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P16157 1 ? 1881 ? 1 1881 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support none _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ARG A 11 ? PHE A 31 ? ARG K 11 PHE K 31 1 ? 21 HELX_P HELX_P2 AA2 GLY A 43 ? LEU A 60 ? GLY K 43 LEU K 60 1 ? 18 HELX_P HELX_P3 AA3 LEU A 60 ? THR A 66 ? LEU K 60 THR K 66 1 ? 7 HELX_P HELX_P4 AA4 HIS A 72 ? LEU A 98 ? HIS K 72 LEU K 98 1 ? 27 HELX_P HELX_P5 AA5 THR A 109 ? ALA A 127 ? THR K 109 ALA K 127 1 ? 19 HELX_P HELX_P6 AA6 GLY A 128 ? VAL A 130 ? GLY K 128 VAL K 130 5 ? 3 HELX_P HELX_P7 AA7 ASN A 135 ? PHE A 161 ? ASN K 135 PHE K 161 1 ? 27 HELX_P HELX_P8 AA8 HIS A 166 ? ARG A 170 ? HIS K 166 ARG K 170 5 ? 5 HELX_P HELX_P9 AA9 HIS A 171 ? LEU A 187 ? HIS K 171 LEU K 187 1 ? 17 HELX_P HELX_P10 AB1 ALA A 202 ? ASN A 224 ? ALA K 202 ASN K 224 1 ? 23 HELX_P HELX_P11 AB2 SER A 230 ? SER A 256 ? SER K 230 SER K 256 1 ? 27 HELX_P HELX_P12 AB3 SER A 266 ? VAL A 274 ? SER K 266 VAL K 274 1 ? 9 HELX_P HELX_P13 AB4 LEU A 275 ? VAL A 281 ? LEU K 275 VAL K 281 1 ? 7 HELX_P HELX_P14 AB5 SER A 290 ? LEU A 312 ? SER K 290 LEU K 312 1 ? 23 HELX_P HELX_P15 AB6 SER A 326 ? HIS A 350 ? SER K 326 HIS K 350 1 ? 25 HELX_P HELX_P16 AB7 PHE A 361 ? ASN A 389 ? PHE K 361 ASN K 389 1 ? 29 HELX_P HELX_P17 AB8 LEU A 390 ? LYS A 394 ? LEU K 390 LYS K 394 5 ? 5 HELX_P HELX_P18 AB9 HIS A 397 ? TYR A 401 ? HIS K 397 TYR K 401 5 ? 5 HELX_P HELX_P19 AC1 ASP A 403 ? PHE A 407 ? ASP K 403 PHE K 407 5 ? 5 HELX_P HELX_P20 AC2 PHE B 3 ? PHE B 23 ? PHE L 3 PHE L 23 1 ? 21 HELX_P HELX_P21 AC3 LEU B 50 ? VAL B 63 ? LEU L 50 VAL L 63 1 ? 14 HELX_P HELX_P22 AC4 VAL B 63 ? MET B 69 ? VAL L 63 MET L 69 1 ? 7 HELX_P HELX_P23 AC5 TYR B 75 ? GLN B 104 ? TYR L 75 GLN L 104 1 ? 30 HELX_P HELX_P24 AC6 GLY B 111 ? LEU B 133 ? GLY L 111 LEU L 133 1 ? 23 HELX_P HELX_P25 AC7 SER B 137 ? ILE B 162 ? SER L 137 ILE L 162 1 ? 26 HELX_P HELX_P26 AC8 ILE B 174 ? LEU B 189 ? ILE L 174 LEU L 189 1 ? 16 HELX_P HELX_P27 AC9 ARG B 191 ? ARG B 195 ? ARG L 191 ARG L 195 5 ? 5 HELX_P HELX_P28 AD1 ALA B 204 ? ASN B 226 ? ALA L 204 ASN L 226 1 ? 23 HELX_P HELX_P29 AD2 GLY B 233 ? GLU B 262 ? GLY L 233 GLU L 262 1 ? 30 HELX_P HELX_P30 AD3 HIS B 263 ? LYS B 266 ? HIS L 263 LYS L 266 5 ? 4 HELX_P HELX_P31 AD4 ASN B 268 ? ALA B 275 ? ASN L 268 ALA L 275 1 ? 8 HELX_P HELX_P32 AD5 LEU B 277 ? VAL B 283 ? LEU L 277 VAL L 283 1 ? 7 HELX_P HELX_P33 AD6 ILE B 291 ? LYS B 321 ? ILE L 291 LYS L 321 1 ? 31 HELX_P HELX_P34 AD7 GLY B 329 ? HIS B 334 ? GLY L 329 HIS L 334 1 ? 6 HELX_P HELX_P35 AD8 HIS B 334 ? MET B 351 ? HIS L 334 MET L 351 1 ? 18 HELX_P HELX_P36 AD9 SER B 357 ? LYS B 384 ? SER L 357 LYS L 384 1 ? 28 HELX_P HELX_P37 AE1 ASP B 398 ? TYR B 402 ? ASP L 398 TYR L 402 5 ? 5 HELX_P HELX_P38 AE2 PHE C 3 ? PHE C 23 ? PHE Q 3 PHE Q 23 1 ? 21 HELX_P HELX_P39 AE3 PHE C 47 ? VAL C 63 ? PHE Q 47 VAL Q 63 1 ? 17 HELX_P HELX_P40 AE4 VAL C 63 ? MET C 69 ? VAL Q 63 MET Q 69 1 ? 7 HELX_P HELX_P41 AE5 TYR C 75 ? GLN C 104 ? TYR Q 75 GLN Q 104 1 ? 30 HELX_P HELX_P42 AE6 GLY C 111 ? VAL C 132 ? GLY Q 111 VAL Q 132 1 ? 22 HELX_P HELX_P43 AE7 SER C 137 ? ILE C 162 ? SER Q 137 ILE Q 162 1 ? 26 HELX_P HELX_P44 AE8 ILE C 174 ? LEU C 189 ? ILE Q 174 LEU Q 189 1 ? 16 HELX_P HELX_P45 AE9 ARG C 191 ? ARG C 195 ? ARG Q 191 ARG Q 195 5 ? 5 HELX_P HELX_P46 AF1 ALA C 204 ? ALA C 228 ? ALA Q 204 ALA Q 228 1 ? 25 HELX_P HELX_P47 AF2 GLY C 233 ? GLU C 262 ? GLY Q 233 GLU Q 262 1 ? 30 HELX_P HELX_P48 AF3 HIS C 263 ? LYS C 266 ? HIS Q 263 LYS Q 266 5 ? 4 HELX_P HELX_P49 AF4 ASN C 268 ? ALA C 275 ? ASN Q 268 ALA Q 275 1 ? 8 HELX_P HELX_P50 AF5 LEU C 277 ? VAL C 283 ? LEU Q 277 VAL Q 283 1 ? 7 HELX_P HELX_P51 AF6 HIS C 292 ? PHE C 313 ? HIS Q 292 PHE Q 313 1 ? 22 HELX_P HELX_P52 AF7 PHE C 313 ? LYS C 321 ? PHE Q 313 LYS Q 321 1 ? 9 HELX_P HELX_P53 AF8 GLY C 329 ? HIS C 334 ? GLY Q 329 HIS Q 334 1 ? 6 HELX_P HELX_P54 AF9 HIS C 334 ? GLY C 352 ? HIS Q 334 GLY Q 352 1 ? 19 HELX_P HELX_P55 AG1 SER C 357 ? LYS C 384 ? SER Q 357 LYS Q 384 1 ? 28 HELX_P HELX_P56 AG2 ASP C 398 ? TYR C 402 ? ASP Q 398 TYR Q 402 5 ? 5 HELX_P HELX_P57 AG3 ALA D 12 ? GLY D 23 ? 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AA3 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA2 1 2 ? parallel AA3 1 2 ? parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 THR A 32 ? HIS A 33 ? THR K 32 HIS K 33 AA1 2 VAL A 106 ? VAL A 107 ? VAL K 106 VAL K 107 AA2 1 VAL B 24 ? GLU B 25 ? VAL L 24 GLU L 25 AA2 2 PHE B 108 ? ASN B 109 ? PHE L 108 ASN L 109 AA3 1 VAL C 24 ? GLU C 25 ? VAL Q 24 GLU Q 25 AA3 2 PHE C 108 ? ASN C 109 ? 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N HIS K 33 O VAL A 106 ? O VAL K 106 AA2 1 2 N GLU B 25 ? N GLU L 25 O PHE B 108 ? O PHE L 108 AA3 1 2 N GLU C 25 ? N GLU Q 25 O PHE C 108 ? O PHE Q 108 # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 SER K 225 ? ? -143.54 51.68 2 1 ALA K 259 ? ? -93.17 52.37 3 1 HIS L 292 ? ? 68.63 153.11 4 1 HIS Q 292 ? ? 88.45 155.10 5 1 ASN Q 355 ? ? -75.25 -166.45 6 1 THR Q 356 ? ? 65.14 159.56 7 1 ASN J 42 ? ? -79.47 -168.43 8 1 GLU J 72 ? ? -98.29 31.21 # _pdbx_entry_details.entry_id 7V0S _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest N # _em_3d_fitting.entry_id 7V0S _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_protocol 'FLEXIBLE FIT' _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id 1 _em_3d_fitting_list.id 1 _em_3d_fitting_list.details ? _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id A _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range ? _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id 4YZF _em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id 1 _em_3d_fitting_list.chain_id ? _em_3d_fitting_list.chain_residue_range ? _em_3d_fitting_list.source_name PDB _em_3d_fitting_list.type 'experimental model' _em_3d_fitting_list.accession_code 4YZF # _em_3d_reconstruction.entry_id 7V0S _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.num_particles 126197 _em_3d_reconstruction.resolution 2.5 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details ;Final gel filtration buffer contained 0.05% w/v digitonin, 130 mM KCl, 20 mM HEPES, pH 7.4, 1 mM ATP, 1 mM MgCl2, 1 mM PMSF. Peak fractions were concentrated to 8 mg/mL, and 0.01% w/v glycyrrhizic acid was added immediately prior to vitrification. ; _em_buffer.pH 7.4 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.details 'Purified by density gradient centrifugation and size exclusion chromatography from digitonin-solubilized erythrocyte membranes.' _em_entity_assembly.name 'Erythrocyte ankyrin-1 complex' _em_entity_assembly.source NATURAL _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.entity_id_list 1,2,3 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 7V0S _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.alignment_procedure 'COMA FREE' _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.cryogen NITROGEN _em_imaging.details ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.nominal_defocus_max 1500 _em_imaging.nominal_defocus_min 500 _em_imaging.nominal_magnification ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.specimen_holder_model 'FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER' _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.specimen_holder_type ? # _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.chamber_temperature 277 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.details '4-6 seconds, wait time 30 seconds' _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.entry_id 7V0S _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 7V0S _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 7V0S _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 K MET 1 ? 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doub N N 604 TYR C OXT sing N N 605 TYR CB CG sing N N 606 TYR CB HB2 sing N N 607 TYR CB HB3 sing N N 608 TYR CG CD1 doub Y N 609 TYR CG CD2 sing Y N 610 TYR CD1 CE1 sing Y N 611 TYR CD1 HD1 sing N N 612 TYR CD2 CE2 doub Y N 613 TYR CD2 HD2 sing N N 614 TYR CE1 CZ doub Y N 615 TYR CE1 HE1 sing N N 616 TYR CE2 CZ sing Y N 617 TYR CE2 HE2 sing N N 618 TYR CZ OH sing N N 619 TYR OH HH sing N N 620 TYR OXT HXT sing N N 621 VAL N CA sing N N 622 VAL N H sing N N 623 VAL N H2 sing N N 624 VAL CA C sing N N 625 VAL CA CB sing N N 626 VAL CA HA sing N N 627 VAL C O doub N N 628 VAL C OXT sing N N 629 VAL CB CG1 sing N N 630 VAL CB CG2 sing N N 631 VAL CB HB sing N N 632 VAL CG1 HG11 sing N N 633 VAL CG1 HG12 sing N N 634 VAL CG1 HG13 sing N N 635 VAL CG2 HG21 sing N N 636 VAL CG2 HG22 sing N N 637 VAL CG2 HG23 sing N N 638 VAL OXT HXT sing N N 639 # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' 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