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;YEHATTMPSQAGISYNTIVNRAGYAPLPISITPTKIKLIPTVNLEYVTCHYKTGMDSPAIKCCGSQECTPTYRPDEQCKV FTGVYPFMWGGAYCFCDTENTQVSKAYVMKSDDCLADHAEAYKAHTASVQAFLNITVGEHSIVTTVYVNGETPVNFNGVK ITAGPLSTAWTPFDRKIVQYAGEIYNYDFPEYGAGQPGAFGDIQSRTVSSSDLYANTNLVLQRPKAGAIHVPYTQAPSGF EQWKKDKAPSLKFTAPFGCEIYTNPIRAENCAVGSIPLAFDIPDALFTRVSETPTLSAAECTLNECVYSSDFGGIATVKY SASKSGKCAVHVPSGTATLKEAAVELTEQGSATIHFSTANIHPEFRLQICTSYVTCKGDCHPPKDHIVTHPQYHAQTFTA AVSKTAWTWLTSLLGGSAVIIIIGLVLATIVAMYVLTNQKHN ; A,D,G,J ? 2 'polypeptide(L)' no no ;STEELFNEYKLTRPYMARCIRCAVGSCHSPIAIEAVKSDGHDGYVRLQTSSQYGLDSSGNLKGRTMRYDMHGTIKEIPLH QVSLYTSRPCHIVDGHGYFLLARCPAGDSITMEFKKDSVRHSCSVPYEVKFNPVGRELYTHPPEHGVEQACQVYAHDAQN RGAYVEMHLPGSEVDSSLVSLSGSSVTVTPPDGTSALVECECGGTKISETINKTKQFSQCTKKEQCRAYRLQNDKWVYNS DKLPKAAGATLKGKLHVPFLLADGKCTVPLAPEPMITFGFRSVSLKLHPKNPTYLITRQLADEPHYTHELISEPAVRNFT VTEKGWEFVWGNHPPKRFWAQETAPGNPHGLPHEVITHYYHRYPMSTILGLSICAAIATVSVAASTWLFCRSRVACLTPY RLTPNARIPFCLAVLCCARTARA ; ;STEELFNEYKLTRPYMARCIRCAVGSCHSPIAIEAVKSDGHDGYVRLQTSSQYGLDSSGNLKGRTMRYDMHGTIKEIPLH 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ALA n 1 125 HIS n 1 126 THR n 1 127 ALA n 1 128 SER n 1 129 VAL n 1 130 GLN n 1 131 ALA n 1 132 PHE n 1 133 LEU n 1 134 ASN n 1 135 ILE n 1 136 THR n 1 137 VAL n 1 138 GLY n 1 139 GLU n 1 140 HIS n 1 141 SER n 1 142 ILE n 1 143 VAL n 1 144 THR n 1 145 THR n 1 146 VAL n 1 147 TYR n 1 148 VAL n 1 149 ASN n 1 150 GLY n 1 151 GLU n 1 152 THR n 1 153 PRO n 1 154 VAL n 1 155 ASN n 1 156 PHE n 1 157 ASN n 1 158 GLY n 1 159 VAL n 1 160 LYS n 1 161 ILE n 1 162 THR n 1 163 ALA n 1 164 GLY n 1 165 PRO n 1 166 LEU n 1 167 SER n 1 168 THR n 1 169 ALA n 1 170 TRP n 1 171 THR n 1 172 PRO n 1 173 PHE n 1 174 ASP n 1 175 ARG n 1 176 LYS n 1 177 ILE n 1 178 VAL n 1 179 GLN n 1 180 TYR n 1 181 ALA n 1 182 GLY n 1 183 GLU n 1 184 ILE n 1 185 TYR n 1 186 ASN n 1 187 TYR n 1 188 ASP n 1 189 PHE n 1 190 PRO n 1 191 GLU n 1 192 TYR n 1 193 GLY n 1 194 ALA n 1 195 GLY n 1 196 GLN n 1 197 PRO n 1 198 GLY n 1 199 ALA n 1 200 PHE n 1 201 GLY n 1 202 ASP n 1 203 ILE n 1 204 GLN n 1 205 SER n 1 206 ARG n 1 207 THR 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_entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample 'Biological sequence' 1 442 VEEV ? ? ? 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P05674 1 ? 275 ? 1 275 13 4 7SFW M 1 ? 122 ? 7SFW 1 ? 122 ? 1 122 14 5 7SFW N 1 ? 107 ? 7SFW 2 ? 109 ? 2 109 15 4 7SFW O 1 ? 122 ? 7SFW 1 ? 122 ? 1 122 16 5 7SFW P 1 ? 107 ? 7SFW 2 ? 109 ? 2 109 17 4 7SFW Q 1 ? 122 ? 7SFW 1 ? 122 ? 1 122 18 5 7SFW R 1 ? 107 ? 7SFW 2 ? 109 ? 2 109 19 4 7SFW S 1 ? 122 ? 7SFW 1 ? 122 ? 1 122 20 5 7SFW T 1 ? 107 ? 7SFW 2 ? 109 ? 2 109 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;N-acetyl-beta-D-glucosamine; 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-glucose; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE ; 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.5990 ? 53924 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0448 ? 6007 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0052 ? 6912 ? f_plane_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 6.4969 ? 5480 ? f_dihedral_angle_d ? ? # _struct.entry_id 7SFW _struct.title ;CryoEM structure of Venezuelan Equine Encephalitis virus (VEEV) TC-83 strain VLP in complex with Fab hVEEV-63 (focus refine of the asymmetric unit) ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7SFW _struct_keywords.text 'VLP, VEEV, viral protein, fab, VIRUS-IMMUNE SYSTEM complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRUS/IMMUNE SYSTEM' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 1 ? E N N 2 ? F N N 3 ? G N N 1 ? H N N 2 ? I N N 3 ? J N N 1 ? K N N 2 ? 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O CYS 22 SG ? ? ? 1_555 O CYS 96 SG ? ? O CYS 22 O CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf56 disulf ? ? P CYS 21 SG ? ? ? 1_555 P CYS 86 SG ? ? P CYS 22 P CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf57 disulf ? ? Q CYS 22 SG ? ? ? 1_555 Q CYS 96 SG ? ? Q CYS 22 Q CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf58 disulf ? ? R CYS 21 SG ? ? ? 1_555 R CYS 86 SG ? ? R CYS 22 R CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf59 disulf ? ? S CYS 22 SG ? ? ? 1_555 S CYS 96 SG ? ? S CYS 22 S CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf60 disulf ? ? T CYS 21 SG ? ? ? 1_555 T CYS 86 SG ? ? T CYS 22 T CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? covale1 covale one ? A ASN 134 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? A ASN 134 A NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? B ASN 318 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? B ASN 318 B NAG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.430 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? D ASN 134 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? D ASN 134 D NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? G ASN 134 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? G ASN 134 G NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? H ASN 318 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? H ASN 318 H NAG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? J ASN 134 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? J ASN 134 J NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? K ASN 318 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? K ASN 318 K NAG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLY 164 A . ? GLY 164 A PRO 165 A ? PRO 165 A 1 1.46 2 ASN 264 A . ? ASN 264 A PRO 265 A ? PRO 265 A 1 -1.96 3 GLY 164 D . ? GLY 164 D PRO 165 D ? PRO 165 D 1 0.77 4 ASN 264 D . ? 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anti-parallel AD6 3 4 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD7 3 4 ? anti-parallel AD7 4 5 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AD9 3 4 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE2 2 3 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE4 2 3 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE5 3 4 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE6 2 3 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE7 2 3 ? anti-parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE8 2 3 ? anti-parallel AE8 3 4 ? anti-parallel AE8 4 5 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AE9 2 3 ? anti-parallel AE9 3 4 ? anti-parallel AE9 4 5 ? anti-parallel AE9 5 6 ? anti-parallel AE9 6 7 ? anti-parallel AE9 7 8 ? anti-parallel AF1 1 2 ? anti-parallel AF1 2 3 ? anti-parallel AF1 3 4 ? anti-parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF2 2 3 ? anti-parallel AF2 3 4 ? anti-parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF3 2 3 ? anti-parallel AF3 3 4 ? anti-parallel AF3 4 5 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF4 2 3 ? anti-parallel AF4 3 4 ? anti-parallel AF4 4 5 ? anti-parallel AF5 1 2 ? anti-parallel AF5 2 3 ? anti-parallel AF6 1 2 ? anti-parallel AF6 2 3 ? anti-parallel AF7 1 2 ? anti-parallel AF8 1 2 ? anti-parallel AF9 1 2 ? anti-parallel AF9 2 3 ? anti-parallel AF9 3 4 ? anti-parallel AG1 1 2 ? anti-parallel AG2 1 2 ? anti-parallel AG3 1 2 ? anti-parallel AG3 2 3 ? anti-parallel AG3 3 4 ? anti-parallel AG3 4 5 ? anti-parallel AG4 1 2 ? anti-parallel AG5 1 2 ? anti-parallel AG5 2 3 ? anti-parallel AG5 3 4 ? anti-parallel AG6 1 2 ? anti-parallel AG6 2 3 ? anti-parallel AG6 3 4 ? anti-parallel AG6 4 5 ? anti-parallel AG6 5 6 ? anti-parallel AG7 1 2 ? anti-parallel AG8 1 2 ? anti-parallel AG8 2 3 ? anti-parallel AG9 1 2 ? anti-parallel AG9 2 3 ? anti-parallel AG9 3 4 ? anti-parallel AH1 1 2 ? anti-parallel AH1 2 3 ? anti-parallel AH2 1 2 ? anti-parallel AH2 2 3 ? anti-parallel AH3 1 2 ? anti-parallel AH3 2 3 ? 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anti-parallel AI9 3 4 ? anti-parallel AJ1 1 2 ? anti-parallel AJ1 2 3 ? anti-parallel AJ2 1 2 ? anti-parallel AJ2 2 3 ? anti-parallel AJ3 1 2 ? anti-parallel AJ4 1 2 ? anti-parallel AJ4 2 3 ? anti-parallel AJ5 1 2 ? anti-parallel AJ5 2 3 ? anti-parallel AJ5 3 4 ? anti-parallel AJ6 1 2 ? anti-parallel AJ6 2 3 ? anti-parallel AJ7 1 2 ? anti-parallel AJ7 2 3 ? anti-parallel AJ8 1 2 ? anti-parallel AJ8 2 3 ? anti-parallel AJ8 3 4 ? anti-parallel AJ8 4 5 ? anti-parallel AJ8 5 6 ? anti-parallel AJ9 1 2 ? anti-parallel AJ9 2 3 ? anti-parallel AJ9 3 4 ? anti-parallel AJ9 4 5 ? anti-parallel AK1 1 2 ? anti-parallel AK1 2 3 ? anti-parallel AK2 1 2 ? anti-parallel AK2 2 3 ? anti-parallel AK2 3 4 ? anti-parallel AK3 1 2 ? anti-parallel AK3 2 3 ? anti-parallel AK3 3 4 ? anti-parallel AK4 1 2 ? parallel AK4 2 3 ? anti-parallel AK4 3 4 ? anti-parallel AK4 4 5 ? anti-parallel AK5 1 2 ? parallel AK5 2 3 ? anti-parallel AK5 3 4 ? anti-parallel AK6 1 2 ? anti-parallel AK6 2 3 ? anti-parallel AK7 1 2 ? anti-parallel AK7 2 3 ? anti-parallel AK7 3 4 ? anti-parallel AK8 1 2 ? anti-parallel AK8 2 3 ? anti-parallel AK8 3 4 ? anti-parallel AK9 1 2 ? parallel AK9 2 3 ? anti-parallel AK9 3 4 ? anti-parallel AK9 4 5 ? anti-parallel AK9 5 6 ? anti-parallel AL1 1 2 ? parallel AL1 2 3 ? anti-parallel AL1 3 4 ? anti-parallel AL2 1 2 ? parallel AL2 2 3 ? anti-parallel AL2 3 4 ? anti-parallel AL2 4 5 ? anti-parallel AL3 1 2 ? parallel AL3 2 3 ? anti-parallel AL3 3 4 ? anti-parallel AL4 1 2 ? anti-parallel AL4 2 3 ? anti-parallel AL5 1 2 ? anti-parallel AL5 2 3 ? anti-parallel AL5 3 4 ? anti-parallel AL6 1 2 ? anti-parallel AL6 2 3 ? anti-parallel AL6 3 4 ? anti-parallel AL7 1 2 ? anti-parallel AL7 2 3 ? anti-parallel AL7 3 4 ? anti-parallel AL7 4 5 ? anti-parallel AL8 1 2 ? parallel AL8 2 3 ? anti-parallel AL8 3 4 ? anti-parallel AL8 4 5 ? anti-parallel AL9 1 2 ? parallel AL9 2 3 ? anti-parallel AL9 3 4 ? anti-parallel AM1 1 2 ? anti-parallel AM1 2 3 ? anti-parallel AM2 1 2 ? parallel AM2 2 3 ? anti-parallel AM2 3 4 ? anti-parallel AM2 4 5 ? 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