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'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 BMA 'D-saccharide, beta linking' . beta-D-mannopyranose 'beta-D-mannose; D-mannose; mannose' 'C6 H12 O6' 180.156 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MAN 'D-saccharide, alpha linking' . alpha-D-mannopyranose 'alpha-D-mannose; D-mannose; mannose' 'C6 H12 O6' 180.156 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;N-acetyl-beta-D-glucosamine; 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-glucose; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE ; 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 TYS 'L-peptide linking' n O-SULFO-L-TYROSINE ? 'C9 H11 N O6 S' 261.252 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7T73 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7T73 _struct.title 'HIV-1 Envelope ApexGT2.2MUT in complex with PCT64.LMCA Fab' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7T73 _struct_keywords.text 'HIV, germline targeting vaccine, VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 3 ? F N N 3 ? G N N 4 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 5 ? K N N 6 ? L N N 5 ? M N N 5 ? N N N 7 ? O N N 5 ? P N N 6 ? Q N N 5 ? R N N 7 ? S N N 6 ? T N N 5 ? U N N 5 ? V N N 8 ? W N N 9 ? X N N 9 ? Y N N 9 ? Z N N 9 ? AA N N 9 ? BA N N 9 ? CA N N 9 ? DA N N 9 ? EA N N 9 ? FA N N 9 ? GA N N 9 ? HA N N 9 ? IA N N 9 ? JA N N 9 ? KA N N 9 ? LA N N 9 ? MA N N 9 ? NA N N 9 ? OA N N 9 ? PA N N 9 ? QA N N 9 ? RA N N 9 ? SA N N 9 ? TA N N 9 ? UA N N 9 ? VA N N 9 ? WA N N 9 ? XA N N 9 ? YA N N 9 ? ZA N N 9 ? AB N N 9 ? BB N N 9 ? CB N N 9 ? DB N N 9 ? EB N N 9 ? FB N N 9 ? GB N N 9 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 THR A 28 ? ALA A 32 ? THR H 28 ALA H 32 5 ? 5 HELX_P HELX_P2 AA2 ALA A 64 ? LYS A 67 ? ALA H 61 LYS H 64 5 ? 4 HELX_P HELX_P3 AA3 LYS A 89 ? THR A 93 ? LYS H 83 THR H 87 5 ? 5 HELX_P HELX_P4 AA4 SER B 30 ? SER B 32 ? SER L 29 SER L 31 5 ? 3 HELX_P HELX_P5 AA5 GLU B 80 ? PHE B 84 ? GLU L 79 PHE L 83 5 ? 5 HELX_P HELX_P6 AA6 ASN C 99 ? LYS C 118 ? 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ASN C 99 SER C 115 1 ? 17 HELX_P HELX_P21 AC3 LEU E 123 ? CYS E 127 ? LEU C 122 CYS C 126 5 ? 5 HELX_P HELX_P22 AC4 THR E 140 ? ARG E 144 ? THR C 139 ARG C 151 5 ? 5 HELX_P HELX_P23 AC5 LYS E 327 ? ARG E 342 ? LYS C 335 ARG C 350 1 ? 16 HELX_P HELX_P24 AC6 ASP E 360 ? THR E 365 ? ASP C 368 THR C 373 1 ? 6 HELX_P HELX_P25 AC7 SER E 451 ? THR E 455 ? SER C 460 THR C 464 5 ? 5 HELX_P HELX_P26 AC8 MET E 466 ? SER E 472 ? MET C 475 SER C 481 1 ? 7 HELX_P HELX_P27 AC9 GLU E 473 ? TYR E 475 ? GLU C 482 TYR C 484 5 ? 3 HELX_P HELX_P28 AD1 ASN F 99 ? LEU F 117 ? ASN E 98 LEU E 116 1 ? 19 HELX_P HELX_P29 AD2 LEU F 123 ? CYS F 127 ? LEU E 122 CYS E 126 5 ? 5 HELX_P HELX_P30 AD3 THR F 140 ? ARG F 144 ? THR E 139 ARG E 151 5 ? 5 HELX_P HELX_P31 AD4 THR F 333 ? PHE F 345 ? THR E 341 PHE E 353 1 ? 13 HELX_P HELX_P32 AD5 ASP F 360 ? THR F 364 ? ASP E 368 THR E 372 5 ? 5 HELX_P HELX_P33 AD6 ARG F 467 ? TYR F 475 ? ARG E 476 TYR E 484 1 ? 9 HELX_P HELX_P34 AD7 THR G 18 ? SER G 23 ? THR D 529 SER D 534 1 ? 6 HELX_P HELX_P35 AD8 MET G 24 ? LEU G 26 ? MET D 535 LEU D 537 5 ? 3 HELX_P HELX_P36 AD9 THR G 27 ? ASN G 32 ? THR D 538 ASN D 543 1 ? 6 HELX_P HELX_P37 AE1 ILE G 62 ? TRP G 85 ? ILE D 573 TRP D 596 1 ? 24 HELX_P HELX_P38 AE2 ASN G 100 ? SER G 104 ? ASN D 611 SER D 615 5 ? 5 HELX_P HELX_P39 AE3 ASN G 107 ? ASN G 114 ? ASN D 618 ASN D 625 1 ? 8 HELX_P HELX_P40 AE4 THR G 116 ? ILE G 124 ? THR D 627 ILE D 635 1 ? 9 HELX_P HELX_P41 AE5 THR G 128 ? GLN G 139 ? THR D 639 GLN D 650 1 ? 12 HELX_P HELX_P42 AE6 ASN G 140 ? GLN G 142 ? ASN D 651 GLN D 653 5 ? 3 HELX_P HELX_P43 AE7 GLU G 143 ? LEU G 149 ? GLU D 654 LEU D 660 1 ? 7 HELX_P HELX_P44 AE8 LEU H 12 ? SER H 17 ? LEU F 523 SER F 528 5 ? 6 HELX_P HELX_P45 AE9 THR H 18 ? SER H 23 ? THR F 529 SER F 534 1 ? 6 HELX_P HELX_P46 AF1 THR H 25 ? ARG H 31 ? THR F 536 ARG F 542 1 ? 7 HELX_P HELX_P47 AF2 ILE H 62 ? TRP H 85 ? ILE F 573 TRP F 596 1 ? 24 HELX_P HELX_P48 AF3 SER H 109 ? ASN H 114 ? 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C CYS 370 SG ? ? ? 1_555 C CYS 436 SG ? ? A CYS 378 A CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.015 ? ? disulf11 disulf ? ? C CYS 377 SG ? ? ? 1_555 C CYS 409 SG ? ? A CYS 385 A CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf12 disulf ? ? C CYS 492 SG ? ? ? 1_555 D CYS 94 SG ? ? A CYS 501 B CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf13 disulf ? ? D CYS 87 SG ? ? ? 1_555 D CYS 93 SG ? ? B CYS 598 B CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? ? disulf14 disulf ? ? E CYS 120 SG ? ? ? 1_555 E CYS 198 SG ? ? C CYS 119 C CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.175 ? ? disulf15 disulf ? ? E CYS 127 SG ? ? ? 1_555 E CYS 189 SG ? ? C CYS 126 C CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf16 disulf ? ? E CYS 132 SG ? ? ? 1_555 E CYS 150 SG ? ? C CYS 131 C CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.229 ? ? disulf17 disulf ? ? E CYS 211 SG ? ? ? 1_555 E CYS 240 SG ? ? C CYS 218 C CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf18 disulf ? ? E CYS 221 SG ? ? ? 1_555 E CYS 232 SG ? ? C CYS 228 C CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf19 disulf ? ? E CYS 289 SG ? ? ? 1_555 E CYS 323 SG ? ? C CYS 296 C CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf20 disulf ? ? E CYS 370 SG ? ? ? 1_555 E CYS 436 SG ? ? C CYS 378 C CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.016 ? ? disulf21 disulf ? ? E CYS 377 SG ? ? ? 1_555 E CYS 409 SG ? ? C CYS 385 C CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf22 disulf ? ? E CYS 492 SG ? ? ? 1_555 G CYS 94 SG ? ? C CYS 501 D CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf23 disulf ? ? F CYS 55 SG ? ? ? 1_555 F CYS 75 SG ? ? E CYS 54 E CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.143 ? ? disulf24 disulf ? ? F CYS 120 SG ? ? ? 1_555 F CYS 198 SG ? ? E CYS 119 E CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.057 ? ? disulf25 disulf ? ? F CYS 127 SG ? ? ? 1_555 F CYS 189 SG ? ? E CYS 126 E CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf26 disulf ? ? F CYS 132 SG ? ? ? 1_555 F CYS 150 SG ? ? E CYS 131 E CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ? ? disulf27 disulf ? ? 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F VAL 497 449 1 Y 1 E GLY 507 ? F GLY 498 450 1 Y 1 E ARG 508 ? F ARG 499 451 1 Y 1 E ARG 509 ? F ARG 500 452 1 Y 1 E ARG 510 ? F ARG 501 453 1 Y 1 E ARG 511 ? F ARG 502 454 1 Y 1 E ARG 512 ? F ARG 503 455 1 Y 1 E ARG 513 ? F ARG 504 456 1 Y 1 D ALA 512 ? G ALA 1 457 1 Y 1 D VAL 513 ? G VAL 2 458 1 Y 1 D GLY 514 ? G GLY 3 459 1 Y 1 D ILE 515 ? G ILE 4 460 1 Y 1 D GLY 516 ? G GLY 5 461 1 Y 1 D ALA 517 ? G ALA 6 462 1 Y 1 D VAL 518 ? G VAL 7 463 1 Y 1 D SER 519 ? G SER 8 464 1 Y 1 D GLY 547 ? G GLY 36 465 1 Y 1 D ILE 548 ? G ILE 37 466 1 Y 1 D VAL 549 ? G VAL 38 467 1 Y 1 D GLN 550 ? G GLN 39 468 1 Y 1 D GLN 551 ? G GLN 40 469 1 Y 1 D GLN 552 ? G GLN 41 470 1 Y 1 D SER 553 ? G SER 42 471 1 Y 1 D ASN 554 ? G ASN 43 472 1 Y 1 D LEU 555 ? G LEU 44 473 1 Y 1 D LEU 556 ? G LEU 45 474 1 Y 1 D ARG 557 ? G ARG 46 475 1 Y 1 D ALA 558 ? G ALA 47 476 1 Y 1 D PRO 559 ? G PRO 48 477 1 Y 1 D GLU 560 ? G GLU 49 478 1 Y 1 D PRO 561 ? G PRO 50 479 1 Y 1 D GLN 562 ? G GLN 51 480 1 Y 1 D GLN 563 ? G GLN 52 481 1 Y 1 D HIS 564 ? G HIS 53 482 1 Y 1 D LEU 565 ? G LEU 54 483 1 Y 1 D LEU 566 ? G LEU 55 484 1 Y 1 D LYS 567 ? G LYS 56 485 1 Y 1 D ASP 568 ? G ASP 57 486 1 Y 1 D THR 569 ? G THR 58 487 1 Y 1 D HIS 570 ? G HIS 59 488 1 Y 1 D TRP 571 ? G TRP 60 489 1 Y 1 D LEU 663 ? G LEU 152 490 1 Y 1 D ASP 664 ? G ASP 153 491 1 Y 1 D GLY 665 ? G GLY 154 492 1 Y 1 D THR 666 ? G THR 155 493 1 Y 1 D LYS 667 ? G LYS 156 494 1 Y 1 D HIS 668 ? G HIS 157 495 1 Y 1 D HIS 669 ? G HIS 158 496 1 Y 1 D HIS 670 ? G HIS 159 497 1 Y 1 D HIS 671 ? G HIS 160 498 1 Y 1 D HIS 672 ? G HIS 161 499 1 Y 1 D HIS 673 ? G HIS 162 500 1 Y 1 F ALA 512 ? H ALA 1 501 1 Y 1 F VAL 513 ? H VAL 2 502 1 Y 1 F GLY 514 ? H GLY 3 503 1 Y 1 F ILE 515 ? H ILE 4 504 1 Y 1 F GLY 516 ? H GLY 5 505 1 Y 1 F ALA 517 ? H ALA 6 506 1 Y 1 F VAL 518 ? H VAL 7 507 1 Y 1 F SER 519 ? H SER 8 508 1 Y 1 F GLY 547 ? H GLY 36 509 1 Y 1 F ILE 548 ? H ILE 37 510 1 Y 1 F VAL 549 ? H VAL 38 511 1 Y 1 F GLN 550 ? H GLN 39 512 1 Y 1 F GLN 551 ? 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H HIS 162 # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details ? # _em_entity_assembly_naturalsource.id 2 _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.cell ? _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location ? _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id 11676 _em_entity_assembly_naturalsource.organ ? _em_entity_assembly_naturalsource.organelle ? _em_entity_assembly_naturalsource.organism 'Human immunodeficiency virus 1' _em_entity_assembly_naturalsource.strain ? _em_entity_assembly_naturalsource.tissue ? # _em_entity_assembly_recombinant.id 2 _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_recombinant.cell HEK _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id 9606 _em_entity_assembly_recombinant.organism 'Homo sapiens' _em_entity_assembly_recombinant.plasmid ? _em_entity_assembly_recombinant.strain ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 50 _em_image_recording.average_exposure_time ? _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode COUNTING _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged ? _em_image_recording.num_real_images ? _em_image_recording.avg_electron_dose_per_subtomogram ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' ? ? ? 1 ? ? 2 'IMAGE ACQUISITION' ? ? ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? ? ? 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? ? ? ? ? ? 8 'MODEL REFINEMENT' ? ? ? ? ? ? 9 OTHER ? ? ? ? ? ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? ? ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? ? ? 1 ? ? 14 'VOLUME SELECTION' ? ? ? 1 ? 1 15 'SERIES ALIGNMENT' ? ? ? 1 ? 1 16 'MOLECULAR REPLACEMENT' ? ? ? 1 ? 1 17 'LATTICE DISTORTION CORRECTION' ? ? ? 1 ? 1 18 'SYMMETRY DETERMINATION' ? ? ? 1 ? 1 19 'CRYSTALLOGRAPHY MERGING' ? ? ? 1 ? 1 # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'Bill & Melinda Gates Foundation' 'United States' OPP1084519 1 'Bill & Melinda Gates Foundation' 'United States' OPP1196345 2 'National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)' 'United States' 'UM1 Al100663' 3 'National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)' 'United States' 'UM1 AI144462' 4 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero I 5 NAG 1 G NAG 1 A NAG 1000 n I 5 NAG 2 G NAG 2 A NAG 1021 n J 5 NAG 1 I NAG 1 A NAG 1001 n J 5 NAG 2 I NAG 2 A NAG 1006 n K 6 NAG 1 J NAG 1 A NAG 1002 n K 6 NAG 2 J NAG 2 A NAG 1003 n K 6 BMA 3 J BMA 3 A BMA 1004 n K 6 MAN 4 J MAN 4 A MAN 1005 n L 5 NAG 1 K NAG 1 A NAG 1009 n L 5 NAG 2 K NAG 2 A NAG 1010 n M 5 NAG 1 M NAG 1 A NAG 1016 n M 5 NAG 2 M NAG 2 A NAG 1017 n N 7 NAG 1 N NAG 1 C NAG 1000 n N 7 NAG 2 N NAG 2 C NAG 1001 n N 7 BMA 3 N BMA 3 C BMA 1020 n O 5 NAG 1 O NAG 1 C NAG 1002 n O 5 NAG 2 O NAG 2 C NAG 1008 n P 6 NAG 1 P NAG 1 C NAG 1004 n P 6 NAG 2 P NAG 2 C NAG 1005 n P 6 BMA 3 P BMA 3 C BMA 1006 n P 6 MAN 4 P MAN 4 C MAN 1007 n Q 5 NAG 1 Q NAG 1 C NAG 1014 n Q 5 NAG 2 Q NAG 2 C NAG 1015 n R 7 NAG 1 R NAG 1 E NAG 1000 n R 7 NAG 2 R NAG 2 E NAG 1008 n R 7 BMA 3 R BMA 3 E BMA 1024 n S 6 NAG 1 S NAG 1 E NAG 1002 n S 6 NAG 2 S NAG 2 E NAG 1003 n S 6 BMA 3 S BMA 3 E BMA 1004 n S 6 MAN 4 S MAN 4 E MAN 1005 n T 5 NAG 1 T NAG 1 E NAG 1007 n T 5 NAG 2 T NAG 2 E NAG 1014 n U 5 NAG 1 U NAG 1 E NAG 1010 n U 5 NAG 2 U NAG 2 E NAG 1011 n V 8 NAG 1 V NAG 1 E NAG 1016 n V 8 NAG 2 V NAG 2 E NAG 1017 n V 8 BMA 3 V BMA 3 E BMA 1018 n V 8 MAN 4 V MAN 4 E MAN 1025 n V 8 MAN 5 V MAN 5 E MAN 1026 n V 8 MAN 6 V MAN 6 E MAN 1027 n V 8 MAN 7 V MAN 7 E MAN 1019 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier BMA 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpb BMA 'COMMON NAME' GMML 1.0 b-D-mannopyranose BMA 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-Manp BMA 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man MAN 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpa MAN 'COMMON NAME' GMML 1.0 a-D-mannopyranose MAN 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 a-D-Manp MAN 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide 7 oligosaccharide 8 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 5 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 5 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 5 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}' LINUCS PDB-CARE ? 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# loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order _pdbx_entity_branch_link.details 1 5 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 2 6 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 3 6 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 4 6 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 5 7 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 6 7 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 7 8 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 8 8 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 9 8 4 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? 10 8 5 MAN C1 O1 4 MAN O3 HO3 sing ? 11 8 6 MAN C1 O1 4 MAN O6 HO6 sing ? 12 8 7 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 5 NAG 1 n 5 NAG 2 n 6 NAG 1 n 6 NAG 2 n 6 BMA 3 n 6 MAN 4 n 7 NAG 1 n 7 NAG 2 n 7 BMA 3 n 8 NAG 1 n 8 NAG 2 n 8 BMA 3 n 8 MAN 4 n 8 MAN 5 n 8 MAN 6 n 8 MAN 7 n # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 9 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? 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