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_citation.journal_id_ISSN 1476-4687 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 609 _citation.language ? _citation.page_first 835 _citation.page_last 845 _citation.title 'Structures of a phycobilisome in light-harvesting and photoprotected states.' _citation.year 2022 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41586-022-05156-4 _citation.pdbx_database_id_PubMed 36045294 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Dominguez-Martin, M.A.' 1 ? primary 'Sauer, P.V.' 2 ? primary 'Kirst, H.' 3 ? primary 'Sutter, M.' 4 ? primary 'Bina, D.' 5 ? primary 'Greber, B.J.' 6 ? primary 'Nogales, E.' 7 ? primary 'Polivka, T.' 8 ? primary 'Kerfeld, C.A.' 9 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules 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CIRDLDYYLRYATYAMLAGDASILDERVLNGLKETYNSLGVPISSTVQAIQAIKEVTASLVGADAGKEMGVYLDYICSGL S ; AB,AD,AF,AI,AL,AO,AQ,AS,AV,AX,AZ ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MSVVSQVILQADDQLRYPTSGELKGIQAFLTTGAQRIRIAETLAENEKKIVDQAQKQLFKKHPEYRAPGGNAYGQRQYNQ CLRDYGWYLRLVTYGVLAGNKEPIETTGLIGVKEMYNSLNVPVPGMVDAVTVLKDAALGLLSAEDANETAPYFDYIIQFM S ; ;MSVVSQVILQADDQLRYPTSGELKGIQAFLTTGAQRIRIAETLAENEKKIVDQAQKQLFKKHPEYRAPGGNAYGQRQYNQ CLRDYGWYLRLVTYGVLAGNKEPIETTGLIGVKEMYNSLNVPVPGMVDAVTVLKDAALGLLSAEDANETAPYFDYIIQFM S ; AE ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MRDAVTTLIKNYDLTGRYLDRNAMDELKAYFESGSARIAAAAMINANSATIVKRAAAQLFEEIPELIRPSGNAYTTRRFS ACLRDMDYYLRYASYALIAADNNVLDERVLQGLRETYNSLGVPIGPTVRGIQIMKEMIEAMAEDSSLNSTDFIASPFDHM TRELSELSV ; ;MRDAVTTLIKNYDLTGRYLDRNAMDELKAYFESGSARIAAAAMINANSATIVKRAAAQLFEEIPELIRPSGNAYTTRRFS ACLRDMDYYLRYASYALIAADNNVLDERVLQGLRETYNSLGVPIGPTVRGIQIMKEMIEAMAEDSSLNSTDFIASPFDHM TRELSELSV ; AK ? 5 'polypeptide(L)' no no MRMFRITACVPSQTRIRTQRELQNTYFTKLVPYDNWFREQQRIMKMGGKIVKVELATGRPGTNAGLA MRMFRITACVPSQTRIRTQRELQNTYFTKLVPYDNWFREQQRIMKMGGKIVKVELATGRPGTNAGLA BB,BC ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MSVKASGGSSLARPQLYQTVPVSAISQAEQQDRFLEGSELNELTAYFQSGALRLEIAETLTQNADLIVSRAANRIFTGGS PLSYLEKPVERQPALVGASSDSRNGSVTYAESNGSGGLFGGLRSVFSSTGPIPPGFRPINIARYGPSNMQKSLRDMSWFL RYTTYAIVAGDPNIIVVNTRGLKEVIENACSIDATIVAIQEMRAASADYFRNNAQAKEIVLQYFDILLSEFKAPTPANKV RQGPSNDIQGLELPQSYFNAAAKRQKYAMKPGLSALEKNAVIKAAYRQIFERDITKAYSQSISYLESQVRNGDISMKEFV RRLAKSPLYRKQFFEPFINSRALELAFRHILGRGPSSREEVQKYFSIVSSGGLPALVDALVDSQEYADYFGEETVPYLRG LGVEAQECRNWGMQQDLFSYSAPFRKVPQFITTFAQYDRPLPDQHVYGSGNDPLEIQFGAIFPKETRNPSKRPAPFNKDT KRILIHRGPAVNNQVGNPSAVGEFPGSLGAKVFRLNGGLPGAKVGKNTGTSVKFGESSTQALIRAAYRQVFGRDLYEGQR LSVAEIQLENGDISVREFIKRLAKSELFLKLYWAPHYVCKAIEYMHRRLLGRPTYGRQEMNQYFDIASKQGFYAVVEAMI DSKEYSDAFGEDTVPYERYLTPGGLQMRSARVGSLREDIGQRVDKEVTPRFVELGQVSAIRTEPEIAYRSNQGVTRQRQQ TKVFKLVSTYDKVAVKNAIRAAYRQVFERDLEPYIINSEFTALESKLSNNEINVKEFIEGLGTSELYMKEFYAPYPNTKV IEMGTKHFLGRAPLNQKEIQQYNQILASQGLKAFIGAMVNGMEYLQTFGEDTVPYRRFPTLPAANFPNTERLYNKLTKQD 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;MALPLLNYAPKSQNVRVEGYEIGSEEKPVVFTTENILSSSDMDNLIEAAYRQIFFHAFKWDREKVLESQLRNGQITVRDF VRGLLLSNTFRNSFYEKNSNYRFVEHCVQKILGRDVYSEREKIAWSIVVATKGYQGLIDDLLNSDEYLNNFGYDTVPYQR RRNLPGREAGELPFNIKSPRYDAYHRRQLGFPQIVWQNEVRRFIPQEKKLTAGNPMNFLGMARSINPAANTIPKVSAQNI NIEASVPRR ; ;MALPLLNYAPKSQNVRVEGYEIGSEEKPVVFTTENILSSSDMDNLIEAAYRQIFFHAFKWDREKVLESQLRNGQITVRDF VRGLLLSNTFRNSFYEKNSNYRFVEHCVQKILGRDVYSEREKIAWSIVVATKGYQGLIDDLLNSDEYLNNFGYDTVPYQR RRNLPGREAGELPFNIKSPRYDAYHRRQLGFPQIVWQNEVRRFIPQEKKLTAGNPMNFLGMARSINPAANTIPKVSAQNI NIEASVPRR ; BG ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MPFTIDSARGIFPNTLAADVVPATIARFSQLNAEDQLALIWFAYLEMGKTLTIAAPGAASMQLAENALKEIQAMGPLQQT QAMCDLANRADTPLCRTYASWSPNIKLGFWYRLGELMEQGFVAPIPAGYQLSANANAVLATIQGLESGQQITVLRNAVVD MGFTAGKDGKRIAEPVVPPQDTASRTKVSIEGVTNATVLNYMDNLNANDFDTLIELFTSDGALQPPFQRPIVGKENVLRF FREECQNLKLIPERGVTEPAEDGFTQIKVTGKVQTPWFGGNVGMNIAWRFLLNPEGKIFFVAIDLLASPKELLNFAR ; ;MPFTIDSARGIFPNTLAADVVPATIARFSQLNAEDQLALIWFAYLEMGKTLTIAAPGAASMQLAENALKEIQAMGPLQQT QAMCDLANRADTPLCRTYASWSPNIKLGFWYRLGELMEQGFVAPIPAGYQLSANANAVLATIQGLESGQQITVLRNAVVD MGFTAGKDGKRIAEPVVPPQDTASRTKVSIEGVTNATVLNYMDNLNANDFDTLIELFTSDGALQPPFQRPIVGKENVLRF FREECQNLKLIPERGVTEPAEDGFTQIKVTGKVQTPWFGGNVGMNIAWRFLLNPEGKIFFVAIDLLASPKELLNFAR ; BH ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MLKKLFGAKKEFYVQLDESQAPAQVEEADVAIVKSEVAPVEKPAPTTSKKTSIKKKSATKAAAPVETPASAPVAPAPKAK VDPSQVAFASGDPIPQNVARRTPGPSLNRFKEMARQVKVKR ; ;MLKKLFGAKKEFYVQLDESQAPAQVEEADVAIVKSEVAPVEKPAPTTSKKTSIKKKSATKAAAPVETPASAPVAPAPKAK VDPSQVAFASGDPIPQNVARRTPGPSLNRFKEMARQVKVKR ; BI ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 10 PHYCOCYANOBILIN CYC 11 "beta,beta-carotene-4,4'-dione" 45D # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 SER n 1 3 ILE n 1 4 VAL n 1 5 THR n 1 6 LYS n 1 7 SER n 1 8 ILE n 1 9 VAL n 1 10 ASN n 1 11 ALA n 1 12 ASP n 1 13 ALA n 1 14 GLU n 1 15 ALA n 1 16 ARG n 1 17 TYR n 1 18 LEU n 1 19 SER n 1 20 PRO n 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BB N N 11 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP PHAA_SYNY3 Q01951 ? 1 ;MSIVTKSIVNADAEARYLSPGELDRIKAFVTGGAARLRIAETLTGSRETIVKQAGDRLFQKRPDIVSPGGNAYGEEMTAT CLRDMDYYLRLVTYGVVSGDVTPIEEIGLVGVREMYRSLGTPIEAVAQSVREMKEVASGLMSSDDAAEASAYFDFVIGKM S ; 1 2 UNP APCB_SYNY3 Q01952 ? 2 ;MQDAITAVINSADVQGKYLDGAAMDKLKSYFASGELRVRAASVISANAATIVKEAVAKSLLYSDVTRPGGNMYTTRRYAA CIRDLDYYLRYATYAMLAGDASILDERVLNGLKETYNSLGVPISSTVQAIQAIKEVTASLVGADAGKEMGVYLDYICSGL S ; 1 3 UNP APCD_SYNY3 P72870 ? 3 ;MSVVSQVILQADDQLRYPTSGELKGIQAFLTTGAQRIRIAETLAENEKKIVDQAQKQLFKKHPEYRAPGGNAYGQRQYNQ CLRDYGWYLRLVTYGVLAGNKEPIETTGLIGVKEMYNSLNVPVPGMVDAVTVLKDAALGLLSAEDANETAPYFDYIIQFM S ; 1 4 UNP APCF_SYNY3 P74551 ? 4 ;MRDAVTTLIKNYDLTGRYLDRNAMDELKAYFESGSARIAAAAMINANSATIVKRAAAQLFEEIPELIRPSGNAYTTRRFS ACLRDMDYYLRYASYALIAADNNVLDERVLQGLRETYNSLGVPIGPTVRGIQIMKEMIEAMAEDSSLNSTDFIASPFDHM TRELSELSV ; 1 5 UNP PYC1_SYNY3 Q01950 ? 5 MRMFRITACVPSQTRIRTQRELQNTYFTKLVPYDNSFREQQRIMKMGGKIVKVELATGRPGTNAGLA 1 6 UNP APCE_SYNY3 Q55544 ? 6 ;MSVKASGGSSLARPQLYQTVPVSAISQAEQQDRFLEGSELNELTAYFQSGALRLEIAETLTQNADLIVSRAANRIFTGGS PLSYLEKPVERQPALVGASSDSRNGSVTYAESNGSGGLFGGLRSVFSSTGPIPPGFRPINIARYGPSNMQKSLRDMSWFL RYTTYAIVAGDPNIIVVNTRGLKEVIENACSIDATIVAIQEMRAASADYFRNNAQAKEIVLQYFDILLSEFKAPTPANKV RQGPSNDIQGLELPQSYFNAAAKRQKYAMKPGLSALEKNAVIKAAYRQIFERDITKAYSQSISYLESQVRNGDISMKEFV RRLAKSPLYRKQFFEPFINSRALELAFRHILGRGPSSREEVQKYFSIVSSGGLPALVDALVDSQEYADYFGEETVPYLRG LGVEAQECRNWGMQQDLFSYSAPFRKVPQFITTFAQYDRPLPDQHVYGSGNDPLEIQFGAIFPKETRNPSKRPAPFNKDT KRILIHRGPAVNNQVGNPSAVGEFPGSLGAKVFRLNGGLPGAKVGKNTGTSVKFGESSTQALIRAAYRQVFGRDLYEGQR LSVAEIQLENGDISVREFIKRLAKSELFLKLYWAPHYVCKAIEYMHRRLLGRPTYGRQEMNQYFDIASKQGFYAVVEAMI DSKEYSDAFGEDTVPYERYLTPGGLQMRSARVGSLREDIGQRVDKEVTPRFVELGQVSAIRTEPEIAYRSNQGVTRQRQQ TKVFKLVSTYDKVAVKNAIRAAYRQVFERDLEPYIINSEFTALESKLSNNEINVKEFIEGLGTSELYMKEFYAPYPNTKV IEMGTKHFLGRAPLNQKEIQQYNQILASQGLKAFIGAMVNGMEYLQTFGEDTVPYRRFPTLPAANFPNTERLYNKLTKQD KELVVPSFTPVVKVGG ; 1 7 UNP PYG_SYNY3 P73093 ? 7 ;MALPLLNYAPKSQNVRVEGYEIGSEEKPVVFTTENILSSSDMDNLIEAAYRQIFFHAFKWDREKVLESQLRNGQITVRDF VRGLLLSNTFRNSFYEKNSNYRFVEHCVQKILGRDVYSEREKIAWSIVVATKGYQGLIDDLLNSDEYLNNFGYDTVPYQR RRNLPGREAGELPFNIKSPRYDAYHRRQLGFPQIVWQNEVRRFIPQEKKLTAGNPMNFLGMARSINPAANTIPKVSAQNI NIEASVPRR ; 1 8 UNP OCP_SYNY3 P74102 ? 8 ;MPFTIDSARGIFPNTLAADVVPATIARFSQLNAEDQLALIWFAYLEMGKTLTIAAPGAASMQLAENALKEIQAMGPLQQT QAMCDLANRADTPLCRTYASWSPNIKLGFWYRLGELMEQGFVAPIPAGYQLSANANAVLATIQGLESGQQITVLRNAVVD MGFTAGKDGKRIAEPVVPPQDTASRTKVSIEGVTNATVLNYMDNLNANDFDTLIELFTSDGALQPPFQRPIVGKENVLRF FREECQNLKLIPERGVTEPAEDGFTQIKVTGKVQTPWFGGNVGMNIAWRFLLNPEGKIFFVAIDLLASPKELLNFAR ; 1 9 UNP P74135_SYNY3 P74135 ? 9 ;MLKKLFGAKKEFYVQLDESQAPAQVEEADVAIVKSEVAPVEKPAPTTSKKTSIKKKSATKAAAPVETPASAPVAPAPKAK VDPSQVAFASGDPIPQNVARRTPGPSLNRFKEMARQVKVKR ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7SCB AA 1 ? 161 ? 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UNP Q01950 SER 36 conflict 36 2 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 29-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 29 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list ;A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB ; # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 2 ? 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