HEADER CELL INVASION/IMMUNE SYSTEM 02-MAY-22 7UVI TITLE PFS230 DOMAIN 1 BOUND BY RUPA-55 FAB COMPND MOL_ID: 1; COMPND 2 MOLECULE: RUPA-55 FAB HEAVY CHAIN; COMPND 3 CHAIN: A, D; COMPND 4 ENGINEERED: YES; COMPND 5 MOL_ID: 2; COMPND 6 MOLECULE: RUPA-55 FAB LIGHT CHAIN; COMPND 7 CHAIN: B, E; COMPND 8 ENGINEERED: YES; COMPND 9 MOL_ID: 3; COMPND 10 MOLECULE: GAMETOCYTE SURFACE PROTEIN P230; COMPND 11 CHAIN: C, F; COMPND 12 FRAGMENT: DOMAIN 1; COMPND 13 ENGINEERED: YES SOURCE MOL_ID: 1; SOURCE 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: HOMO SAPIENS; SOURCE 3 ORGANISM_TAXID: 9606; SOURCE 4 EXPRESSION_SYSTEM: HOMO SAPIENS; SOURCE 5 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID: 9606; SOURCE 6 MOL_ID: 2; SOURCE 7 ORGANISM_SCIENTIFIC: HOMO SAPIENS; SOURCE 8 ORGANISM_TAXID: 9606; SOURCE 9 EXPRESSION_SYSTEM: HOMO SAPIENS; SOURCE 10 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID: 9606; SOURCE 11 MOL_ID: 3; SOURCE 12 ORGANISM_SCIENTIFIC: PLASMODIUM FALCIPARUM; SOURCE 13 ORGANISM_COMMON: MALARIA PARASITE P. FALCIPARUM; SOURCE 14 ORGANISM_TAXID: 5833; SOURCE 15 GENE: PFS230, PF230, S230, PF3D7_0209000; SOURCE 16 EXPRESSION_SYSTEM: HOMO SAPIENS; SOURCE 17 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID: 9606 KEYWDS ANTIBODY-FRAGMENT, MALARIA TRANSMISSION, CELL INVASION, CELL KEYWDS 2 INVASION-IMMUNE SYSTEM COMPLEX EXPDTA X-RAY DIFFRACTION AUTHOR D.IVANOCHKO,J.NEWTON,J.P.JULIEN REVDAT 4 30-OCT-24 7UVI 1 REMARK REVDAT 3 25-OCT-23 7UVI 1 REMARK REVDAT 2 30-AUG-23 7UVI 1 JRNL REVDAT 1 15-FEB-23 7UVI 0 JRNL AUTH D.IVANOCHKO,A.FABRA-GARCIA,K.TEELEN,M.VAN DE VEGTE-BOLMER, JRNL AUTH 2 G.J.VAN GEMERT,J.NEWTON,A.SEMESI,M.DE BRUIJNI,J.BOLSCHER, JRNL AUTH 3 J.RAMJITH,M.SZABAT,S.VOGT,L.KRAFT,S.DUNCAN,S.M.LEE, JRNL AUTH 4 M.R.KAMYA,M.E.FEENEY,P.JAGANNATHAN,B.GREENHOUSE, JRNL AUTH 5 R.W.SAUERWEIN,C.RICHTER KING,R.S.MACGILL,T.BOUSEMA,M.M.JORE, JRNL AUTH 6 J.P.JULIEN JRNL TITL POTENT TRANSMISSION-BLOCKING MONOCLONAL ANTIBODIES FROM JRNL TITL 2 NATURALLY EXPOSED INDIVIDUALS TARGET A CONSERVED EPITOPE ON JRNL TITL 3 PLASMODIUM FALCIPARUM PFS230. JRNL REF IMMUNITY V. 56 420 2023 JRNL REFN ISSN 1074-7613 JRNL PMID 36792575 JRNL DOI 10.1016/J.IMMUNI.2023.01.013 REMARK 2 REMARK 2 RESOLUTION. 2.92 ANGSTROMS. REMARK 3 REMARK 3 REFINEMENT. REMARK 3 PROGRAM : PHENIX 1.17.1_3660 REMARK 3 AUTHORS : PAUL ADAMS,PAVEL AFONINE,VINCENT CHEN,IAN REMARK 3 : DAVIS,KRESHNA GOPAL,RALF GROSSE-KUNSTLEVE, REMARK 3 : LI-WEI HUNG,ROBERT IMMORMINO,TOM IOERGER, REMARK 3 : AIRLIE MCCOY,ERIK MCKEE,NIGEL MORIARTY, REMARK 3 : REETAL PAI,RANDY READ,JANE RICHARDSON, REMARK 3 : DAVID RICHARDSON,TOD ROMO,JIM SACCHETTINI, REMARK 3 : NICHOLAS SAUTER,JACOB SMITH,LAURENT REMARK 3 : STORONI,TOM TERWILLIGER,PETER ZWART REMARK 3 REMARK 3 REFINEMENT TARGET : GEOSTD + MONOMER LIBRARY + CDL V1.2 REMARK 3 REMARK 3 DATA USED IN REFINEMENT. REMARK 3 RESOLUTION RANGE HIGH (ANGSTROMS) : 2.92 REMARK 3 RESOLUTION RANGE LOW (ANGSTROMS) : 29.67 REMARK 3 MIN(FOBS/SIGMA_FOBS) : 1.340 REMARK 3 COMPLETENESS FOR RANGE (%) : 99.7 REMARK 3 NUMBER OF REFLECTIONS : 42985 REMARK 3 REMARK 3 FIT TO DATA USED IN REFINEMENT. REMARK 3 R VALUE (WORKING + TEST SET) : 0.219 REMARK 3 R VALUE (WORKING SET) : 0.218 REMARK 3 FREE R VALUE : 0.237 REMARK 3 FREE R VALUE TEST SET SIZE (%) : 4.730 REMARK 3 FREE R VALUE TEST SET COUNT : 2033 REMARK 3 REMARK 3 FIT TO DATA USED IN REFINEMENT (IN BINS). REMARK 3 BIN RESOLUTION RANGE COMPL. NWORK NFREE RWORK RFREE REMARK 3 1 29.6700 - 7.1700 0.99 2928 99 0.2095 0.1349 REMARK 3 2 7.1700 - 5.7000 1.00 2745 202 0.2160 0.2563 REMARK 3 3 5.7000 - 4.9900 0.99 2789 101 0.1804 0.2312 REMARK 3 4 4.9900 - 4.5300 1.00 2657 202 0.1675 0.1948 REMARK 3 5 4.5300 - 4.2100 1.00 2767 101 0.1690 0.2224 REMARK 3 6 4.2100 - 3.9600 1.00 2765 101 0.1960 0.2332 REMARK 3 7 3.9600 - 3.7600 1.00 2671 202 0.2188 0.2676 REMARK 3 8 3.7600 - 3.6000 1.00 2741 101 0.2374 0.2481 REMARK 3 9 3.6000 - 3.4600 1.00 2739 101 0.2364 0.2521 REMARK 3 10 3.4600 - 3.3400 0.99 2626 199 0.2574 0.3069 REMARK 3 11 3.3400 - 3.2400 1.00 2720 101 0.2765 0.3558 REMARK 3 12 3.2400 - 3.1500 1.00 2724 101 0.2981 0.3230 REMARK 3 13 3.1500 - 3.0600 1.00 2639 200 0.3221 0.3581 REMARK 3 14 3.0600 - 2.9900 1.00 2753 101 0.3449 0.4057 REMARK 3 15 2.9900 - 2.9200 1.00 2688 121 0.3953 0.4395 REMARK 3 REMARK 3 BULK SOLVENT MODELLING. REMARK 3 METHOD USED : FLAT BULK SOLVENT MODEL REMARK 3 SOLVENT RADIUS : 1.11 REMARK 3 SHRINKAGE RADIUS : 0.90 REMARK 3 K_SOL : NULL REMARK 3 B_SOL : NULL REMARK 3 REMARK 3 ERROR ESTIMATES. REMARK 3 COORDINATE ERROR (MAXIMUM-LIKELIHOOD BASED) : 0.436 REMARK 3 PHASE ERROR (DEGREES, MAXIMUM-LIKELIHOOD BASED) : 31.455 REMARK 3 REMARK 3 B VALUES. REMARK 3 FROM WILSON PLOT (A**2) : 82.25 REMARK 3 MEAN B VALUE (OVERALL, A**2) : 106.5 REMARK 3 OVERALL ANISOTROPIC B VALUE. REMARK 3 B11 (A**2) : NULL REMARK 3 B22 (A**2) : NULL REMARK 3 B33 (A**2) : NULL REMARK 3 B12 (A**2) : NULL REMARK 3 B13 (A**2) : NULL REMARK 3 B23 (A**2) : NULL REMARK 3 REMARK 3 TWINNING INFORMATION. REMARK 3 FRACTION: NULL REMARK 3 OPERATOR: NULL REMARK 3 REMARK 3 DEVIATIONS FROM IDEAL VALUES. REMARK 3 RMSD COUNT REMARK 3 BOND : 0.004 9697 REMARK 3 ANGLE : 0.929 13174 REMARK 3 CHIRALITY : 0.056 1483 REMARK 3 PLANARITY : 0.007 1680 REMARK 3 DIHEDRAL : 18.137 3534 REMARK 3 REMARK 3 TLS DETAILS REMARK 3 NUMBER OF TLS GROUPS : NULL REMARK 3 REMARK 3 NCS DETAILS REMARK 3 NUMBER OF NCS GROUPS : 3 REMARK 3 NCS GROUP : 1 REMARK 3 NCS OPERATOR : 1 REMARK 3 REFERENCE SELECTION: (CHAIN 'A' AND (RESID 2 THROUGH 29 OR REMARK 3 RESID 31 THROUGH 60 OR RESID 62 THROUGH REMARK 3 82C OR RESID 84 THROUGH 116 OR RESID 118 REMARK 3 THROUGH 127 OR RESID 130 THROUGH 147 OR REMARK 3 RESID 149 THROUGH 150 OR RESID 152 REMARK 3 THROUGH 169 OR RESID 172 THROUGH 190 OR REMARK 3 RESID 192 THROUGH 200 OR RESID 202 REMARK 3 THROUGH 205 OR RESID 207 THROUGH 208 OR REMARK 3 RESID 210 THROUGH 211 OR RESID 213)) REMARK 3 SELECTION : (CHAIN 'D' AND (RESID 2 THROUGH 29 OR REMARK 3 RESID 31 THROUGH 60 OR RESID 62 THROUGH REMARK 3 82C OR RESID 84 THROUGH 116 OR RESID 118 REMARK 3 THROUGH 127 OR RESID 130 THROUGH 147 OR REMARK 3 RESID 149 THROUGH 150 OR RESID 152 REMARK 3 THROUGH 169 OR RESID 172 THROUGH 190 OR REMARK 3 RESID 192 THROUGH 200 OR RESID 202 REMARK 3 THROUGH 205 OR RESID 207 THROUGH 208 OR REMARK 3 RESID 210 THROUGH 211 OR RESID 213)) REMARK 3 ATOM PAIRS NUMBER : NULL REMARK 3 RMSD : NULL REMARK 3 NCS GROUP : 2 REMARK 3 NCS OPERATOR : 1 REMARK 3 REFERENCE SELECTION: (CHAIN 'B' AND (RESID 1 THROUGH 9 OR REMARK 3 RESID 11 THROUGH 26 OR RESID 28 THROUGH REMARK 3 29 OR RESID 31 THROUGH 44 OR RESID 46 REMARK 3 THROUGH 80 OR RESID 82 THROUGH 126 OR REMARK 3 RESID 128 THROUGH 144 OR RESID 146 REMARK 3 THROUGH 148 OR RESID 150 THROUGH 154 OR REMARK 3 RESID 157 THROUGH 168 OR RESID 170 REMARK 3 THROUGH 171 OR RESID 173 THROUGH 187 OR REMARK 3 RESID 189 THROUGH 209)) REMARK 3 SELECTION : (CHAIN 'E' AND (RESID 1 THROUGH 9 OR REMARK 3 RESID 11 THROUGH 26 OR RESID 28 THROUGH REMARK 3 29 OR RESID 31 THROUGH 44 OR RESID 46 REMARK 3 THROUGH 80 OR RESID 82 THROUGH 126 OR REMARK 3 RESID 128 THROUGH 144 OR RESID 146 REMARK 3 THROUGH 148 OR RESID 150 THROUGH 154 OR REMARK 3 RESID 157 THROUGH 168 OR RESID 170 REMARK 3 THROUGH 171 OR RESID 173 THROUGH 187 OR REMARK 3 RESID 189 THROUGH 209)) REMARK 3 ATOM PAIRS NUMBER : NULL REMARK 3 RMSD : NULL REMARK 3 NCS GROUP : 3 REMARK 3 NCS OPERATOR : 1 REMARK 3 REFERENCE SELECTION: (CHAIN 'C' AND (RESID 580 THROUGH 586 OR REMARK 3 RESID 590 THROUGH 613 OR RESID 615 REMARK 3 THROUGH 633 OR RESID 635 THROUGH 643 OR REMARK 3 RESID 645 THROUGH 652 OR RESID 658 REMARK 3 THROUGH 660 OR RESID 662 THROUGH 677 OR REMARK 3 RESID 680 THROUGH 697 OR RESID 699 REMARK 3 THROUGH 715 OR RESID 717 THROUGH 719 OR REMARK 3 RESID 721 THROUGH 730 OR RESID 740)) REMARK 3 SELECTION : (CHAIN 'F' AND (RESID 580 THROUGH 586 OR REMARK 3 RESID 590 THROUGH 613 OR RESID 615 REMARK 3 THROUGH 633 OR RESID 635 THROUGH 643 OR REMARK 3 RESID 645 THROUGH 652 OR RESID 658 REMARK 3 THROUGH 660 OR RESID 662 THROUGH 677 OR REMARK 3 RESID 680 THROUGH 697 OR RESID 699 REMARK 3 THROUGH 715 OR RESID 717 THROUGH 719 OR REMARK 3 RESID 721 THROUGH 730 OR RESID 740)) REMARK 3 ATOM PAIRS NUMBER : NULL REMARK 3 RMSD : NULL REMARK 3 REMARK 3 OTHER REFINEMENT REMARKS: NULL REMARK 4 REMARK 4 7UVI COMPLIES WITH FORMAT V. 3.30, 13-JUL-11 REMARK 100 REMARK 100 THIS ENTRY HAS BEEN PROCESSED BY RCSB ON 19-MAY-22. REMARK 100 THE DEPOSITION ID IS D_1000265017. REMARK 200 REMARK 200 EXPERIMENTAL DETAILS REMARK 200 EXPERIMENT TYPE : X-RAY DIFFRACTION REMARK 200 DATE OF DATA COLLECTION : 17-FEB-21 REMARK 200 TEMPERATURE (KELVIN) : 100 REMARK 200 PH : NULL REMARK 200 NUMBER OF CRYSTALS USED : 1 REMARK 200 REMARK 200 SYNCHROTRON (Y/N) : Y REMARK 200 RADIATION SOURCE : APS REMARK 200 BEAMLINE : 23-ID-B REMARK 200 X-RAY GENERATOR MODEL : NULL REMARK 200 MONOCHROMATIC OR LAUE (M/L) : M REMARK 200 WAVELENGTH OR RANGE (A) : 1.033167 REMARK 200 MONOCHROMATOR : NULL REMARK 200 OPTICS : NULL REMARK 200 REMARK 200 DETECTOR TYPE : PIXEL REMARK 200 DETECTOR MANUFACTURER : DECTRIS EIGER X 16M REMARK 200 INTENSITY-INTEGRATION SOFTWARE : XPREP REMARK 200 DATA SCALING SOFTWARE : XDS REMARK 200 REMARK 200 NUMBER OF UNIQUE REFLECTIONS : 43033 REMARK 200 RESOLUTION RANGE HIGH (A) : 2.920 REMARK 200 RESOLUTION RANGE LOW (A) : 29.670 REMARK 200 REJECTION CRITERIA (SIGMA(I)) : NULL REMARK 200 REMARK 200 OVERALL. REMARK 200 COMPLETENESS FOR RANGE (%) : 99.7 REMARK 200 DATA REDUNDANCY : 26.90 REMARK 200 R MERGE (I) : 0.27400 REMARK 200 R SYM (I) : NULL REMARK 200 FOR THE DATA SET : 11.5000 REMARK 200 REMARK 200 IN THE HIGHEST RESOLUTION SHELL. REMARK 200 HIGHEST RESOLUTION SHELL, RANGE HIGH (A) : 2.92 REMARK 200 HIGHEST RESOLUTION SHELL, RANGE LOW (A) : 3.03 REMARK 200 COMPLETENESS FOR SHELL (%) : NULL REMARK 200 DATA REDUNDANCY IN SHELL : NULL REMARK 200 R MERGE FOR SHELL (I) : 2.99500 REMARK 200 R SYM FOR SHELL (I) : NULL REMARK 200 FOR SHELL : 1.700 REMARK 200 REMARK 200 DIFFRACTION PROTOCOL: SINGLE WAVELENGTH REMARK 200 METHOD USED TO DETERMINE THE STRUCTURE: MOLECULAR REPLACEMENT REMARK 200 SOFTWARE USED: PHASER REMARK 200 STARTING MODEL: 6OHG REMARK 200 REMARK 200 REMARK: NULL REMARK 280 REMARK 280 CRYSTAL REMARK 280 SOLVENT CONTENT, VS (%): 64.63 REMARK 280 MATTHEWS COEFFICIENT, VM (ANGSTROMS**3/DA): 3.48 REMARK 280 REMARK 280 CRYSTALLIZATION CONDITIONS: 0.1 M CAPS PH 10.5, 0.8 M DI-POTASSIUM REMARK 280 HYDROGEN PHOSPHATE, 0.2 M LITHIUM SULFATE, 1.2 M SODIUM DI- REMARK 280 HYDROGEN PHOSPHATE, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE REMARK 280 298K REMARK 290 REMARK 290 CRYSTALLOGRAPHIC SYMMETRY REMARK 290 SYMMETRY OPERATORS FOR SPACE GROUP: I 2 2 2 REMARK 290 REMARK 290 SYMOP SYMMETRY REMARK 290 NNNMMM OPERATOR REMARK 290 1555 X,Y,Z REMARK 290 2555 -X,-Y,Z REMARK 290 3555 -X,Y,-Z REMARK 290 4555 X,-Y,-Z REMARK 290 5555 X+1/2,Y+1/2,Z+1/2 REMARK 290 6555 -X+1/2,-Y+1/2,Z+1/2 REMARK 290 7555 -X+1/2,Y+1/2,-Z+1/2 REMARK 290 8555 X+1/2,-Y+1/2,-Z+1/2 REMARK 290 REMARK 290 WHERE NNN -> OPERATOR NUMBER REMARK 290 MMM -> TRANSLATION VECTOR REMARK 290 REMARK 290 CRYSTALLOGRAPHIC SYMMETRY TRANSFORMATIONS REMARK 290 THE FOLLOWING TRANSFORMATIONS OPERATE ON THE ATOM/HETATM REMARK 290 RECORDS IN THIS ENTRY TO PRODUCE CRYSTALLOGRAPHICALLY REMARK 290 RELATED MOLECULES. REMARK 290 SMTRY1 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 REMARK 290 SMTRY2 1 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 REMARK 290 SMTRY3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 REMARK 290 SMTRY1 2 -1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 REMARK 290 SMTRY2 2 0.000000 -1.000000 0.000000 0.00000 REMARK 290 SMTRY3 2 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 REMARK 290 SMTRY1 3 -1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 REMARK 290 SMTRY2 3 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 REMARK 290 SMTRY3 3 0.000000 0.000000 -1.000000 0.00000 REMARK 290 SMTRY1 4 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 REMARK 290 SMTRY2 4 0.000000 -1.000000 0.000000 0.00000 REMARK 290 SMTRY3 4 0.000000 0.000000 -1.000000 0.00000 REMARK 290 SMTRY1 5 1.000000 0.000000 0.000000 45.51000 REMARK 290 SMTRY2 5 0.000000 1.000000 0.000000 50.39000 REMARK 290 SMTRY3 5 0.000000 0.000000 1.000000 212.87500 REMARK 290 SMTRY1 6 -1.000000 0.000000 0.000000 45.51000 REMARK 290 SMTRY2 6 0.000000 -1.000000 0.000000 50.39000 REMARK 290 SMTRY3 6 0.000000 0.000000 1.000000 212.87500 REMARK 290 SMTRY1 7 -1.000000 0.000000 0.000000 45.51000 REMARK 290 SMTRY2 7 0.000000 1.000000 0.000000 50.39000 REMARK 290 SMTRY3 7 0.000000 0.000000 -1.000000 212.87500 REMARK 290 SMTRY1 8 1.000000 0.000000 0.000000 45.51000 REMARK 290 SMTRY2 8 0.000000 -1.000000 0.000000 50.39000 REMARK 290 SMTRY3 8 0.000000 0.000000 -1.000000 212.87500 REMARK 290 REMARK 290 REMARK: NULL REMARK 300 REMARK 300 BIOMOLECULE: 1, 2 REMARK 300 SEE REMARK 350 FOR THE AUTHOR PROVIDED AND/OR PROGRAM REMARK 300 GENERATED ASSEMBLY INFORMATION FOR THE STRUCTURE IN REMARK 300 THIS ENTRY. THE REMARK MAY ALSO PROVIDE INFORMATION ON REMARK 300 BURIED SURFACE AREA. REMARK 350 REMARK 350 COORDINATES FOR A COMPLETE MULTIMER REPRESENTING THE KNOWN REMARK 350 BIOLOGICALLY SIGNIFICANT OLIGOMERIZATION STATE OF THE REMARK 350 MOLECULE CAN BE GENERATED BY APPLYING BIOMT TRANSFORMATIONS REMARK 350 GIVEN BELOW. BOTH NON-CRYSTALLOGRAPHIC AND REMARK 350 CRYSTALLOGRAPHIC OPERATIONS ARE GIVEN. REMARK 350 REMARK 350 BIOMOLECULE: 1 REMARK 350 AUTHOR DETERMINED BIOLOGICAL UNIT: TRIMERIC REMARK 350 APPLY THE FOLLOWING TO CHAINS: A, B, C REMARK 350 BIOMT1 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 REMARK 350 BIOMT2 1 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 REMARK 350 BIOMT3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 REMARK 350 REMARK 350 BIOMOLECULE: 2 REMARK 350 AUTHOR DETERMINED BIOLOGICAL UNIT: TRIMERIC REMARK 350 APPLY THE FOLLOWING TO CHAINS: D, E, F REMARK 350 BIOMT1 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 REMARK 350 BIOMT2 1 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 REMARK 350 BIOMT3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 REMARK 465 REMARK 465 MISSING RESIDUES REMARK 465 THE FOLLOWING RESIDUES WERE NOT LOCATED IN THE REMARK 465 EXPERIMENT. (M=MODEL NUMBER; RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN REMARK 465 IDENTIFIER; SSSEQ=SEQUENCE NUMBER; I=INSERTION CODE.) REMARK 465 REMARK 465 M RES C SSSEQI REMARK 465 LYS A 214 REMARK 465 SER A 215 REMARK 465 CYS A 216 REMARK 465 GLY B 212 REMARK 465 GLU B 213 REMARK 465 CYS B 214 REMARK 465 VAL C 552 REMARK 465 GLY C 553 REMARK 465 VAL C 554 REMARK 465 ASP C 555 REMARK 465 GLU C 556 REMARK 465 LEU C 557 REMARK 465 ASP C 558 REMARK 465 LYS C 559 REMARK 465 ILE C 560 REMARK 465 ASP C 561 REMARK 465 GLN C 747 REMARK 465 PHE C 748 REMARK 465 GLU C 749 REMARK 465 LYS C 750 REMARK 465 SER D 215 REMARK 465 CYS D 216 REMARK 465 CYS E 214 REMARK 465 VAL F 552 REMARK 465 GLY F 553 REMARK 465 VAL F 554 REMARK 465 ASP F 555 REMARK 465 GLU F 556 REMARK 465 LEU F 557 REMARK 465 ASP F 558 REMARK 465 LYS F 559 REMARK 465 ILE F 560 REMARK 465 ASP F 561 REMARK 465 LEU F 562 REMARK 465 SER F 563 REMARK 465 TYR F 564 REMARK 465 GLU F 565 REMARK 465 THR F 566 REMARK 465 THR F 567 REMARK 465 GLU F 568 REMARK 465 SER F 569 REMARK 465 GLY F 570 REMARK 465 ASP F 571 REMARK 465 THR F 572 REMARK 465 ALA F 573 REMARK 465 VAL F 574 REMARK 465 SER F 575 REMARK 465 GLU F 576 REMARK 465 GLN F 747 REMARK 465 PHE F 748 REMARK 465 GLU F 749 REMARK 465 LYS F 750 REMARK 500 REMARK 500 GEOMETRY AND STEREOCHEMISTRY REMARK 500 SUBTOPIC: TORSION ANGLES REMARK 500 REMARK 500 TORSION ANGLES OUTSIDE THE EXPECTED RAMACHANDRAN REGIONS: REMARK 500 (M=MODEL NUMBER; RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN IDENTIFIER; REMARK 500 SSEQ=SEQUENCE NUMBER; I=INSERTION CODE). REMARK 500 REMARK 500 STANDARD TABLE: REMARK 500 FORMAT:(10X,I3,1X,A3,1X,A1,I4,A1,4X,F7.2,3X,F7.2) REMARK 500 REMARK 500 EXPECTED VALUES: GJ KLEYWEGT AND TA JONES (1996). PHI/PSI- REMARK 500 CHOLOGY: RAMACHANDRAN REVISITED. STRUCTURE 4, 1395 - 1400 REMARK 500 REMARK 500 M RES CSSEQI PSI PHI REMARK 500 ARG A 55 -32.32 -136.73 REMARK 500 PHE A 100E 74.14 -100.37 REMARK 500 PRO A 113 36.72 -84.57 REMARK 500 SER A 132 -66.18 -96.19 REMARK 500 LEU B 47 -61.71 -103.64 REMARK 500 ALA B 51 -4.89 78.44 REMARK 500 SER B 52 -1.11 -151.28 REMARK 500 ASP C 580 75.32 52.71 REMARK 500 ASN C 588 -24.00 73.23 REMARK 500 THR C 602 -53.98 -123.06 REMARK 500 LYS C 634 -1.40 70.47 REMARK 500 GLU C 654 -50.62 -121.85 REMARK 500 THR C 656 18.01 56.60 REMARK 500 GLU C 678 1.59 58.59 REMARK 500 TRP C 743 -12.28 72.88 REMARK 500 LYS D 129 33.89 -97.90 REMARK 500 SER D 130 28.54 -140.63 REMARK 500 SER D 132 52.50 -97.74 REMARK 500 ASP D 144 62.98 61.89 REMARK 500 LEU E 47 -60.45 -107.93 REMARK 500 ALA E 51 -3.23 78.00 REMARK 500 SER E 52 -0.74 -150.21 REMARK 500 ASN E 138 66.63 60.01 REMARK 500 ASN F 588 -22.65 76.22 REMARK 500 LYS F 589 -23.13 -146.37 REMARK 500 LYS F 634 -8.17 72.81 REMARK 500 GLU F 654 -64.77 -94.34 REMARK 500 THR F 656 -12.88 72.13 REMARK 500 ASN F 677 57.83 -143.56 REMARK 500 REMARK 500 REMARK: NULL REMARK 500 REMARK 500 GEOMETRY AND STEREOCHEMISTRY REMARK 500 SUBTOPIC: NON-CIS, NON-TRANS REMARK 500 REMARK 500 THE FOLLOWING PEPTIDE BONDS DEVIATE SIGNIFICANTLY FROM BOTH REMARK 500 CIS AND TRANS CONFORMATION. CIS BONDS, IF ANY, ARE LISTED REMARK 500 ON CISPEP RECORDS. TRANS IS DEFINED AS 180 +/- 30 AND REMARK 500 CIS IS DEFINED AS 0 +/- 30 DEGREES. REMARK 500 MODEL OMEGA REMARK 500 SER C 744 HIS C 745 -149.00 REMARK 500 REMARK 500 REMARK: NULL REMARK 900 REMARK 900 RELATED ENTRIES REMARK 900 RELATED ID: 7UVH RELATED DB: PDB DBREF 7UVI A 1 216 PDB 7UVI 7UVI 1 216 DBREF 7UVI B 1 214 PDB 7UVI 7UVI 1 214 DBREF 7UVI C 552 731 UNP P68874 P230_PLAF7 552 731 DBREF 7UVI D 1 216 PDB 7UVI 7UVI 1 216 DBREF 7UVI E 1 214 PDB 7UVI 7UVI 1 214 DBREF 7UVI F 552 731 UNP P68874 P230_PLAF7 552 731 SEQADV 7UVI GLN C 585 UNP P68874 ASN 585 CONFLICT SEQADV 7UVI GLY C 732 UNP P68874 EXPRESSION TAG SEQADV 7UVI SER C 733 UNP P68874 EXPRESSION TAG SEQADV 7UVI LEU C 734 UNP P68874 EXPRESSION TAG SEQADV 7UVI LYS C 735 UNP P68874 EXPRESSION TAG SEQADV 7UVI GLU C 736 UNP P68874 EXPRESSION TAG SEQADV 7UVI ASN C 737 UNP P68874 EXPRESSION TAG SEQADV 7UVI LEU C 738 UNP P68874 EXPRESSION TAG SEQADV 7UVI TYR C 739 UNP P68874 EXPRESSION TAG SEQADV 7UVI PHE C 740 UNP P68874 EXPRESSION TAG SEQADV 7UVI GLN C 741 UNP P68874 EXPRESSION TAG SEQADV 7UVI GLY C 742 UNP P68874 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ASN ILE ARG TYR ILE TYR TYR ALA ASP SER VAL LYS SEQRES 6 D 227 GLY ARG PHE THR ILE SER ARG ASP ASN ALA LYS ASN SER SEQRES 7 D 227 LEU PHE LEU GLN MET ASP SER LEU ARG ALA GLU ASP THR SEQRES 8 D 227 ALA VAL TYR TYR CYS ALA THR ILE ALA GLY PRO LEU SER SEQRES 9 D 227 LEU LYS GLY ASP PHE PHE PHE ASP SER TRP GLY GLN GLY SEQRES 10 D 227 THR LEU VAL THR VAL SER PRO ALA SER THR LYS GLY PRO SEQRES 11 D 227 SER VAL PHE PRO LEU ALA PRO SER SER LYS SER THR SER SEQRES 12 D 227 GLY GLY THR ALA ALA LEU GLY CYS LEU VAL LYS ASP TYR SEQRES 13 D 227 PHE PRO GLU PRO VAL THR VAL SER TRP ASN SER GLY ALA SEQRES 14 D 227 LEU THR SER GLY VAL HIS THR PHE PRO ALA VAL LEU GLN SEQRES 15 D 227 SER SER GLY LEU TYR SER LEU SER SER VAL VAL THR VAL SEQRES 16 D 227 PRO SER SER SER LEU GLY THR GLN THR TYR ILE CYS ASN SEQRES 17 D 227 VAL ASN HIS LYS PRO SER ASN THR LYS VAL ASP LYS LYS SEQRES 18 D 227 VAL GLU PRO LYS SER CYS SEQRES 1 E 215 GLU ILE VAL MET THR GLN SER PRO ALA THR LEU SER VAL SEQRES 2 E 215 SER PRO GLY GLU 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O TYR A 91 SHEET 5 AA2 6 LEU A 45 ILE A 51 -1 O GLU A 46 N ARG A 38 SHEET 6 AA2 6 ILE A 57 TYR A 59 -1 O TYR A 58 N SER A 50 SHEET 1 AA3 4 GLY A 10 VAL A 12 0 SHEET 2 AA3 4 THR A 107 VAL A 111 1 O THR A 110 N VAL A 12 SHEET 3 AA3 4 ALA A 88 ALA A 96 -1 N TYR A 90 O THR A 107 SHEET 4 AA3 4 SER A 102 TRP A 103 -1 O SER A 102 N THR A 94 SHEET 1 AA4 4 SER A 120 LEU A 124 0 SHEET 2 AA4 4 THR A 135 TYR A 145 -1 O LYS A 143 N SER A 120 SHEET 3 AA4 4 TYR A 176 PRO A 185 -1 O TYR A 176 N TYR A 145 SHEET 4 AA4 4 VAL A 163 THR A 165 -1 N HIS A 164 O VAL A 181 SHEET 1 AA5 4 SER A 120 LEU A 124 0 SHEET 2 AA5 4 THR A 135 TYR A 145 -1 O LYS A 143 N SER A 120 SHEET 3 AA5 4 TYR A 176 PRO A 185 -1 O TYR A 176 N TYR A 145 SHEET 4 AA5 4 VAL A 169 LEU A 170 -1 N VAL A 169 O SER A 177 SHEET 1 AA6 3 THR A 151 TRP A 154 0 SHEET 2 AA6 3 TYR A 194 HIS A 200 -1 O ASN A 197 N SER A 153 SHEET 3 AA6 3 THR A 205 VAL A 211 -1 O LYS A 209 N CYS A 196 SHEET 1 AA7 4 MET B 4 SER B 7 0 SHEET 2 AA7 4 ALA B 19 ALA B 25 -1 O 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ANISOU 3750 CA LEU C 619 10457 10124 7157 -266 1611 -1506 C ANISOU 3751 C LEU C 619 11147 11221 8247 -274 1317 -1456 C ANISOU 3752 O LEU C 619 13032 13475 10423 -213 1121 -1350 O ANISOU 3753 CB LEU C 619 9474 9321 6310 -90 1666 -1337 C ANISOU 3754 CG LEU C 619 11359 10830 7756 -99 1955 -1398 C ANISOU 3755 CD1 LEU C 619 9756 9427 6330 58 2050 -1228 C ANISOU 3756 CD2 LEU C 619 10863 10212 6727 -367 1853 -1588 C ANISOU 3757 N ILE C 620 9743 9710 6872 -364 1337 -1548 N ANISOU 3758 CA ILE C 620 9441 9785 6918 -384 1092 -1525 C ANISOU 3759 C ILE C 620 9909 10488 7315 -595 803 -1631 C ANISOU 3760 O ILE C 620 11000 11453 8093 -827 812 -1821 O ANISOU 3761 CB ILE C 620 10503 10648 8039 -392 1272 -1548 C ANISOU 3762 CG1 ILE C 620 9815 9917 7485 -72 1528 -1327 C ANISOU 3763 CG2 ILE C 620 9559 10088 7388 -475 1026 -1574 C ANISOU 3764 CD1 ILE C 620 11014 11742 9055 126 1335 -1184 C ANISOU 3765 N LYS C 621 10496 11459 8208 -512 571 -1517 N ANISOU 3766 CA LYS C 621 9885 11167 7643 -616 307 -1532 C 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THR D 193 14245 12135 12884 -715 1090 100 O ANISOU 6294 CB THR D 193 16935 14205 13705 -864 1565 -204 C ANISOU 6295 OG1 THR D 193 18384 15746 15029 -849 1295 -429 O ANISOU 6296 CG2 THR D 193 17172 14570 14741 -838 1994 -235 C ANISOU 6297 N TYR D 194 14576 12439 12424 -647 605 -97 N ANISOU 6298 CA TYR D 194 13080 11218 11591 -571 370 -147 C ANISOU 6299 C TYR D 194 13461 11713 11921 -563 284 -387 C ANISOU 6300 O TYR D 194 14023 12269 12010 -567 46 -441 O ANISOU 6301 CB TYR D 194 12497 10647 11007 -494 19 2 C ANISOU 6302 CG TYR D 194 13704 11671 12271 -527 100 228 C ANISOU 6303 CD1 TYR D 194 12929 10976 12113 -588 187 289 C ANISOU 6304 CD2 TYR D 194 15025 12726 13014 -524 86 399 C ANISOU 6305 CE1 TYR D 194 12555 10416 11790 -667 256 489 C ANISOU 6306 CE2 TYR D 194 14009 11487 12035 -575 182 610 C ANISOU 6307 CZ TYR D 194 13358 10911 12009 -658 273 641 C ANISOU 6308 OH TYR D 194 14166 11480 12852 -754 362 846 O ANISOU 6309 N ILE D 195 12704 11070 11684 -559 457 -506 N ANISOU 6310 CA ILE D 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ANISOU 6533 CB ALA E 9 19493 11603 13816 1096 -2900 767 C ANISOU 6534 N THR E 10 19290 10480 12411 934 -2392 560 N ANISOU 6535 CA THR E 10 18070 8879 10491 781 -2230 523 C ANISOU 6536 C THR E 10 17428 7969 10086 917 -1926 504 C ANISOU 6537 O THR E 10 17366 7883 10591 1120 -1915 652 O ANISOU 6538 CB THR E 10 19116 9827 10993 637 -2530 854 C ANISOU 6539 OG1 THR E 10 20444 11514 12275 502 -2888 926 O ANISOU 6540 CG2 THR E 10 20667 11038 11687 413 -2360 741 C ANISOU 6541 N LEU E 11 17309 7647 9550 789 -1649 317 N ANISOU 6542 CA LEU E 11 17417 7517 9781 816 -1354 257 C ANISOU 6543 C LEU E 11 18371 8111 10113 665 -1292 400 C ANISOU 6544 O LEU E 11 19198 8941 10428 505 -1198 292 O ANISOU 6545 CB LEU E 11 17535 7888 10077 776 -1066 -79 C ANISOU 6546 CG LEU E 11 16777 7021 9468 723 -764 -212 C ANISOU 6547 CD1 LEU E 11 18762 8951 12036 877 -719 -245 C ANISOU 6548 CD2 LEU E 11 16115 6745 8780 605 -533 -450 C ANISOU 6549 N SER E 12 18351 7761 10166 729 -1299 661 N ANISOU 6550 CA SER E 12 19213 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ANISOU 7667 O SER E 156 17625 16838 12918 -296 2069 -1715 O ANISOU 7668 CB SER E 156 19338 17459 14114 540 1913 -1931 C ANISOU 7669 OG SER E 156 19758 18953 14790 453 2291 -2023 O ANISOU 7670 N GLY E 157 19010 16617 13783 -454 1674 -1515 N ANISOU 7671 CA GLY E 157 17333 14987 11877 -871 1792 -1543 C ANISOU 7672 C GLY E 157 16073 14214 10959 -1032 1739 -1381 C ANISOU 7673 O GLY E 157 15474 13646 10196 -1363 1801 -1441 O ANISOU 7674 N ASN E 158 16261 14737 11553 -753 1623 -1167 N ANISOU 7675 CA ASN E 158 15886 14691 11311 -755 1551 -982 C ANISOU 7676 C ASN E 158 15168 13361 10617 -757 1403 -610 C ANISOU 7677 O ASN E 158 17003 15457 12534 -625 1386 -365 O ANISOU 7678 CB ASN E 158 17051 16662 12815 -352 1551 -917 C ANISOU 7679 CG ASN E 158 19088 19454 15011 -372 1639 -1281 C ANISOU 7680 OD1 ASN E 158 21195 21568 17048 -728 1750 -1525 O ANISOU 7681 ND2 ASN E 158 17855 18894 14068 25 1593 -1275 N ANISOU 7682 N SER E 159 15213 12615 10618 -851 1274 -559 N ANISOU 7683 CA SER E 159 15059 11909 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