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'X-RAY DIFFRACTION' 8.256 11.630 . . 134 2440 99.9612 . . . 0.164 . 0.126 . . . . . . . . . . . # _struct.entry_id 7SR6 _struct.title 'Human Endogenous Retrovirus (HERV-K) reverse transcriptase ternary complex with dsDNA template Primer and dNTP' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7SR6 _struct_keywords.text 'reverse transcriptase RT dCTP dTTP dsDNA template primer, REPLICATION' _struct_keywords.pdbx_keywords REPLICATION # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 3 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 2 ? H N N 3 ? I N N 4 ? J N N 5 ? K N N 6 ? L N N 6 ? M N N 6 ? N N N 6 ? O N N 6 ? P N N 7 ? Q N N 8 ? R N N 8 ? S N N 8 ? T N N 4 ? U N N 6 ? V N N 6 ? W N N 6 ? X N N 6 ? Y N N 9 ? Z N N 6 ? AA N N 6 ? BA N N 6 ? 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ZB N N 12 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP V9H0F6_HUMAN V9H0F6 ? 1 ;KSRKRRNRVSFLGAATVEPPKPIPLTWKTEKPVWVNQWPLPKQKLEALHLLANEQLEKGHIEPSFSPWNSPVFVIQKKSG KWRMLTDLRAVNALIQPMGPLQPGLPSPAMIPKDWPLIIIDLKDCFFTIPLAEQDCEKFAFTIPAINNKEPATRFQWKVL PQGMLNSPTICQTFVGRALQPVREKFSDCYIIHYIDDILCAAETKDKLIDCYTFLQAEVANAGLAIASDKIQTSTPFHYL GMQIENRKIKPQKIEIRKDTLKTLNDFQKLLGDINWIRPTLGIPTYAMSNLFSILRGDSDLNSKRILTPEATKEIKLVEE KIQSAQINRIGPLAPLQLLIFATAHSPTGIIIQNTDLVEWSFLPHSTVKTFTLYLDQIATLIGQTRLRITKLCGNDPDKI VVPLTKEQVRQAFINSGAWQIGLANFVGIIDNHYPKTKIFQFLKLTTWILPKITRCEPLENALTVFTDGSSNGKAAYTGP KERVIKTPYQSAQRAELVAVITVLQDFDQPINIISDSAYVVQATRDVETALIKYSMDDQLNQLFNLLQQTVRKRNFPFYI THIRAHTNLPGPLTKANEQADLLVSSALIKAQELHA ; 1 2 PDB 7SR6 7SR6 ? 2 ? 1 3 PDB 7SR6 7SR6 ? 3 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7SR6 A 23 ? 618 ? 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'expression tag' 0 88 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_and_software_defined_assembly PISA tetrameric 4 2 author_and_software_defined_assembly PISA tetrameric 4 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 18040 ? 1 MORE 11 ? 1 'SSA (A^2)' 49750 ? 2 'ABSA (A^2)' 18360 ? 2 MORE -22 ? 2 'SSA (A^2)' 49490 ? # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,B,C,D,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,TB,UB,VB,WB 2 1 E,F,G,H,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,XB,YB,ZB # loop_ _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 1 1 'gel filtration' ? 2 2 'gel filtration' ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 PRO A 63 ? 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THR F 204 ALA F 222 1 ? 19 HELX_P HELX_P44 AE8 ALA E 249 ? ILE E 253 ? ALA F 227 ILE F 231 5 ? 5 HELX_P HELX_P45 AE9 THR E 285 ? GLY E 304 ? THR F 263 GLY F 282 1 ? 20 HELX_P HELX_P46 AF1 PRO E 306 ? ALA E 309 ? PRO F 284 ALA F 287 5 ? 4 HELX_P HELX_P47 AF2 MET E 310 ? LEU E 317 ? MET F 288 LEU F 295 1 ? 8 HELX_P HELX_P48 AF3 THR E 330 ? ALA E 347 ? THR F 308 ALA F 325 1 ? 18 HELX_P HELX_P49 AF4 TYR E 396 ? GLY E 416 ? TYR F 374 GLY F 394 1 ? 21 HELX_P HELX_P50 AF5 THR E 427 ? SER E 438 ? THR F 405 SER F 416 1 ? 12 HELX_P HELX_P51 AF6 SER E 438 ? LEU E 445 ? SER F 416 LEU F 423 1 ? 8 HELX_P HELX_P52 AF7 SER E 513 ? PHE E 529 ? SER F 491 PHE F 507 1 ? 17 HELX_P HELX_P53 AF8 SER E 539 ? VAL E 549 ? SER F 517 VAL F 527 1 ? 11 HELX_P HELX_P54 AF9 ASP E 559 ? LYS E 575 ? ASP F 537 LYS F 553 1 ? 17 HELX_P HELX_P55 AG1 GLY E 593 ? LEU E 605 ? GLY F 571 LEU F 583 1 ? 13 HELX_P HELX_P56 AG2 PRO F 63 ? LYS F 80 ? PRO G 41 LYS G 58 1 ? 18 HELX_P HELX_P57 AG3 LEU F 110 ? ALA F 115 ? 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MG ? ? ? 1_555 J DCP . O1A ? ? A MG 601 A DCP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.157 ? ? metalc8 metalc ? ? I MG . MG ? ? ? 1_555 J DCP . O3B ? ? A MG 601 A DCP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? ? metalc9 metalc ? ? I MG . MG ? ? ? 1_555 J DCP . O2G ? ? A MG 601 A DCP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.704 ? ? metalc10 metalc ? ? C DC 6 "O4'" ? ? ? 1_555 JA K . K ? ? D DC 7 D K 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.250 ? ? metalc11 metalc ? ? C DA 11 "O4'" ? ? ? 1_555 KA K . K ? ? D DA 12 D K 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.351 ? ? metalc12 metalc ? ? E GLN 124 O ? ? ? 1_555 GB K . K ? ? F GLN 102 F K 621 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.324 ? ? metalc13 metalc ? ? E ASP 143 OD1 ? ? ? 1_555 NA MG . MG ? ? F ASP 121 F MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.884 ? ? metalc14 metalc ? ? E ASP 143 OD2 ? ? ? 1_555 NA MG . MG ? ? F ASP 121 F MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.643 ? ? metalc15 metalc ? ? E LEU 144 O ? ? ? 1_555 NA MG . MG ? ? F LEU 122 F MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.195 ? ? metalc16 metalc ? ? E ASP 218 OD2 ? ? ? 1_555 NA MG . MG ? ? F ASP 196 F MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.182 ? ? metalc17 metalc ? ? NA MG . MG ? ? ? 1_555 QA TTP . O2B ? ? F MG 602 F TTP 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.015 ? ? metalc18 metalc ? ? NA MG . MG ? ? ? 1_555 QA TTP . O1G ? ? F MG 602 F TTP 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.112 ? ? metalc19 metalc ? ? NA MG . MG ? ? ? 1_555 QA TTP . O1A ? ? F MG 602 F TTP 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.155 ? ? metalc20 metalc ? ? F ARG 111 O ? ? ? 1_555 SB MG . MG ? ? G ARG 89 G MG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.995 ? ? metalc21 metalc ? ? F VAL 449 O ? ? ? 1_555 SB MG . MG ? ? G VAL 427 G MG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.116 ? ? metalc22 metalc ? ? F GLY 450 O ? ? ? 1_555 SB MG . MG ? ? G GLY 428 G MG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.794 ? ? hydrog1 hydrog ? ? C DA 4 N1 ? ? ? 1_555 D DT 21 N3 ? ? D DA 5 E DT 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? C DA 4 N6 ? ? ? 1_555 D DT 21 O4 ? ? D DA 5 E DT 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? C DC 5 N3 ? ? ? 1_555 D DG 20 N1 ? ? D DC 6 E DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? C DC 5 N4 ? ? ? 1_555 D DG 20 O6 ? ? D DC 6 E DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? C DC 5 O2 ? ? ? 1_555 D DG 20 N2 ? ? D DC 6 E DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? C DC 6 N3 ? ? ? 1_555 D DG 19 N1 ? ? D DC 7 E DG 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? C DC 6 N4 ? ? ? 1_555 D DG 19 O6 ? ? D DC 7 E DG 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? C DC 6 O2 ? ? ? 1_555 D DG 19 N2 ? ? D DC 7 E DG 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? C DT 7 N3 ? ? ? 1_555 D DA 18 N1 ? ? D DT 8 E DA 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? C DT 7 O4 ? ? ? 1_555 D DA 18 N6 ? ? D DT 8 E DA 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? C DG 8 N1 ? ? ? 1_555 D DC 17 N3 ? ? D DG 9 E DC 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? C DG 8 N2 ? ? ? 1_555 D DC 17 O2 ? ? D DG 9 E DC 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? C DG 8 O6 ? ? ? 1_555 D DC 17 N4 ? ? D DG 9 E DC 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? C DA 9 N1 ? ? ? 1_555 D DT 16 N3 ? ? D DA 10 E DT 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? C DA 9 N6 ? ? ? 1_555 D DT 16 O4 ? ? D DA 10 E DT 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? C DA 10 N1 ? ? ? 1_555 D DT 15 N3 ? ? D DA 11 E DT 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? C DA 10 N6 ? ? ? 1_555 D DT 15 O4 ? ? D DA 11 E DT 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? C DA 11 N1 ? ? ? 1_555 D DT 14 N3 ? ? D DA 12 E DT 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? C DA 11 N6 ? ? ? 1_555 D DT 14 O4 ? ? D DA 12 E DT 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? C DG 12 N1 ? ? ? 1_555 D DC 13 N3 ? ? D DG 13 E DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? C DG 12 N2 ? ? ? 1_555 D DC 13 O2 ? ? D DG 13 E DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? C DG 12 O6 ? ? ? 1_555 D DC 13 N4 ? ? D DG 13 E DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? C DC 13 N3 ? ? ? 1_555 D DG 12 N1 ? ? D DC 14 E DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? C DC 13 N4 ? ? ? 1_555 D DG 12 O6 ? ? D DC 14 E DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? C DC 13 O2 ? ? ? 1_555 D DG 12 N2 ? ? D DC 14 E DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? C DG 14 N1 ? ? ? 1_555 D DC 11 N3 ? ? D DG 15 E DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? C DG 14 N2 ? ? ? 1_555 D DC 11 O2 ? ? D DG 15 E DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? C DG 14 O6 ? ? ? 1_555 D DC 11 N4 ? ? D DG 15 E DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? C DA 15 N1 ? ? ? 1_555 D DT 10 N3 ? ? D DA 16 E DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog30 hydrog ? ? C DA 15 N6 ? ? ? 1_555 D DT 10 O4 ? ? 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Y N 107 DA C8 N7 doub Y N 108 DA C8 H8 sing N N 109 DA N7 C5 sing Y N 110 DA C5 C6 sing Y N 111 DA C5 C4 doub Y N 112 DA C6 N6 sing N N 113 DA C6 N1 doub Y N 114 DA N6 H61 sing N N 115 DA N6 H62 sing N N 116 DA N1 C2 sing Y N 117 DA C2 N3 doub Y N 118 DA C2 H2 sing N N 119 DA N3 C4 sing Y N 120 DC OP3 P sing N N 121 DC OP3 HOP3 sing N N 122 DC P OP1 doub N N 123 DC P OP2 sing N N 124 DC P "O5'" sing N N 125 DC OP2 HOP2 sing N N 126 DC "O5'" "C5'" sing N N 127 DC "C5'" "C4'" sing N N 128 DC "C5'" "H5'" sing N N 129 DC "C5'" "H5''" sing N N 130 DC "C4'" "O4'" sing N N 131 DC "C4'" "C3'" sing N N 132 DC "C4'" "H4'" sing N N 133 DC "O4'" "C1'" sing N N 134 DC "C3'" "O3'" sing N N 135 DC "C3'" "C2'" sing N N 136 DC "C3'" "H3'" sing N N 137 DC "O3'" "HO3'" sing N N 138 DC "C2'" "C1'" sing N N 139 DC "C2'" "H2'" sing N N 140 DC "C2'" "H2''" sing N N 141 DC "C1'" N1 sing N N 142 DC "C1'" "H1'" sing N N 143 DC N1 C2 sing N N 144 DC N1 C6 sing N N 145 DC C2 O2 doub N N 146 DC C2 N3 sing N N 147 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Y N 225 DG C8 N7 doub Y N 226 DG C8 H8 sing N N 227 DG N7 C5 sing Y N 228 DG C5 C6 sing N N 229 DG C5 C4 doub Y N 230 DG C6 O6 doub N N 231 DG C6 N1 sing N N 232 DG N1 C2 sing N N 233 DG N1 H1 sing N N 234 DG C2 N2 sing N N 235 DG C2 N3 doub N N 236 DG N2 H21 sing N N 237 DG N2 H22 sing N N 238 DG N3 C4 sing N N 239 DIO C1 "C1'" sing N N 240 DIO C1 O1 sing N N 241 DIO C1 H11 sing N N 242 DIO C1 H12 sing N N 243 DIO C2 "C2'" sing N N 244 DIO C2 O1 sing N N 245 DIO C2 H21 sing N N 246 DIO C2 H22 sing N N 247 DIO "C1'" "O1'" sing N N 248 DIO "C1'" "H1'1" sing N N 249 DIO "C1'" "H1'2" sing N N 250 DIO "C2'" "O1'" sing N N 251 DIO "C2'" "H2'1" sing N N 252 DIO "C2'" "H2'2" sing N N 253 DT OP3 P sing N N 254 DT OP3 HOP3 sing N N 255 DT P OP1 doub N N 256 DT P OP2 sing N N 257 DT P "O5'" sing N N 258 DT OP2 HOP2 sing N N 259 DT "O5'" "C5'" sing N N 260 DT "C5'" "C4'" sing N N 261 DT "C5'" "H5'" sing N N 262 DT "C5'" "H5''" sing N N 263 DT "C4'" "O4'" sing N N 264 DT "C4'" "C3'" sing N N 265 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