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? 49.31 80.87 85 1 ASP I 325 ? ? 83.99 -29.43 86 1 ASN I 346 ? ? -154.61 58.38 87 1 SER I 356 ? ? -100.05 -154.75 88 1 ALA I 382 ? ? -113.19 -96.58 89 1 PRO I 458 ? ? -86.21 46.77 90 1 ASP I 501 ? ? -147.01 26.02 91 1 ASP L 166 ? ? 32.38 -119.54 92 1 SER L 174 ? ? -68.99 65.43 93 1 ALA L 251 ? ? -164.22 94.92 94 1 GLN L 324 ? ? 49.33 80.85 95 1 ASP L 325 ? ? 83.95 -29.32 96 1 ASN L 346 ? ? -154.52 58.35 97 1 SER L 356 ? ? -100.08 -154.78 98 1 ALA L 382 ? ? -113.20 -96.51 99 1 PRO L 458 ? ? -86.30 46.90 100 1 ASP L 501 ? ? -147.01 25.90 101 1 ASP J 166 ? ? 32.39 -119.49 102 1 SER J 174 ? ? -68.88 65.40 103 1 ALA J 251 ? ? -164.27 94.96 104 1 GLN J 324 ? ? 49.28 80.89 105 1 ASP J 325 ? ? 83.91 -29.30 106 1 ASN J 346 ? ? -154.55 58.31 107 1 SER J 356 ? ? -100.06 -154.75 108 1 ALA J 382 ? ? -113.23 -96.60 109 1 PRO J 458 ? ? -86.31 46.94 110 1 ASP J 501 ? ? -146.98 25.96 111 1 ASP K 166 ? ? 32.44 -119.56 112 1 SER K 174 ? ? -68.92 65.44 113 1 ALA K 251 ? ? -164.23 94.93 114 1 GLN K 324 ? ? 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_em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages 2 _em_3d_reconstruction.num_particles 247311 _em_3d_reconstruction.resolution 3.9 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 8 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.details ;Recombinant D13 was expressed with N-terminal polyhistidine-tag (His-tag) using bacterial expression system. The protein was purified using metal affinity chromatography. His-tag was removed by proteolysis and the protein was further purified using size exclusion chromatography. The final purified protein was trimeric. D13 assembled in tubular objects in low salt buffer. ; _em_entity_assembly.name 'Vaccinia virus scaffolding protein D13 with N-terminal 17 residue truncation, in its trimer sextet oligomeric state' _em_entity_assembly.source RECOMBINANT _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.entity_id_list 1 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_image_scans.entry_id 7VFH _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.dimension_height 4096 _em_image_scans.dimension_width 4096 _em_image_scans.frames_per_image ? _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.sampling_size 5 _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.used_frames_per_image ? _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.number_digital_images ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 7VFH _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.alignment_procedure 'COMA FREE' _em_imaging.c2_aperture_diameter 70 _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.cryogen NITROGEN _em_imaging.details ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.nominal_defocus_max 2500 _em_imaging.nominal_defocus_min 500 _em_imaging.nominal_magnification 105000 _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.specimen_holder_model 'FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER' _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.specimen_holder_type ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details ? _em_sample_support.grid_material COPPER _em_sample_support.grid_mesh_size 300 _em_sample_support.grid_type 'Quantifoil R2/2' _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? # _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.chamber_temperature 277 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE-PROPANE _em_vitrification.details ;3 microliter sample volume was loaded onto a holey grid with additional graphene oxide film. 10 sec waiting time, 5 sec blotting time and blot force 0, no delay time were applied before plunging. ; _em_vitrification.humidity 90 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.entry_id 7VFH _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 7VFH _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 7VFH _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A ASP 46 ? 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