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EMDB EMD-26195 ? ? # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Structure of Lassa virus glycoprotein bound to Fab 25.10C' _pdbx_database_related.db_id EMD-26195 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7TYV _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2022-02-14 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Enriquez, A.S.' 1 0000-0002-8225-6688 'Hastie, K.M.' 2 0000-0002-3406-1210 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Cell Rep' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2211-1247 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 39 _citation.language ? _citation.page_first 110841 _citation.page_last 110841 _citation.title 'Delineating the mechanism of anti-Lassa virus GPC-A neutralizing antibodies.' _citation.year 2022 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.celrep.2022.110841 _citation.pdbx_database_id_PubMed 35613585 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Enriquez, A.S.' 1 ? primary 'Buck, T.K.' 2 ? primary 'Li, H.' 3 ? primary 'Norris, M.J.' 4 ? primary 'Moon-Walker, A.' 5 ? primary 'Zandonatti, M.A.' 6 ? primary 'Harkins, S.S.' 7 ? primary 'Robinson, J.E.' 8 ? primary 'Branco, L.M.' 9 ? primary 'Garry, R.F.' 10 ? primary 'Saphire, E.O.' 11 ? primary 'Hastie, K.M.' 12 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 7TYV _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7TYV _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Glycoprotein G1' 29098.430 3 ? 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2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose 221.208 13 ? ? ? ? # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MGQIVTFFQEVPHVIEEVMNIVLIALSVLAVLKGLYNFATCGLVGLVTFLLLCGRSCTTSLYKGVYELQTLELNMETLNM TMPLSCTKNNSHHYIMVGNETGLELTLTNTSIINHKFCNLSDAHKKNLYDHALMSIISTFHLSIPNFNQYEAMSCDFNGG KISVQYNLSHSYAGDAANHCGTVANGVLQTFMRMAWGGSYIALDSGCGNWDCIMTSYQYLIIQNTTWEDHCQFSRPSPIG YLGLLSQRTRDIYISRRRR ; ;MGQIVTFFQEVPHVIEEVMNIVLIALSVLAVLKGLYNFATCGLVGLVTFLLLCGRSCTTSLYKGVYELQTLELNMETLNM TMPLSCTKNNSHHYIMVGNETGLELTLTNTSIINHKFCNLSDAHKKNLYDHALMSIISTFHLSIPNFNQYEAMSCDFNGG KISVQYNLSHSYAGDAANHCGTVANGVLQTFMRMAWGGSYIALDSGCGNWDCIMTSYQYLIIQNTTWEDHCQFSRPSPIG YLGLLSQRTRDIYISRRRR ; A,B,C ? 2 'polypeptide(L)' no no ;QVQLQESGGGLVKPGGSLRLSCTASGFNFNKYNMNWVRQAPGKGLEWVSSISALSTYIYYADSLKGRFTVSRDNAKNSLF 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_entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample 'Biological sequence' 1 259 ? ? 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'Drosophila melanogaster' 7227 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP GLYC_LASSJ P08669 ? 1 ;MGQIVTFFQEVPHVIEEVMNIVLIALSVLAVLKGLYNFATCGLVGLVTFLLLCGRSCTTSLYKGVYELQTLELNMETLNM TMPLSCTKNNSHHYIMVGNETGLELTLTNTSIINHKFCNLSDAHKKNLYDHALMSIISTFHLSIPNFNQYEAMSCDFNGG KISVQYNLSHSYAGDAANHCGTVANGVLQTFMRMAWGGSYIALDSGRGNWDCIMTSYQYLIIQNTTWEDHCQFSRPSPIG YLGLLSQRTRDIYISRRLL ; 1 2 PDB 7TYV 7TYV ? 2 ? 1 3 PDB 7TYV 7TYV ? 3 ? 1 4 UNP GLYC_LASSJ P08669 ? 4 ;GTFTWTLSDSEGKDTPGGYCLTRWMLIEAELKCFGNTAVAKCNEKHDEEFCDMLRLFDFNKQAIQRLKAEAQMSIQLINK AVNALINDQLIMKNHLRDIMGIPYCNYSKYWYLNHTTTGRTSLPKCWLVSNGSYLNETHFSDDIEQQADNMITEMLQKEY MERQ ; 260 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7TYV A 1 ? 259 ? 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UNP P08669 GLU 329 'engineered mutation' 329 16 12 7TYV THR c 73 ? UNP P08669 MET 332 'engineered mutation' 332 17 12 7TYV CYS c 101 ? UNP P08669 GLY 360 'engineered mutation' 360 18 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 BMA 'D-saccharide, beta linking' . beta-D-mannopyranose 'beta-D-mannose; D-mannose; mannose' 'C6 H12 O6' 180.156 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 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'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7TYV _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.B_iso_max ? _refine.B_iso_mean 68.47 _refine.B_iso_min ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.details ? _refine.diff_density_max ? _refine.diff_density_max_esd ? _refine.diff_density_min ? _refine.diff_density_min_esd ? _refine.diff_density_rms ? _refine.diff_density_rms_esd ? _refine.entry_id 7TYV _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.ls_abs_structure_details ? _refine.ls_abs_structure_Flack ? _refine.ls_abs_structure_Flack_esd ? _refine.ls_abs_structure_Rogers ? _refine.ls_abs_structure_Rogers_esd ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_extinction_coef ? _refine.ls_extinction_coef_esd ? _refine.ls_extinction_expression ? _refine.ls_extinction_method ? _refine.ls_goodness_of_fit_all ? _refine.ls_goodness_of_fit_all_esd ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs_esd ? _refine.ls_hydrogen_treatment ? _refine.ls_matrix_type ? _refine.ls_number_constraints ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_work ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_Fsqd_factor_obs ? _refine.ls_R_I_factor_obs ? _refine.ls_redundancy_reflns_all ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.ls_restrained_S_all ? _refine.ls_restrained_S_obs ? _refine.ls_shift_over_esd_max ? _refine.ls_shift_over_esd_mean ? _refine.ls_structure_factor_coef ? _refine.ls_weighting_details ? _refine.ls_weighting_scheme ? _refine.ls_wR_factor_all ? _refine.ls_wR_factor_obs ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.occupancy_max ? _refine.occupancy_min ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.pdbx_R_complete ? _refine.ls_R_factor_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_ref ? _refine.ls_shift_over_su_max ? _refine.ls_shift_over_su_max_lt ? _refine.ls_shift_over_su_mean ? _refine.ls_shift_over_su_mean_lt ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_ls_sigma_Fsqd ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method NONE _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2' _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0027 ? 17648 ? f_bond_d ? ? 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A ASN 79 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? A ASN 79 F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 89 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? A ASN 89 A NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 99 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? A ASN 99 I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? A ASN 109 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? A ASN 109 A NAG 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? A ASN 167 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? A ASN 167 A NAG 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? A ASN 224 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? A ASN 224 V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? B ASN 79 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? B ASN 79 N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? B ASN 89 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? B ASN 89 B NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? B ASN 99 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? B ASN 99 O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? B ASN 109 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? B ASN 109 B NAG 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? B ASN 167 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? B ASN 167 B NAG 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? B ASN 224 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? B ASN 224 P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? C ASN 79 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? C ASN 79 R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? C ASN 89 ND2 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? C ASN 89 C NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? C ASN 99 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? C ASN 99 S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? C ASN 109 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? C ASN 109 C NAG 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? 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? ? 1 1 1 2 'IMAGE ACQUISITION' ? ? ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? ? ? 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? ? ? ? ? ? 8 'MODEL REFINEMENT' ? ? ? ? ? ? 9 OTHER ? ? ? ? ? ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? ? ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? cryoSPARC V2.14.2 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 0.7 _em_specimen.details 'This sample was monodisperse' _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # _pdbx_audit_support.funding_organization 'National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)' _pdbx_audit_support.country 'United States' _pdbx_audit_support.grant_number 'U19 A142790' _pdbx_audit_support.ordinal 1 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero M 5 NAG 1 F NAG 1 A NAG 1079 n M 5 NAG 2 F NAG 2 A NAG 1080 n M 5 BMA 3 F BMA 3 A BMA 1081 n M 5 MAN 4 F MAN 4 A MAN 1082 n M 5 MAN 5 F MAN 5 A MAN 1385 n N 6 NAG 1 I NAG 1 A NAG 1099 n N 6 NAG 2 I NAG 2 A NAG 1100 n O 6 NAG 1 V NAG 1 A NAG 1224 n O 6 NAG 2 V NAG 2 A NAG 1225 n P 7 NAG 1 M NAG 1 A NAG 1375 n P 7 NAG 2 M NAG 2 A NAG 1381 n P 7 BMA 3 M BMA 3 A BMA 1382 n P 7 MAN 4 M MAN 4 A MAN 1383 n P 7 MAN 5 M MAN 5 A MAN 1384 n Q 5 NAG 1 N NAG 1 B NAG 1079 n Q 5 NAG 2 N NAG 2 B NAG 1080 n Q 5 BMA 3 N BMA 3 B BMA 1081 n Q 5 MAN 4 N MAN 4 B MAN 1082 n Q 5 MAN 5 N MAN 5 B MAN 1381 n R 6 NAG 1 O NAG 1 B NAG 1099 n R 6 NAG 2 O NAG 2 B NAG 1100 n S 6 NAG 1 P NAG 1 B NAG 1224 n S 6 NAG 2 P NAG 2 B NAG 1225 n T 8 NAG 1 Q NAG 1 B NAG 1375 n T 8 NAG 2 Q NAG 2 B NAG 1376 n T 8 BMA 3 Q BMA 3 B BMA 1377 n T 8 MAN 4 Q MAN 4 B MAN 1378 n T 8 MAN 5 Q MAN 5 B MAN 1379 n T 8 MAN 6 Q MAN 6 B MAN 1380 n U 5 NAG 1 R NAG 1 C NAG 1079 n U 5 NAG 2 R NAG 2 C NAG 1080 n U 5 BMA 3 R BMA 3 C BMA 1081 n U 5 MAN 4 R MAN 4 C MAN 1082 n U 5 MAN 5 R MAN 5 C MAN 1382 n V 6 NAG 1 S NAG 1 C NAG 1099 n V 6 NAG 2 S NAG 2 C NAG 1100 n W 9 NAG 1 T NAG 1 C NAG 1224 n W 9 NAG 2 T NAG 2 C NAG 1225 n W 9 BMA 3 T BMA 3 C BMA 1375 n X 8 NAG 1 U NAG 1 C NAG 1376 n X 8 NAG 2 U NAG 2 C NAG 1377 n X 8 BMA 3 U BMA 3 C BMA 1378 n X 8 MAN 4 U MAN 4 C MAN 1379 n X 8 MAN 5 U MAN 5 C MAN 1380 n X 8 MAN 6 U MAN 6 C MAN 1381 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier BMA 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpb BMA 'COMMON NAME' GMML 1.0 b-D-mannopyranose BMA 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-Manp BMA 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man MAN 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpa MAN 'COMMON NAME' GMML 1.0 a-D-mannopyranose MAN 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 a-D-Manp MAN 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide 7 oligosaccharide 8 oligosaccharide 9 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 5 'DManpa1-3[DManpa1-6]DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH' 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 5 'WURCS=2.0/3,5,4/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3-3/a4-b1_b4-c1_c3-d1_c6-e1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 5 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{}[(6+1)][a-D-Manp]{}}}}' LINUCS PDB-CARE ? 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