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H N N 1 ? # _struct_ref.id 1 _struct_ref.db_name UNP _struct_ref.db_code Q92FL9_LISIN _struct_ref.pdbx_db_accession Q92FL9 _struct_ref.pdbx_db_isoform ? _struct_ref.entity_id 1 _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code ;MATNDELKNQLANKQNGGQVASAQSLDLKGLLEAPTMRKKFEKVLDKKAPQFLTSLLNLYNGDDYLQKTDPMTVVTSAMV AATLDLPIDKNLGYAWIVPYKGRAQFQLGYKGYIQLALRTGQYKSINVIEVREGELLKWNRLTEEIELDLDNNTSEKVVG YCGYFQLINGFEKTVYWTRKEIEAHKQKFSKSDFGWKKDYDAMAKKTVLRNMLSKWGILSIDMQTAVTEDEAEPRERKDV TDDESIPDIIDAPVTPSDTLEAGSVVQGSMI ; _struct_ref.pdbx_align_begin 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7UBB C 4 ? 274 ? Q92FL9 1 ? 271 ? 1 271 2 1 7UBB D 4 ? 274 ? Q92FL9 1 ? 271 ? 1 271 3 1 7UBB E 4 ? 274 ? Q92FL9 1 ? 271 ? 1 271 4 1 7UBB F 4 ? 274 ? Q92FL9 1 ? 271 ? 1 271 5 1 7UBB G 4 ? 274 ? Q92FL9 1 ? 271 ? 1 271 6 1 7UBB H 4 ? 274 ? Q92FL9 1 ? 271 ? 1 271 7 1 7UBB I 4 ? 274 ? Q92FL9 1 ? 271 ? 1 271 8 1 7UBB J 4 ? 274 ? Q92FL9 1 ? 271 ? 1 271 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 7UBB GLY C 1 ? UNP Q92FL9 ? ? 'expression tag' -2 1 1 7UBB SER C 2 ? UNP Q92FL9 ? ? 'expression tag' -1 2 1 7UBB HIS C 3 ? UNP Q92FL9 ? ? 'expression tag' 0 3 2 7UBB GLY D 1 ? UNP Q92FL9 ? ? 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'expression tag' -2 22 8 7UBB SER J 2 ? UNP Q92FL9 ? ? 'expression tag' -1 23 8 7UBB HIS J 3 ? UNP Q92FL9 ? ? 'expression tag' 0 24 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'mass spectrometry' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ;Native Mass Spectrometry shows two types of complexes for this sample (in ammonium acetate buffer): 7-10 subunits on on copy of the 83-mer ssDNA, or 16-17 subunits on two copies of the ssDNA. It is unclear which type of complex is present in the reconstruction. ; # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 TYR A 113 ? 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ASP F 193 ASP F 199 1 ? 7 HELX_P HELX_P16 AB7 ASP D 204 ? TRP D 219 ? ASP F 201 TRP F 216 1 ? 16 HELX_P HELX_P17 AB8 LYS E 114 ? GLY E 124 ? LYS G 111 GLY G 121 1 ? 11 HELX_P HELX_P18 AB9 ARG E 182 ? PHE E 192 ? ARG G 179 PHE G 189 1 ? 11 HELX_P HELX_P19 AC1 ASP E 196 ? ASP E 202 ? ASP G 193 ASP G 199 1 ? 7 HELX_P HELX_P20 AC2 ASP E 204 ? TRP E 219 ? ASP G 201 TRP G 216 1 ? 16 HELX_P HELX_P21 AC3 LYS F 114 ? GLY F 124 ? LYS H 111 GLY H 121 1 ? 11 HELX_P HELX_P22 AC4 ARG F 182 ? PHE F 192 ? ARG H 179 PHE H 189 1 ? 11 HELX_P HELX_P23 AC5 ASP F 196 ? ASP F 202 ? ASP H 193 ASP H 199 1 ? 7 HELX_P HELX_P24 AC6 ASP F 204 ? TRP F 219 ? ASP H 201 TRP H 216 1 ? 16 HELX_P HELX_P25 AC7 LYS G 114 ? GLY G 124 ? LYS I 111 GLY I 121 1 ? 11 HELX_P HELX_P26 AC8 ARG G 182 ? PHE G 192 ? ARG I 179 PHE I 189 1 ? 11 HELX_P HELX_P27 AC9 ASP G 196 ? ASP G 202 ? ASP I 193 ASP I 199 1 ? 7 HELX_P HELX_P28 AD1 ASP G 204 ? TRP G 219 ? ASP I 201 TRP I 216 1 ? 16 HELX_P HELX_P29 AD2 LYS H 114 ? GLY H 124 ? LYS J 111 GLY J 121 1 ? 11 HELX_P HELX_P30 AD3 ARG H 182 ? PHE H 192 ? ARG J 179 PHE J 189 1 ? 11 HELX_P HELX_P31 AD4 ASP H 196 ? ASP H 202 ? ASP J 193 ASP J 199 1 ? 7 HELX_P HELX_P32 AD5 ASP H 204 ? TRP H 219 ? ASP J 201 TRP J 216 1 ? 16 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 3 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 3 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 3 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 3 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 3 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 3 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 3 ? AB7 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 TYR A 126 ? ARG A 135 ? TYR C 123 ARG C 132 AA1 2 VAL A 161 ? LEU A 170 ? VAL C 158 LEU C 167 AA1 3 GLU A 175 ? THR A 181 ? GLU C 172 THR C 178 AA2 1 LEU A 139 ? TRP A 142 ? LEU C 136 TRP C 139 AA2 2 ILE A 149 ? LEU A 151 ? ILE C 146 LEU C 148 AA3 1 TYR B 126 ? ARG B 135 ? TYR D 123 ARG D 132 AA3 2 VAL B 161 ? LEU B 170 ? VAL D 158 LEU D 167 AA3 3 GLU B 175 ? THR B 181 ? GLU D 172 THR D 178 AA4 1 LEU B 139 ? TRP B 142 ? LEU D 136 TRP D 139 AA4 2 ILE B 149 ? LEU B 151 ? ILE D 146 LEU D 148 AA5 1 TYR C 126 ? ARG C 135 ? TYR E 123 ARG E 132 AA5 2 VAL C 161 ? LEU C 170 ? VAL E 158 LEU E 167 AA5 3 GLU C 175 ? THR C 181 ? GLU E 172 THR E 178 AA6 1 LEU C 139 ? TRP C 142 ? LEU E 136 TRP E 139 AA6 2 ILE C 149 ? LEU C 151 ? ILE E 146 LEU E 148 AA7 1 TYR D 126 ? ARG D 135 ? TYR F 123 ARG F 132 AA7 2 VAL D 161 ? LEU D 170 ? VAL F 158 LEU F 167 AA7 3 GLU D 175 ? THR D 181 ? GLU F 172 THR F 178 AA8 1 LEU D 139 ? TRP D 142 ? LEU F 136 TRP F 139 AA8 2 ILE D 149 ? LEU D 151 ? ILE F 146 LEU F 148 AA9 1 TYR E 126 ? ARG E 135 ? TYR G 123 ARG G 132 AA9 2 VAL E 161 ? LEU E 170 ? VAL G 158 LEU G 167 AA9 3 GLU E 175 ? THR E 181 ? GLU G 172 THR G 178 AB1 1 LEU E 139 ? TRP E 142 ? LEU G 136 TRP G 139 AB1 2 ILE E 149 ? LEU E 151 ? ILE G 146 LEU G 148 AB2 1 TYR F 126 ? ARG F 135 ? TYR H 123 ARG H 132 AB2 2 VAL F 161 ? LEU F 170 ? VAL H 158 LEU H 167 AB2 3 GLU F 175 ? THR F 181 ? GLU H 172 THR H 178 AB3 1 LEU F 139 ? TRP F 142 ? LEU H 136 TRP H 139 AB3 2 ILE F 149 ? LEU F 151 ? ILE H 146 LEU H 148 AB4 1 TYR G 126 ? ARG G 135 ? TYR I 123 ARG I 132 AB4 2 VAL G 161 ? LEU G 170 ? VAL I 158 LEU I 167 AB4 3 GLU G 175 ? THR G 181 ? GLU I 172 THR I 178 AB5 1 LEU G 139 ? TRP G 142 ? LEU I 136 TRP I 139 AB5 2 ILE G 149 ? LEU G 151 ? ILE I 146 LEU I 148 AB6 1 TYR H 126 ? ARG H 135 ? TYR J 123 ARG J 132 AB6 2 VAL H 161 ? LEU H 170 ? VAL J 158 LEU J 167 AB6 3 GLU H 175 ? THR H 181 ? GLU J 172 THR J 178 AB7 1 LEU H 139 ? TRP H 142 ? LEU J 136 TRP J 139 AB7 2 ILE H 149 ? LEU H 151 ? ILE J 146 LEU J 148 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N ILE A 132 ? N ILE C 129 O CYS A 165 ? O CYS C 162 AA1 2 3 N TYR A 164 ? N TYR C 161 O TRP A 180 ? O TRP C 177 AA2 1 2 N LEU A 140 ? N LEU C 137 O GLU A 150 ? O GLU C 147 AA3 1 2 N ILE B 132 ? N ILE D 129 O CYS B 165 ? O CYS D 162 AA3 2 3 N TYR B 164 ? N TYR D 161 O TRP B 180 ? O TRP D 177 AA4 1 2 N LEU B 140 ? N LEU D 137 O GLU B 150 ? O GLU D 147 AA5 1 2 N ILE C 132 ? N ILE E 129 O CYS C 165 ? O CYS E 162 AA5 2 3 N TYR C 164 ? N TYR E 161 O TRP C 180 ? O TRP E 177 AA6 1 2 N LEU C 140 ? N LEU E 137 O GLU C 150 ? O GLU E 147 AA7 1 2 N ILE D 132 ? N ILE F 129 O CYS D 165 ? O CYS F 162 AA7 2 3 N TYR D 164 ? N TYR F 161 O TRP D 180 ? O TRP F 177 AA8 1 2 N LEU D 140 ? N LEU F 137 O GLU D 150 ? O GLU F 147 AA9 1 2 N ILE E 132 ? N ILE G 129 O CYS E 165 ? O CYS G 162 AA9 2 3 N TYR E 164 ? N TYR G 161 O TRP E 180 ? O TRP G 177 AB1 1 2 N LEU E 140 ? N LEU G 137 O GLU E 150 ? O GLU G 147 AB2 1 2 N ILE F 132 ? N ILE H 129 O CYS F 165 ? O CYS H 162 AB2 2 3 N TYR F 164 ? N TYR H 161 O TRP F 180 ? O TRP H 177 AB3 1 2 N LEU F 140 ? N LEU H 137 O GLU F 150 ? O GLU H 147 AB4 1 2 N ILE G 132 ? N ILE I 129 O CYS G 165 ? O CYS I 162 AB4 2 3 N TYR G 164 ? N TYR I 161 O TRP G 180 ? O TRP I 177 AB5 1 2 N LEU G 140 ? N LEU I 137 O GLU G 150 ? O GLU I 147 AB6 1 2 N ILE H 132 ? N ILE J 129 O CYS H 165 ? O CYS J 162 AB6 2 3 N TYR H 164 ? N TYR J 161 O TRP H 180 ? O TRP J 177 AB7 1 2 N LEU H 140 ? N LEU J 137 O GLU H 150 ? O GLU J 147 # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 ASP C 151 ? ? 34.23 45.23 2 1 ASP D 151 ? ? 34.21 45.28 3 1 ASP E 151 ? ? 34.27 45.24 4 1 ASP F 151 ? ? 34.26 45.27 5 1 ASP G 151 ? ? 34.25 45.25 6 1 ASP H 151 ? ? 34.22 45.25 7 1 ASP I 151 ? ? 34.26 45.24 8 1 ASP J 151 ? ? 34.29 45.27 # _pdbx_entry_details.entry_id 7UBB _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.compound_details ;The modeled complex consists of 8 subunits of the RecT protein, which form a helical filament on ssDNA. The ssDNA was not modeled due to the low resolution. Density for four additional subunits, two on either end of the filament, was present, but not clear enough to dock into. ; _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest ? # _em_3d_fitting.entry_id 7UBB _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.details ;Phenix Real Space Refinement was by rigid body refinement of the eight different subunits. Due to the limited resolution, the refinement was limited to rigid body only. ; _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_protocol 'AB INITIO MODEL' _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 7UBB _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.details 'The final resolution with a tight mask was 4.5 Angstrom' _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.num_particles 180965 _em_3d_reconstruction.resolution 4.5 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details ;The LiRecT protein was mixed at 37C with one oligonucleotide, and placed on ice for 90 min. Then immediately prior to vitrification, 1 ul of 1.5 mM n-dodecyl-beta-maltoside (Anatrace) was added (0.5 CMC). ; _em_buffer.pH 6.0 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.details ;The protein was purified by Nickel affinity and anion exchange chromatography. The DNA was chemically synthesized and HPLC purified. ; _em_entity_assembly.name 'RecT protein from Listeria innocua phage A118, complexed with and 83-mer ssDNA' _em_entity_assembly.source RECOMBINANT _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.entity_id_list 1 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_image_scans.entry_id 7UBB _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.dimension_height 4000 _em_image_scans.dimension_width 6000 _em_image_scans.frames_per_image ? _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.used_frames_per_image ? _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.number_digital_images ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 7UBB _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter 50 _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.cryogen ? _em_imaging.details ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode 'SPOT SCAN' _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.nominal_defocus_max 1000 _em_imaging.nominal_defocus_min 3500 _em_imaging.nominal_magnification 81000 _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.specimen_holder_type ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details '60 seconds at 20 mA using a Pelco easiGlow' _em_sample_support.grid_material GOLD _em_sample_support.grid_mesh_size 300 _em_sample_support.grid_type 'Quantifoil R1.2/1.3' _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.citation_id ? # _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.chamber_temperature 277 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.details '1.5 second blot time. Ted Pella 595 filter paper.' _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.entry_id 7UBB _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 7UBB _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 7UBB _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 C GLY -2 ? A GLY 1 2 1 Y 1 C SER -1 ? A SER 2 3 1 Y 1 C HIS 0 ? A HIS 3 4 1 Y 1 C MET 1 ? A MET 4 5 1 Y 1 C ALA 2 ? A ALA 5 6 1 Y 1 C THR 3 ? A THR 6 7 1 Y 1 C ASN 4 ? A ASN 7 8 1 Y 1 C ASP 5 ? A ASP 8 9 1 Y 1 C GLU 6 ? A GLU 9 10 1 Y 1 C LEU 7 ? A LEU 10 11 1 Y 1 C LYS 8 ? A LYS 11 12 1 Y 1 C ASN 9 ? A ASN 12 13 1 Y 1 C GLN 10 ? A GLN 13 14 1 Y 1 C LEU 11 ? A LEU 14 15 1 Y 1 C ALA 12 ? A ALA 15 16 1 Y 1 C ASN 13 ? A ASN 16 17 1 Y 1 C LYS 14 ? A LYS 17 18 1 Y 1 C GLN 15 ? A GLN 18 19 1 Y 1 C ASN 16 ? A ASN 19 20 1 Y 1 C GLY 17 ? A GLY 20 21 1 Y 1 C GLY 18 ? A GLY 21 22 1 Y 1 C GLN 19 ? A GLN 22 23 1 Y 1 C VAL 20 ? A VAL 23 24 1 Y 1 C ALA 21 ? A ALA 24 25 1 Y 1 C SER 22 ? A SER 25 26 1 Y 1 C ALA 23 ? A ALA 26 27 1 Y 1 C GLN 24 ? A GLN 27 28 1 Y 1 C SER 25 ? A SER 28 29 1 Y 1 C LEU 26 ? A LEU 29 30 1 Y 1 C ASP 27 ? A ASP 30 31 1 Y 1 C LEU 28 ? A LEU 31 32 1 Y 1 C LYS 29 ? A LYS 32 33 1 Y 1 C GLY 30 ? A GLY 33 34 1 Y 1 C LEU 31 ? A LEU 34 35 1 Y 1 C LEU 32 ? A LEU 35 36 1 Y 1 C GLU 33 ? A GLU 36 37 1 Y 1 C ALA 34 ? A ALA 37 38 1 Y 1 C PRO 35 ? A PRO 38 39 1 Y 1 C THR 36 ? A THR 39 40 1 Y 1 C MET 37 ? A MET 40 41 1 Y 1 C ARG 38 ? A ARG 41 42 1 Y 1 C LYS 39 ? A LYS 42 43 1 Y 1 C LYS 40 ? A LYS 43 44 1 Y 1 C PHE 41 ? A PHE 44 45 1 Y 1 C GLU 42 ? A GLU 45 46 1 Y 1 C LYS 43 ? A LYS 46 47 1 Y 1 C VAL 44 ? A VAL 47 48 1 Y 1 C LEU 45 ? A LEU 48 49 1 Y 1 C ASP 46 ? A ASP 49 50 1 Y 1 C LYS 47 ? A LYS 50 51 1 Y 1 C LYS 48 ? A LYS 51 52 1 Y 1 C ALA 49 ? A ALA 52 53 1 Y 1 C PRO 50 ? A PRO 53 54 1 Y 1 C GLN 51 ? A GLN 54 55 1 Y 1 C PHE 52 ? A PHE 55 56 1 Y 1 C LEU 53 ? A LEU 56 57 1 Y 1 C THR 54 ? A THR 57 58 1 Y 1 C SER 55 ? A SER 58 59 1 Y 1 C LEU 56 ? A LEU 59 60 1 Y 1 C LEU 57 ? A LEU 60 61 1 Y 1 C ASN 58 ? A ASN 61 62 1 Y 1 C LEU 59 ? A LEU 62 63 1 Y 1 C TYR 60 ? A TYR 63 64 1 Y 1 C ASN 61 ? A ASN 64 65 1 Y 1 C GLY 62 ? A GLY 65 66 1 Y 1 C ASP 63 ? A ASP 66 67 1 Y 1 C ASP 64 ? A ASP 67 68 1 Y 1 C TYR 65 ? A TYR 68 69 1 Y 1 C LEU 66 ? A LEU 69 70 1 Y 1 C GLN 67 ? A GLN 70 71 1 Y 1 C LYS 68 ? A LYS 71 72 1 Y 1 C THR 69 ? A THR 72 73 1 Y 1 C ASP 70 ? A ASP 73 74 1 Y 1 C PRO 71 ? A PRO 74 75 1 Y 1 C MET 72 ? A MET 75 76 1 Y 1 C THR 73 ? A THR 76 77 1 Y 1 C VAL 74 ? A VAL 77 78 1 Y 1 C VAL 75 ? A VAL 78 79 1 Y 1 C THR 76 ? A THR 79 80 1 Y 1 C SER 77 ? A SER 80 81 1 Y 1 C ALA 78 ? A ALA 81 82 1 Y 1 C MET 79 ? A MET 82 83 1 Y 1 C VAL 80 ? A VAL 83 84 1 Y 1 C ALA 81 ? A ALA 84 85 1 Y 1 C ALA 82 ? A ALA 85 86 1 Y 1 C THR 83 ? A THR 86 87 1 Y 1 C LEU 84 ? A LEU 87 88 1 Y 1 C ASP 85 ? A ASP 88 89 1 Y 1 C LEU 86 ? A LEU 89 90 1 Y 1 C PRO 87 ? A PRO 90 91 1 Y 1 C ILE 88 ? A ILE 91 92 1 Y 1 C ASP 89 ? A ASP 92 93 1 Y 1 C LYS 90 ? A LYS 93 94 1 Y 1 C ASN 91 ? A ASN 94 95 1 Y 1 C LEU 92 ? A LEU 95 96 1 Y 1 C GLY 93 ? A GLY 96 97 1 Y 1 C TYR 94 ? A TYR 97 98 1 Y 1 C ALA 95 ? A ALA 98 99 1 Y 1 C TRP 96 ? A TRP 99 100 1 Y 1 C ILE 97 ? A ILE 100 101 1 Y 1 C VAL 98 ? A VAL 101 102 1 Y 1 C PRO 99 ? A PRO 102 103 1 Y 1 C TYR 100 ? A TYR 103 104 1 Y 1 C LYS 101 ? A LYS 104 105 1 Y 1 C GLY 102 ? A GLY 105 106 1 Y 1 C ARG 103 ? A ARG 106 107 1 Y 1 C ALA 104 ? A ALA 107 108 1 Y 1 C GLN 105 ? A GLN 108 109 1 Y 1 C PHE 106 ? A PHE 109 110 1 Y 1 C GLN 107 ? A GLN 110 111 1 Y 1 C LEU 108 ? A LEU 111 112 1 Y 1 C GLY 109 ? A GLY 112 113 1 Y 1 C ASP 222 ? A ASP 225 114 1 Y 1 C MET 223 ? A MET 226 115 1 Y 1 C GLN 224 ? A GLN 227 116 1 Y 1 C THR 225 ? A THR 228 117 1 Y 1 C ALA 226 ? A ALA 229 118 1 Y 1 C VAL 227 ? A VAL 230 119 1 Y 1 C THR 228 ? A THR 231 120 1 Y 1 C GLU 229 ? A GLU 232 121 1 Y 1 C ASP 230 ? A ASP 233 122 1 Y 1 C GLU 231 ? A GLU 234 123 1 Y 1 C ALA 232 ? A ALA 235 124 1 Y 1 C GLU 233 ? A GLU 236 125 1 Y 1 C PRO 234 ? A PRO 237 126 1 Y 1 C ARG 235 ? A ARG 238 127 1 Y 1 C GLU 236 ? A GLU 239 128 1 Y 1 C ARG 237 ? A ARG 240 129 1 Y 1 C LYS 238 ? A LYS 241 130 1 Y 1 C ASP 239 ? A ASP 242 131 1 Y 1 C VAL 240 ? A VAL 243 132 1 Y 1 C THR 241 ? A THR 244 133 1 Y 1 C ASP 242 ? A ASP 245 134 1 Y 1 C ASP 243 ? A ASP 246 135 1 Y 1 C GLU 244 ? 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B MET 4 167 1 Y 1 D ALA 2 ? B ALA 5 168 1 Y 1 D THR 3 ? B THR 6 169 1 Y 1 D ASN 4 ? B ASN 7 170 1 Y 1 D ASP 5 ? B ASP 8 171 1 Y 1 D GLU 6 ? B GLU 9 172 1 Y 1 D LEU 7 ? B LEU 10 173 1 Y 1 D LYS 8 ? B LYS 11 174 1 Y 1 D ASN 9 ? B ASN 12 175 1 Y 1 D GLN 10 ? B GLN 13 176 1 Y 1 D LEU 11 ? B LEU 14 177 1 Y 1 D ALA 12 ? B ALA 15 178 1 Y 1 D ASN 13 ? B ASN 16 179 1 Y 1 D LYS 14 ? B LYS 17 180 1 Y 1 D GLN 15 ? B GLN 18 181 1 Y 1 D ASN 16 ? B ASN 19 182 1 Y 1 D GLY 17 ? B GLY 20 183 1 Y 1 D GLY 18 ? B GLY 21 184 1 Y 1 D GLN 19 ? B GLN 22 185 1 Y 1 D VAL 20 ? B VAL 23 186 1 Y 1 D ALA 21 ? B ALA 24 187 1 Y 1 D SER 22 ? B SER 25 188 1 Y 1 D ALA 23 ? B ALA 26 189 1 Y 1 D GLN 24 ? B GLN 27 190 1 Y 1 D SER 25 ? B SER 28 191 1 Y 1 D LEU 26 ? B LEU 29 192 1 Y 1 D ASP 27 ? B ASP 30 193 1 Y 1 D LEU 28 ? B LEU 31 194 1 Y 1 D LYS 29 ? B LYS 32 195 1 Y 1 D GLY 30 ? B GLY 33 196 1 Y 1 D LEU 31 ? B LEU 34 197 1 Y 1 D LEU 32 ? B LEU 35 198 1 Y 1 D GLU 33 ? B GLU 36 199 1 Y 1 D ALA 34 ? 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