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'expression tag' 268 78 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details heptameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 7 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 19700 ? 1 MORE -179 ? 1 'SSA (A^2)' 36920 ? # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support homology _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'Homologous to other structures with the same stoichiometry.' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 7 ? LEU A 23 ? SER A 7 LEU A 23 1 ? 17 HELX_P HELX_P2 AA2 LEU A 24 ? LEU A 26 ? LEU A 24 LEU A 26 5 ? 3 HELX_P HELX_P3 AA3 SER A 29 ? ASN A 68 ? SER A 29 ASN A 68 1 ? 40 HELX_P HELX_P4 AA4 ALA A 72 ? THR A 104 ? ALA A 72 THR A 104 1 ? 33 HELX_P HELX_P5 AA5 LYS A 122 ? LEU A 127 ? LYS A 122 LEU A 127 1 ? 6 HELX_P HELX_P6 AA6 LYS A 134 ? LYS A 150 ? LYS A 134 LYS A 150 1 ? 17 HELX_P HELX_P7 AA7 GLN A 151 ? VAL A 153 ? GLN A 151 VAL A 153 5 ? 3 HELX_P HELX_P8 AA8 GLU A 156 ? PHE A 167 ? GLU A 156 PHE A 167 1 ? 12 HELX_P HELX_P9 AA9 GLU A 180 ? GLU A 187 ? GLU A 180 GLU A 187 1 ? 8 HELX_P HELX_P10 AB1 PRO A 190 ? ASN A 219 ? PRO A 190 ASN A 219 1 ? 30 HELX_P HELX_P11 AB2 SER B 7 ? ILE B 28 ? SER B 7 ILE B 28 1 ? 22 HELX_P HELX_P12 AB3 ASP B 31 ? SER B 66 ? ASP B 31 SER B 66 1 ? 36 HELX_P HELX_P13 AB4 ASN B 68 ? ILE B 103 ? ASN B 68 ILE B 103 1 ? 36 HELX_P HELX_P14 AB5 ASN B 119 ? VAL B 129 ? ASN B 119 VAL B 129 1 ? 11 HELX_P HELX_P15 AB6 ASN B 130 ? GLY B 132 ? ASN B 130 GLY B 132 5 ? 3 HELX_P HELX_P16 AB7 GLY B 133 ? TYR B 152 ? GLY B 133 TYR B 152 1 ? 20 HELX_P HELX_P17 AB8 ALA B 158 ? PHE B 167 ? ALA B 158 PHE B 167 1 ? 10 HELX_P HELX_P18 AB9 GLU B 182 ? GLU B 187 ? GLU B 182 GLU B 187 1 ? 6 HELX_P HELX_P19 AC1 PRO B 190 ? ARG B 218 ? PRO B 190 ARG B 218 1 ? 29 HELX_P HELX_P20 AC2 LYS C 9 ? HIS C 36 ? LYS C 9 HIS C 36 1 ? 28 HELX_P HELX_P21 AC3 GLY C 39 ? ALA C 59 ? GLY C 39 ALA C 59 1 ? 21 HELX_P HELX_P22 AC4 ASP C 68 ? VAL C 72 ? ASP C 68 VAL C 72 5 ? 5 HELX_P HELX_P23 AC5 LYS D 9 ? HIS D 36 ? LYS D 9 HIS D 36 1 ? 28 HELX_P HELX_P24 AC6 GLY D 39 ? SER D 58 ? GLY D 39 SER D 58 1 ? 20 HELX_P HELX_P25 AC7 ALA D 59 ? GLU D 61 ? ALA D 59 GLU D 61 5 ? 3 HELX_P HELX_P26 AC8 ASP D 68 ? VAL D 72 ? ASP D 68 VAL D 72 5 ? 5 HELX_P HELX_P27 AC9 GLY E 8 ? HIS E 36 ? GLY E 8 HIS E 36 1 ? 29 HELX_P HELX_P28 AD1 GLY E 39 ? SER E 58 ? GLY E 39 SER E 58 1 ? 20 HELX_P HELX_P29 AD2 ASP E 68 ? VAL E 72 ? ASP E 68 VAL E 72 5 ? 5 HELX_P HELX_P30 AD3 LYS F 9 ? HIS F 36 ? LYS F 9 HIS F 36 1 ? 28 HELX_P HELX_P31 AD4 GLY F 39 ? ALA F 59 ? GLY F 39 ALA F 59 1 ? 21 HELX_P HELX_P32 AD5 LYS G 9 ? HIS G 36 ? LYS G 9 HIS G 36 1 ? 28 HELX_P HELX_P33 AD6 GLY G 39 ? ALA G 59 ? GLY G 39 ALA G 59 1 ? 21 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # _struct_sheet.id AA1 _struct_sheet.type ? _struct_sheet.number_strands 2 _struct_sheet.details ? # _struct_sheet_order.sheet_id AA1 _struct_sheet_order.range_id_1 1 _struct_sheet_order.range_id_2 2 _struct_sheet_order.offset ? _struct_sheet_order.sense anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 LYS A 172 ? VAL A 174 ? LYS A 172 VAL A 174 AA1 2 VAL A 177 ? ILE A 179 ? VAL A 177 ILE A 179 # _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id AA1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id N _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id LYS _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id A _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id 172 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code ? _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id N _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id LYS _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id A _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id 172 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id O _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id ILE _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id A _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id 179 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code ? _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id O _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id ILE _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id A _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id 179 # _pdbx_validate_close_contact.id 1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num 1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 OH _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 B _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 TYR _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 58 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 ? _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 ? _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 OE2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 B _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 GLU _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 209 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 ? _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 ? _pdbx_validate_close_contact.dist 2.12 # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 PRO A 69 ? ? -76.71 44.71 2 1 ARG A 120 ? ? 73.27 -8.67 3 1 LEU A 128 ? ? 76.62 -18.63 4 1 ASN A 130 ? ? -134.61 -53.94 5 1 GLU A 155 ? ? 39.37 40.95 6 1 PHE A 167 ? ? -109.48 40.28 7 1 ASP A 176 ? ? 78.73 -11.52 8 1 ARG B 120 ? ? -64.02 5.07 9 1 ASP B 154 ? ? -94.81 50.69 10 1 HIS D 36 ? ? 60.97 61.24 11 1 PRO G 74 ? ? -59.37 176.66 # _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.entry_id 7SAU _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest ? _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details 'C-terminal TEV cleavage site and TwinStrep Tag' _pdbx_entry_details.source_details ? # _em_3d_fitting.entry_id 7SAU _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.details ;A homology model based on the structure of FjoGldLM (PDB 6YS8) was used as a starting model and modified to fit the EM density using Coot. Refinement was carried out using Phenix. ; _em_3d_fitting.overall_b_value 72.16 _em_3d_fitting.ref_protocol 'AB INITIO MODEL' _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 7SAU _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.num_particles 394678 _em_3d_reconstruction.resolution 3.0 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 8.0 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.name 'Type IX Secretion System/gliding motility GldLM motor complex' _em_entity_assembly.source RECOMBINANT _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.entity_id_list 1,2 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 7SAU _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.cryogen ? _em_imaging.details ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.nominal_defocus_max ? _em_imaging.nominal_defocus_min ? _em_imaging.nominal_magnification ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.specimen_holder_type ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details '15 mA' _em_sample_support.grid_material GOLD _em_sample_support.grid_mesh_size 300 _em_sample_support.grid_type 'Quantifoil R1.2/1.3' _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? # _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.chamber_temperature 277.15 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.details ;Wait time 10 s Blot time 2 s ; _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.entry_id 7SAU _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 7SAU _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 7SAU _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A MET 1 ? 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