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EMDB EMD-25730 ? ? # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details . _pdbx_database_related.db_id EMD-25730 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7T6X _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2021-12-14 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Torrents de la Pena, A.' 1 0000-0001-5598-1780 'Ward, A.B.' 2 0000-0001-7153-3769 'Eshun-Wilson, L.' 3 0000-0001-6988-1457 'Lander, G.C.' 4 0000-0003-4921-1135 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Science _citation.journal_id_ASTM SCIEAS _citation.journal_id_CSD 0038 _citation.journal_id_ISSN 1095-9203 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 378 _citation.language ? _citation.page_first 263 _citation.page_last 269 _citation.title 'Structure of the hepatitis C virus E1E2 glycoprotein complex.' _citation.year 2022 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1126/science.abn9884 _citation.pdbx_database_id_PubMed 36264808 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Torrents de la Pena, A.' 1 0000-0001-5598-1780 primary 'Sliepen, K.' 2 0000-0003-1414-0648 primary 'Eshun-Wilson, L.' 3 0000-0001-6988-1457 primary 'Newby, M.L.' 4 0000-0003-0624-245X primary 'Allen, J.D.' 5 0000-0003-2547-968X primary 'Zon, I.' 6 0000-0003-4346-0739 primary 'Koekkoek, S.' 7 ? primary 'Chumbe, A.' 8 0000-0003-0870-5075 primary 'Crispin, M.' 9 0000-0002-1072-2694 primary 'Schinkel, J.' 10 ? primary 'Lander, G.C.' 11 0000-0003-4921-1135 primary 'Sanders, R.W.' 12 0000-0002-2324-8573 primary 'Ward, A.B.' 13 0000-0001-7153-3769 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Envelope glycoprotein E2' 40156.699 1 ? ? 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'polypeptide(L)' no no ;MELGLSWLFLVAILAQPAMAQVQFVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTRHAIHWVRQAPGQRLEWMGWINPGNGNAKY SQKFQGRVTITRDTPASTVYMELSSLRSEDMGVYYCARDGGYSHDYSYFYGLDVWGPGTTVIVSSASTKGPSVFPLAPSS KSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVD KRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPR EEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGF YPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK ; ;MELGLSWLFLVAILAQPAMAQVQFVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTRHAIHWVRQAPGQRLEWMGWINPGNGNAKY SQKFQGRVTITRDTPASTVYMELSSLRSEDMGVYYCARDGGYSHDYSYFYGLDVWGPGTTVIVSSASTKGPSVFPLAPSS KSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVD KRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPR EEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGF YPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK ; A ? 5 'polypeptide(L)' no no ;METPAQLLFLLLLWLPGSTQSVLTQPPSAASGTPGQRVTISCSGSSSNIGGNFVDWYQQFPGTAPKLLIYTNDQRPSGVP ARFSGSKSGTSASLAISGLRSEDEADYYCAAWDDIVNGWVFGGGTKLEIKRTAAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLIS DFYPGAVTVAWKADSSPVKAGVETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTECS ; ;METPAQLLFLLLLWLPGSTQSVLTQPPSAASGTPGQRVTISCSGSSSNIGGNFVDWYQQFPGTAPKLLIYTNDQRPSGVP ARFSGSKSGTSASLAISGLRSEDEADYYCAAWDDIVNGWVFGGGTKLEIKRTAAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLIS DFYPGAVTVAWKADSSPVKAGVETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTECS ; B ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MGWSCIILFLVATATGVHEIMLTQSPVTLSVSPGERATLSCRASQSIGTNLAWYQKPGQAPRLLIHGASTRATGVPVSFS GSGSGTEFTLTISSLQSEDFAVYYCQQYNNWPLTFGGGTKVEIKSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFP EPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSC ; ;MGWSCIILFLVATATGVHEIMLTQSPVTLSVSPGERATLSCRASQSIGTNLAWYQKPGQAPRLLIHGASTRATGVPVSFS GSGSGTEFTLTISSLQSEDFAVYYCQQYNNWPLTFGGGTKVEIKSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFP 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'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;N-acetyl-beta-D-glucosamine; 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-glucose; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE ; 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7T6X _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 7T6X _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.021 ? 9462 ? f_bond_d ? ? 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H CYS 47 SG ? ? ? 1_555 H CYS 115 SG ? ? E CYS 238 E CYS 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.057 ? ? covale1 covale one ? A ASN 40 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? U ASN 423 U NAG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 47 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? U ASN 430 U NAG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 65 ND2 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? U ASN 448 F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? A ASN 93 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? U ASN 476 U NAG 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.529 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? A ASN 149 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? U ASN 532 U NAG 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? A ASN 157 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? U ASN 540 G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.470 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? A ASN 173 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? U ASN 556 I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.526 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? A ASN 193 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? U ASN 576 U NAG 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? A ASN 240 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? U ASN 623 J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.422 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? A ASN 262 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? U ASN 645 K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.526 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? A ASN 312 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? U ASN 695 M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.516 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? H ASN 5 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? E ASN 196 O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? H ASN 18 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? E ASN 209 P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? H ASN 43 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? E ASN 234 E NAG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? H ASN 114 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? E ASN 305 N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? N-Glycosylation covale16 covale both ? 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O BMA 3 O MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.526 ? ? covale35 covale both ? P BMA . O6 ? ? ? 1_555 P MAN . C1 ? ? O BMA 3 O MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.498 ? ? covale36 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? P NAG 1 P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? ? covale37 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q BMA . C1 ? ? P NAG 2 P BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 SER 25 F . ? SER 7 D PRO 26 F ? PRO 8 D 1 -6.10 2 TRP 111 F . ? TRP 107 D PRO 112 F ? PRO 108 D 1 15.75 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 4 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 6 ? AB1 ? 4 ? AB2 ? 3 ? AB3 ? 5 ? AB4 ? 5 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 6 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 3 ? AB9 ? 4 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 4 ? AC3 ? 6 ? AC4 ? 4 ? AC5 ? 4 ? AC6 ? 5 ? AC7 ? 4 ? AC8 ? 2 ? AC9 ? 4 ? AD1 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AA9 4 5 ? anti-parallel AA9 5 6 ? anti-parallel AB1 1 2 ? parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB3 4 5 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB4 4 5 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB6 1 2 ? parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB6 4 5 ? anti-parallel AB6 5 6 ? anti-parallel AB7 1 2 ? parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC3 1 2 ? parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC3 4 5 ? anti-parallel AC3 5 6 ? anti-parallel AC4 1 2 ? parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC6 1 2 ? parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC6 4 5 ? anti-parallel AC7 1 2 ? parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 CYS A 46 ? ASN A 47 ? CYS U 429 ASN U 430 AA1 2 PRO G 138 a ARG G 142 e PRO C 100 ARG C 100 AA1 3 ARG G 145 h SER G 148 k ARG C 100 SER C 100 AA1 4 ILE G 87 ? ALA G 89 ? ILE C 53 ALA C 55 AA2 1 SER A 90 ? TYR A 91 ? SER U 473 TYR U 474 AA2 2 CYS A 186 ? ALA A 187 ? CYS U 569 ALA U 570 AA2 3 HIS A 197 ? CYS A 198 ? HIS U 580 CYS U 581 AA3 1 VAL A 114 ? SER A 115 ? VAL U 497 SER U 498 AA3 2 VAL A 153 ? PHE A 154 ? VAL U 536 PHE U 537 AA4 1 PRO A 130 ? VAL A 133 ? PRO U 513 VAL U 516 AA4 2 VAL A 123 ? PHE A 126 ? VAL U 506 PHE U 509 AA4 3 GLY A 168 ? MET A 172 ? GLY U 551 MET U 555 AA4 4 THR A 178 ? GLY A 182 ? THR U 561 GLY U 565 AA5 1 TRP A 219 ? THR A 221 ? TRP U 602 THR U 604 AA5 2 CYS A 224 ? VAL A 226 ? CYS U 607 VAL U 609 AA5 3 VAL A 253 ? ASN A 262 ? VAL U 636 ASN U 645 AA5 4 TYR A 241 ? ILE A 250 ? TYR U 624 ILE U 633 AA6 1 ASP A 275 ? ARG A 276 ? ASP U 658 ARG U 659 AA6 2 SER A 295 ? PHE A 296 ? SER U 678 PHE U 679 AA7 1 LEU A 283 ? LEU A 284 ? LEU U 666 LEU U 667 AA7 2 GLN A 288 ? GLN A 290 ? GLN U 671 GLN U 673 AA7 3 VAL A 316 ? TYR A 318 ? VAL U 699 TYR U 701 AA7 4 HIS A 308 ? LEU A 309 ? HIS U 691 LEU U 692 AA8 1 GLU B 24 ? GLN B 25 A GLU H 6 GLN H 6 AA8 2 LEU B 37 ? LYS B 42 ? LEU H 18 LYS H 23 AA8 3 THR B 106 ? TRP B 111 ? THR H 77 TRP H 82 AA8 4 THR B 97 ? ASP B 101 ? THR H 68 ASP H 72 AA9 1 GLU B 29 ? LYS B 31 ? GLU H 10 LYS H 12 AA9 2 THR B 156 ? VAL B 160 ? THR H 107 VAL H 111 AA9 3 GLY B 120 ? PRO B 131 ? GLY H 88 PRO H 99 AA9 4 TRP B 52 ? GLN B 58 ? TRP H 33 GLN H 39 AA9 5 GLU B 65 ? ILE B 70 ? GLU H 46 ILE H 51 AA9 6 THR B 86 ? TYR B 88 ? THR H 57 TYR H 59 AB1 1 GLU B 29 ? LYS B 31 ? GLU H 10 LYS H 12 AB1 2 THR B 156 ? VAL B 160 ? THR H 107 VAL H 111 AB1 3 GLY B 120 ? PRO B 131 ? GLY H 88 PRO H 99 AB1 4 HIS B 144 L TRP B 152 ? HIS H 100 TRP H 103 AB2 1 ALA C 37 ? ARG C 42 ? ALA L 19 ARG L 24 AB2 2 GLY C 89 ? ILE C 94 ? GLY L 70 ILE L 75 AB2 3 PHE C 81 ? SER C 86 ? PHE L 62 SER L 67 AB3 1 SER C 72 ? ARG C 73 ? SER L 53 ARG L 54 AB3 2 ARG C 64 ? TYR C 68 ? ARG L 45 TYR L 49 AB3 3 LEU C 52 ? GLN C 57 ? LEU L 33 GLN L 38 AB3 4 VAL C 104 ? TYR C 110 ? VAL L 85 TYR L 91 AB3 5 ILE C 115 ? PHE C 117 ? ILE L 96 PHE L 98 AB4 1 SER C 72 ? ARG C 73 ? SER L 53 ARG L 54 AB4 2 ARG C 64 ? TYR C 68 ? ARG L 45 TYR L 49 AB4 3 LEU C 52 ? GLN C 57 ? LEU L 33 GLN L 38 AB4 4 VAL C 104 ? TYR C 110 ? VAL L 85 TYR L 91 AB4 5 THR C 121 ? ARG C 122 ? THR L 102 ARG L 103 AB5 1 PHE D 24 ? GLN D 26 ? PHE A 4 GLN A 6 AB5 2 VAL D 38 ? ALA D 44 ? VAL A 18 ALA A 24 AB5 3 THR D 98 ? LEU D 103 ? THR A 77 LEU A 82 AB5 4 VAL D 88 ? ASP D 93 ? VAL A 67 ASP A 72 AB6 1 GLU D 30 ? VAL D 31 ? GLU A 10 VAL A 11 AB6 2 THR D 139 ? ILE D 142 ? THR A 107 ILE A 110 AB6 3 GLY D 112 ? ASP D 119 ? GLY A 88 ASP A 95 AB6 4 ALA D 53 ? GLN D 59 ? ALA A 33 GLN A 39 AB6 5 LEU D 65 ? ILE D 71 ? LEU A 45 ILE A 51 AB6 6 ALA D 78 ? TYR D 80 ? ALA A 57 TYR A 59 AB7 1 GLU D 30 ? VAL D 31 ? GLU A 10 VAL A 11 AB7 2 THR D 139 ? ILE D 142 ? THR A 107 ILE A 110 AB7 3 GLY D 112 ? ASP D 119 ? GLY A 88 ASP A 95 AB7 4 LEU D 132 H TRP D 135 ? LEU A 100 TRP A 103 AB8 1 ARG E 37 ? SER E 43 ? ARG B 18 SER B 24 AB8 2 SER E 91 ? SER E 97 ? SER B 70 SER B 76 AB8 3 PHE E 83 ? SER E 84 ? PHE B 62 SER B 63 AB9 1 LYS E 66 ? ILE E 69 ? LYS B 45 ILE B 48 AB9 2 VAL E 54 ? GLN E 59 ? VAL B 33 GLN B 38 AB9 3 ASP E 106 ? ASP E 113 ? ASP B 85 ASP B 92 AB9 4 GLY E 118 B PHE E 121 ? GLY B 95 PHE B 98 AC1 1 LYS E 66 ? ILE E 69 ? LYS B 45 ILE B 48 AC1 2 VAL E 54 ? GLN E 59 ? VAL B 33 GLN B 38 AC1 3 ASP E 106 ? ASP E 113 ? ASP B 85 ASP B 92 AC1 4 THR E 125 ? LYS E 126 ? THR B 102 LYS B 103 AC2 1 LEU F 22 ? SER F 25 ? LEU D 4 SER D 7 AC2 2 ALA F 37 ? ILE F 47 ? ALA D 19 ILE D 29 AC2 3 GLY F 85 ? ILE F 92 ? GLY D 77 ILE D 84 AC2 4 PHE F 79 ? SER F 82 ? PHE D 69 SER D 72 AC3 1 THR F 28 ? LEU F 29 ? THR D 10 LEU D 11 AC3 2 THR F 119 ? VAL F 121 ? THR D 115 VAL D 117 AC3 3 ALA F 101 ? GLN F 107 ? ALA D 93 GLN D 99 AC3 4 ALA F 52 ? LYS F 56 ? ALA D 34 LYS D 38 AC3 5 ARG F 62 ? HIS F 66 ? ARG D 44 HIS D 48 AC3 6 THR F 70 ? ARG F 71 ? THR D 59 ARG D 60 AC4 1 THR F 28 ? LEU F 29 ? THR D 10 LEU D 11 AC4 2 THR F 119 ? VAL F 121 ? THR D 115 VAL D 117 AC4 3 ALA F 101 ? GLN F 107 ? ALA D 93 GLN D 99 AC4 4 THR F 114 ? PHE F 115 ? THR D 110 PHE D 111 AC5 1 VAL G 23 ? GLN G 24 ? VAL C 5 GLN C 6 AC5 2 VAL G 36 ? LYS G 41 ? VAL C 18 LYS C 23 AC5 3 VAL G 112 ? LEU G 116 ? VAL C 78 LEU C 82 AC5 4 VAL G 101 ? ALA G 105 ? VAL C 67 ALA C 71 AC6 1 GLU G 28 ? VAL G 29 ? GLU C 10 VAL C 11 AC6 2 THR G 161 ? THR G 164 ? THR C 107 THR C 110 AC6 3 ALA G 125 ? SER G 132 ? ALA C 88 SER C 95 AC6 4 HIS G 50 ? GLN G 57 ? HIS C 32 GLN C 39 AC6 5 LEU G 63 ? ARG G 71 a LEU C 45 ARG C 52 AC7 1 GLU G 28 ? VAL G 29 ? GLU C 10 VAL C 11 AC7 2 THR G 161 ? THR G 164 ? THR C 107 THR C 110 AC7 3 ALA G 125 ? SER G 132 ? ALA C 88 SER C 95 AC7 4 PHE G 154 q TRP G 157 ? PHE C 100 TRP C 103 AC8 1 GLN H 2 ? ARG H 4 ? GLN E 193 ARG E 195 AC8 2 HIS H 11 ? THR H 13 ? HIS E 202 THR E 204 AC9 1 ILE H 21 ? GLU H 24 ? 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ALA E 235 CYS E 238 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N CYS A 46 ? N CYS U 429 O CYS G 141 d O CYS C 100 AA1 2 3 N SER G 140 c N SER C 100 O TYR G 147 j O TYR C 100 AA1 3 4 O CYS G 146 i O CYS C 100 N LEU G 88 ? N LEU C 54 AA2 1 2 N SER A 90 ? N SER U 473 O ALA A 187 ? O ALA U 570 AA2 2 3 N CYS A 186 ? N CYS U 569 O CYS A 198 ? O CYS U 581 AA3 1 2 N VAL A 114 ? N VAL U 497 O PHE A 154 ? O PHE U 537 AA4 1 2 O VAL A 131 ? O VAL U 514 N CYS A 125 ? N CYS U 508 AA4 2 3 N PHE A 126 ? N PHE U 509 O GLY A 168 ? O GLY U 551 AA4 3 4 N CYS A 169 ? N CYS U 552 O CYS A 181 ? O CYS U 564 AA5 1 2 N ILE A 220 ? N ILE U 603 O CYS A 224 ? O CYS U 607 AA5 2 3 N LEU A 225 ? N LEU U 608 O ALA A 260 ? O ALA U 643 AA5 3 4 O ALA A 259 ? O ALA U 642 N PHE A 244 ? N PHE U 627 AA6 1 2 N ASP A 275 ? N ASP U 658 O PHE A 296 ? O PHE U 679 AA7 1 2 N LEU A 284 ? N LEU U 667 O GLN A 288 ? O GLN U 671 AA7 2 3 N TRP A 289 ? N TRP U 672 O GLN A 317 ? O GLN U 700 AA7 3 4 O TYR A 318 ? O TYR U 701 N HIS A 308 ? N HIS U 691 AA8 1 2 N GLU B 24 ? N GLU H 6 O LYS B 42 ? O LYS H 23 AA8 2 3 N LEU B 37 ? N LEU H 18 O TRP B 111 ? O TRP H 82 AA8 3 4 O TYR B 108 ? O TYR H 79 N SER B 99 ? N SER H 70 AA9 1 2 N LYS B 31 ? N LYS H 12 O ILE B 159 ? O ILE H 110 AA9 2 3 O THR B 156 ? O THR H 107 N TYR B 122 ? N TYR H 90 AA9 3 4 O TYR B 123 ? O TYR H 91 N VAL B 56 ? N VAL H 37 AA9 4 5 N ILE B 53 ? N ILE H 34 O ILE B 70 ? O ILE H 51 AA9 5 6 N ILE B 69 ? N ILE H 50 O ARG B 87 ? O ARG H 58 AB1 1 2 N LYS B 31 ? N LYS H 12 O ILE B 159 ? O ILE H 110 AB1 2 3 O THR B 156 ? O THR H 107 N TYR B 122 ? N TYR H 90 AB1 3 4 N VAL B 130 ? N VAL H 98 O ASP B 145 M O ASP H 100 AB2 1 2 N LEU C 39 ? N LEU L 21 O LEU C 92 ? O LEU L 73 AB2 2 3 O ILE C 93 ? O ILE L 74 N SER C 82 ? N SER L 63 AB3 1 2 O SER C 72 ? O SER L 53 N TYR C 68 ? N TYR L 49 AB3 2 3 O LEU C 66 ? O LEU L 47 N TRP C 54 ? N TRP L 35 AB3 3 4 N GLN C 57 ? N GLN L 38 O VAL C 104 ? O VAL L 85 AB3 4 5 N GLN C 109 ? N GLN L 90 O THR C 116 ? O THR L 97 AB4 1 2 O SER C 72 ? O SER L 53 N TYR C 68 ? 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H LEU 95 1095 1 Y 1 E VAL 287 ? H VAL 96 1096 1 Y 1 E GLY 288 ? H GLY 97 1097 1 Y 1 E GLN 289 ? H GLN 98 1098 1 Y 1 E LEU 290 ? H LEU 99 1099 1 Y 1 E PHE 291 ? H PHE 100 1100 1 Y 1 E THR 292 ? H THR 101 1101 1 Y 1 E PHE 293 ? H PHE 102 1102 1 Y 1 E MET 347 ? H MET 156 1103 1 Y 1 E ILE 348 ? H ILE 157 1104 1 Y 1 E ALA 349 ? H ALA 158 1105 1 Y 1 E GLY 350 ? H GLY 159 1106 1 Y 1 E ALA 351 ? H ALA 160 1107 1 Y 1 E HIS 352 ? H HIS 161 1108 1 Y 1 E TRP 353 ? H TRP 162 1109 1 Y 1 E GLY 354 ? H GLY 163 1110 1 Y 1 E VAL 355 ? H VAL 164 1111 1 Y 1 E LEU 356 ? H LEU 165 1112 1 Y 1 E ALA 357 ? H ALA 166 1113 1 Y 1 E GLY 358 ? H GLY 167 1114 1 Y 1 E LEU 359 ? H LEU 168 1115 1 Y 1 E ALA 360 ? H ALA 169 1116 1 Y 1 E TYR 361 ? H TYR 170 1117 1 Y 1 E PHE 362 ? H PHE 171 1118 1 Y 1 E SER 363 ? H SER 172 1119 1 Y 1 E MET 364 ? H MET 173 1120 1 Y 1 E VAL 365 ? H VAL 174 1121 1 Y 1 E GLY 366 ? H GLY 175 1122 1 Y 1 E ASN 367 ? H ASN 176 1123 1 Y 1 E TRP 368 ? H TRP 177 1124 1 Y 1 E ALA 369 ? H ALA 178 1125 1 Y 1 E LYS 370 ? H LYS 179 1126 1 Y 1 E VAL 371 ? H VAL 180 1127 1 Y 1 E LEU 372 ? H LEU 181 1128 1 Y 1 E ALA 373 ? H ALA 182 1129 1 Y 1 E VAL 374 ? H VAL 183 1130 1 Y 1 E LEU 375 ? H LEU 184 1131 1 Y 1 E LEU 376 ? H LEU 185 1132 1 Y 1 E LEU 377 ? H LEU 186 1133 1 Y 1 E PHE 378 ? H PHE 187 1134 1 Y 1 E ALA 379 ? H ALA 188 1135 1 Y 1 E GLY 380 ? H GLY 189 1136 1 Y 1 E VAL 381 ? H VAL 190 1137 1 Y 1 E ASP 382 ? H ASP 191 1138 1 Y 1 E ALA 383 ? H ALA 192 # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.id _em_buffer_component.name 1 25 mM ? 1 'TRIS hydrochloride' 1 150 mM NaCl 2 'sodium Chloride' # _em_ctf_correction.details ? _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' # _em_entity_assembly_naturalsource.cell ? _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location ? _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.id 2 _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id 11103 _em_entity_assembly_naturalsource.organism 'Hepacivirus C' _em_entity_assembly_naturalsource.organelle ? _em_entity_assembly_naturalsource.organ ? _em_entity_assembly_naturalsource.strain AMS0232 _em_entity_assembly_naturalsource.tissue ? # _em_entity_assembly_recombinant.cell 'HEK 293F' _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_recombinant.id 2 _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id 9606 _em_entity_assembly_recombinant.organism 'Homo sapiens' _em_entity_assembly_recombinant.plasmid pPPI4 _em_entity_assembly_recombinant.strain ? # _em_image_processing.details ? _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 # _em_image_recording.average_exposure_time 9 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_subtomogram ? _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 50 _em_image_recording.details 'images were collected at 250 ms per frame. 36 frames were collected.' _em_image_recording.detector_mode COUNTING _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)' _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged 2 _em_image_recording.num_real_images 5121 # _em_particle_selection.details ? _em_particle_selection.id 1 _em_particle_selection.image_processing_id 1 _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 2017845 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.category _em_software.details _em_software.id _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id _em_software.name _em_software.version 'CRYSTALLOGRAPHY MERGING' ? 1 1 ? 1 ? ? 'IMAGE ACQUISITION' ? 2 ? ? 1 Leginon ? MASKING ? 3 ? ? ? ? ? 'CTF CORRECTION' ? 4 1 ? ? Gctf 1.06 'LAYERLINE INDEXING' ? 5 ? ? ? ? ? 'DIFFRACTION INDEXING' ? 6 ? ? ? ? ? 'MODEL FITTING' ? 7 ? ? ? ? ? 'MODEL REFINEMENT' ? 8 ? ? ? ? ? OTHER ? 9 ? ? ? ? ? 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? 10 1 ? ? cryoSPARC v3.2.0 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? 11 1 ? ? cryoSPARC v3.2.0 CLASSIFICATION ? 12 1 ? ? ? ? RECONSTRUCTION ? 13 1 ? ? ? ? 'PARTICLE SELECTION' ? 14 1 1 1 ? ? 'VOLUME SELECTION' ? 15 1 1 1 ? ? 'SERIES ALIGNMENT' ? 16 1 1 1 ? ? 'MOLECULAR REPLACEMENT' ? 17 1 1 1 ? ? 'LATTICE DISTORTION CORRECTION' ? 18 1 1 1 ? ? 'SYMMETRY DETERMINATION' ? 19 1 1 1 ? ? # _em_specimen.concentration 0.8 _em_specimen.details ;Full-length hepatitis C virus E1E2 glycoprotein complexed with AR4A, AT12009, and IGH505 Fabs and embedded in peptidiscs is diluted in TBS to a final concentration of 0.8 mg/ml. ; _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.id 1 _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # _pdbx_audit_support.funding_organization 'Netherlands Organisation for Scientific Research (NWO)' _pdbx_audit_support.country Netherlands _pdbx_audit_support.grant_number ? _pdbx_audit_support.ordinal 1 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero I 9 NAG 1 F NAG 1 U NAG 720 n I 9 NAG 2 F NAG 2 U NAG 721 n J 10 NAG 1 G NAG 1 U NAG 725 n J 10 NAG 2 G NAG 2 U NAG 726 n J 10 BMA 3 G BMA 3 U BMA 727 n K 10 NAG 1 I NAG 1 U NAG 728 n K 10 NAG 2 I NAG 2 U NAG 729 n K 10 BMA 3 I BMA 3 U BMA 730 n L 11 NAG 1 J NAG 1 U NAG 732 n L 11 NAG 2 J NAG 2 U NAG 733 n L 11 BMA 3 J BMA 3 U BMA 734 n L 11 MAN 4 J MAN 4 U MAN 735 n L 11 MAN 5 J MAN 5 U MAN 736 n M 10 NAG 1 K NAG 1 U NAG 737 n M 10 NAG 2 K NAG 2 U NAG 738 n M 10 BMA 3 K BMA 3 U BMA 739 n N 9 NAG 1 M NAG 1 U NAG 740 n N 9 NAG 2 M NAG 2 U NAG 741 n O 12 NAG 1 N NAG 1 E NAG 361 n O 12 NAG 2 N NAG 2 E NAG 362 n O 12 BMA 3 N BMA 3 E BMA 363 n O 12 MAN 4 N MAN 4 E MAN 364 n O 12 MAN 5 N MAN 5 E MAN 365 n P 12 NAG 1 O NAG 1 E NAG 366 n P 12 NAG 2 O NAG 2 E NAG 367 n P 12 BMA 3 O BMA 3 E BMA 368 n P 12 MAN 4 O MAN 4 E MAN 369 n P 12 MAN 5 O MAN 5 E MAN 370 n Q 10 NAG 1 P NAG 1 E NAG 373 n Q 10 NAG 2 P NAG 2 E NAG 374 n Q 10 BMA 3 P BMA 3 E BMA 375 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier BMA 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpb BMA 'COMMON NAME' GMML 1.0 b-D-mannopyranose BMA 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-Manp BMA 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man MAN 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpa MAN 'COMMON NAME' GMML 1.0 a-D-mannopyranose MAN 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 a-D-Manp MAN 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 9 oligosaccharide 10 oligosaccharide 11 oligosaccharide 12 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 9 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 9 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 9 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}' LINUCS PDB-CARE ? 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# loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order _pdbx_entity_branch_link.details 1 9 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 2 10 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 3 10 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 4 11 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 5 11 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 6 11 4 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? 7 11 5 MAN C1 O1 4 MAN O6 HO6 sing ? 8 12 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 9 12 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 10 12 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 11 12 5 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 9 NAG 1 n 9 NAG 2 n 10 NAG 1 n 10 NAG 2 n 10 BMA 3 n 11 NAG 1 n 11 NAG 2 n 11 BMA 3 n 11 MAN 4 n 11 MAN 5 n 12 NAG 1 n 12 NAG 2 n 12 BMA 3 n 12 MAN 4 n 12 MAN 5 n # loop_ _pdbx_entity_instance_feature.ordinal _pdbx_entity_instance_feature.comp_id _pdbx_entity_instance_feature.asym_id _pdbx_entity_instance_feature.seq_num _pdbx_entity_instance_feature.auth_comp_id _pdbx_entity_instance_feature.auth_asym_id _pdbx_entity_instance_feature.auth_seq_num _pdbx_entity_instance_feature.feature_type _pdbx_entity_instance_feature.details 1 BMA ? ? BMA ? ? 'SUBJECT OF INVESTIGATION' ? 2 MAN ? ? MAN ? ? 'SUBJECT OF INVESTIGATION' ? 3 NAG ? ? NAG ? ? 'SUBJECT OF INVESTIGATION' ? # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 13 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support microscopy _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #