B 84 ? GLU L 79 PHE L 83 5 ? 5 HELX_P HELX_P5 AA5 PHE C 338 ? ASN C 343 ? PHE A 338 ASN A 343 1 ? 6 HELX_P HELX_P6 AA6 SER C 349 ? TRP C 353 ? SER A 349 TRP A 353 5 ? 5 HELX_P HELX_P7 AA7 ASP C 364 ? SER C 371 ? ASP A 364 SER A 371 1 ? 8 HELX_P HELX_P8 AA8 SER C 383 ? ASP C 389 ? SER A 383 ASP A 389 5 ? 7 HELX_P HELX_P9 AA9 ASP C 405 ? ILE C 410 ? ASP A 405 ILE A 410 5 ? 6 HELX_P HELX_P10 AB1 GLY C 416 ? ASN C 422 ? GLY A 416 ASN A 422 1 ? 7 HELX_P HELX_P11 AB2 SER C 438 ? SER C 443 ? SER A 438 SER A 443 1 ? 6 HELX_P HELX_P12 AB3 GLY C 502 ? TYR C 505 ? GLY A 502 TYR A 505 5 ? 4 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 22 SG ? ? ? 1_555 A CYS 96 SG ? ? H CYS 22 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf2 disulf ? ? B CYS 23 SG ? ? ? 1_555 B CYS 89 SG ? ? L CYS 23 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf3 disulf ? ? C CYS 336 SG ? ? ? 1_555 C CYS 361 SG ? ? A CYS 336 A CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf4 disulf ? ? C CYS 379 SG ? ? ? 1_555 C CYS 432 SG ? ? A CYS 379 A CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.059 ? ? disulf5 disulf ? ? C CYS 391 SG ? ? ? 1_555 C CYS 525 SG ? ? A CYS 391 A CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? ? disulf6 disulf ? ? C CYS 480 SG ? ? ? 1_555 C CYS 488 SG ? ? A CYS 480 A CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? covale1 covale one ? C ASN 331 ND2 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? A ASN 331 A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.531 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? C ASN 343 ND2 ? ? ? 1_555 D NAG . C1 ? ? A ASN 343 B NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.507 ? N-Glycosylation covale3 covale both ? D NAG . O4 ? ? ? 1_555 D NAG . C1 ? ? B NAG 1 B NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.503 ? ? covale4 covale both ? D NAG . O6 ? ? ? 1_555 D FUC . C1 ? ? B NAG 1 B FUC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.487 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 NAG D . ? ASN C 343 ? NAG B 1 ? 1_555 ASN A 343 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 2 NAG E . ? ASN C 331 ? NAG A 1301 ? 1_555 ASN A 331 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 3 CYS A 22 ? CYS A 96 ? CYS H 22 ? 1_555 CYS H 92 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 4 CYS B 23 ? CYS B 89 ? CYS L 23 ? 1_555 CYS L 88 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 5 CYS C 336 ? CYS C 361 ? CYS A 336 ? 1_555 CYS A 361 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 6 CYS C 379 ? CYS C 432 ? CYS A 379 ? 1_555 CYS A 432 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 7 CYS C 391 ? CYS C 525 ? CYS A 391 ? 1_555 CYS A 525 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 8 CYS C 480 ? CYS C 488 ? CYS A 480 ? 1_555 CYS A 488 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # _struct_mon_prot_cis.pdbx_id 1 _struct_mon_prot_cis.label_comp_id SER _struct_mon_prot_cis.label_seq_id 7 _struct_mon_prot_cis.label_asym_id B _struct_mon_prot_cis.label_alt_id . _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code ? _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id SER _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id 7 _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id L _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 8 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 B _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 ? _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 8 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 L _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num 1 _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle -3.44 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 4 ? AA2 ? 6 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 6 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 5 ? AA8 ? 3 ? AA9 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA2 5 6 ? anti-parallel AA3 1 2 ? parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? anti-parallel AA5 5 6 ? anti-parallel AA6 1 2 ? parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA8 1 2 ? parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 GLN A 3 ? GLN A 6 ? GLN H 3 GLN H 6 AA1 2 VAL A 18 ? SER A 25 ? VAL H 18 SER H 25 AA1 3 THR A 78 ? LEU A 83 ? THR H 77 LEU H 82 AA1 4 VAL A 68 ? ASP A 73 ? VAL H 67 ASP H 72 AA2 1 ALA A 9 ? VAL A 11 ? ALA H 9 VAL H 11 AA2 2 THR A 112 ? VAL A 116 ? THR H 107 VAL H 111 AA2 3 VAL A 93 ? ASN A 100 ? VAL H 89 ASN H 96 AA2 4 SER A 32 ? GLN A 39 ? SER H 32 GLN H 39 AA2 5 GLU A 46 ? ILE A 51 ? GLU H 46 ILE H 51 AA2 6 THR A 58 ? TYR A 60 ? THR H 57 TYR H 59 AA3 1 ALA A 9 ? VAL A 11 ? ALA H 9 VAL H 11 AA3 2 THR A 112 ? VAL A 116 ? THR H 107 VAL H 111 AA3 3 VAL A 93 ? ASN A 100 ? VAL H 89 ASN H 96 AA3 4 VAL A 106 ? TRP A 108 ? VAL H 101 TRP H 103 AA4 1 LEU B 4 ? SER B 7 ? LEU L 4 SER L 7 AA4 2 ALA B 19 ? ALA B 25 ? ALA L 19 ALA L 25 AA4 3 ASP B 71 ? ILE B 76 ? ASP L 70 ILE L 75 AA4 4 PHE B 63 ? SER B 68 ? PHE L 62 SER L 67 AA5 1 THR B 10 ? LEU B 13 ? THR L 10 LEU L 13 AA5 2 THR B 103 ? ILE B 107 ? THR L 102 ILE L 106 AA5 3 VAL B 86 ? TYR B 92 ? VAL L 85 TYR L 91 AA5 4 LEU B 34 ? GLN B 39 ? LEU L 33 GLN L 38 AA5 5 ARG B 46 ? TYR B 50 ? ARG L 45 TYR L 49 AA5 6 SER B 54 ? ARG B 55 ? SER L 53 ARG L 54 AA6 1 THR B 10 ? LEU B 13 ? THR L 10 LEU L 13 AA6 2 THR B 103 ? ILE B 107 ? THR L 102 ILE L 106 AA6 3 VAL B 86 ? TYR B 92 ? VAL L 85 TYR L 91 AA6 4 TRP B 97 ? THR B 98 ? TRP L 96 THR L 97 AA7 1 ASN C 354 ? ILE C 358 ? ASN A 354 ILE A 358 AA7 2 ASN C 394 ? ARG C 403 ? ASN A 394 ARG A 403 AA7 3 PRO C 507 ? GLU C 516 ? PRO A 507 GLU A 516 AA7 4 GLY C 431 ? ASN C 437 ? GLY A 431 ASN A 437 AA7 5 THR C 376 ? TYR C 380 ? THR A 376 TYR A 380 AA8 1 CYS C 361 ? VAL C 362 ? CYS A 361 VAL A 362 AA8 2 VAL C 524 ? CYS C 525 ? VAL A 524 CYS A 525 AA8 3 CYS C 391 ? PHE C 392 ? CYS A 391 PHE A 392 AA9 1 LEU C 452 ? ARG C 454 ? LEU A 452 ARG A 454 AA9 2 LEU C 492 ? SER C 494 ? LEU A 492 SER A 494 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N VAL A 5 ? N VAL H 5 O LYS A 23 ? O LYS H 23 AA1 2 3 N VAL A 20 ? N VAL H 20 O MET A 81 ? O MET H 80 AA1 3 4 O GLU A 82 ? O GLU H 81 N THR A 69 ? N THR H 68 AA2 1 2 N VAL A 11 ? N VAL H 11 O THR A 115 ? O THR H 110 AA2 2 3 O THR A 112 ? O THR H 107 N TYR A 94 ? N TYR H 90 AA2 3 4 O TYR A 95 ? O TYR H 91 N VAL A 37 ? N VAL H 37 AA2 4 5 N TRP A 36 ? N TRP H 36 O MET A 48 ? O MET H 48 AA2 5 6 N GLY A 50 ? N GLY H 50 O ASN A 59 ? O ASN H 58 AA3 1 2 N VAL A 11 ? N VAL H 11 O THR A 115 ? O THR H 110 AA3 2 3 O THR A 112 ? O THR H 107 N TYR A 94 ? N TYR H 90 AA3 3 4 N LEU A 98 ? N LEU H 94 O TYR A 107 ? O TYR H 102 AA4 1 2 N THR B 5 ? N THR L 5 O ARG B 24 ? O ARG L 24 AA4 2 3 N ALA B 19 ? N ALA L 19 O ILE B 76 ? O ILE L 75 AA4 3 4 O THR B 73 ? O THR L 72 N SER B 66 ? N SER L 65 AA5 1 2 N LEU B 11 ? N LEU L 11 O LYS B 104 ? O LYS L 103 AA5 2 3 O THR B 103 ? O THR L 102 N TYR B 87 ? N TYR L 86 AA5 3 4 O GLN B 90 ? O GLN L 89 N ALA B 35 ? N ALA L 34 AA5 4 5 N TRP B 36 ? N TRP L 35 O LEU B 48 ? O LEU L 47 AA5 5 6 N TYR B 50 ? N TYR L 49 O SER B 54 ? O SER L 53 AA6 1 2 N LEU B 11 ? N LEU L 11 O LYS B 104 ? O LYS L 103 AA6 2 3 O THR B 103 ? O THR L 102 N TYR B 87 ? N TYR L 86 AA6 3 4 N HIS B 91 ? N HIS L 90 O THR B 98 ? O THR L 97 AA7 1 2 N LYS C 356 ? N LYS A 356 O ALA C 397 ? O ALA A 397 AA7 2 3 N ILE C 402 ? N ILE A 402 O TYR C 508 ? O TYR A 508 AA7 3 4 O LEU C 513 ? O LEU A 513 N CYS C 432 ? N CYS A 432 AA7 4 5 O GLY C 431 ? O GLY A 431 N TYR C 380 ? N TYR A 380 AA8 1 2 N CYS C 361 ? N CYS A 361 O CYS C 525 ? O CYS A 525 AA8 2 3 O VAL C 524 ? O VAL A 524 N PHE C 392 ? N PHE A 392 AA9 1 2 N TYR C 453 ? N TYR A 453 O GLN C 493 ? O GLN A 493 # _pdbx_entry_details.entry_id 7RU4 _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest N _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.has_protein_modification Y # loop_ _pdbx_validate_rmsd_bond.id _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_value _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_target_value _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_deviation _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_bond.linker_flag 1 1 CB H PHE 79 ? ? CG H PHE 79 ? ? 1.395 1.509 -0.114 0.017 N 2 1 CB L TYR 36 ? ? CG L TYR 36 ? ? 1.398 1.512 -0.114 0.015 N 3 1 CB L TYR 87 ? ? CG L TYR 87 ? ? 1.397 1.512 -0.115 0.015 N 4 1 CB A TYR 396 ? ? 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CZ L ARG 54 ? ? NH2 L ARG 54 ? ? 116.64 120.30 -3.66 0.50 N 2 1 NE L ARG 77 ? ? CZ L ARG 77 ? ? NH2 L ARG 77 ? ? 115.78 120.30 -4.52 0.50 N 3 1 NE A ARG 403 ? ? CZ A ARG 403 ? ? NH2 A ARG 403 ? ? 116.66 120.30 -3.64 0.50 N 4 1 CB A TYR 421 ? ? CG A TYR 421 ? ? CD2 A TYR 421 ? ? 117.19 121.00 -3.81 0.60 N 5 1 CB A TYR 495 ? ? CG A TYR 495 ? ? 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A mask was applied to the RBD and antibody Fv region, the remaining signal was subtracted, and the remaining signal was refined locally using cryoSPARC. ; _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.num_particles 96012 _em_3d_reconstruction.resolution 3.3 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details 'Detergent added shortly before freezing' _em_buffer.pH 7.4 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # loop_ _em_entity_assembly.id _em_entity_assembly.parent_id _em_entity_assembly.details _em_entity_assembly.name _em_entity_assembly.source _em_entity_assembly.type _em_entity_assembly.entity_id_list _em_entity_assembly.synonym _em_entity_assembly.oligomeric_details 1 0 'Incubated IgG at 1:2 ratio with Spike trimer for about 15 minutes at room temperature' 'CC6.33 IgG in complex with SARS-2-CoV-6P-Mut7 S protein' 'MULTIPLE SOURCES' COMPLEX '1, 2, 3' ? ? 2 1 ? 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C VAL 36 37 1 Y 1 A TYR 37 ? C TYR 37 38 1 Y 1 A TYR 38 ? C TYR 38 39 1 Y 1 A PRO 39 ? C PRO 39 40 1 Y 1 A ASP 40 ? C ASP 40 41 1 Y 1 A LYS 41 ? C LYS 41 42 1 Y 1 A VAL 42 ? C VAL 42 43 1 Y 1 A PHE 43 ? C PHE 43 44 1 Y 1 A ARG 44 ? C ARG 44 45 1 Y 1 A SER 45 ? C SER 45 46 1 Y 1 A SER 46 ? C SER 46 47 1 Y 1 A VAL 47 ? C VAL 47 48 1 Y 1 A LEU 48 ? C LEU 48 49 1 Y 1 A HIS 49 ? C HIS 49 50 1 Y 1 A SER 50 ? C SER 50 51 1 Y 1 A THR 51 ? C THR 51 52 1 Y 1 A GLN 52 ? C GLN 52 53 1 Y 1 A ASP 53 ? C ASP 53 54 1 Y 1 A LEU 54 ? C LEU 54 55 1 Y 1 A PHE 55 ? C PHE 55 56 1 Y 1 A LEU 56 ? C LEU 56 57 1 Y 1 A PRO 57 ? C PRO 57 58 1 Y 1 A PHE 58 ? C PHE 58 59 1 Y 1 A PHE 59 ? C PHE 59 60 1 Y 1 A SER 60 ? C SER 60 61 1 Y 1 A ASN 61 ? C ASN 61 62 1 Y 1 A VAL 62 ? C VAL 62 63 1 Y 1 A THR 63 ? C THR 63 64 1 Y 1 A TRP 64 ? C TRP 64 65 1 Y 1 A PHE 65 ? C PHE 65 66 1 Y 1 A HIS 66 ? C HIS 66 67 1 Y 1 A ALA 67 ? C ALA 67 68 1 Y 1 A ILE 68 ? C ILE 68 69 1 Y 1 A HIS 69 ? C HIS 69 70 1 Y 1 A VAL 70 ? 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